MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Brucella suis VBI22 chromosome I

Total Repeats: 1588

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016797	CGGGG	2	10	4059	4068	0 %	0 %	80 %	20 %	376279707
2	NC_016797	GGTCG	2	10	7635	7644	0 %	20 %	60 %	20 %	376279710
3	NC_016797	TCGGC	2	10	7664	7673	0 %	20 %	40 %	40 %	376279710
4	NC_016797	CTGAC	2	10	8101	8110	20 %	20 %	20 %	40 %	376279710
5	NC_016797	AAGAG	2	10	8857	8866	60 %	0 %	40 %	0 %	376279711
6	NC_016797	GCACC	2	10	9007	9016	20 %	0 %	20 %	60 %	376279711
7	NC_016797	TTTCA	2	10	11488	11497	20 %	60 %	0 %	20 %	376279713
8	NC_016797	ATCCG	2	10	11527	11536	20 %	20 %	20 %	40 %	376279713
9	NC_016797	AGCTT	2	10	12699	12708	20 %	40 %	20 %	20 %	376279714
10	NC_016797	CCAGT	2	10	15679	15688	20 %	20 %	20 %	40 %	376279717
11	NC_016797	CTCCG	2	10	17515	17524	0 %	20 %	20 %	60 %	376279719
12	NC_016797	CGTCA	2	10	19521	19530	20 %	20 %	20 %	40 %	376279721
13	NC_016797	AAAGC	2	10	19624	19633	60 %	0 %	20 %	20 %	376279721
14	NC_016797	GCAGG	2	10	22448	22457	20 %	0 %	60 %	20 %	376279722
15	NC_016797	TGCGC	2	10	22826	22835	0 %	20 %	40 %	40 %	376279722
16	NC_016797	GCGTC	2	10	24575	24584	0 %	20 %	40 %	40 %	376279724
17	NC_016797	GATGC	2	10	26759	26768	20 %	20 %	40 %	20 %	376279725
18	NC_016797	CATGC	2	10	26938	26947	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
19	NC_016797	CATGC	2	10	28353	28362	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
20	NC_016797	CGAAA	2	10	28551	28560	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
21	NC_016797	GATCG	2	10	28920	28929	20 %	20 %	40 %	20 %	376279727
22	NC_016797	TATGA	2	10	29721	29730	40 %	40 %	20 %	0 %	376279728
23	NC_016797	ACCCG	2	10	30196	30205	20 %	0 %	20 %	60 %	376279728
24	NC_016797	AGCGC	2	10	31045	31054	20 %	0 %	40 %	40 %	376279729
25	NC_016797	CGGAG	2	10	31529	31538	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
26	NC_016797	CTGTC	2	10	31871	31880	0 %	40 %	20 %	40 %	376279730
27	NC_016797	CATGG	2	10	32292	32301	20 %	20 %	40 %	20 %	376279730
28	NC_016797	AAAGG	2	10	34186	34195	60 %	0 %	40 %	0 %	376279731
29	NC_016797	AAAGC	2	10	36232	36241	60 %	0 %	20 %	20 %	376279733
30	NC_016797	GCGAT	2	10	36583	36592	20 %	20 %	40 %	20 %	376279734
31	NC_016797	CCGTG	2	10	40683	40692	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
32	NC_016797	GCCGC	2	10	40945	40954	0 %	0 %	40 %	60 %	376279738
33	NC_016797	GACCA	2	10	40991	41000	40 %	0 %	20 %	40 %	376279738
34	NC_016797	GCATG	2	10	41682	41691	20 %	20 %	40 %	20 %	376279739
35	NC_016797	GTGCG	2	10	41768	41777	0 %	20 %	60 %	20 %	376279739
36	NC_016797	TCTTG	2	10	41877	41886	0 %	60 %	20 %	20 %	376279739
37	NC_016797	GCCGC	2	10	42512	42521	0 %	0 %	40 %	60 %	376279740
38	NC_016797	GCGTC	2	10	44986	44995	0 %	20 %	40 %	40 %	376279743
39	NC_016797	TCGTT	2	10	46477	46486	0 %	60 %	20 %	20 %	376279745
40	NC_016797	GGCAT	2	10	49011	49020	20 %	20 %	40 %	20 %	376279746
41	NC_016797	TAAAG	2	10	50828	50837	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016797	TGAAA	2	10	51945	51954	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016797	GCCGC	2	10	53079	53088	0 %	0 %	40 %	60 %	376279751
44	NC_016797	CGGGC	2	10	54695	54704	0 %	0 %	60 %	40 %	376279752
45	NC_016797	TGCGC	2	10	54713	54722	0 %	20 %	40 %	40 %	376279752
46	NC_016797	TGGTC	2	10	56843	56852	0 %	40 %	40 %	20 %	376279752
47	NC_016797	GGTGC	2	10	57159	57168	0 %	20 %	60 %	20 %	376279752
