MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Burkholderia sp. YI23 plasmid byi_2p

Total Repeats: 7389

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_016591	CAGC	2	8	240093	240100	25 %	0 %	25 %	50 %	377807282
5002	NC_016591	GCT	2	6	240200	240205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377807282
5003	NC_016591	ACGCCG	2	12	240254	240265	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	377807282
5004	NC_016591	GCG	2	6	240292	240297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	377807282
5005	NC_016591	GGCA	2	8	240314	240321	25 %	0 %	50 %	25 %	377807282
5006	NC_016591	GAC	2	6	240324	240329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377807282
5007	NC_016591	GCT	2	6	240381	240386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377807282
5008	NC_016591	ACGC	2	8	240387	240394	25 %	0 %	25 %	50 %	377807282
5009	NC_016591	TGC	2	6	240466	240471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377807282
5010	NC_016591	GGC	3	9	240552	240560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	377807282
5011	NC_016591	TTGA	2	8	240574	240581	25 %	50 %	25 %	0 %	377807282
5012	NC_016591	TGA	2	6	240720	240725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	377807282
5013	NC_016591	CAT	2	6	240729	240734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	377807282
5014	NC_016591	CGCT	2	8	240763	240770	0 %	25 %	25 %	50 %	377807282
5015	NC_016591	GC	3	6	240822	240827	0 %	0 %	50 %	50 %	377807282
5016	NC_016591	GAAG	2	8	240837	240844	50 %	0 %	50 %	0 %	377807282
5017	NC_016591	C	6	6	240849	240854	0 %	0 %	0 %	100 %	377807282
5018	NC_016591	AGCCT	2	10	240875	240884	20 %	20 %	20 %	40 %	377807282
5019	NC_016591	TGACC	2	10	241239	241248	20 %	20 %	20 %	40 %	377807283
5020	NC_016591	CCG	3	9	241307	241315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	377807283
5021	NC_016591	CGC	2	6	241338	241343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	377807283
5022	NC_016591	GGCCT	2	10	241390	241399	0 %	20 %	40 %	40 %	377807283
5023	NC_016591	GGC	2	6	241423	241428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	377807283
5024	NC_016591	CCG	2	6	241445	241450	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	377807283
5025	NC_016591	GGC	2	6	241470	241475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	377807283
5026	NC_016591	CGG	2	6	241656	241661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	377807284
5027	NC_016591	GTTCG	2	10	241674	241683	0 %	40 %	40 %	20 %	377807284
5028	NC_016591	GGC	2	6	241782	241787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	377807284
5029	NC_016591	GCA	2	6	241806	241811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377807284
5030	NC_016591	GCA	2	6	241815	241820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377807284
5031	NC_016591	TGG	2	6	241823	241828	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	377807284
5032	NC_016591	TGG	2	6	241850	241855	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	377807284
5033	NC_016591	TGAC	2	8	241867	241874	25 %	25 %	25 %	25 %	377807284
5034	NC_016591	GCC	3	9	241888	241896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	377807284
5035	NC_016591	CCG	2	6	241950	241955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	377807284
5036	NC_016591	TCCA	2	8	241959	241966	25 %	25 %	0 %	50 %	377807284
5037	NC_016591	CCGG	2	8	241968	241975	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5038	NC_016591	AGA	2	6	242026	242031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	377807285
5039	NC_016591	TGA	2	6	242057	242062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	377807285
5040	NC_016591	CGG	2	6	242087	242092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	377807285
5041	NC_016591	CGGC	2	8	242192	242199	0 %	0 %	50 %	50 %	377807285
5042	NC_016591	GGC	2	6	242258	242263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	377807286
5043	NC_016591	CGA	2	6	242305	242310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377807286
5044	NC_016591	GCA	2	6	242317	242322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377807286
5045	NC_016591	CGC	2	6	242354	242359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	377807286
5046	NC_016591	GGC	2	6	242414	242419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	377807286
5047	NC_016591	GGC	2	6	242444	242449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	377807286
5048	NC_016591	GTG	2	6	242475	242480	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	377807286
5049	NC_016591	GCA	2	6	242494	242499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377807286
5050	NC_016591	GCA	2	6	242506	242511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377807286
5051	NC_016591	CCT	2	6	242588	242593	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	377807286
5052	NC_016591	CG	3	6	242641	242646	0 %	0 %	50 %	50 %	377807286
5053	NC_016591	CCG	2	6	242818	242823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	377807287
5054	NC_016591	GCT	2	6	242877	242882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377807287
5055	NC_016591	CGA	2	6	242987	242992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377807287
5056	NC_016591	GC	3	6	243040	243045	0 %	0 %	50 %	50 %	377807287
5057	NC_016591	CGG	2	6	243060	243065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	377807287
5058	NC_016591	GAT	2	6	243116	243121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	377807287
5059	NC_016591	TGG	2	6	243148	243153	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	377807287
5060	NC_016591	GCC	2	6	243168	243173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	377807287
5061	NC_016591	GCCA	2	8	243187	243194	25 %	0 %	25 %	50 %	377807287
5062	NC_016591	AT	3	6	243312	243317	50 %	50 %	0 %	0 %	377807287
5063	NC_016591	AAT	2	6	243406	243411	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	377807288
5064	NC_016591	TTG	2	6	243493	243498	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	377807288
5065	NC_016591	GCA	2	6	243521	243526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377807288
