MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Brucella suis VBI22 chromosome II

Total Repeats: 858

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016775	GCGAA	2	10	288	297	40 %	0 %	40 %	20 %	376277992
2	NC_016775	CATGG	2	10	431	440	20 %	20 %	40 %	20 %	376277992
3	NC_016775	CCGCG	2	10	782	791	0 %	0 %	40 %	60 %	376277992
4	NC_016775	ATTTC	2	10	1583	1592	20 %	60 %	0 %	20 %	376277994
5	NC_016775	GGGAG	2	10	1695	1704	20 %	0 %	80 %	0 %	376277994
6	NC_016775	CTGCC	2	10	2165	2174	0 %	20 %	20 %	60 %	376277996
7	NC_016775	CAAGG	2	10	2499	2508	40 %	0 %	40 %	20 %	376277996
8	NC_016775	AAAAG	2	10	3050	3059	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_016775	GCCGC	2	10	4432	4441	0 %	0 %	40 %	60 %	376277998
10	NC_016775	ACCGA	2	10	8529	8538	40 %	0 %	20 %	40 %	376278001
11	NC_016775	CGGCG	2	10	11736	11745	0 %	0 %	60 %	40 %	376278005
12	NC_016775	CCCCG	2	10	13915	13924	0 %	0 %	20 %	80 %	376278007
13	NC_016775	GCCGA	2	10	15121	15130	20 %	0 %	40 %	40 %	376278008
14	NC_016775	CATCA	2	10	15567	15576	40 %	20 %	0 %	40 %	376278008
15	NC_016775	AGGCG	2	10	18892	18901	20 %	0 %	60 %	20 %	376278012
16	NC_016775	GCCAT	2	10	19156	19165	20 %	20 %	20 %	40 %	376278013
17	NC_016775	TGAGG	2	10	19442	19451	20 %	20 %	60 %	0 %	376278013
18	NC_016775	GCTTC	2	10	19524	19533	0 %	40 %	20 %	40 %	376278013
19	NC_016775	AGCGG	2	10	22081	22090	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
20	NC_016775	TCTCG	2	10	23155	23164	0 %	40 %	20 %	40 %	376278017
21	NC_016775	CGGCC	2	10	23869	23878	0 %	0 %	40 %	60 %	376278017
22	NC_016775	CGGCC	2	10	24357	24366	0 %	0 %	40 %	60 %	376278018
23	NC_016775	ATCCG	2	10	24804	24813	20 %	20 %	20 %	40 %	376278018
24	NC_016775	GGCGA	2	10	25158	25167	20 %	0 %	60 %	20 %	376278019
25	NC_016775	ACGGC	2	10	27189	27198	20 %	0 %	40 %	40 %	376278022
26	NC_016775	GCGCA	2	10	28296	28305	20 %	0 %	40 %	40 %	376278023
27	NC_016775	TCGGT	2	10	28513	28522	0 %	40 %	40 %	20 %	376278023
28	NC_016775	CCGCG	2	10	33705	33714	0 %	0 %	40 %	60 %	376278028
29	NC_016775	CTGCC	2	10	35736	35745	0 %	20 %	20 %	60 %	376278028
30	NC_016775	GGCCT	2	10	37474	37483	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
31	NC_016775	CGGAA	2	10	38764	38773	40 %	0 %	40 %	20 %	376278033
32	NC_016775	ATGAA	2	10	40045	40054	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016775	CATGC	2	10	40993	41002	20 %	20 %	20 %	40 %	376278035
34	NC_016775	TTTGT	2	10	41206	41215	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016775	GCGCC	2	10	41738	41747	0 %	0 %	40 %	60 %	376278036
36	NC_016775	CAGCG	2	10	42620	42629	20 %	0 %	40 %	40 %	376278037
37	NC_016775	CGCTC	2	10	43415	43424	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
38	NC_016775	CGGCG	2	10	43519	43528	0 %	0 %	60 %	40 %	376278039
39	NC_016775	GCAAA	2	10	44106	44115	60 %	0 %	20 %	20 %	376278040
40	NC_016775	TGAAA	2	10	44271	44280	60 %	20 %	20 %	0 %	376278041
41	NC_016775	CCGCT	2	10	50263	50272	0 %	20 %	20 %	60 %	376278045
42	NC_016775	GGTAA	2	10	51594	51603	40 %	20 %	40 %	0 %	376278046
43	NC_016775	CCGGC	2	10	52048	52057	0 %	0 %	40 %	60 %	376278046
44	NC_016775	CGGAA	2	10	52748	52757	40 %	0 %	40 %	20 %	376278046
45	NC_016775	GCCGT	2	10	55047	55056	0 %	20 %	40 %	40 %	376278048
46	NC_016775	CATTC	2	10	55296	55305	20 %	40 %	0 %	40 %	376278048
47	NC_016775	CTTCG	2	10	57174	57183	0 %	40 %	20 %	40 %	376278050
48	NC_016775	TTTGC	2	10	59159	59168	0 %	60 %	20 %	20 %	376278052
49	NC_016775	TGCCC	2	10	60556	60565	0 %	20 %	20 %	60 %	376278053
50	NC_016775	TGCGG	2	10	60794	60803	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
51	NC_016775	ATGCG	2	10	62497	62506	20 %	20 %	40 %	20 %	376278056
52	NC_016775	ATGTG	2	10	64335	64344	20 %	40 %	40 %	0 %	376278057