48	NC_016797	GAAAG	2	10	60266	60275	60 %	0 %	40 %	0 %	376279755
49	NC_016797	GCCTT	2	10	61918	61927	0 %	40 %	20 %	40 %	376279757
50	NC_016797	TGTCG	2	10	63519	63528	0 %	40 %	40 %	20 %	376279760
51	NC_016797	AGAAA	2	10	63690	63699	80 %	0 %	20 %	0 %	376279760
52	NC_016797	CAAGA	2	10	66469	66478	60 %	0 %	20 %	20 %	376279762
53	NC_016797	CCCAT	2	10	67744	67753	20 %	20 %	0 %	60 %	376279764
54	NC_016797	GCATC	2	10	69071	69080	20 %	20 %	20 %	40 %	376279765
55	NC_016797	ATCTT	2	10	70018	70027	20 %	60 %	0 %	20 %	376279766
56	NC_016797	GGCGC	2	10	72636	72645	0 %	0 %	60 %	40 %	376279771
57	NC_016797	CGGAG	2	10	72748	72757	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
58	NC_016797	GGCGC	2	10	73985	73994	0 %	0 %	60 %	40 %	376279772
59	NC_016797	GATGC	2	10	75997	76006	20 %	20 %	40 %	20 %	376279772
60	NC_016797	CGCGC	2	10	76929	76938	0 %	0 %	40 %	60 %	376279773
61	NC_016797	CATCA	2	10	77005	77014	40 %	20 %	0 %	40 %	376279773
62	NC_016797	GCGCA	2	10	77482	77491	20 %	0 %	40 %	40 %	376279773
63	NC_016797	CGGCG	2	10	77547	77556	0 %	0 %	60 %	40 %	376279774
64	NC_016797	TTCCA	2	10	77649	77658	20 %	40 %	0 %	40 %	376279774
65	NC_016797	AAATA	2	10	78879	78888	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_016797	ACGTT	2	10	79787	79796	20 %	40 %	20 %	20 %	376279775
67	NC_016797	TGGCG	2	10	81007	81016	0 %	20 %	60 %	20 %	376279775
68	NC_016797	AAGGC	2	10	83514	83523	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
69	NC_016797	TCTGG	2	10	83659	83668	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
70	NC_016797	GAGGT	2	10	85326	85335	20 %	20 %	60 %	0 %	376279779
71	NC_016797	TCGAT	2	10	89213	89222	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
72	NC_016797	AACGC	2	10	92667	92676	40 %	0 %	20 %	40 %	376279789
73	NC_016797	GGGCG	2	10	93110	93119	0 %	0 %	80 %	20 %	376279789
74	NC_016797	CGCTG	2	10	93879	93888	0 %	20 %	40 %	40 %	376279790
75	NC_016797	CGGCA	2	10	93955	93964	20 %	0 %	40 %	40 %	376279790
76	NC_016797	GGGCA	2	10	94802	94811	20 %	0 %	60 %	20 %	376279791
77	NC_016797	TTCCA	2	10	95488	95497	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
78	NC_016797	CGGTT	2	10	95860	95869	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
79	NC_016797	GAACC	2	10	95912	95921	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
80	NC_016797	ATAGA	2	10	96294	96303	60 %	20 %	20 %	0 %	376279793
81	NC_016797	AAAAG	2	10	96989	96998	80 %	0 %	20 %	0 %	376279794
82	NC_016797	CCCAG	2	10	99047	99056	20 %	0 %	20 %	60 %	376279795
83	NC_016797	GACCG	2	10	100173	100182	20 %	0 %	40 %	40 %	376279796
84	NC_016797	CGGCC	2	10	100862	100871	0 %	0 %	40 %	60 %	376279797
85	NC_016797	CGGCG	2	10	103382	103391	0 %	0 %	60 %	40 %	376279801
86	NC_016797	CGGGC	2	10	103735	103744	0 %	0 %	60 %	40 %	376279801
87	NC_016797	CATCG	2	10	104745	104754	20 %	20 %	20 %	40 %	376279801
88	NC_016797	GGGAG	2	10	104804	104813	20 %	0 %	80 %	0 %	376279801
89	NC_016797	GCACC	2	10	106796	106805	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
90	NC_016797	TTTGT	2	10	107289	107298	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_016797	GCCAT	2	10	108034	108043	20 %	20 %	20 %	40 %	376279807
92	NC_016797	CGCTG	2	10	111112	111121	0 %	20 %	40 %	40 %	376279810
93	NC_016797	GCCTG	2	10	111475	111484	0 %	20 %	40 %	40 %	376279810
94	NC_016797	TGCCG	2	10	111959	111968	0 %	20 %	40 %	40 %	376279811
95	NC_016797	TGCCG	2	10	112166	112175	0 %	20 %	40 %	40 %	376279811
