MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bradyrhizobium sp. S23321

Total Repeats: 180391

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5002	NC_017082	CGG	3	9	195784	195792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383768459
5003	NC_017082	ACC	2	6	195793	195798	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383768459
5004	NC_017082	TGC	2	6	195833	195838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383768459
5005	NC_017082	GAA	2	6	195856	195861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383768459
5006	NC_017082	GCG	2	6	195862	195867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383768459
5007	NC_017082	CGG	2	6	195870	195875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383768459
5008	NC_017082	CGA	2	6	195891	195896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383768459
5009	NC_017082	GCC	2	6	195909	195914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383768459
5010	NC_017082	CG	3	6	195921	195926	0 %	0 %	50 %	50 %	383768459
5011	NC_017082	GCG	2	6	195937	195942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383768459
5012	NC_017082	CGA	2	6	195975	195980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383768459
5013	NC_017082	GCCA	2	8	196073	196080	25 %	0 %	25 %	50 %	383768459
5014	NC_017082	AGC	2	6	196094	196099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383768459
5015	NC_017082	GTCG	2	8	196159	196166	0 %	25 %	50 %	25 %	383768459
5016	NC_017082	CG	3	6	196165	196170	0 %	0 %	50 %	50 %	383768459
5017	NC_017082	GGGA	2	8	196188	196195	25 %	0 %	75 %	0 %	383768459
5018	NC_017082	GCC	2	6	196250	196255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5019	NC_017082	GCC	2	6	196287	196292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383768460
5020	NC_017082	GAGC	2	8	196293	196300	25 %	0 %	50 %	25 %	383768460
5021	NC_017082	GATC	2	8	196334	196341	25 %	25 %	25 %	25 %	383768460
5022	NC_017082	CCG	2	6	196346	196351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383768460
5023	NC_017082	TGG	2	6	196396	196401	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383768460
5024	NC_017082	GGC	2	6	196541	196546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383768460
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5026	NC_017082	GGCG	2	8	196742	196749	0 %	0 %	75 %	25 %	383768460
5027	NC_017082	TCG	2	6	196862	196867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383768460
5028	NC_017082	GCA	2	6	196965	196970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5029	NC_017082	TGT	2	6	197024	197029	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5030	NC_017082	GGCAC	2	10	197109	197118	20 %	0 %	40 %	40 %	383768461
5031	NC_017082	GGT	3	9	197149	197157	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383768461
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5033	NC_017082	CGG	2	6	197245	197250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383768461
5034	NC_017082	CCG	2	6	197265	197270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383768461
5035	NC_017082	ACCG	2	8	197366	197373	25 %	0 %	25 %	50 %	383768461
5036	NC_017082	GCG	2	6	197380	197385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383768461
5037	NC_017082	ATG	2	6	197396	197401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383768461
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5040	NC_017082	CTCG	2	8	197563	197570	0 %	25 %	25 %	50 %	383768461
5041	NC_017082	CGC	2	6	197575	197580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383768461
5042	NC_017082	GCCG	2	8	197626	197633	0 %	0 %	50 %	50 %	383768461
5043	NC_017082	CCG	2	6	197684	197689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383768462
5044	NC_017082	TTG	2	6	197711	197716	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383768462
5045	NC_017082	CTG	2	6	197717	197722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383768462
5046	NC_017082	GCA	2	6	197824	197829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383768462
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5048	NC_017082	TGC	2	6	197916	197921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383768462
5049	NC_017082	CG	3	6	197935	197940	0 %	0 %	50 %	50 %	383768462
5050	NC_017082	ATC	2	6	197945	197950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383768462
5051	NC_017082	TCG	2	6	197979	197984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383768462
5052	NC_017082	TCA	2	6	197997	198002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383768462
5053	NC_017082	CGC	2	6	198100	198105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383768462
5054	NC_017082	GC	3	6	198104	198109	0 %	0 %	50 %	50 %	383768462
5055	NC_017082	TGC	2	6	198111	198116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383768462
5056	NC_017082	ATCC	2	8	198209	198216	25 %	25 %	0 %	50 %	383768462
5057	NC_017082	CCG	2	6	198248	198253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383768462
5058	NC_017082	ATC	2	6	198254	198259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383768462
5059	NC_017082	A	6	6	198269	198274	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5060	NC_017082	TC	3	6	198326	198331	0 %	50 %	0 %	50 %	383768463
5061	NC_017082	TCG	2	6	198365	198370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383768463
5062	NC_017082	GC	3	6	198387	198392	0 %	0 %	50 %	50 %	383768463
5063	NC_017082	GGC	3	9	198419	198427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383768463
5064	NC_017082	TGC	2	6	198458	198463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383768463
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5070	NC_017082	AGCGCA	2	12	198653	198664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383768463