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5068	NC_016591	TGC	2	6	243617	243622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377807288
5069	NC_016591	CGA	2	6	243627	243632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377807288
5070	NC_016591	GAG	2	6	243646	243651	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	377807288
5071	NC_016591	CAG	2	6	243654	243659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377807288
5072	NC_016591	GC	3	6	243709	243714	0 %	0 %	50 %	50 %	377807288
5073	NC_016591	GCTGT	2	10	243721	243730	0 %	40 %	40 %	20 %	377807288
5074	NC_016591	CGT	2	6	243788	243793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377807288
5075	NC_016591	CGT	2	6	243893	243898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377807289
5076	NC_016591	TGA	2	6	243986	243991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	377807289
5077	NC_016591	GAA	2	6	244113	244118	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	377807289
5078	NC_016591	CTT	2	6	244148	244153	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	377807289
5079	NC_016591	TGGT	2	8	244154	244161	0 %	50 %	50 %	0 %	377807289
5080	NC_016591	CAC	2	6	244176	244181	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5081	NC_016591	ATGT	2	8	244225	244232	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5082	NC_016591	CTG	2	6	244260	244265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5083	NC_016591	ACACGT	2	12	244269	244280	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
5084	NC_016591	GAA	2	6	244322	244327	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	377807290
5085	NC_016591	TGC	3	9	244331	244339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377807290
5086	NC_016591	CTG	2	6	244344	244349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377807290
5087	NC_016591	GTCG	2	8	244358	244365	0 %	25 %	50 %	25 %	377807290
5088	NC_016591	TCGA	2	8	244440	244447	25 %	25 %	25 %	25 %	377807290
5089	NC_016591	CGC	2	6	244453	244458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	377807290
5090	NC_016591	A	6	6	244487	244492	100 %	0 %	0 %	0 %	377807290
5091	NC_016591	AAGG	2	8	244509	244516	50 %	0 %	50 %	0 %	377807290
5092	NC_016591	AAAGGC	2	12	244644	244655	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	377807290
5093	NC_016591	CGA	2	6	244733	244738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377807290
5094	NC_016591	CG	3	6	244791	244796	0 %	0 %	50 %	50 %	377807290
5095	NC_016591	TGCC	2	8	244815	244822	0 %	25 %	25 %	50 %	377807290
5096	NC_016591	GCC	2	6	244839	244844	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	377807290
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5099	NC_016591	CGC	2	6	244870	244875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	377807290
5100	NC_016591	GGC	2	6	244904	244909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	377807290
5101	NC_016591	GTC	2	6	244913	244918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377807290
5102	NC_016591	CGA	2	6	244951	244956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377807290
5103	NC_016591	AAGT	2	8	245031	245038	50 %	25 %	25 %	0 %	377807290
5104	NC_016591	GA	3	6	245067	245072	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5105	NC_016591	GAC	2	6	245079	245084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5106	NC_016591	AAC	2	6	245085	245090	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5107	NC_016591	CAT	2	6	245217	245222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	377807291
5108	NC_016591	CGT	2	6	245229	245234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377807291
5109	NC_016591	GTT	2	6	245250	245255	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	377807291
5110	NC_016591	CGCC	2	8	245267	245274	0 %	0 %	25 %	75 %	377807291
5111	NC_016591	GTC	2	6	245342	245347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377807291
5112	NC_016591	GAA	2	6	245361	245366	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	377807291
5113	NC_016591	GAA	2	6	245376	245381	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	377807291
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5115	NC_016591	ACGTAC	2	12	245488	245499	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	377807291
5116	NC_016591	CCG	2	6	245540	245545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	377807291
5117	NC_016591	CGA	2	6	245610	245615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377807291
5118	NC_016591	GAA	2	6	245634	245639	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	377807291
5119	NC_016591	TCG	2	6	245675	245680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377807291
5120	NC_016591	CG	3	6	245704	245709	0 %	0 %	50 %	50 %	377807291
5121	NC_016591	CCA	2	6	245751	245756	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	377807291
5122	NC_016591	GCCG	2	8	245775	245782	0 %	0 %	50 %	50 %	377807291
5123	NC_016591	GAG	2	6	245815	245820	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	377807291
5124	NC_016591	GAA	2	6	245831	245836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	377807291
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5126	NC_016591	CGA	2	6	245897	245902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377807292
5127	NC_016591	CTG	2	6	245942	245947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377807292
5128	NC_016591	GCA	2	6	245977	245982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377807292
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5130	NC_016591	TTCTGC	2	12	246036	246047	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	377807292
5131	NC_016591	CGT	2	6	246076	246081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377807292
5132	NC_016591	ATG	2	6	246096	246101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	377807292
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5134	NC_016591	CGG	2	6	246140	246145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	377807292
5135	NC_016591	CGA	2	6	246290	246295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377807292
