MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Bacillus cereus F837/76 plasmid pF837_55

Total Repeats: 178

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016794	CATC	2	8	151	158	25 %	25 %	0 %	50 %	376270192
2	NC_016794	ATCT	2	8	179	186	25 %	50 %	0 %	25 %	376270192
3	NC_016794	ATAG	2	8	585	592	50 %	25 %	25 %	0 %	376270194
4	NC_016794	GCTC	2	8	826	833	0 %	25 %	25 %	50 %	376270195
5	NC_016794	AACA	2	8	935	942	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_016794	CTTT	2	8	997	1004	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_016794	CAAA	2	8	1332	1339	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_016794	CATT	2	8	1618	1625	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_016794	GCCC	2	8	1661	1668	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
10	NC_016794	TCCT	2	8	1922	1929	0 %	50 %	0 %	50 %	376270196
11	NC_016794	TGAC	2	8	2832	2839	25 %	25 %	25 %	25 %	376270198
12	NC_016794	ACTG	2	8	2855	2862	25 %	25 %	25 %	25 %	376270198
13	NC_016794	TTTC	2	8	3215	3222	0 %	75 %	0 %	25 %	376270199
14	NC_016794	TTTC	2	8	3421	3428	0 %	75 %	0 %	25 %	376270200
15	NC_016794	TTTA	2	8	3620	3627	25 %	75 %	0 %	0 %	376270201
16	NC_016794	ATAG	2	8	3842	3849	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_016794	AAAC	2	8	4205	4212	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_016794	TAAA	2	8	4602	4609	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016794	TTTA	2	8	4748	4755	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016794	TGGA	2	8	4986	4993	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016794	TTTC	2	8	5022	5029	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_016794	TATT	2	8	5077	5084	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016794	ACCC	2	8	5355	5362	25 %	0 %	0 %	75 %	376270203
24	NC_016794	AAAC	2	8	5626	5633	75 %	0 %	0 %	25 %	376270204
25	NC_016794	AATA	2	8	5692	5699	75 %	25 %	0 %	0 %	376270204
26	NC_016794	TTCG	2	8	6005	6012	0 %	50 %	25 %	25 %	376270205
27	NC_016794	CAAC	2	8	6422	6429	50 %	0 %	0 %	50 %	376270206
28	NC_016794	CCAA	2	8	6791	6798	50 %	0 %	0 %	50 %	376270207
29	NC_016794	TTAC	2	8	6876	6883	25 %	50 %	0 %	25 %	376270207
30	NC_016794	TTGC	2	8	6935	6942	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_016794	ATCA	2	8	7034	7041	50 %	25 %	0 %	25 %	376270208
32	NC_016794	TCTT	2	8	7340	7347	0 %	75 %	0 %	25 %	376270209
33	NC_016794	TTTC	2	8	7601	7608	0 %	75 %	0 %	25 %	376270209
34	NC_016794	CCTT	2	8	8184	8191	0 %	50 %	0 %	50 %	376270211
35	NC_016794	TTTA	2	8	8601	8608	25 %	75 %	0 %	0 %	376270213
36	NC_016794	AGTT	2	8	8663	8670	25 %	50 %	25 %	0 %	376270213
37	NC_016794	TTGC	2	8	8734	8741	0 %	50 %	25 %	25 %	376270213
38	NC_016794	AATA	2	8	9039	9046	75 %	25 %	0 %	0 %	376270213
39	NC_016794	TTAA	2	8	9602	9609	50 %	50 %	0 %	0 %	376270214
40	NC_016794	TTGA	2	8	10063	10070	25 %	50 %	25 %	0 %	376270214
41	NC_016794	TTTC	2	8	10371	10378	0 %	75 %	0 %	25 %	376270215
42	NC_016794	TTGT	2	8	10577	10584	0 %	75 %	25 %	0 %	376270216
43	NC_016794	GTTT	2	8	10837	10844	0 %	75 %	25 %	0 %	376270217
