MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Bacillus amyloliquefaciens subsp. plantarum CAU B946

Total Repeats: 11623

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016784	TCTT	2	8	11	18	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_016784	CTGG	2	8	567	574	0 %	25 %	50 %	25 %	375360691
3	NC_016784	TTTA	2	8	849	856	25 %	75 %	0 %	0 %	375360691
4	NC_016784	AACA	2	8	1079	1086	75 %	0 %	0 %	25 %	375360691
5	NC_016784	CAAA	2	8	1131	1138	75 %	0 %	0 %	25 %	375360691
6	NC_016784	GATT	2	8	1214	1221	25 %	50 %	25 %	0 %	375360691
7	NC_016784	GAAA	2	8	1268	1275	75 %	0 %	25 %	0 %	375360691
8	NC_016784	GAAA	2	8	1725	1732	75 %	0 %	25 %	0 %	375360691
9	NC_016784	TCAT	2	8	2099	2106	25 %	50 %	0 %	25 %	375360692
10	NC_016784	CGAT	2	8	2139	2146	25 %	25 %	25 %	25 %	375360692
11	NC_016784	TTCA	2	8	2920	2927	25 %	50 %	0 %	25 %	375360692
12	NC_016784	GAGC	2	8	3309	3316	25 %	0 %	50 %	25 %	375360693
13	NC_016784	GAAG	2	8	3649	3656	50 %	0 %	50 %	0 %	375360694
14	NC_016784	TCAG	2	8	3749	3756	25 %	25 %	25 %	25 %	375360694
15	NC_016784	GCTG	2	8	4326	4333	0 %	25 %	50 %	25 %	375360694
16	NC_016784	GACA	2	8	4671	4678	50 %	0 %	25 %	25 %	375360695
17	NC_016784	GAAA	2	8	4679	4686	75 %	0 %	25 %	0 %	375360695
18	NC_016784	CCGT	2	8	4695	4702	0 %	25 %	25 %	50 %	375360695
19	NC_016784	CGGT	2	8	5115	5122	0 %	25 %	50 %	25 %	375360696
20	NC_016784	GCGG	2	8	6167	6174	0 %	0 %	75 %	25 %	375360696
21	NC_016784	TCAG	2	8	7046	7053	25 %	25 %	25 %	25 %	375360697
22	NC_016784	TCCT	2	8	7066	7073	0 %	50 %	0 %	50 %	375360697
23	NC_016784	AATG	2	8	7161	7168	50 %	25 %	25 %	0 %	375360697
24	NC_016784	ATCA	2	8	7722	7729	50 %	25 %	0 %	25 %	375360697
25	NC_016784	AGAA	2	8	7773	7780	75 %	0 %	25 %	0 %	375360697
26	NC_016784	ACAA	2	8	7967	7974	75 %	0 %	0 %	25 %	375360697
27	NC_016784	AATC	2	8	7998	8005	50 %	25 %	0 %	25 %	375360697
28	NC_016784	ACTG	2	8	8250	8257	25 %	25 %	25 %	25 %	375360697
29	NC_016784	ATCA	2	8	8336	8343	50 %	25 %	0 %	25 %	375360697
30	NC_016784	CTGA	2	8	8965	8972	25 %	25 %	25 %	25 %	375360697
31	NC_016784	CGTC	2	8	9369	9376	0 %	25 %	25 %	50 %	375360697
32	NC_016784	TAAA	2	8	9722	9729	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016784	AGTC	2	8	9748	9755	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_016784	CCTG	2	8	9891	9898	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
35	NC_016784	GTGA	2	8	10173	10180	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016784	AGCC	2	8	11227	11234	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
37	NC_016784	AAGC	2	8	11752	11759	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_016784	CACG	2	8	12448	12455	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
39	NC_016784	GCGA	2	8	13236	13243	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
40	NC_016784	TAGG	2	8	13811	13818	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016784	CGGG	2	8	13907	13914	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
42	NC_016784	ATCG	2	8	14572	14579	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_016784	AGGC	2	8	15506	15513	25 %	0 %	50 %	25 %	375360698
44	NC_016784	TTTA	2	8	15682	15689	25 %	75 %	0 %	0 %	375360698
45	NC_016784	GGAC	2	8	17131	17138	25 %	0 %	50 %	25 %	375360699
46	NC_016784	ATGA	2	8	17471	17478	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016784	AATG	2	8	17954	17961	50 %	25 %	25 %	0 %	375360700