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5073	NC_017082	AAG	2	6	198763	198768	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383768463
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5075	NC_017082	ATCGAG	2	12	198799	198810	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	383768463
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5089	NC_017082	CTG	2	6	199240	199245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383768463
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5093	NC_017082	CGG	2	6	199465	199470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383768463
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5096	NC_017082	A	6	6	199668	199673	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5097	NC_017082	CG	3	6	199710	199715	0 %	0 %	50 %	50 %	383768464
5098	NC_017082	CTGG	2	8	199868	199875	0 %	25 %	50 %	25 %	383768464
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5102	NC_017082	TC	3	6	199985	199990	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5103	NC_017082	ACC	2	6	200010	200015	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383768465
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5115	NC_017082	CTGG	2	8	200470	200477	0 %	25 %	50 %	25 %	383768466
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5120	NC_017082	TTC	2	6	200600	200605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383768466
5121	NC_017082	GAA	2	6	200608	200613	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383768466
5122	NC_017082	GC	3	6	200652	200657	0 %	0 %	50 %	50 %	383768466
5123	NC_017082	ATC	2	6	200663	200668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383768466
5124	NC_017082	CTG	3	9	200669	200677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383768466
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5129	NC_017082	CAT	2	6	200776	200781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383768466
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5151	NC_017082	TCC	2	6	201543	201548	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383768467
5152	NC_017082	TGA	2	6	201558	201563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383768467
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5161	NC_017082	GGC	2	6	201927	201932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383768467
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5165	NC_017082	G	7	7	201989	201995	0 %	0 %	100 %	0 %	383768468
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5199	NC_017082	GGC	2	6	203256	203261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383768468
5200	NC_017082	GAT	2	6	203264	203269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383768468
5201	NC_017082	GC	3	6	203318	203323	0 %	0 %	50 %	50 %	383768468
5202	NC_017082	CGG	2	6	203370	203375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383768468
5203	NC_017082	GCAG	2	8	203380	203387	25 %	0 %	50 %	25 %	383768468
5204	NC_017082	GGT	2	6	203396	203401	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383768468
5205	NC_017082	GAT	2	6	203402	203407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383768468
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5207	NC_017082	GCC	2	6	203428	203433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383768468
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5212	NC_017082	CGA	2	6	203712	203717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383768469
5213	NC_017082	TCGA	2	8	203729	203736	25 %	25 %	25 %	25 %	383768469
5214	NC_017082	TCT	2	6	203754	203759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383768469
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5217	NC_017082	CGA	2	6	203812	203817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383768469
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5219	NC_017082	GTCG	2	8	203838	203845	0 %	25 %	50 %	25 %	383768469
5220	NC_017082	GAAAT	2	10	203894	203903	60 %	20 %	20 %	0 %	383768469
5221	NC_017082	CGA	2	6	203931	203936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383768469
5222	NC_017082	GTG	2	6	203960	203965	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383768469
5223	NC_017082	ACG	2	6	204062	204067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383768469
5224	NC_017082	C	6	6	204083	204088	0 %	0 %	0 %	100 %	383768469
5225	NC_017082	GCGG	2	8	204097	204104	0 %	0 %	75 %	25 %	383768469
5226	NC_017082	CGG	2	6	204118	204123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383768469
5227	NC_017082	CGTT	2	8	204125	204132	0 %	50 %	25 %	25 %	383768469
5228	NC_017082	CGCCAG	2	12	204181	204192	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	383768469
5229	NC_017082	GAT	2	6	204196	204201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383768469
5230	NC_017082	CGT	2	6	204216	204221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383768469
5231	NC_017082	TCT	2	6	204235	204240	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5232	NC_017082	GTC	2	6	204264	204269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5233	NC_017082	AATC	2	8	204278	204285	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5234	NC_017082	CG	3	6	204341	204346	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5235	NC_017082	CCA	2	6	204406	204411	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5236	NC_017082	CG	3	6	204481	204486	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5237	NC_017082	GGC	2	6	204569	204574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5238	NC_017082	CCG	2	6	204589	204594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5239	NC_017082	GA	3	6	204620	204625	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5240	NC_017082	CAACGG	2	12	204636	204647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383768470
