MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Burkholderia sp. YI23 chromosome 2

Total Repeats: 48063

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_016625	GCCT	2	8	159310	159317	0 %	25 %	25 %	50 %	377812368
4002	NC_016625	CGC	2	6	159318	159323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	377812368
4003	NC_016625	CGG	3	9	159353	159361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	377812368
4004	NC_016625	TTGCG	2	10	159378	159387	0 %	40 %	40 %	20 %	377812368
4005	NC_016625	AGC	2	6	159388	159393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377812368
4006	NC_016625	CGT	2	6	159417	159422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377812368
4007	NC_016625	GAT	2	6	159603	159608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	377812368
4008	NC_016625	CGC	2	6	159649	159654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	377812368
4009	NC_016625	GTCAAC	2	12	159661	159672	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	377812368
4010	NC_016625	GCC	2	6	159708	159713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	377812368
4011	NC_016625	TCG	2	6	159766	159771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377812368
4012	NC_016625	CG	3	6	159770	159775	0 %	0 %	50 %	50 %	377812368
4013	NC_016625	TGCGA	2	10	159802	159811	20 %	20 %	40 %	20 %	377812368
4014	NC_016625	AGCG	2	8	159831	159838	25 %	0 %	50 %	25 %	377812368
4015	NC_016625	CAGA	2	8	159843	159850	50 %	0 %	25 %	25 %	377812368
4016	NC_016625	CGA	2	6	159887	159892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377812368
4017	NC_016625	GC	3	6	159893	159898	0 %	0 %	50 %	50 %	377812368
4018	NC_016625	ATCGAC	2	12	159927	159938	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	377812368
4019	NC_016625	GC	3	6	159948	159953	0 %	0 %	50 %	50 %	377812368
4020	NC_016625	CCG	3	9	159983	159991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	377812368
4021	NC_016625	GCC	2	6	159993	159998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	377812368
4022	NC_016625	GCA	2	6	160013	160018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377812368
4023	NC_016625	GC	3	6	160033	160038	0 %	0 %	50 %	50 %	377812368
4024	NC_016625	CGC	2	6	160050	160055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	377812368
4025	NC_016625	GCCGC	2	10	160067	160076	0 %	0 %	40 %	60 %	377812368
4026	NC_016625	GCGG	2	8	160081	160088	0 %	0 %	75 %	25 %	377812368
4027	NC_016625	GGC	2	6	160093	160098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	377812368
4028	NC_016625	CTG	2	6	160120	160125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377812368
4029	NC_016625	CG	3	6	160179	160184	0 %	0 %	50 %	50 %	377812368
4030	NC_016625	GC	3	6	160206	160211	0 %	0 %	50 %	50 %	377812368
4031	NC_016625	CG	5	10	160221	160230	0 %	0 %	50 %	50 %	377812368
4032	NC_016625	TC	3	6	160288	160293	0 %	50 %	0 %	50 %	377812368
4033	NC_016625	GCCG	2	8	160301	160308	0 %	0 %	50 %	50 %	377812368
4034	NC_016625	CTG	2	6	160360	160365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377812368
4035	NC_016625	ATCG	2	8	160457	160464	25 %	25 %	25 %	25 %	377812368
4036	NC_016625	CGTG	2	8	160566	160573	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4037	NC_016625	TG	3	6	160577	160582	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4038	NC_016625	GGC	2	6	160594	160599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4039	NC_016625	A	6	6	160633	160638	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4040	NC_016625	CGAT	2	8	160750	160757	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4041	NC_016625	ATGCC	2	10	160803	160812	20 %	20 %	20 %	40 %	377812369
4042	NC_016625	TCAA	2	8	160818	160825	50 %	25 %	0 %	25 %	377812369
4043	NC_016625	GAA	2	6	160862	160867	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	377812369
4044	NC_016625	TGC	2	6	160962	160967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377812369
4045	NC_016625	TGC	2	6	161007	161012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377812369
4046	NC_016625	CGA	2	6	161065	161070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377812369
4047	NC_016625	CAA	2	6	161095	161100	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	377812369
4048	NC_016625	GGC	2	6	161126	161131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	377812369
4049	NC_016625	GCT	2	6	161239	161244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377812369
4050	NC_016625	GC	3	6	161328	161333	0 %	0 %	50 %	50 %	377812370
4051	NC_016625	CGC	3	9	161331	161339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	377812370
4052	NC_016625	CGA	2	6	161403	161408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377812370
4053	NC_016625	GCG	2	6	161413	161418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	377812370
4054	NC_016625	TCGT	2	8	161476	161483	0 %	50 %	25 %	25 %	377812370
4055	NC_016625	GC	4	8	161484	161491	0 %	0 %	50 %	50 %	377812370
4056	NC_016625	GTG	2	6	161539	161544	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	377812370
4057	NC_016625	CG	3	6	161577	161582	0 %	0 %	50 %	50 %	377812370
4058	NC_016625	GTC	2	6	161596	161601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377812370
4059	NC_016625	ACA	2	6	161639	161644	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	377812370
4060	NC_016625	GCT	3	9	161673	161681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377812370
4061	NC_016625	GTC	2	6	161755	161760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377812370
4062	NC_016625	CG	3	6	161817	161822	0 %	0 %	50 %	50 %	377812370
4063	NC_016625	TGA	2	6	161831	161836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	377812370
4064	NC_016625	GCA	2	6	161838	161843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377812370
4065	NC_016625	GGTC	2	8	161880	161887	0 %	25 %	50 %	25 %	377812370
4066	NC_016625	GCT	2	6	161942	161947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377812370
