MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Bacillus cereus NC7401 plasmid pNC1

Total Repeats: 138

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016772	TTCT	2	8	64	71	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_016772	ATGT	2	8	177	184	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016772	GTTA	2	8	530	537	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016772	CATA	2	8	610	617	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_016772	TCGT	2	8	837	844	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_016772	ATTA	2	8	1071	1078	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_016772	AATC	2	8	1882	1889	50 %	25 %	0 %	25 %	375287511
8	NC_016772	TTAA	2	8	2797	2804	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_016772	AAAG	2	8	3038	3045	75 %	0 %	25 %	0 %	375287512
10	NC_016772	GAAC	2	8	3407	3414	50 %	0 %	25 %	25 %	375287513
11	NC_016772	TAAT	2	8	3786	3793	50 %	50 %	0 %	0 %	375287513
12	NC_016772	AAGA	2	8	4124	4131	75 %	0 %	25 %	0 %	375287514
13	NC_016772	AACC	2	8	4538	4545	50 %	0 %	0 %	50 %	375287515
14	NC_016772	GTTT	2	8	4578	4585	0 %	75 %	25 %	0 %	375287515
15	NC_016772	AAAT	2	8	5364	5371	75 %	25 %	0 %	0 %	375287516
16	NC_016772	TAAA	2	8	5423	5430	75 %	25 %	0 %	0 %	375287516
17	NC_016772	CAAT	2	8	5435	5442	50 %	25 %	0 %	25 %	375287516
18	NC_016772	TTAA	2	8	5865	5872	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016772	CCTT	2	8	6106	6113	0 %	50 %	0 %	50 %	375287518
20	NC_016772	GTTT	2	8	6397	6404	0 %	75 %	25 %	0 %	375287518
21	NC_016772	CCAT	2	8	6568	6575	25 %	25 %	0 %	50 %	375287519
22	NC_016772	GATA	2	8	6579	6586	50 %	25 %	25 %	0 %	375287519
23	NC_016772	CGTC	2	8	6796	6803	0 %	25 %	25 %	50 %	375287519
24	NC_016772	TTAT	2	8	7876	7883	25 %	75 %	0 %	0 %	375287520
25	NC_016772	TAAT	2	8	8137	8144	50 %	50 %	0 %	0 %	375287520
26	NC_016772	TATT	2	8	9461	9468	25 %	75 %	0 %	0 %	375287520
27	NC_016772	AAAT	2	8	9524	9531	75 %	25 %	0 %	0 %	375287520
28	NC_016772	GTAA	2	8	10551	10558	50 %	25 %	25 %	0 %	375287520
29	NC_016772	TGAA	2	8	10978	10985	50 %	25 %	25 %	0 %	375287520
30	NC_016772	ATAG	2	8	11166	11173	50 %	25 %	25 %	0 %	375287520
31	NC_016772	TATC	2	8	11599	11606	25 %	50 %	0 %	25 %	375287521
32	NC_016772	CTGA	2	8	12091	12098	25 %	25 %	25 %	25 %	375287521
33	NC_016772	AATT	2	8	12584	12591	50 %	50 %	0 %	0 %	375287521
34	NC_016772	AAGG	2	8	12973	12980	50 %	0 %	50 %	0 %	375287522
35	NC_016772	ATTA	2	8	13662	13669	50 %	50 %	0 %	0 %	375287522
36	NC_016772	CTTT	2	8	13757	13764	0 %	75 %	0 %	25 %	375287522
37	NC_016772	AGGA	2	8	13905	13912	50 %	0 %	50 %	0 %	375287522
38	NC_016772	CTGT	2	8	13955	13962	0 %	50 %	25 %	25 %	375287522
39	NC_016772	TGAT	2	8	14455	14462	25 %	50 %	25 %	0 %	375287522
40	NC_016772	AGTA	2	8	14496	14503	50 %	25 %	25 %	0 %	375287522
41	NC_016772	TCAT	2	8	15439	15446	25 %	50 %	0 %	25 %	375287522
42	NC_016772	TTGA	2	8	15640	15647	25 %	50 %	25 %	0 %	375287522
43	NC_016772	TCTA	2	8	16266	16273	25 %	50 %	0 %	25 %	375287522
44	NC_016772	ATCT	2	8	16875	16882	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_016772	CGTC	2	8	16888	16895	0 %	25 %	25 %	50 %	375287523