48	NC_016784	TGAA	2	8	18019	18026	50 %	25 %	25 %	0 %	375360700
49	NC_016784	CAAG	2	8	18497	18504	50 %	0 %	25 %	25 %	375360700
50	NC_016784	AAGA	2	8	18830	18837	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016784	ATCT	2	8	18907	18914	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_016784	AATG	2	8	19231	19238	50 %	25 %	25 %	0 %	375360701
53	NC_016784	TAAA	2	8	19368	19375	75 %	25 %	0 %	0 %	375360701
54	NC_016784	CGGG	2	8	20061	20068	0 %	0 %	75 %	25 %	375360702
55	NC_016784	TATT	2	8	20322	20329	25 %	75 %	0 %	0 %	375360702
56	NC_016784	TGAT	2	8	20839	20846	25 %	50 %	25 %	0 %	375360703
57	NC_016784	CGTC	2	8	23022	23029	0 %	25 %	25 %	50 %	375360704
58	NC_016784	CTTT	2	8	23235	23242	0 %	75 %	0 %	25 %	375360704
59	NC_016784	GCAT	2	8	24061	24068	25 %	25 %	25 %	25 %	375360705
60	NC_016784	AAAT	2	8	24169	24176	75 %	25 %	0 %	0 %	375360705
61	NC_016784	GTCT	2	8	24404	24411	0 %	50 %	25 %	25 %	375360706
62	NC_016784	GTGA	2	8	24635	24642	25 %	25 %	50 %	0 %	375360706
63	NC_016784	GAAA	2	8	25141	25148	75 %	0 %	25 %	0 %	375360707
64	NC_016784	TTAA	2	8	25190	25197	50 %	50 %	0 %	0 %	375360707
65	NC_016784	CGGC	2	8	26177	26184	0 %	0 %	50 %	50 %	375360707
66	NC_016784	TGAA	2	8	26372	26379	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_016784	ATAA	2	8	26829	26836	75 %	25 %	0 %	0 %	375360708
68	NC_016784	TTTG	2	8	26891	26898	0 %	75 %	25 %	0 %	375360708
69	NC_016784	ATGA	2	8	27070	27077	50 %	25 %	25 %	0 %	375360709
70	NC_016784	AAAG	2	8	27519	27526	75 %	0 %	25 %	0 %	375360709
71	NC_016784	ATTT	2	8	27627	27634	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_016784	TAAG	2	8	27733	27740	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_016784	GGAA	2	8	27795	27802	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_016784	ATCA	2	8	27905	27912	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_016784	TTAC	2	8	28386	28393	25 %	50 %	0 %	25 %	375360710
76	NC_016784	TGAA	2	8	28836	28843	50 %	25 %	25 %	0 %	375360710
77	NC_016784	GAAG	2	8	29311	29318	50 %	0 %	50 %	0 %	375360710
78	NC_016784	GCGG	2	8	29861	29868	0 %	0 %	75 %	25 %	375360711
79	NC_016784	ATAA	2	8	30078	30085	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_016784	CAAC	2	8	30512	30519	50 %	0 %	0 %	50 %	375360712
81	NC_016784	GAAG	2	8	30664	30671	50 %	0 %	50 %	0 %	375360712
82	NC_016784	ACAG	2	8	30788	30795	50 %	0 %	25 %	25 %	375360713
83	NC_016784	TAAA	2	8	31459	31466	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_016784	AGTC	2	8	31485	31492	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
85	NC_016784	CCTG	2	8	31627	31634	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
86	NC_016784	GTGA	2	8	31909	31916	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_016784	AGCC	2	8	32963	32970	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
88	NC_016784	AAGC	2	8	33488	33495	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
89	NC_016784	CACG	2	8	34184	34191	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
90	NC_016784	GCGA	2	8	34972	34979	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
91	NC_016784	TAGG	2	8	35547	35554	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_016784	CGGG	2	8	35643	35650	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
93	NC_016784	ATCG	2	8	36308	36315	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
94	NC_016784	ATGA	2	8	36669	36676	50 %	25 %	25 %	0 %	375360715