4067	NC_016625	TCG	2	6	161948	161953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377812370
4068	NC_016625	GCTG	2	8	161966	161973	0 %	25 %	50 %	25 %	377812370
4069	NC_016625	GCG	2	6	162029	162034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	377812370
4070	NC_016625	TCA	2	6	162131	162136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	377812370
4071	NC_016625	ATG	2	6	162151	162156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	377812370
4072	NC_016625	TCGG	2	8	162160	162167	0 %	25 %	50 %	25 %	377812370
4073	NC_016625	GCT	2	6	162186	162191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377812370
4074	NC_016625	CTTC	2	8	162230	162237	0 %	50 %	0 %	50 %	377812370
4075	NC_016625	TGA	2	6	162294	162299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	377812370
4076	NC_016625	TCG	2	6	162327	162332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377812371
4077	NC_016625	CG	4	8	162336	162343	0 %	0 %	50 %	50 %	377812371
4078	NC_016625	GT	3	6	162345	162350	0 %	50 %	50 %	0 %	377812371
4079	NC_016625	CGGCG	2	10	162356	162365	0 %	0 %	60 %	40 %	377812371
4080	NC_016625	CAT	2	6	162412	162417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	377812371
4081	NC_016625	TCG	2	6	162456	162461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377812371
4082	NC_016625	GC	3	6	162489	162494	0 %	0 %	50 %	50 %	377812371
4083	NC_016625	CGA	2	6	162621	162626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377812371
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4085	NC_016625	TCGC	2	8	162695	162702	0 %	25 %	25 %	50 %	377812371
4086	NC_016625	GC	3	6	162719	162724	0 %	0 %	50 %	50 %	377812371
4087	NC_016625	GC	4	8	162752	162759	0 %	0 %	50 %	50 %	377812371
4088	NC_016625	TGC	2	6	162765	162770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377812371
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4093	NC_016625	GCAT	2	8	162960	162967	25 %	25 %	25 %	25 %	377812371
4094	NC_016625	CAT	2	6	163000	163005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	377812371
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4104	NC_016625	TCG	2	6	163340	163345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377812371
4105	NC_016625	TTC	2	6	163348	163353	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	377812371
4106	NC_016625	TCG	2	6	163372	163377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377812372
4107	NC_016625	CG	3	6	163482	163487	0 %	0 %	50 %	50 %	377812372
4108	NC_016625	TCG	2	6	163513	163518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377812372
4109	NC_016625	CGA	2	6	163520	163525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377812372
4110	NC_016625	CGA	2	6	163529	163534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377812372
4111	NC_016625	CGA	2	6	163538	163543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377812372
4112	NC_016625	CG	3	6	163545	163550	0 %	0 %	50 %	50 %	377812372
4113	NC_016625	GTC	2	6	163596	163601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377812372
4114	NC_016625	GGCTC	2	10	163639	163648	0 %	20 %	40 %	40 %	377812372
4115	NC_016625	TTCG	2	8	163672	163679	0 %	50 %	25 %	25 %	377812372
4116	NC_016625	GCA	2	6	163808	163813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377812372
4117	NC_016625	CG	3	6	163833	163838	0 %	0 %	50 %	50 %	377812372
4118	NC_016625	CAT	2	6	163839	163844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	377812372
4119	NC_016625	GC	4	8	163850	163857	0 %	0 %	50 %	50 %	377812372
4120	NC_016625	CCG	2	6	163872	163877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	377812372
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4122	NC_016625	TCG	2	6	163900	163905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377812372
4123	NC_016625	CGT	2	6	163921	163926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377812372
4124	NC_016625	TCG	2	6	163944	163949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377812373
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4151	NC_016625	CG	3	6	165037	165042	0 %	0 %	50 %	50 %	377812374
4152	NC_016625	GC	3	6	165117	165122	0 %	0 %	50 %	50 %	377812374
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4161	NC_016625	CG	3	6	165598	165603	0 %	0 %	50 %	50 %	377812375
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4245	NC_016625	CG	3	6	168836	168841	0 %	0 %	50 %	50 %	377812377
4246	NC_016625	CG	4	8	168858	168865	0 %	0 %	50 %	50 %	377812377
4247	NC_016625	TCG	2	6	168931	168936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377812377
4248	NC_016625	GAC	2	6	168938	168943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377812377
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4250	NC_016625	GAC	2	6	169093	169098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377812377
4251	NC_016625	TCG	2	6	169172	169177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377812377
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4253	NC_016625	TGC	2	6	169212	169217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377812377
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4260	NC_016625	GAA	2	6	169551	169556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4261	NC_016625	CGA	2	6	169641	169646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4262	NC_016625	GCC	2	6	169656	169661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	377812378
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4271	NC_016625	CGA	2	6	170013	170018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377812378
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4274	NC_016625	CGC	2	6	170224	170229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4275	NC_016625	GCA	2	6	170244	170249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4276	NC_016625	CGCTAT	2	12	170323	170334	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4280	NC_016625	GCCC	2	8	170632	170639	0 %	0 %	25 %	75 %	377812379
