MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Blattabacterium sp. (Cryptocercus punctulatus) str. Cpu plasmid pCpu

Total Repeats: 47

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016598	TTC	2	6	247	252	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_016598	AAT	2	6	253	258	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016598	TTC	2	6	289	294	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_016598	TTC	2	6	319	324	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_016598	TAG	2	6	354	359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016598	AGG	2	6	367	372	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_016598	TCT	3	9	410	418	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_016598	ATC	2	6	442	447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_016598	ATG	2	6	453	458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016598	CAT	2	6	466	471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_016598	ATT	2	6	544	549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016598	CAT	2	6	617	622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374290639
13	NC_016598	AGC	2	6	649	654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374290639
14	NC_016598	ATT	3	9	689	697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374290639
15	NC_016598	GAG	2	6	846	851	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374290639
16	NC_016598	ATA	2	6	923	928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374290639
17	NC_016598	AGA	2	6	1135	1140	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016598	CTT	2	6	1161	1166	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_016598	TAT	3	9	1231	1239	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016598	ATT	2	6	1285	1290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016598	AAT	2	6	1304	1309	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016598	ATT	2	6	1326	1331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016598	CAT	2	6	1424	1429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_016598	TAT	2	6	1560	1565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374290640
25	NC_016598	TCA	2	6	1679	1684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374290640
26	NC_016598	TTC	2	6	1712	1717	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374290640
27	NC_016598	AAT	2	6	1769	1774	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374290640
28	NC_016598	GTT	2	6	1796	1801	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374290640
29	NC_016598	ATC	2	6	1872	1877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374290641
30	NC_016598	ATC	2	6	1973	1978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374290641
31	NC_016598	TTC	2	6	2186	2191	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374290641
32	NC_016598	CAT	2	6	2308	2313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374290641
33	NC_016598	TTC	2	6	2315	2320	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374290641
34	NC_016598	TTG	2	6	2390	2395	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374290641
35	NC_016598	AAT	2	6	2433	2438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374290641
36	NC_016598	AGA	2	6	2447	2452	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374290641
37	NC_016598	CTG	2	6	2470	2475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374290641
38	NC_016598	CAG	2	6	2476	2481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374290641
39	NC_016598	TAT	2	6	2515	2520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374290641
40	NC_016598	TCT	2	6	2583	2588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374290641
41	NC_016598	CAT	2	6	2681	2686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374290641
42	NC_016598	AAT	2	6	2731	2736	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374290641
43	NC_016598	TTG	2	6	2873	2878	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374290641
44	NC_016598	TAA	2	6	2986	2991	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_016598	ATA	2	6	3064	3069	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_016598	ATT	2	6	3221	3226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016598	ATT	2	6	3436	3441	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.