MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Burkholderia sp. YI23 chromosome 1

Total Repeats: 2905

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016589	AGCGC	2	10	3389	3398	20 %	0 %	40 %	40 %	377819447
2	NC_016589	AATCG	2	10	6524	6533	40 %	20 %	20 %	20 %	377819448
3	NC_016589	ATTCG	2	10	6777	6786	20 %	40 %	20 %	20 %	377819448
4	NC_016589	GCGCA	2	10	7011	7020	20 %	0 %	40 %	40 %	377819449
5	NC_016589	GCCAG	2	10	8589	8598	20 %	0 %	40 %	40 %	377819450
6	NC_016589	CCGGT	2	10	8603	8612	0 %	20 %	40 %	40 %	377819450
7	NC_016589	ACAGC	2	10	10678	10687	40 %	0 %	20 %	40 %	377819452
8	NC_016589	GCGCA	2	10	11126	11135	20 %	0 %	40 %	40 %	377819452
9	NC_016589	AGTGG	2	10	11140	11149	20 %	20 %	60 %	0 %	377819452
10	NC_016589	GCGCC	2	10	11604	11613	0 %	0 %	40 %	60 %	377819453
11	NC_016589	CGCGA	2	10	12226	12235	20 %	0 %	40 %	40 %	377819453
12	NC_016589	AATGC	2	10	12383	12392	40 %	20 %	20 %	20 %	377819453
13	NC_016589	CGGCG	2	10	14576	14585	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
14	NC_016589	CCGTC	2	10	16460	16469	0 %	20 %	20 %	60 %	377819456
15	NC_016589	GCTCG	2	10	19198	19207	0 %	20 %	40 %	40 %	377819459
16	NC_016589	CGTGC	2	10	19324	19333	0 %	20 %	40 %	40 %	377819459
17	NC_016589	CGTGG	2	10	19375	19384	0 %	20 %	60 %	20 %	377819459
18	NC_016589	TTGTG	2	10	20786	20795	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016589	GCACG	2	10	21488	21497	20 %	0 %	40 %	40 %	377819460
20	NC_016589	GGCTT	2	10	22318	22327	0 %	40 %	40 %	20 %	377819461
21	NC_016589	TGTCC	2	10	22649	22658	0 %	40 %	20 %	40 %	377819461
22	NC_016589	CCGCC	2	10	27406	27415	0 %	0 %	20 %	80 %	377819465
23	NC_016589	GGCGC	3	15	27669	27683	0 %	0 %	60 %	40 %	377819465
24	NC_016589	GCGCG	2	10	28435	28444	0 %	0 %	60 %	40 %	377819466
25	NC_016589	GCGCC	2	10	30951	30960	0 %	0 %	40 %	60 %	377819468
26	NC_016589	CGTGC	2	10	31153	31162	0 %	20 %	40 %	40 %	377819468
27	NC_016589	TCGCT	2	10	31904	31913	0 %	40 %	20 %	40 %	377819469
28	NC_016589	ATCGC	2	10	33336	33345	20 %	20 %	20 %	40 %	377819470
29	NC_016589	GCGAC	2	10	34116	34125	20 %	0 %	40 %	40 %	377819470
30	NC_016589	CGCGC	2	10	36037	36046	0 %	0 %	40 %	60 %	377819472
31	NC_016589	TCGCT	2	10	36558	36567	0 %	40 %	20 %	40 %	377819472
32	NC_016589	AATGA	2	10	36909	36918	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016589	CTTTT	2	10	37018	37027	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NC_016589	GGTCG	2	10	38094	38103	0 %	20 %	60 %	20 %	377819474
35	NC_016589	GATGT	2	10	39990	39999	20 %	40 %	40 %	0 %	377819476
36	NC_016589	GATGC	2	10	41213	41222	20 %	20 %	40 %	20 %	377819478
37	NC_016589	TCGGC	2	10	41985	41994	0 %	20 %	40 %	40 %	377819479
38	NC_016589	CGTGC	2	10	43174	43183	0 %	20 %	40 %	40 %	377819479
39	NC_016589	GCACG	2	10	46812	46821	20 %	0 %	40 %	40 %	377819482
40	NC_016589	CTCGA	2	10	47934	47943	20 %	20 %	20 %	40 %	377819484
41	NC_016589	GGCCG	2	10	48521	48530	0 %	0 %	60 %	40 %	377819484
42	NC_016589	CGCGC	2	10	48906	48915	0 %	0 %	40 %	60 %	377819484
43	NC_016589	CGTGC	2	10	49232	49241	0 %	20 %	40 %	40 %	377819484
44	NC_016589	CGCGC	2	10	49609	49618	0 %	0 %	40 %	60 %	377819485
45	NC_016589	ATCAG	2	10	49668	49677	40 %	20 %	20 %	20 %	377819485
46	NC_016589	TGCGA	2	10	50000	50009	20 %	20 %	40 %	20 %	377819485
47	NC_016589	AAGGC	2	10	50814	50823	40 %	0 %	40 %	20 %	377819485
48	NC_016589	CAAAA	2	10	51802	51811	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
49	NC_016589	GCCGC	2	10	54505	54514	0 %	0 %	40 %	60 %	377819489
50	NC_016589	AGCGC	2	10	55423	55432	20 %	0 %	40 %	40 %	377819490