4281	NC_016625	CGT	2	6	170677	170682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377812379
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4283	NC_016625	ACG	3	9	170822	170830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377812379
4284	NC_016625	CTT	2	6	170862	170867	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	377812379
4285	NC_016625	GGC	2	6	170900	170905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4286	NC_016625	GAC	2	6	170946	170951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4287	NC_016625	TCG	2	6	170958	170963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4289	NC_016625	CTG	2	6	171217	171222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4290	NC_016625	CGAC	2	8	171225	171232	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4291	NC_016625	AGG	2	6	171255	171260	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4292	NC_016625	CGAG	2	8	171301	171308	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4293	NC_016625	GCT	2	6	171312	171317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4294	NC_016625	CTG	2	6	171350	171355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377812380
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4307	NC_016625	CGA	2	6	171906	171911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377812380
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4310	NC_016625	TCG	2	6	172041	172046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377812380
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4312	NC_016625	A	7	7	172318	172324	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4313	NC_016625	TCGC	2	8	172384	172391	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4314	NC_016625	GC	3	6	172393	172398	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4315	NC_016625	GCG	2	6	172411	172416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4316	NC_016625	ATC	2	6	172527	172532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	377812381
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4318	NC_016625	CTG	2	6	172554	172559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377812381
4319	NC_016625	CGT	2	6	172582	172587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377812381
4320	NC_016625	GTCG	2	8	172619	172626	0 %	25 %	50 %	25 %	377812381
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4343	NC_016625	TCG	2	6	173206	173211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377812381
4344	NC_016625	ATCGTC	2	12	173223	173234	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	377812381
4345	NC_016625	GCCGT	2	10	173253	173262	0 %	20 %	40 %	40 %	377812381
4346	NC_016625	AAATTG	2	12	173321	173332	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	377812381
4347	NC_016625	GACT	2	8	173509	173516	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4348	NC_016625	CGGCG	2	10	173523	173532	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
4349	NC_016625	CCG	2	6	173538	173543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4350	NC_016625	AAC	2	6	173556	173561	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4351	NC_016625	GCGG	2	8	173592	173599	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4352	NC_016625	CT	3	6	173618	173623	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4353	NC_016625	GC	4	8	173716	173723	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4354	NC_016625	TCAGC	2	10	173799	173808	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
4355	NC_016625	CTCG	2	8	173838	173845	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4356	NC_016625	TGC	2	6	173879	173884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4357	NC_016625	GAC	2	6	173923	173928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377812382
4358	NC_016625	CTTCG	2	10	173968	173977	0 %	40 %	20 %	40 %	377812382
4359	NC_016625	GC	3	6	173988	173993	0 %	0 %	50 %	50 %	377812382
4360	NC_016625	CGG	2	6	174006	174011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	377812382
4361	NC_016625	CGA	2	6	174051	174056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377812382
4362	NC_016625	CGA	2	6	174123	174128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377812382
4363	NC_016625	CCA	2	6	174135	174140	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	377812382
4364	NC_016625	CGC	2	6	174207	174212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	377812382
4365	NC_016625	CGAT	2	8	174231	174238	25 %	25 %	25 %	25 %	377812382
4366	NC_016625	GCA	2	6	174246	174251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377812382
4367	NC_016625	ACCGA	2	10	174272	174281	40 %	0 %	20 %	40 %	377812382
4368	NC_016625	GC	3	6	174294	174299	0 %	0 %	50 %	50 %	377812382
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4490	NC_016625	GGC	2	6	179810	179815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	377812387
4491	NC_016625	GTC	2	6	179840	179845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377812387
4492	NC_016625	CAG	2	6	179850	179855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377812387
4493	NC_016625	T	6	6	179928	179933	0 %	100 %	0 %	0 %	377812387
4494	NC_016625	GCC	2	6	179955	179960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	377812387
4495	NC_016625	TTC	2	6	179966	179971	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	377812387
4496	NC_016625	AGCG	2	8	180023	180030	25 %	0 %	50 %	25 %	377812387
4497	NC_016625	CCTC	2	8	180054	180061	0 %	25 %	0 %	75 %	377812387
4498	NC_016625	GAG	2	6	180062	180067	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	377812387
4499	NC_016625	AGC	2	6	180077	180082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377812387
4500	NC_016625	ATG	2	6	180389	180394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	377812388

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