MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Bacillus cereus NC7401 plasmid pNCcld

Total Repeats: 228

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016792	TAAAA	2	10	707	716	80 %	20 %	0 %	0 %	376258300
2	NC_016792	ATGAT	2	10	1108	1117	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016792	AAGAA	2	10	1766	1775	80 %	0 %	20 %	0 %	376258302
4	NC_016792	TACAA	2	10	2149	2158	60 %	20 %	0 %	20 %	376258302
5	NC_016792	ATTTG	2	10	3077	3086	20 %	60 %	20 %	0 %	376258304
6	NC_016792	TTCTG	2	10	4248	4257	0 %	60 %	20 %	20 %	376258305
7	NC_016792	ATACG	2	10	5016	5025	40 %	20 %	20 %	20 %	376258306
8	NC_016792	GCATT	2	10	5234	5243	20 %	40 %	20 %	20 %	376258306
9	NC_016792	CATTC	2	10	6194	6203	20 %	40 %	0 %	40 %	376258306
10	NC_016792	TAAAA	2	10	8040	8049	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_016792	TTCCT	2	10	8334	8343	0 %	60 %	0 %	40 %	376258308
12	NC_016792	TTTTC	2	10	9529	9538	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_016792	TTGTT	2	10	10388	10397	0 %	80 %	20 %	0 %	376258309
14	NC_016792	CGTTC	2	10	11780	11789	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
15	NC_016792	CACAA	2	10	13191	13200	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
16	NC_016792	CATTT	2	10	19289	19298	20 %	60 %	0 %	20 %	376258314
17	NC_016792	ATGAT	2	10	19338	19347	40 %	40 %	20 %	0 %	376258314
18	NC_016792	ATTTG	2	10	20246	20255	20 %	60 %	20 %	0 %	376258314
19	NC_016792	TTTCT	2	10	21571	21580	0 %	80 %	0 %	20 %	376258314
20	NC_016792	CGGTA	2	10	23060	23069	20 %	20 %	40 %	20 %	376258314
21	NC_016792	CGAAA	2	10	27267	27276	60 %	0 %	20 %	20 %	376258315
22	NC_016792	TTTCT	2	10	30123	30132	0 %	80 %	0 %	20 %	376258315
23	NC_016792	TCGCA	2	10	31074	31083	20 %	20 %	20 %	40 %	376258315
24	NC_016792	CTTTT	2	10	31884	31893	0 %	80 %	0 %	20 %	376258315
25	NC_016792	TTCAA	2	10	33364	33373	40 %	40 %	0 %	20 %	376258315
26	NC_016792	ATATT	2	10	35107	35116	40 %	60 %	0 %	0 %	376258317
27	NC_016792	AATTA	2	10	36788	36797	60 %	40 %	0 %	0 %	376258318
28	NC_016792	TTAAT	2	10	37327	37336	40 %	60 %	0 %	0 %	376258318
29	NC_016792	CTCTT	2	10	38976	38985	0 %	60 %	0 %	40 %	376258319
30	NC_016792	AGTTG	2	10	39359	39368	20 %	40 %	40 %	0 %	376258320
31	NC_016792	TATTG	2	10	39809	39818	20 %	60 %	20 %	0 %	376258321
32	NC_016792	AAAAT	2	10	41162	41171	80 %	20 %	0 %	0 %	376258322
33	NC_016792	CCATC	2	10	41275	41284	20 %	20 %	0 %	60 %	376258322
34	NC_016792	CTAAA	2	10	46292	46301	60 %	20 %	0 %	20 %	376258326
35	NC_016792	TAACT	2	10	46762	46771	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
36	NC_016792	GTAAT	2	10	49872	49881	40 %	40 %	20 %	0 %	376258331
37	NC_016792	CATAT	2	10	50453	50462	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
38	NC_016792	ATTTT	2	10	52342	52351	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016792	GATTA	2	10	53195	53204	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016792	AGAGC	2	10	55143	55152	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
41	NC_016792	AAAAG	2	10	55384	55393	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016792	CAATC	2	10	56877	56886	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
43	NC_016792	CAATC	2	10	57180	57189	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
44	NC_016792	CAAGA	2	10	57370	57379	60 %	0 %	20 %	20 %	376258337
45	NC_016792	GTTTT	2	10	58060	58069	0 %	80 %	20 %	0 %	376258338
46	NC_016792	ATTGT	2	10	59047	59056	20 %	60 %	20 %	0 %	376258338
47	NC_016792	ATTTA	2	10	59757	59766	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_016792	GCTTT	2	10	59875	59884	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
49	NC_016792	GCTTT	2	10	59955	59964	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