44	NC_016794	AAAG	2	8	11186	11193	75 %	0 %	25 %	0 %	376270217
45	NC_016794	AAGT	2	8	11741	11748	50 %	25 %	25 %	0 %	376270219
46	NC_016794	ATCC	2	8	12261	12268	25 %	25 %	0 %	50 %	376270221
47	NC_016794	TTCT	2	8	12403	12410	0 %	75 %	0 %	25 %	376270223
48	NC_016794	CTCA	2	8	12646	12653	25 %	25 %	0 %	50 %	376270223
49	NC_016794	GAAG	2	8	12851	12858	50 %	0 %	50 %	0 %	376270223
50	NC_016794	TTCA	2	8	13144	13151	25 %	50 %	0 %	25 %	376270223
51	NC_016794	AAAT	2	8	13462	13469	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_016794	GAAA	2	8	13831	13838	75 %	0 %	25 %	0 %	376270225
53	NC_016794	ATGT	2	8	13857	13864	25 %	50 %	25 %	0 %	376270225
54	NC_016794	CAAA	2	8	13875	13882	75 %	0 %	0 %	25 %	376270225
55	NC_016794	CTAT	2	8	14209	14216	25 %	50 %	0 %	25 %	376270227
56	NC_016794	TAAA	2	8	14516	14523	75 %	25 %	0 %	0 %	376270228
57	NC_016794	TTTG	2	8	14995	15002	0 %	75 %	25 %	0 %	376270228
58	NC_016794	AAAT	2	8	15515	15522	75 %	25 %	0 %	0 %	376270228
59	NC_016794	AAAC	2	8	15932	15939	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_016794	TATT	2	8	16688	16695	25 %	75 %	0 %	0 %	376270230
61	NC_016794	GAAG	2	8	16848	16855	50 %	0 %	50 %	0 %	376270230
62	NC_016794	AAGA	2	8	16861	16868	75 %	0 %	25 %	0 %	376270230
63	NC_016794	ATTT	2	8	17560	17567	25 %	75 %	0 %	0 %	376270231
64	NC_016794	TTCT	2	8	17862	17869	0 %	75 %	0 %	25 %	376270232
65	NC_016794	ATTC	2	8	18544	18551	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_016794	TAAA	2	8	18591	18598	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_016794	AAAC	2	8	19104	19111	75 %	0 %	0 %	25 %	376270233
68	NC_016794	CAAA	2	8	19378	19385	75 %	0 %	0 %	25 %	376270233
69	NC_016794	AATC	2	8	19392	19399	50 %	25 %	0 %	25 %	376270233
70	NC_016794	AATA	2	8	19748	19755	75 %	25 %	0 %	0 %	376270233
71	NC_016794	ATAA	2	8	20159	20166	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_016794	TACA	2	8	21039	21046	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_016794	ATTC	2	8	21195	21202	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_016794	ACTA	2	8	21384	21391	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_016794	ATTT	2	8	21518	21525	25 %	75 %	0 %	0 %	376270235
76	NC_016794	ATGT	2	8	21588	21595	25 %	50 %	25 %	0 %	376270235
77	NC_016794	ATAA	2	8	21631	21638	75 %	25 %	0 %	0 %	376270235
78	NC_016794	TTTG	2	8	21960	21967	0 %	75 %	25 %	0 %	376270235
79	NC_016794	CTTC	2	8	22407	22414	0 %	50 %	0 %	50 %	376270235
80	NC_016794	TTCC	2	8	22549	22556	0 %	50 %	0 %	50 %	376270235
81	NC_016794	TTTA	2	8	23001	23008	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_016794	GTAT	2	8	23245	23252	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_016794	CCCT	2	8	23414	23421	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
84	NC_016794	CACG	2	8	23503	23510	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
85	NC_016794	TTTA	2	8	23562	23569	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_016794	ATTT	2	8	24217	24224	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_016794	GGTA	2	8	24480	24487	25 %	25 %	50 %	0 %	376270237