53	NC_016775	ATCGC	2	10	68493	68502	20 %	20 %	20 %	40 %	376278061
54	NC_016775	GACGG	2	10	68804	68813	20 %	0 %	60 %	20 %	376278061
55	NC_016775	TATCT	2	10	73039	73048	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
56	NC_016775	AGGGC	2	10	78408	78417	20 %	0 %	60 %	20 %	376278070
57	NC_016775	AATTC	2	10	78528	78537	40 %	40 %	0 %	20 %	376278070
58	NC_016775	TCGGT	2	10	81732	81741	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
59	NC_016775	TTCTC	2	10	81761	81770	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
60	NC_016775	CGCGG	2	10	81969	81978	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
61	NC_016775	TCTGC	2	10	83116	83125	0 %	40 %	20 %	40 %	376278073
62	NC_016775	ACTTG	2	10	87288	87297	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
63	NC_016775	GCCGG	2	10	93458	93467	0 %	0 %	60 %	40 %	376278084
64	NC_016775	TGCGG	2	10	93482	93491	0 %	20 %	60 %	20 %	376278084
65	NC_016775	ATGAA	2	10	93711	93720	60 %	20 %	20 %	0 %	376278084
66	NC_016775	CTTTC	2	10	94080	94089	0 %	60 %	0 %	40 %	376278085
67	NC_016775	GCAAT	2	10	94706	94715	40 %	20 %	20 %	20 %	376278085
68	NC_016775	CTTGC	2	10	94950	94959	0 %	40 %	20 %	40 %	376278086
69	NC_016775	GGAAT	2	10	95220	95229	40 %	20 %	40 %	0 %	376278086
70	NC_016775	GTAAT	2	10	95840	95849	40 %	40 %	20 %	0 %	376278087
71	NC_016775	AAGCG	2	10	96071	96080	40 %	0 %	40 %	20 %	376278087
72	NC_016775	CCGAG	2	10	96527	96536	20 %	0 %	40 %	40 %	376278087
73	NC_016775	CGGTA	2	10	97157	97166	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
74	NC_016775	CCAAG	2	10	97332	97341	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
75	NC_016775	TCGCT	2	10	97677	97686	0 %	40 %	20 %	40 %	376278088
76	NC_016775	ATGGC	2	10	98193	98202	20 %	20 %	40 %	20 %	376278088
77	NC_016775	TTCGC	2	10	99579	99588	0 %	40 %	20 %	40 %	376278089
78	NC_016775	GCTCT	2	10	99692	99701	0 %	40 %	20 %	40 %	376278089
79	NC_016775	ATGAG	2	10	99786	99795	40 %	20 %	40 %	0 %	376278089
80	NC_016775	GTTCC	2	10	99898	99907	0 %	40 %	20 %	40 %	376278089
81	NC_016775	TGCTG	2	10	100506	100515	0 %	40 %	40 %	20 %	376278090
82	NC_016775	ATGAA	2	10	103419	103428	60 %	20 %	20 %	0 %	376278094
83	NC_016775	CCGCT	2	10	103714	103723	0 %	20 %	20 %	60 %	376278095
84	NC_016775	CCGAT	2	10	103867	103876	20 %	20 %	20 %	40 %	376278095
85	NC_016775	TCCTT	2	10	106763	106772	0 %	60 %	0 %	40 %	376278097
86	NC_016775	GGCGA	2	10	107744	107753	20 %	0 %	60 %	20 %	376278098
87	NC_016775	CTTGC	2	10	107991	108000	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
88	NC_016775	CCTGC	2	10	112665	112674	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
89	NC_016775	CCGCG	2	10	113300	113309	0 %	0 %	40 %	60 %	376278103
90	NC_016775	CGGTG	2	10	114888	114897	0 %	20 %	60 %	20 %	376278104
91	NC_016775	GCCCG	2	10	115925	115934	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
92	NC_016775	GCACA	2	10	117216	117225	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
93	NC_016775	GTTCG	2	10	117237	117246	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
94	NC_016775	GCCAT	2	10	117847	117856	20 %	20 %	20 %	40 %	376278105
95	NC_016775	GAAAA	2	10	119169	119178	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
96	NC_016775	CGATA	2	10	121406	121415	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
97	NC_016775	GCCCG	2	10	121820	121829	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
98	NC_016775	CGCGG	2	10	127970	127979	0 %	0 %	60 %	40 %	376278116
99	NC_016775	AATCA	2	10	129091	129100	60 %	20 %	0 %	20 %	376278118
100	NC_016775	TGGGC	2	10	132783	132792	0 %	20 %	60 %	20 %	376278123
101	NC_016775	CAAGA	2	10	132895	132904	60 %	0 %	20 %	20 %	376278123