5241	NC_017082	GGC	2	6	204660	204665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383768470
5242	NC_017082	TTCG	2	8	204711	204718	0 %	50 %	25 %	25 %	383768470
5243	NC_017082	GCTC	2	8	204737	204744	0 %	25 %	25 %	50 %	383768470
5244	NC_017082	CAG	3	9	204745	204753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383768470
5245	NC_017082	GCCA	2	8	204755	204762	25 %	0 %	25 %	50 %	383768470
5246	NC_017082	CAA	2	6	204795	204800	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383768470
5247	NC_017082	GTCG	2	8	204831	204838	0 %	25 %	50 %	25 %	383768470
5248	NC_017082	CTG	2	6	204964	204969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383768470
5249	NC_017082	ATC	2	6	204988	204993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383768470
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5259	NC_017082	CAG	2	6	205316	205321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383768471
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5261	NC_017082	GCG	2	6	205403	205408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383768471
5262	NC_017082	TCG	2	6	205440	205445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383768471
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5266	NC_017082	CG	3	6	205520	205525	0 %	0 %	50 %	50 %	383768471
5267	NC_017082	TGA	2	6	205549	205554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383768471
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5272	NC_017082	GGT	2	6	205811	205816	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383768471
5273	NC_017082	GCG	2	6	205867	205872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5274	NC_017082	CGC	2	6	205882	205887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383768472
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5283	NC_017082	GGC	2	6	206172	206177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383768472
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5294	NC_017082	GATG	2	8	206596	206603	25 %	25 %	50 %	0 %	383768473
5295	NC_017082	TGG	2	6	206635	206640	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383768473
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5302	NC_017082	GGC	2	6	206972	206977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383768473
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5328	NC_017082	CGGA	2	8	208243	208250	25 %	0 %	50 %	25 %	383768475
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5338	NC_017082	CCCA	2	8	208932	208939	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
5339	NC_017082	ACCTT	2	10	209034	209043	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
5340	NC_017082	CCT	2	6	209064	209069	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5341	NC_017082	ACC	2	6	209099	209104	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5342	NC_017082	GCCG	2	8	209146	209153	0 %	0 %	50 %	50 %	383768477
5343	NC_017082	CTCGT	2	10	209156	209165	0 %	40 %	20 %	40 %	383768477
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5348	NC_017082	GAC	2	6	209345	209350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383768477
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5355	NC_017082	GCC	2	6	209650	209655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383768477
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5357	NC_017082	CGA	2	6	209743	209748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383768477
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5359	NC_017082	CGA	2	6	209812	209817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383768477
5360	NC_017082	CGT	2	6	209893	209898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383768477
5361	NC_017082	TCGAT	2	10	209907	209916	20 %	40 %	20 %	20 %	383768477
5362	NC_017082	ACA	2	6	209937	209942	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383768477
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5364	NC_017082	CGG	2	6	209974	209979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383768477
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5381	NC_017082	GTC	2	6	210719	210724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383768478
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5482	NC_017082	CGGCA	2	10	215221	215230	20 %	0 %	40 %	40 %	383768482
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5488	NC_017082	CTCGAG	2	12	215432	215443	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	383768482
5489	NC_017082	CAC	2	6	215449	215454	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383768482
5490	NC_017082	CG	3	6	215462	215467	0 %	0 %	50 %	50 %	383768482
5491	NC_017082	CAA	3	9	215497	215505	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383768482
5492	NC_017082	GCCC	2	8	215547	215554	0 %	0 %	25 %	75 %	383768482
5493	NC_017082	GGC	2	6	215584	215589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383768482
5494	NC_017082	TTC	2	6	215624	215629	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383768482
5495	NC_017082	CAA	2	6	215737	215742	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383768482
5496	NC_017082	GTC	2	6	215756	215761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383768482
5497	NC_017082	CGTC	2	8	215767	215774	0 %	25 %	25 %	50 %	383768482
5498	NC_017082	AGCGCG	2	12	215922	215933	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	383768482
5499	NC_017082	CCA	2	6	215993	215998	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5500	NC_017082	TGG	2	6	216018	216023	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding

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