50	NC_016792	GCTTT	2	10	60036	60045	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
51	NC_016792	GCTTT	2	10	60117	60126	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
52	NC_016792	AGCCA	2	10	61070	61079	40 %	0 %	20 %	40 %	376258339
53	NC_016792	AAAAT	2	10	62562	62571	80 %	20 %	0 %	0 %	376258339
54	NC_016792	ATTTC	2	10	65447	65456	20 %	60 %	0 %	20 %	376258344
55	NC_016792	CCTTC	2	10	68156	68165	0 %	40 %	0 %	60 %	376258349
56	NC_016792	AAGAA	2	10	70725	70734	80 %	0 %	20 %	0 %	376258353
57	NC_016792	CTTTT	2	10	77292	77301	0 %	80 %	0 %	20 %	376258362
58	NC_016792	CACAA	2	10	80145	80154	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
59	NC_016792	ATAAG	2	10	80759	80768	60 %	20 %	20 %	0 %	376258366
60	NC_016792	CATTC	2	10	80982	80991	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
61	NC_016792	CACAA	2	10	81894	81903	60 %	0 %	0 %	40 %	376258368
62	NC_016792	TTTGC	2	10	82762	82771	0 %	60 %	20 %	20 %	376258370
63	NC_016792	ACAAA	2	10	84962	84971	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
64	NC_016792	AAAAT	2	10	85107	85116	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_016792	GAAGC	2	10	86962	86971	40 %	0 %	40 %	20 %	376258374
66	NC_016792	ATGGA	2	10	87550	87559	40 %	20 %	40 %	0 %	376258374
67	NC_016792	TTATT	2	10	88588	88597	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_016792	ATTTA	2	10	88646	88655	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_016792	GAAGT	2	10	89023	89032	40 %	20 %	40 %	0 %	376258375
70	NC_016792	TACGA	2	10	90161	90170	40 %	20 %	20 %	20 %	376258375
71	NC_016792	AGTAA	2	10	90402	90411	60 %	20 %	20 %	0 %	376258375
72	NC_016792	AAAGA	2	10	91992	92001	80 %	0 %	20 %	0 %	376258375
73	NC_016792	TGATT	2	10	92665	92674	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_016792	CTTCT	2	10	92966	92975	0 %	60 %	0 %	40 %	376258377
75	NC_016792	CTCTT	2	10	94930	94939	0 %	60 %	0 %	40 %	376258378
76	NC_016792	TTGAT	2	10	95017	95026	20 %	60 %	20 %	0 %	376258378
77	NC_016792	AGTTC	2	10	96494	96503	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
78	NC_016792	AACAA	2	10	97143	97152	80 %	0 %	0 %	20 %	376258380
79	NC_016792	TTATT	2	10	97653	97662	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_016792	GTGAT	2	10	102719	102728	20 %	40 %	40 %	0 %	376258384
81	NC_016792	ATTTT	2	10	103736	103745	20 %	80 %	0 %	0 %	376258384
82	NC_016792	AAAAG	2	10	104072	104081	80 %	0 %	20 %	0 %	376258384
83	NC_016792	AGTCT	2	10	107990	107999	20 %	40 %	20 %	20 %	376258388
84	NC_016792	TAGAT	2	10	108087	108096	40 %	40 %	20 %	0 %	376258388
85	NC_016792	GAAAA	2	10	108265	108274	80 %	0 %	20 %	0 %	376258388
86	NC_016792	ATAAA	2	10	111234	111243	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_016792	GAAAG	2	10	111247	111256	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
88	NC_016792	AAATC	2	10	111467	111476	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
89	NC_016792	AGAAA	2	10	112143	112152	80 %	0 %	20 %	0 %	376258393
90	NC_016792	AAGAA	2	10	112663	112672	80 %	0 %	20 %	0 %	376258394
91	NC_016792	TAGTA	2	10	114764	114773	40 %	40 %	20 %	0 %	376258396
92	NC_016792	ATTGC	2	10	116296	116305	20 %	40 %	20 %	20 %	376258397
93	NC_016792	AATTC	2	10	117398	117407	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
94	NC_016792	GAATG	2	10	118164	118173	40 %	20 %	40 %	0 %	376258401
95	NC_016792	ATGAA	2	10	118259	118268	60 %	20 %	20 %	0 %	376258401
96	NC_016792	AAACC	2	10	118397	118406	60 %	0 %	0 %	40 %	376258401
97	NC_016792	AAAAG	2	10	125881	125890	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
98	NC_016792	ATTTG	2	10	126973	126982	20 %	60 %	20 %	0 %	376258416