102	NC_016775	AGATA	2	10	134509	134518	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
103	NC_016775	TGGGA	2	10	136170	136179	20 %	20 %	60 %	0 %	376278129
104	NC_016775	GGGCA	3	15	140749	140763	20 %	0 %	60 %	20 %	376278134
105	NC_016775	GCCGC	2	10	141615	141624	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
106	NC_016775	CCGCA	2	10	143265	143274	20 %	0 %	20 %	60 %	376278138
107	NC_016775	ATGAA	2	10	144316	144325	60 %	20 %	20 %	0 %	376278139
108	NC_016775	TTGGC	2	10	145146	145155	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
109	NC_016775	CGCAG	2	10	146777	146786	20 %	0 %	40 %	40 %	376278142
110	NC_016775	CCGGC	2	10	150159	150168	0 %	0 %	40 %	60 %	376278148
111	NC_016775	CGCAT	2	10	150237	150246	20 %	20 %	20 %	40 %	376278148
112	NC_016775	CTATA	2	10	151714	151723	40 %	40 %	0 %	20 %	376278149
113	NC_016775	CCGGG	2	10	152296	152305	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
114	NC_016775	GCTTT	2	10	152698	152707	0 %	60 %	20 %	20 %	376278150
115	NC_016775	CGCGG	2	10	152777	152786	0 %	0 %	60 %	40 %	376278150
116	NC_016775	CGGAT	2	10	159667	159676	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
117	NC_016775	TGGGC	2	10	159798	159807	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
118	NC_016775	TGTTT	2	10	160251	160260	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_016775	CCCGT	2	10	160976	160985	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
120	NC_016775	AGCGG	2	10	162930	162939	20 %	0 %	60 %	20 %	376278161
121	NC_016775	GCCGC	2	10	165418	165427	0 %	0 %	40 %	60 %	376278164
122	NC_016775	GTGGC	2	10	165734	165743	0 %	20 %	60 %	20 %	376278164
123	NC_016775	GCCTG	2	10	166531	166540	0 %	20 %	40 %	40 %	376278165
124	NC_016775	GGCCG	2	10	169486	169495	0 %	0 %	60 %	40 %	376278167
125	NC_016775	AGGGC	2	10	169919	169928	20 %	0 %	60 %	20 %	376278168
126	NC_016775	GCCCG	2	10	170729	170738	0 %	0 %	40 %	60 %	376278169
127	NC_016775	GTTCG	2	10	172381	172390	0 %	40 %	40 %	20 %	376278170
128	NC_016775	GTCTC	2	10	172416	172425	0 %	40 %	20 %	40 %	376278170
129	NC_016775	GCCGA	2	10	175168	175177	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
130	NC_016775	GCCCC	2	10	175195	175204	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
131	NC_016775	CTTCA	2	10	179860	179869	20 %	40 %	0 %	40 %	376278177
132	NC_016775	TGACC	2	10	180129	180138	20 %	20 %	20 %	40 %	376278177
133	NC_016775	GCCTC	2	10	182397	182406	0 %	20 %	20 %	60 %	376278181
134	NC_016775	GGATA	2	10	188089	188098	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
135	NC_016775	GTGAA	2	10	190295	190304	40 %	20 %	40 %	0 %	376278188
136	NC_016775	GAAGA	2	10	190627	190636	60 %	0 %	40 %	0 %	376278188
137	NC_016775	GCCGC	2	10	191130	191139	0 %	0 %	40 %	60 %	376278188
138	NC_016775	TGACG	2	10	191835	191844	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
139	NC_016775	GATCA	2	10	193283	193292	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
140	NC_016775	GCGCC	2	10	197215	197224	0 %	0 %	40 %	60 %	376278191
141	NC_016775	GTTCA	2	10	197291	197300	20 %	40 %	20 %	20 %	376278191
142	NC_016775	AGCAG	2	10	203603	203612	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
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148	NC_016775	ATCAA	2	10	209354	209363	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
149	NC_016775	TGAAA	2	10	209364	209373	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
150	NC_016775	TGAAG	2	10	209810	209819	40 %	20 %	40 %	0 %	376278203
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238	NC_016775	GCCCC	2	10	349213	349222	0 %	0 %	20 %	80 %	376278342
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