96	NC_016797	CCTTT	2	10	112204	112213	0 %	60 %	0 %	40 %	376279811
97	NC_016797	GCCGC	2	10	114505	114514	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
98	NC_016797	CTGGC	2	10	114584	114593	0 %	20 %	40 %	40 %	376279813
99	NC_016797	GCGCA	2	10	117287	117296	20 %	0 %	40 %	40 %	376279813
100	NC_016797	GCTCG	2	10	118252	118261	0 %	20 %	40 %	40 %	376279813
101	NC_016797	GACCA	2	10	118268	118277	40 %	0 %	20 %	40 %	376279813
102	NC_016797	CGCGG	2	10	120305	120314	0 %	0 %	60 %	40 %	376279813
103	NC_016797	GGCGA	2	10	120593	120602	20 %	0 %	60 %	20 %	376279813
104	NC_016797	TGGCT	2	10	121868	121877	0 %	40 %	40 %	20 %	376279813
105	NC_016797	GCTCG	2	10	122047	122056	0 %	20 %	40 %	40 %	376279813
106	NC_016797	ATGGA	2	10	122837	122846	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
107	NC_016797	GCGCG	2	10	122872	122881	0 %	0 %	60 %	40 %	376279814
108	NC_016797	CGCGG	2	10	124662	124671	0 %	0 %	60 %	40 %	376279815
109	NC_016797	GATAG	2	10	127119	127128	40 %	20 %	40 %	0 %	376279818
110	NC_016797	TGGAA	2	10	133456	133465	40 %	20 %	40 %	0 %	376279823
111	NC_016797	ACCGC	2	10	135157	135166	20 %	0 %	20 %	60 %	376279825
112	NC_016797	GCCAT	2	10	135809	135818	20 %	20 %	20 %	40 %	376279825
113	NC_016797	GCCGA	2	10	140319	140328	20 %	0 %	40 %	40 %	376279827
114	NC_016797	CCGGC	2	10	140626	140635	0 %	0 %	40 %	60 %	376279827
115	NC_016797	AGCAC	2	10	141559	141568	40 %	0 %	20 %	40 %	376279827
116	NC_016797	CCGCC	2	10	145027	145036	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
117	NC_016797	GCACG	2	10	146937	146946	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
118	NC_016797	CGAAC	2	10	147233	147242	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
119	NC_016797	GCTTC	2	10	147281	147290	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
120	NC_016797	CGAAG	2	10	147418	147427	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
121	NC_016797	CAATG	2	10	148658	148667	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
122	NC_016797	CGCGC	2	10	148672	148681	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
123	NC_016797	CCTTG	2	10	149231	149240	0 %	40 %	20 %	40 %	376279833
124	NC_016797	TGCGA	2	10	150841	150850	20 %	20 %	40 %	20 %	376279835
125	NC_016797	CGGCA	2	10	153979	153988	20 %	0 %	40 %	40 %	376279840
126	NC_016797	CAGTG	2	10	154495	154504	20 %	20 %	40 %	20 %	376279841
127	NC_016797	TCAAC	2	10	155676	155685	40 %	20 %	0 %	40 %	376279842
128	NC_016797	AGGGC	2	10	158275	158284	20 %	0 %	60 %	20 %	376279844
129	NC_016797	GCACC	2	10	159479	159488	20 %	0 %	20 %	60 %	376279844
130	NC_016797	GTTCG	2	10	159647	159656	0 %	40 %	40 %	20 %	376279844
131	NC_016797	ACAGC	2	10	162439	162448	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
132	NC_016797	GCCGG	2	10	162971	162980	0 %	0 %	60 %	40 %	376279846
133	NC_016797	CGGAG	2	10	165774	165783	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
134	NC_016797	ACAAA	2	10	165841	165850	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
135	NC_016797	GCCGC	2	10	168827	168836	0 %	0 %	40 %	60 %	376279850
136	NC_016797	CTGCC	2	10	170405	170414	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
137	NC_016797	TGAAA	2	10	171777	171786	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
138	NC_016797	CGTGT	2	10	172674	172683	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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