46	NC_016772	TATT	2	8	17869	17876	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016772	ATTA	2	8	18492	18499	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_016772	TTTA	2	8	18727	18734	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016772	TAGA	2	8	18864	18871	50 %	25 %	25 %	0 %	375287525
50	NC_016772	TTCC	2	8	19352	19359	0 %	50 %	0 %	50 %	375287527
51	NC_016772	ATCA	2	8	19776	19783	50 %	25 %	0 %	25 %	375287528
52	NC_016772	CTTC	2	8	20047	20054	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_016772	GTTT	2	8	21315	21322	0 %	75 %	25 %	0 %	375287530
54	NC_016772	CTTC	2	8	22008	22015	0 %	50 %	0 %	50 %	375287531
55	NC_016772	TTTC	2	8	23129	23136	0 %	75 %	0 %	25 %	375287532
56	NC_016772	ATGT	2	8	25261	25268	25 %	50 %	25 %	0 %	375287533
57	NC_016772	TAAC	2	8	26166	26173	50 %	25 %	0 %	25 %	375287534
58	NC_016772	CATC	2	8	26280	26287	25 %	25 %	0 %	50 %	375287534
59	NC_016772	AACT	2	8	26308	26315	50 %	25 %	0 %	25 %	375287534
60	NC_016772	ACAA	2	8	26448	26455	75 %	0 %	0 %	25 %	375287534
61	NC_016772	CACC	2	8	26732	26739	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
62	NC_016772	TGTT	2	8	26997	27004	0 %	75 %	25 %	0 %	375287535
63	NC_016772	TTTA	2	8	27009	27016	25 %	75 %	0 %	0 %	375287535
64	NC_016772	TCAT	2	8	27020	27027	25 %	50 %	0 %	25 %	375287535
65	NC_016772	TAAC	2	8	27756	27763	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_016772	TCGT	2	8	28009	28016	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
67	NC_016772	GTTT	2	8	28024	28031	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_016772	ATTA	2	8	28116	28123	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_016772	TTTC	2	8	28296	28303	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_016772	CCAT	2	8	29008	29015	25 %	25 %	0 %	50 %	375287538
71	NC_016772	TCCC	2	8	29278	29285	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
72	NC_016772	CAAA	2	8	29705	29712	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_016772	TTTC	2	8	29811	29818	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_016772	ATAA	2	8	29843	29850	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_016772	AATA	2	8	30174	30181	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_016772	CATT	2	8	30266	30273	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_016772	TAAT	2	8	30416	30423	50 %	50 %	0 %	0 %	375287539
78	NC_016772	TCAT	2	8	30427	30434	25 %	50 %	0 %	25 %	375287539
79	NC_016772	AATT	2	8	30657	30664	50 %	50 %	0 %	0 %	375287539
80	NC_016772	TGTT	2	8	30777	30784	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_016772	TGTT	2	8	31091	31098	0 %	75 %	25 %	0 %	375287540
82	NC_016772	GGAT	2	8	31294	31301	25 %	25 %	50 %	0 %	375287540
83	NC_016772	CTTT	2	8	31395	31402	0 %	75 %	0 %	25 %	375287540
84	NC_016772	TTCT	2	8	31533	31540	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_016772	TACA	2	8	31948	31955	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_016772	TCAA	2	8	32138	32145	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_016772	CTTC	2	8	32725	32732	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_016772	TTTC	2	8	32739	32746	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_016772	CGTT	2	8	32874	32881	0 %	50 %	25 %	25 %	375287541