88	NC_016794	AGAA	2	8	25313	25320	75 %	0 %	25 %	0 %	376270238
89	NC_016794	AATC	2	8	25511	25518	50 %	25 %	0 %	25 %	376270238
90	NC_016794	TAGA	2	8	25590	25597	50 %	25 %	25 %	0 %	376270238
91	NC_016794	GTTG	2	8	26036	26043	0 %	50 %	50 %	0 %	376270239
92	NC_016794	AATA	2	8	26127	26134	75 %	25 %	0 %	0 %	376270239
93	NC_016794	ACAG	2	8	26239	26246	50 %	0 %	25 %	25 %	376270240
94	NC_016794	ATAA	2	8	26724	26731	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_016794	ATAC	2	8	27817	27824	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_016794	ATAA	2	8	27848	27855	75 %	25 %	0 %	0 %	376270242
97	NC_016794	TTTA	2	8	28009	28016	25 %	75 %	0 %	0 %	376270243
98	NC_016794	GCCA	2	8	28589	28596	25 %	0 %	25 %	50 %	376270243
99	NC_016794	AGGT	2	8	28708	28715	25 %	25 %	50 %	0 %	376270243
100	NC_016794	ATAA	2	8	28988	28995	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_016794	CTGT	2	8	29688	29695	0 %	50 %	25 %	25 %	376270244
102	NC_016794	CGTC	2	8	29827	29834	0 %	25 %	25 %	50 %	376270244
103	NC_016794	TTTC	2	8	30491	30498	0 %	75 %	0 %	25 %	376270245
104	NC_016794	ATTG	2	8	31000	31007	25 %	50 %	25 %	0 %	376270247
105	NC_016794	ACAT	2	8	31431	31438	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_016794	TTCG	2	8	31534	31541	0 %	50 %	25 %	25 %	376270248
107	NC_016794	TTTG	2	8	31859	31866	0 %	75 %	25 %	0 %	376270248
108	NC_016794	AAAC	2	8	32366	32373	75 %	0 %	0 %	25 %	376270248
109	NC_016794	TAAC	2	8	32548	32555	50 %	25 %	0 %	25 %	376270248
110	NC_016794	ACTA	2	8	32624	32631	50 %	25 %	0 %	25 %	376270248
111	NC_016794	ACTA	2	8	32975	32982	50 %	25 %	0 %	25 %	376270249
112	NC_016794	TACA	2	8	33124	33131	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
113	NC_016794	TTTA	2	8	33139	33146	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_016794	GAAA	2	8	33252	33259	75 %	0 %	25 %	0 %	376270250
115	NC_016794	ATCC	2	8	33850	33857	25 %	25 %	0 %	50 %	376270250
116	NC_016794	ACAA	2	8	33924	33931	75 %	0 %	0 %	25 %	376270250
117	NC_016794	ATAG	2	8	34255	34262	50 %	25 %	25 %	0 %	376270250
118	NC_016794	ATGA	2	8	34687	34694	50 %	25 %	25 %	0 %	376270251
119	NC_016794	TATG	2	8	34704	34711	25 %	50 %	25 %	0 %	376270251
120	NC_016794	ATTT	2	8	34900	34907	25 %	75 %	0 %	0 %	376270251
121	NC_016794	AACA	2	8	34943	34950	75 %	0 %	0 %	25 %	376270251
122	NC_016794	TTTA	2	8	35086	35093	25 %	75 %	0 %	0 %	376270252
123	NC_016794	GTTG	2	8	35295	35302	0 %	50 %	50 %	0 %	376270252
124	NC_016794	GCCT	2	8	35420	35427	0 %	25 %	25 %	50 %	376270252
125	NC_016794	TCCA	2	8	35500	35507	25 %	25 %	0 %	50 %	376270252
126	NC_016794	CCAA	2	8	36053	36060	50 %	0 %	0 %	50 %	376270253
127	NC_016794	ATTG	2	8	36918	36925	25 %	50 %	25 %	0 %	376270254
128	NC_016794	GTTT	2	8	36984	36991	0 %	75 %	25 %	0 %	376270254
129	NC_016794	TCTG	2	8	37317	37324	0 %	50 %	25 %	25 %	376270255
130	NC_016794	TAGT	2	8	37336	37343	25 %	50 %	25 %	0 %	376270255
131	NC_016794	CGTC	2	8	37384	37391	0 %	25 %	25 %	50 %	376270255
132	NC_016794	ATCT	2	8	38470	38477	25 %	50 %	0 %	25 %	376270256
