MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bacillus amyloliquefaciens subsp. plantarum YAU B9601-Y2

Total Repeats: 91384

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_017061	TCCC	2	8	196285	196292	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
4002	NC_017061	CAG	2	6	196307	196312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384263803
4003	NC_017061	CGC	2	6	196356	196361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384263803
4004	NC_017061	GAT	2	6	196380	196385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384263803
4005	NC_017061	GCC	2	6	196482	196487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384263803
4006	NC_017061	CGGC	2	8	196518	196525	0 %	0 %	50 %	50 %	384263803
4007	NC_017061	CCG	3	9	196588	196596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384263803
4008	NC_017061	T	7	7	196617	196623	0 %	100 %	0 %	0 %	384263803
4009	NC_017061	GCC	2	6	196645	196650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384263803
4010	NC_017061	GAA	2	6	196685	196690	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384263803
4011	NC_017061	GAC	2	6	196758	196763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384263803
4012	NC_017061	GGC	2	6	196776	196781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384263803
4013	NC_017061	CAG	2	6	196818	196823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384263803
4014	NC_017061	ATCAG	2	10	196843	196852	40 %	20 %	20 %	20 %	384263803
4015	NC_017061	TCC	2	6	197016	197021	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384263803
4016	NC_017061	TC	3	6	197039	197044	0 %	50 %	0 %	50 %	384263803
4017	NC_017061	GCC	2	6	197097	197102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384263803
4018	NC_017061	CCG	2	6	197116	197121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384263803
4019	NC_017061	CGC	2	6	197130	197135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384263803
4020	NC_017061	AGCC	2	8	197221	197228	25 %	0 %	25 %	50 %	384263803
4021	NC_017061	GTG	2	6	197338	197343	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384263803
4022	NC_017061	T	6	6	197344	197349	0 %	100 %	0 %	0 %	384263803
4023	NC_017061	T	6	6	197364	197369	0 %	100 %	0 %	0 %	384263803
4024	NC_017061	GGC	2	6	197376	197381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384263803
4025	NC_017061	T	6	6	197398	197403	0 %	100 %	0 %	0 %	384263803
4026	NC_017061	GAC	2	6	197445	197450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384263803
4027	NC_017061	CGA	2	6	197486	197491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384263803
4028	NC_017061	CCG	2	6	197605	197610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384263803
4029	NC_017061	TCC	2	6	197669	197674	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384263803
4030	NC_017061	ATT	2	6	197770	197775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4031	NC_017061	CCA	2	6	197777	197782	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4032	NC_017061	TTCTTT	2	12	197797	197808	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	384263804
4033	NC_017061	GT	3	6	197872	197877	0 %	50 %	50 %	0 %	384263804
4034	NC_017061	CTGC	2	8	197924	197931	0 %	25 %	25 %	50 %	384263804
4035	NC_017061	CCA	2	6	198033	198038	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384263804
4036	NC_017061	ATC	2	6	198068	198073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384263804
4037	NC_017061	CGC	2	6	198115	198120	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384263804
4038	NC_017061	CGA	3	9	198156	198164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384263804
4039	NC_017061	TCT	2	6	198311	198316	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384263804
4040	NC_017061	TCT	2	6	198365	198370	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384263804
4041	NC_017061	TGTA	2	8	198444	198451	25 %	50 %	25 %	0 %	384263804
4042	NC_017061	GCA	2	6	198573	198578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384263804
4043	NC_017061	CTG	2	6	198580	198585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384263804
4044	NC_017061	ATG	2	6	198620	198625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384263804
4045	NC_017061	GATGA	2	10	198796	198805	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
4046	NC_017061	A	6	6	198824	198829	100 %	0 %	0 %	0 %	384263805
4047	NC_017061	GCC	2	6	198870	198875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384263805
4048	NC_017061	GAT	2	6	198918	198923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384263805
4049	NC_017061	AGCA	2	8	198937	198944	50 %	0 %	25 %	25 %	384263805
4050	NC_017061	TCA	2	6	198950	198955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384263805
4051	NC_017061	GCA	2	6	198993	198998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384263805
4052	NC_017061	ATT	2	6	199072	199077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384263805