99	NC_016792	TAATT	2	10	126995	127004	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_016792	AAACA	2	10	127053	127062	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
101	NC_016792	CTTAC	2	10	127129	127138	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
102	NC_016792	AAATG	2	10	127681	127690	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
103	NC_016792	AAACA	2	10	129478	129487	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
104	NC_016792	AAGCT	2	10	130991	131000	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
105	NC_016792	ATTTG	2	10	131869	131878	20 %	60 %	20 %	0 %	376258426
106	NC_016792	GGAGC	2	10	133003	133012	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
107	NC_016792	TTTTA	2	10	134080	134089	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_016792	CAGTA	2	10	134615	134624	40 %	20 %	20 %	20 %	376258430
109	NC_016792	AAATG	2	10	138214	138223	60 %	20 %	20 %	0 %	376258431
110	NC_016792	TAAAT	2	10	139045	139054	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_016792	TTGTG	2	10	139235	139244	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
112	NC_016792	TTTTA	2	10	140080	140089	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_016792	ATGGA	2	10	140558	140567	40 %	20 %	40 %	0 %	376258435
114	NC_016792	ATGAA	2	10	142389	142398	60 %	20 %	20 %	0 %	376258436
115	NC_016792	ATTCC	2	10	142448	142457	20 %	40 %	0 %	40 %	376258436
116	NC_016792	ACAAA	2	10	142818	142827	80 %	0 %	0 %	20 %	376258436
117	NC_016792	GAAAT	2	10	144928	144937	60 %	20 %	20 %	0 %	376258438
118	NC_016792	TATAA	2	10	145010	145019	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_016792	AATAA	2	10	145037	145046	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_016792	ATTTA	2	10	146477	146486	40 %	60 %	0 %	0 %	376258441
121	NC_016792	GAACT	2	10	147934	147943	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
122	NC_016792	GTATG	2	10	148081	148090	20 %	40 %	40 %	0 %	376258443
123	NC_016792	ACTAA	2	10	148537	148546	60 %	20 %	0 %	20 %	376258444
124	NC_016792	ATTAG	2	10	148657	148666	40 %	40 %	20 %	0 %	376258444
125	NC_016792	TGAAG	2	10	150842	150851	40 %	20 %	40 %	0 %	376258445
126	NC_016792	TAACT	2	10	151421	151430	40 %	40 %	0 %	20 %	376258445
127	NC_016792	GATAA	2	10	151653	151662	60 %	20 %	20 %	0 %	376258446
128	NC_016792	AAACT	2	10	151770	151779	60 %	20 %	0 %	20 %	376258446
129	NC_016792	GTTAT	2	10	159767	159776	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
130	NC_016792	TAAAA	2	10	161386	161395	80 %	20 %	0 %	0 %	376258452
131	NC_016792	GTTTT	2	10	162464	162473	0 %	80 %	20 %	0 %	376258454
132	NC_016792	CCATA	2	10	164833	164842	40 %	20 %	0 %	40 %	376258456
133	NC_016792	TAAAG	2	10	165612	165621	60 %	20 %	20 %	0 %	376258457
134	NC_016792	ACCTG	2	10	167035	167044	20 %	20 %	20 %	40 %	376258458
135	NC_016792	ATTAT	2	10	167262	167271	40 %	60 %	0 %	0 %	376258458
136	NC_016792	AAATT	2	10	168063	168072	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_016792	TAATT	2	10	168810	168819	40 %	60 %	0 %	0 %	376258461
138	NC_016792	TAAGT	2	10	170269	170278	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
139	NC_016792	CATTT	2	10	170492	170501	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
140	NC_016792	TATTG	2	10	173326	173335	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
141	NC_016792	ATTCT	2	10	174985	174994	20 %	60 %	0 %	20 %	376258472
142	NC_016792	TCCTT	2	10	176089	176098	0 %	60 %	0 %	40 %	376258472
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202	NC_016792	TGAAA	2	10	243735	243744	60 %	20 %	20 %	0 %	376258534
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225	NC_016792	TCATT	2	10	264977	264986	20 %	60 %	0 %	20 %	376258557
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.