133	NC_016794	TTTC	2	8	38589	38596	0 %	75 %	0 %	25 %	376270256
134	NC_016794	TGTT	2	8	38800	38807	0 %	75 %	25 %	0 %	376270256
135	NC_016794	GTTG	2	8	39255	39262	0 %	50 %	50 %	0 %	376270256
136	NC_016794	TTGA	2	8	39329	39336	25 %	50 %	25 %	0 %	376270256
137	NC_016794	ATTG	2	8	39680	39687	25 %	50 %	25 %	0 %	376270256
138	NC_016794	TTCA	2	8	39971	39978	25 %	50 %	0 %	25 %	376270256
139	NC_016794	CCAT	2	8	40115	40122	25 %	25 %	0 %	50 %	376270256
140	NC_016794	AGCA	2	8	40420	40427	50 %	0 %	25 %	25 %	376270256
141	NC_016794	GATT	2	8	40440	40447	25 %	50 %	25 %	0 %	376270256
142	NC_016794	TACA	2	8	40730	40737	50 %	25 %	0 %	25 %	376270256
143	NC_016794	CATT	2	8	41604	41611	25 %	50 %	0 %	25 %	376270257
144	NC_016794	ATAC	2	8	41861	41868	50 %	25 %	0 %	25 %	376270258
145	NC_016794	GTAC	2	8	42004	42011	25 %	25 %	25 %	25 %	376270258
146	NC_016794	TTGC	2	8	42914	42921	0 %	50 %	25 %	25 %	376270258
147	NC_016794	GATT	2	8	43729	43736	25 %	50 %	25 %	0 %	376270258
148	NC_016794	TTTG	2	8	44287	44294	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
149	NC_016794	ACCT	2	8	44366	44373	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
150	NC_016794	GAAC	2	8	45418	45425	50 %	0 %	25 %	25 %	376270261
151	NC_016794	ATCT	2	8	45459	45466	25 %	50 %	0 %	25 %	376270261
152	NC_016794	CTAA	2	8	45530	45537	50 %	25 %	0 %	25 %	376270261
153	NC_016794	AAAT	2	8	45733	45740	75 %	25 %	0 %	0 %	376270262
154	NC_016794	CATA	2	8	46043	46050	50 %	25 %	0 %	25 %	376270262
155	NC_016794	CCAT	2	8	46256	46263	25 %	25 %	0 %	50 %	376270263
156	NC_016794	AACA	2	8	46897	46904	75 %	0 %	0 %	25 %	376270264
157	NC_016794	CGGG	2	8	47578	47585	0 %	0 %	75 %	25 %	376270267
158	NC_016794	GTTT	2	8	47773	47780	0 %	75 %	25 %	0 %	376270268
159	NC_016794	TTCT	2	8	48943	48950	0 %	75 %	0 %	25 %	376270269
160	NC_016794	CTTT	2	8	49089	49096	0 %	75 %	0 %	25 %	376270269
161	NC_016794	GGTT	2	8	49737	49744	0 %	50 %	50 %	0 %	376270270
162	NC_016794	ACTT	2	8	50541	50548	25 %	50 %	0 %	25 %	376270271
163	NC_016794	TTTA	2	8	50616	50623	25 %	75 %	0 %	0 %	376270271
164	NC_016794	ACCA	2	8	51222	51229	50 %	0 %	0 %	50 %	376270271
165	NC_016794	TTTA	2	8	51348	51355	25 %	75 %	0 %	0 %	376270271
166	NC_016794	AGTA	2	8	51383	51390	50 %	25 %	25 %	0 %	376270271
167	NC_016794	TTAA	2	8	51454	51461	50 %	50 %	0 %	0 %	376270271
168	NC_016794	TAAA	2	8	51641	51648	75 %	25 %	0 %	0 %	376270271
169	NC_016794	ATAA	2	8	52145	52152	75 %	25 %	0 %	0 %	376270272
170	NC_016794	CTAA	2	8	52233	52240	50 %	25 %	0 %	25 %	376270272
171	NC_016794	GAAC	2	8	52800	52807	50 %	0 %	25 %	25 %	376270272
172	NC_016794	TAGC	2	8	53426	53433	25 %	25 %	25 %	25 %	376270273
173	NC_016794	AGTA	2	8	53487	53494	50 %	25 %	25 %	0 %	376270273
174	NC_016794	GCTT	2	8	53500	53507	0 %	50 %	25 %	25 %	376270273
175	NC_016794	CATG	2	8	53591	53598	25 %	25 %	25 %	25 %	376270273
176	NC_016794	CACC	2	8	54043	54050	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
177	NC_016794	CTGT	2	8	54718	54725	0 %	50 %	25 %	25 %	376270275
178	NC_016794	GTTT	2	8	55262	55269	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.