4053	NC_017061	TAAAA	2	10	199111	199120	80 %	20 %	0 %	0 %	384263805
4054	NC_017061	A	7	7	199117	199123	100 %	0 %	0 %	0 %	384263805
4055	NC_017061	TCT	2	6	199136	199141	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384263805
4056	NC_017061	TCT	2	6	199223	199228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384263805
4057	NC_017061	T	6	6	199311	199316	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4058	NC_017061	TCT	2	6	199334	199339	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384263806
4059	NC_017061	T	8	8	199398	199405	0 %	100 %	0 %	0 %	384263806
4060	NC_017061	AT	3	6	199423	199428	50 %	50 %	0 %	0 %	384263806
4061	NC_017061	GCT	2	6	199432	199437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384263806
4062	NC_017061	GGC	2	6	199474	199479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384263806
4063	NC_017061	T	6	6	199506	199511	0 %	100 %	0 %	0 %	384263806
4064	NC_017061	AT	3	6	199523	199528	50 %	50 %	0 %	0 %	384263806
4065	NC_017061	CCGTT	2	10	199569	199578	0 %	40 %	20 %	40 %	384263806
4066	NC_017061	GCC	2	6	199597	199602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384263806
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4070	NC_017061	GCC	2	6	199636	199641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384263806
4071	NC_017061	CTTT	2	8	199668	199675	0 %	75 %	0 %	25 %	384263806
4072	NC_017061	TCT	2	6	199676	199681	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384263806
4073	NC_017061	T	6	6	199695	199700	0 %	100 %	0 %	0 %	384263806
4074	NC_017061	GCG	2	6	199706	199711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384263806
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4078	NC_017061	AG	3	6	199817	199822	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4079	NC_017061	A	6	6	199843	199848	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4080	NC_017061	A	6	6	199854	199859	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4081	NC_017061	A	7	7	199870	199876	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4082	NC_017061	TA	3	6	199910	199915	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4083	NC_017061	CGG	2	6	199984	199989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4084	NC_017061	GGA	2	6	200022	200027	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4085	NC_017061	CGG	2	6	200069	200074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4086	NC_017061	TCC	2	6	200088	200093	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4087	NC_017061	A	7	7	200185	200191	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4088	NC_017061	CGG	2	6	200220	200225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4089	NC_017061	C	6	6	200267	200272	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4090	NC_017061	CCA	2	6	200274	200279	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4091	NC_017061	T	7	7	200384	200390	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4092	NC_017061	TCA	2	6	200420	200425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4093	NC_017061	GCT	2	6	200442	200447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4094	NC_017061	CCTG	2	8	200483	200490	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4095	NC_017061	TAA	2	6	200510	200515	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4096	NC_017061	A	7	7	200514	200520	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4097	NC_017061	A	7	7	200600	200606	100 %	0 %	0 %	0 %	384263807
4098	NC_017061	CAAG	2	8	200611	200618	50 %	0 %	25 %	25 %	384263807
4099	NC_017061	A	6	6	200621	200626	100 %	0 %	0 %	0 %	384263807
4100	NC_017061	AAGAT	2	10	200667	200676	60 %	20 %	20 %	0 %	384263807
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4103	NC_017061	AG	3	6	201113	201118	50 %	0 %	50 %	0 %	384263807
4104	NC_017061	TGA	2	6	201155	201160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384263807
4105	NC_017061	TCCT	2	8	201217	201224	0 %	50 %	0 %	50 %	384263808
4106	NC_017061	ACA	2	6	201245	201250	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384263808
4107	NC_017061	CTG	2	6	201340	201345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384263808
4108	NC_017061	A	6	6	201384	201389	100 %	0 %	0 %	0 %	384263808
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4110	NC_017061	GCG	2	6	201463	201468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384263808
4111	NC_017061	T	6	6	201470	201475	0 %	100 %	0 %	0 %	384263808
4112	NC_017061	GT	3	6	201505	201510	0 %	50 %	50 %	0 %	384263808
4113	NC_017061	A	6	6	201590	201595	100 %	0 %	0 %	0 %	384263808
4114	NC_017061	CGT	2	6	201638	201643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384263808