90	NC_016772	TTTA	2	8	33417	33424	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_016772	TAAA	2	8	33842	33849	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_016772	AATG	2	8	33870	33877	50 %	25 %	25 %	0 %	375287544
93	NC_016772	CAAG	2	8	33942	33949	50 %	0 %	25 %	25 %	375287544
94	NC_016772	TTTC	2	8	34168	34175	0 %	75 %	0 %	25 %	375287545
95	NC_016772	TCAT	2	8	34410	34417	25 %	50 %	0 %	25 %	375287545
96	NC_016772	TTCA	2	8	34554	34561	25 %	50 %	0 %	25 %	375287546
97	NC_016772	CTTT	2	8	34585	34592	0 %	75 %	0 %	25 %	375287546
98	NC_016772	CATT	2	8	35054	35061	25 %	50 %	0 %	25 %	375287547
99	NC_016772	TACA	2	8	35179	35186	50 %	25 %	0 %	25 %	375287547
100	NC_016772	ACTT	2	8	35759	35766	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_016772	ATCT	2	8	35885	35892	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_016772	CCAA	2	8	36088	36095	50 %	0 %	0 %	50 %	375287549
103	NC_016772	AATT	2	8	36637	36644	50 %	50 %	0 %	0 %	375287551
104	NC_016772	TCTT	2	8	37094	37101	0 %	75 %	0 %	25 %	375287552
105	NC_016772	TTCT	2	8	37246	37253	0 %	75 %	0 %	25 %	375287553
106	NC_016772	ATTC	2	8	37272	37279	25 %	50 %	0 %	25 %	375287553
107	NC_016772	GTGA	2	8	38025	38032	25 %	25 %	50 %	0 %	375287555
108	NC_016772	AATT	2	8	38142	38149	50 %	50 %	0 %	0 %	375287555
109	NC_016772	ATTC	2	8	38170	38177	25 %	50 %	0 %	25 %	375287555
110	NC_016772	TTTC	2	8	38233	38240	0 %	75 %	0 %	25 %	375287555
111	NC_016772	TTAT	2	8	38309	38316	25 %	75 %	0 %	0 %	375287555
112	NC_016772	CAAT	2	8	38502	38509	50 %	25 %	0 %	25 %	375287556
113	NC_016772	ATAC	2	8	38794	38801	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_016772	GTTG	2	8	39000	39007	0 %	50 %	50 %	0 %	375287557
115	NC_016772	TAAG	2	8	39580	39587	50 %	25 %	25 %	0 %	375287558
116	NC_016772	TCTA	2	8	39851	39858	25 %	50 %	0 %	25 %	375287558
117	NC_016772	AGGA	2	8	39998	40005	50 %	0 %	50 %	0 %	375287558
118	NC_016772	TATT	2	8	40056	40063	25 %	75 %	0 %	0 %	375287558
119	NC_016772	CGAT	2	8	40138	40145	25 %	25 %	25 %	25 %	375287559
120	NC_016772	TTTC	2	8	40650	40657	0 %	75 %	0 %	25 %	375287559
121	NC_016772	AAGG	2	8	40690	40697	50 %	0 %	50 %	0 %	375287559
122	NC_016772	ATTC	2	8	40830	40837	25 %	50 %	0 %	25 %	375287559
123	NC_016772	GAAG	2	8	41225	41232	50 %	0 %	50 %	0 %	375287560
124	NC_016772	GATT	2	8	41243	41250	25 %	50 %	25 %	0 %	375287560
125	NC_016772	GTTC	2	8	42064	42071	0 %	50 %	25 %	25 %	375287562
126	NC_016772	TAAA	2	8	42819	42826	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_016772	TAAG	2	8	44204	44211	50 %	25 %	25 %	0 %	375287568
128	NC_016772	CTTT	2	8	44830	44837	0 %	75 %	0 %	25 %	375287568
129	NC_016772	ATTT	2	8	45312	45319	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_016772	AAGA	2	8	46106	46113	75 %	0 %	25 %	0 %	375287571
131	NC_016772	AAAG	2	8	46135	46142	75 %	0 %	25 %	0 %	375287571
132	NC_016772	AGTT	2	8	46335	46342	25 %	50 %	25 %	0 %	375287571
133	NC_016772	ACTA	2	8	46782	46789	50 %	25 %	0 %	25 %	375287572
134	NC_016772	TAAC	2	8	46865	46872	50 %	25 %	0 %	25 %	375287572
135	NC_016772	AGTG	2	8	47062	47069	25 %	25 %	50 %	0 %	375287573
136	NC_016772	AGGT	2	8	47343	47350	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_016772	TAGC	2	8	47745	47752	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
138	NC_016772	TTAA	2	8	47942	47949	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.