51	NC_016589	CGCGG	2	10	55956	55965	0 %	0 %	60 %	40 %	377819491
52	NC_016589	GCCGC	2	10	57320	57329	0 %	0 %	40 %	60 %	377819493
53	NC_016589	TGGCG	2	10	57772	57781	0 %	20 %	60 %	20 %	377819494
54	NC_016589	CGCAG	2	10	59277	59286	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
55	NC_016589	CGCGG	2	10	59542	59551	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
56	NC_016589	CGCGG	2	10	60932	60941	0 %	0 %	60 %	40 %	377819496
57	NC_016589	CGCGG	2	10	61101	61110	0 %	0 %	60 %	40 %	377819497
58	NC_016589	GCGCC	2	10	61980	61989	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
59	NC_016589	GCGCA	2	10	63293	63302	20 %	0 %	40 %	40 %	377819498
60	NC_016589	TCGGC	2	10	66271	66280	0 %	20 %	40 %	40 %	377819500
61	NC_016589	ACGCA	2	10	67684	67693	40 %	0 %	20 %	40 %	377819500
62	NC_016589	CCGCG	2	10	68294	68303	0 %	0 %	40 %	60 %	377819500
63	NC_016589	CGGCG	2	10	68343	68352	0 %	0 %	60 %	40 %	377819500
64	NC_016589	CAGCG	2	10	68392	68401	20 %	0 %	40 %	40 %	377819500
65	NC_016589	ACGTG	2	10	69257	69266	20 %	20 %	40 %	20 %	377819500
66	NC_016589	CCGCG	2	10	70135	70144	0 %	0 %	40 %	60 %	377819501
67	NC_016589	GCAAG	2	10	70983	70992	40 %	0 %	40 %	20 %	377819501
68	NC_016589	TCGCG	2	10	72009	72018	0 %	20 %	40 %	40 %	377819502
69	NC_016589	CGCGG	2	10	74455	74464	0 %	0 %	60 %	40 %	377819502
70	NC_016589	CGAGA	2	10	75890	75899	40 %	0 %	40 %	20 %	377819505
71	NC_016589	GCTTC	2	10	77755	77764	0 %	40 %	20 %	40 %	377819507
72	NC_016589	AGCGG	2	10	78518	78527	20 %	0 %	60 %	20 %	377819508
73	NC_016589	CATCG	2	10	78559	78568	20 %	20 %	20 %	40 %	377819508
74	NC_016589	GTCGG	2	10	80808	80817	0 %	20 %	60 %	20 %	377819510
75	NC_016589	TCGCG	2	10	81180	81189	0 %	20 %	40 %	40 %	377819511
76	NC_016589	GCGAA	2	10	82320	82329	40 %	0 %	40 %	20 %	377819512
77	NC_016589	GAGGC	2	10	82355	82364	20 %	0 %	60 %	20 %	377819512
78	NC_016589	GACCT	2	10	85265	85274	20 %	20 %	20 %	40 %	377819514
79	NC_016589	CGCAT	2	10	87257	87266	20 %	20 %	20 %	40 %	377819516
80	NC_016589	GAGAT	2	10	88351	88360	40 %	20 %	40 %	0 %	377819517
81	NC_016589	CTTCG	2	10	89039	89048	0 %	40 %	20 %	40 %	377819518
82	NC_016589	GCGTC	2	10	89308	89317	0 %	20 %	40 %	40 %	377819518
83	NC_016589	ACGAC	2	10	89526	89535	40 %	0 %	20 %	40 %	377819519
84	NC_016589	GAAAT	2	10	90120	90129	60 %	20 %	20 %	0 %	377819520
85	NC_016589	CGCGC	2	10	91265	91274	0 %	0 %	40 %	60 %	377819521
86	NC_016589	AGCCG	2	10	93237	93246	20 %	0 %	40 %	40 %	377819523
87	NC_016589	GCGCG	2	10	95215	95224	0 %	0 %	60 %	40 %	377819525
88	NC_016589	TCGCG	2	10	95305	95314	0 %	20 %	40 %	40 %	377819525
89	NC_016589	GCGAC	2	10	95635	95644	20 %	0 %	40 %	40 %	377819525
90	NC_016589	GCCGG	2	10	96211	96220	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
91	NC_016589	TGCAC	2	10	97944	97953	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
92	NC_016589	CTTTT	2	10	98046	98055	0 %	80 %	0 %	20 %	377819527
93	NC_016589	GCGCG	2	10	98394	98403	0 %	0 %	60 %	40 %	377819527
94	NC_016589	TGCGC	2	10	99997	100006	0 %	20 %	40 %	40 %	377819530
95	NC_016589	CCTGC	2	10	102430	102439	0 %	20 %	20 %	60 %	377819532
96	NC_016589	ATCGC	2	10	104307	104316	20 %	20 %	20 %	40 %	377819534
97	NC_016589	CGCGA	2	10	105479	105488	20 %	0 %	40 %	40 %	377819534
98	NC_016589	GCCCA	2	10	107622	107631	20 %	0 %	20 %	60 %	377819537
99	NC_016589	CGGCG	2	10	108857	108866	0 %	0 %	60 %	40 %	377819537
100	NC_016589	GACCG	2	10	109179	109188	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
101	NC_016589	CGAGA	2	10	110897	110906	40 %	0 %	40 %	20 %	377819539