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4117	NC_017061	T	6	6	201809	201814	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4118	NC_017061	CGC	2	6	201821	201826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4119	NC_017061	ATG	2	6	201878	201883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4120	NC_017061	GCA	2	6	201898	201903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4121	NC_017061	GGA	2	6	201940	201945	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4122	NC_017061	AT	3	6	202025	202030	50 %	50 %	0 %	0 %	384263809
4123	NC_017061	TCG	2	6	202083	202088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384263809
4124	NC_017061	ATC	2	6	202181	202186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384263809
4125	NC_017061	CTGAG	2	10	202200	202209	20 %	20 %	40 %	20 %	384263809
4126	NC_017061	GGA	2	6	202267	202272	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384263809
4127	NC_017061	GCA	2	6	202276	202281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384263809
4128	NC_017061	ATG	2	6	202461	202466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384263809
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4130	NC_017061	AGTGA	2	10	202583	202592	40 %	20 %	40 %	0 %	384263809
4131	NC_017061	ATT	2	6	202607	202612	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384263809
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4141	NC_017061	ATG	2	6	202948	202953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384263810
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4145	NC_017061	GTCA	2	8	203150	203157	25 %	25 %	25 %	25 %	384263810
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4192	NC_017061	TTC	2	6	205964	205969	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4228	NC_017061	TA	4	8	207984	207991	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4229	NC_017061	TAA	2	6	208014	208019	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4230	NC_017061	TAA	2	6	208028	208033	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4231	NC_017061	AGTAC	2	10	208080	208089	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
4232	NC_017061	CTA	2	6	208108	208113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4233	NC_017061	GCTT	2	8	208193	208200	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4234	NC_017061	A	6	6	208249	208254	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4235	NC_017061	GAAA	2	8	208351	208358	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4236	NC_017061	GAAAG	2	10	208515	208524	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
4237	NC_017061	TTAGA	2	10	208525	208534	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
4238	NC_017061	AGG	2	6	208551	208556	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4239	NC_017061	T	6	6	208576	208581	0 %	100 %	0 %	0 %	384263813
4240	NC_017061	GAAT	2	8	208681	208688	50 %	25 %	25 %	0 %	384263813
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4245	NC_017061	T	6	6	208818	208823	0 %	100 %	0 %	0 %	384263813
4246	NC_017061	A	6	6	208825	208830	100 %	0 %	0 %	0 %	384263813
4247	NC_017061	TTAAAC	2	12	208866	208877	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384263813
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4249	NC_017061	AACT	2	8	208894	208901	50 %	25 %	0 %	25 %	384263813
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4251	NC_017061	GAA	2	6	208931	208936	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384263813
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4368	NC_017061	TA	3	6	213451	213456	50 %	50 %	0 %	0 %	384263815
4369	NC_017061	TCATT	2	10	213457	213466	20 %	60 %	0 %	20 %	384263815
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4372	NC_017061	A	6	6	213492	213497	100 %	0 %	0 %	0 %	384263815
4373	NC_017061	ACA	2	6	213504	213509	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384263815
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4375	NC_017061	TTC	2	6	213583	213588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4376	NC_017061	AATC	2	8	213621	213628	50 %	25 %	0 %	25 %	384263816
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4378	NC_017061	ATC	2	6	213712	213717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384263816
4379	NC_017061	GTG	2	6	213763	213768	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384263816
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4487	NC_017061	TAT	2	6	218633	218638	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4493	NC_017061	AGG	2	6	218888	218893	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4495	NC_017061	AG	3	6	218920	218925	50 %	0 %	50 %	0 %	384263822
4496	NC_017061	GC	3	6	218932	218937	0 %	0 %	50 %	50 %	384263822
4497	NC_017061	GAT	2	6	218948	218953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384263822
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4500	NC_017061	TATCTT	2	12	219053	219064	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384263822

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