95	NC_016784	TCGT	2	8	36817	36824	0 %	50 %	25 %	25 %	375360715
96	NC_016784	AATA	2	8	36990	36997	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_016784	CGGC	2	8	37133	37140	0 %	0 %	50 %	50 %	375360716
98	NC_016784	CAGT	2	8	37148	37155	25 %	25 %	25 %	25 %	375360716
99	NC_016784	TGAG	2	8	37496	37503	25 %	25 %	50 %	0 %	375360716
100	NC_016784	GCAG	2	8	38312	38319	25 %	0 %	50 %	25 %	375360717
101	NC_016784	CCGG	2	8	38741	38748	0 %	0 %	50 %	50 %	375360717
102	NC_016784	CATG	2	8	39243	39250	25 %	25 %	25 %	25 %	375360718
103	NC_016784	GCGG	2	8	39771	39778	0 %	0 %	75 %	25 %	375360718
104	NC_016784	GCTG	2	8	39867	39874	0 %	25 %	50 %	25 %	375360718
105	NC_016784	ATAA	2	8	40075	40082	75 %	25 %	0 %	0 %	375360718
106	NC_016784	TTTA	2	8	40277	40284	25 %	75 %	0 %	0 %	375360719
107	NC_016784	TAAA	2	8	40429	40436	75 %	25 %	0 %	0 %	375360719
108	NC_016784	GATG	2	8	40448	40455	25 %	25 %	50 %	0 %	375360719
109	NC_016784	TTCT	2	8	40615	40622	0 %	75 %	0 %	25 %	375360719
110	NC_016784	AATG	2	8	40930	40937	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_016784	AAAT	2	8	41324	41331	75 %	25 %	0 %	0 %	375360721
112	NC_016784	GAAA	2	8	41637	41644	75 %	0 %	25 %	0 %	375360721
113	NC_016784	GGAA	2	8	41785	41792	50 %	0 %	50 %	0 %	375360722
114	NC_016784	TTCA	2	8	42471	42478	25 %	50 %	0 %	25 %	375360722
115	NC_016784	CAAT	2	8	42612	42619	50 %	25 %	0 %	25 %	375360722
116	NC_016784	AAAC	2	8	42994	43001	75 %	0 %	0 %	25 %	375360723
117	NC_016784	GACG	2	8	43124	43131	25 %	0 %	50 %	25 %	375360723
118	NC_016784	AGAA	2	8	43802	43809	75 %	0 %	25 %	0 %	375360724
119	NC_016784	TCAT	2	8	44320	44327	25 %	50 %	0 %	25 %	375360725
120	NC_016784	TTTA	2	8	44610	44617	25 %	75 %	0 %	0 %	375360725
121	NC_016784	GAAA	2	8	44975	44982	75 %	0 %	25 %	0 %	375360726
122	NC_016784	ACAG	2	8	45474	45481	50 %	0 %	25 %	25 %	375360727
123	NC_016784	AAAC	2	8	45842	45849	75 %	0 %	0 %	25 %	375360727
124	NC_016784	TACG	2	8	46220	46227	25 %	25 %	25 %	25 %	375360728
125	NC_016784	TTGT	2	8	46369	46376	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_016784	AGTA	2	8	46393	46400	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_016784	TTTA	2	8	46575	46582	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_016784	ATAG	2	8	46637	46644	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_016784	GTAT	2	8	47443	47450	25 %	50 %	25 %	0 %	375360729
130	NC_016784	ATTA	2	8	47807	47814	50 %	50 %	0 %	0 %	375360729
131	NC_016784	TGCT	2	8	48066	48073	0 %	50 %	25 %	25 %	375360729
132	NC_016784	AGAA	2	8	49119	49126	75 %	0 %	25 %	0 %	375360730
133	NC_016784	TCAT	2	8	49176	49183	25 %	50 %	0 %	25 %	375360730
134	NC_016784	CTTC	2	8	49635	49642	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_016784	GAAC	2	8	50169	50176	50 %	0 %	25 %	25 %	375360731
136	NC_016784	GAAA	2	8	50291	50298	75 %	0 %	25 %	0 %	375360731
137	NC_016784	GAAA	2	8	50484	50491	75 %	0 %	25 %	0 %	375360731
138	NC_016784	GAAA	2	8	50517	50524	75 %	0 %	25 %	0 %	375360731
139	NC_016784	GAAA	2	8	50993	51000	75 %	0 %	25 %	0 %	375360731
140	NC_016784	ATTC	2	8	51033	51040	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
141	NC_016784	GCAA	2	8	51113	51120	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
142	NC_016784	TCCT	2	8	52212	52219	0 %	50 %	0 %	50 %	375360733
143	NC_016784	AAGC	2	8	52403	52410	50 %	0 %	25 %	25 %	375360733
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