102	NC_016589	GCACG	2	10	111617	111626	20 %	0 %	40 %	40 %	377819539
103	NC_016589	CGTCG	2	10	111710	111719	0 %	20 %	40 %	40 %	377819539
104	NC_016589	CGGAC	2	10	111859	111868	20 %	0 %	40 %	40 %	377819539
105	NC_016589	CGGAT	2	10	111873	111882	20 %	20 %	40 %	20 %	377819539
106	NC_016589	GAACC	2	10	113357	113366	40 %	0 %	20 %	40 %	377819540
107	NC_016589	CCGAA	2	10	113522	113531	40 %	0 %	20 %	40 %	377819540
108	NC_016589	AGCGC	2	10	115321	115330	20 %	0 %	40 %	40 %	377819542
109	NC_016589	CGTCG	2	10	118289	118298	0 %	20 %	40 %	40 %	377819546
110	NC_016589	CGATG	2	10	118805	118814	20 %	20 %	40 %	20 %	377819546
111	NC_016589	CGAGC	2	10	118889	118898	20 %	0 %	40 %	40 %	377819546
112	NC_016589	CGACG	2	10	118940	118949	20 %	0 %	40 %	40 %	377819546
113	NC_016589	TTGCG	2	10	119705	119714	0 %	40 %	40 %	20 %	377819547
114	NC_016589	GCCGC	2	10	119778	119787	0 %	0 %	40 %	60 %	377819547
115	NC_016589	AGCCG	2	10	120203	120212	20 %	0 %	40 %	40 %	377819547
116	NC_016589	GCGCG	2	10	122126	122135	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
117	NC_016589	TTTTG	2	10	122471	122480	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
118	NC_016589	GACAG	2	10	123190	123199	40 %	0 %	40 %	20 %	377819551
119	NC_016589	TCGCG	2	10	123993	124002	0 %	20 %	40 %	40 %	377819552
120	NC_016589	CGCGC	2	10	124444	124453	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
121	NC_016589	CGCGG	2	10	125187	125196	0 %	0 %	60 %	40 %	377819553
122	NC_016589	GCGCT	2	10	126040	126049	0 %	20 %	40 %	40 %	377819554
123	NC_016589	CGCGG	2	10	126904	126913	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
124	NC_016589	ACGAC	2	10	128917	128926	40 %	0 %	20 %	40 %	377819556
125	NC_016589	AATCG	2	10	129493	129502	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
126	NC_016589	AAACC	2	10	129503	129512	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
127	NC_016589	CCTCG	2	10	129835	129844	0 %	20 %	20 %	60 %	377819557
128	NC_016589	CGGCG	2	10	131768	131777	0 %	0 %	60 %	40 %	377819560
129	NC_016589	ATCGA	2	10	131964	131973	40 %	20 %	20 %	20 %	377819560
130	NC_016589	CTGAA	2	10	132923	132932	40 %	20 %	20 %	20 %	377819561
131	NC_016589	CGCCC	2	10	133478	133487	0 %	0 %	20 %	80 %	377819562
132	NC_016589	CGACG	2	10	133583	133592	20 %	0 %	40 %	40 %	377819562
133	NC_016589	AACGC	2	10	134218	134227	40 %	0 %	20 %	40 %	377819562
134	NC_016589	ACCGA	2	10	135009	135018	40 %	0 %	20 %	40 %	377819562
135	NC_016589	TCGCG	2	10	136816	136825	0 %	20 %	40 %	40 %	377819564
136	NC_016589	GCTCG	2	10	138820	138829	0 %	20 %	40 %	40 %	377819566
137	NC_016589	GCGGG	2	10	138985	138994	0 %	0 %	80 %	20 %	377819566
138	NC_016589	CGAAG	2	10	139009	139018	40 %	0 %	40 %	20 %	377819566
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252	NC_016589	AGCGC	2	10	269310	269319	20 %	0 %	40 %	40 %	377819686
253	NC_016589	CAAAA	2	10	274277	274286	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
254	NC_016589	TCGGC	2	10	274382	274391	0 %	20 %	40 %	40 %	377819693
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261	NC_016589	CTTAG	2	10	281258	281267	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
262	NC_016589	GCGCC	2	10	283092	283101	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
263	NC_016589	GATCG	2	10	285765	285774	20 %	20 %	40 %	20 %	377819704
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265	NC_016589	GCGAG	2	10	287601	287610	20 %	0 %	60 %	20 %	377819706
266	NC_016589	TCGCG	2	10	292530	292539	0 %	20 %	40 %	40 %	377819711
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