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5138	NC_016591	CAT	2	6	246377	246382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	377807292
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5140	NC_016591	GGC	2	6	246446	246451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	377807292
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5142	NC_016591	TCT	2	6	246478	246483	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	377807292
5143	NC_016591	GGCA	2	8	246488	246495	25 %	0 %	50 %	25 %	377807292
5144	NC_016591	CAA	2	6	246524	246529	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	377807292
5145	NC_016591	CG	3	6	246557	246562	0 %	0 %	50 %	50 %	377807292
5146	NC_016591	ACC	2	6	246570	246575	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	377807292
5147	NC_016591	GGCA	2	8	246599	246606	25 %	0 %	50 %	25 %	377807292
5148	NC_016591	TGA	2	6	246626	246631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	377807292
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5151	NC_016591	CGATC	2	10	246737	246746	20 %	20 %	20 %	40 %	377807292
5152	NC_016591	CCA	2	6	246754	246759	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	377807292
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5154	NC_016591	CGG	2	6	246842	246847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	377807292
5155	NC_016591	AGT	2	6	246862	246867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	377807292
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5174	NC_016591	CAGGG	2	10	247574	247583	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
5175	NC_016591	A	6	6	247652	247657	100 %	0 %	0 %	0 %	377807294
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5187	NC_016591	AGAAAA	2	12	248473	248484	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5188	NC_016591	GGC	2	6	248486	248491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5190	NC_016591	GCC	2	6	248508	248513	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5191	NC_016591	CTGAAC	2	12	248646	248657	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	377807295
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5196	NC_016591	AAAG	2	8	248831	248838	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5197	NC_016591	TCG	2	6	248879	248884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5199	NC_016591	TCC	2	6	248894	248899	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5200	NC_016591	ACG	2	6	248928	248933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5206	NC_016591	CGG	2	6	249386	249391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5207	NC_016591	GCAC	2	8	249392	249399	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5208	NC_016591	GACG	2	8	249400	249407	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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5212	NC_016591	GAT	2	6	249511	249516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	377807297
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5219	NC_016591	CGA	2	6	250014	250019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377807297
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5232	NC_016591	GCATCT	2	12	250610	250621	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	377807298
5233	NC_016591	CGA	2	6	250628	250633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377807298
5234	NC_016591	AGAC	2	8	250703	250710	50 %	0 %	25 %	25 %	377807298
5235	NC_016591	CTT	2	6	250716	250721	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	377807298
5236	NC_016591	GAC	2	6	250748	250753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377807298
5237	NC_016591	ATCG	2	8	250817	250824	25 %	25 %	25 %	25 %	377807298
5238	NC_016591	CGC	2	6	250856	250861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	377807298
5239	NC_016591	CGA	2	6	250901	250906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377807298
5240	NC_016591	TGAC	2	8	250919	250926	25 %	25 %	25 %	25 %	377807298
5241	NC_016591	CCT	2	6	250940	250945	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5242	NC_016591	TAC	2	6	251000	251005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5243	NC_016591	ATCA	2	8	251084	251091	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5244	NC_016591	ATAC	2	8	251097	251104	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5245	NC_016591	TTCA	2	8	251127	251134	25 %	50 %	0 %	25 %	377807299
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5368	NC_016591	CAA	2	6	257888	257893	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	377807304
5369	NC_016591	CGAGC	2	10	257894	257903	20 %	0 %	40 %	40 %	377807304
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5473	NC_016591	GTCA	2	8	262765	262772	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5474	NC_016591	TTTTC	2	10	262779	262788	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
5475	NC_016591	CGC	2	6	262842	262847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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5478	NC_016591	TCT	2	6	263013	263018	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5479	NC_016591	A	7	7	263032	263038	100 %	0 %	0 %	0 %	377807311
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5485	NC_016591	CTGC	2	8	263272	263279	0 %	25 %	25 %	50 %	377807311
5486	NC_016591	GAC	2	6	263290	263295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377807311
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5488	NC_016591	CG	3	6	263348	263353	0 %	0 %	50 %	50 %	377807311
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5490	NC_016591	TCT	2	6	263466	263471	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	377807311
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5493	NC_016591	GGTGA	2	10	263617	263626	20 %	20 %	60 %	0 %	377807311
5494	NC_016591	ATCGG	2	10	263673	263682	20 %	20 %	40 %	20 %	377807311
5495	NC_016591	TGT	2	6	263714	263719	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	377807311
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