MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Blattabacterium sp. (Mastotermes darwiniensis) str. MADAR chromosome

Total Repeats: 678

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016146	AAAAT	2	10	401	410	80 %	20 %	0 %	0 %	357420709
2	NC_016146	AGAAA	2	10	2048	2057	80 %	0 %	20 %	0 %	357420710
3	NC_016146	AATTT	2	10	5331	5340	40 %	60 %	0 %	0 %	357420711
4	NC_016146	AAAAT	2	10	5367	5376	80 %	20 %	0 %	0 %	357420711
5	NC_016146	TGGAT	2	10	5441	5450	20 %	40 %	40 %	0 %	357420711
6	NC_016146	TAAAA	2	10	7386	7395	80 %	20 %	0 %	0 %	357420714
7	NC_016146	CATTA	2	10	7711	7720	40 %	40 %	0 %	20 %	357420714
8	NC_016146	AAAGT	2	10	10525	10534	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_016146	CAATT	2	10	10940	10949	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_016146	TCAGA	2	10	10959	10968	40 %	20 %	20 %	20 %	357420716
11	NC_016146	CAAAA	2	10	11496	11505	80 %	0 %	0 %	20 %	357420716
12	NC_016146	CAAAC	2	10	12049	12058	60 %	0 %	0 %	40 %	357420716
13	NC_016146	AAATA	2	10	12436	12445	80 %	20 %	0 %	0 %	357420717
14	NC_016146	TTCCA	2	10	12577	12586	20 %	40 %	0 %	40 %	357420717
15	NC_016146	TTGTA	2	10	13714	13723	20 %	60 %	20 %	0 %	357420717
16	NC_016146	TATGA	2	10	17578	17587	40 %	40 %	20 %	0 %	357420722
17	NC_016146	TTATG	2	10	18363	18372	20 %	60 %	20 %	0 %	357420722
18	NC_016146	AAAGA	2	10	19280	19289	80 %	0 %	20 %	0 %	357420723
19	NC_016146	GGAAG	2	10	20728	20737	40 %	0 %	60 %	0 %	357420724
20	NC_016146	TTATC	2	10	20755	20764	20 %	60 %	0 %	20 %	357420724
21	NC_016146	GTATT	2	10	20939	20948	20 %	60 %	20 %	0 %	357420724
22	NC_016146	CTAAT	2	10	21798	21807	40 %	40 %	0 %	20 %	357420725
23	NC_016146	AGATT	2	10	24227	24236	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016146	TTTAT	2	10	25655	25664	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_016146	CATAT	2	10	25665	25674	40 %	40 %	0 %	20 %	357420729
26	NC_016146	TATTT	2	10	25912	25921	20 %	80 %	0 %	0 %	357420729
27	NC_016146	AATAA	2	10	27052	27061	80 %	20 %	0 %	0 %	357420730
28	NC_016146	TATTT	2	10	28399	28408	20 %	80 %	0 %	0 %	357420731
29	NC_016146	CGAAT	2	10	29234	29243	40 %	20 %	20 %	20 %	357420731
30	NC_016146	GATCG	2	10	30066	30075	20 %	20 %	40 %	20 %	357420731
31	NC_016146	CTATT	2	10	31392	31401	20 %	60 %	0 %	20 %	357420733
32	NC_016146	AAAAT	2	10	32157	32166	80 %	20 %	0 %	0 %	357420733
33	NC_016146	ATATT	2	10	32258	32267	40 %	60 %	0 %	0 %	357420733
34	NC_016146	CCATT	2	10	32268	32277	20 %	40 %	0 %	40 %	357420733
35	NC_016146	TATAA	2	10	32864	32873	60 %	40 %	0 %	0 %	357420733
36	NC_016146	GAATT	2	10	32937	32946	40 %	40 %	20 %	0 %	357420733
37	NC_016146	ATTTA	2	10	34326	34335	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_016146	TAGAA	2	10	34431	34440	60 %	20 %	20 %	0 %	357420735
39	NC_016146	TAAAA	2	10	36690	36699	80 %	20 %	0 %	0 %	357420737
40	NC_016146	AAAAT	2	10	36780	36789	80 %	20 %	0 %	0 %	357420737
41	NC_016146	TCCAA	2	10	37144	37153	40 %	20 %	0 %	40 %	357420737
42	NC_016146	TGATA	2	10	39197	39206	40 %	40 %	20 %	0 %	357420740
43	NC_016146	AAATG	2	10	39728	39737	60 %	20 %	20 %	0 %	357420740
44	NC_016146	TTTAT	2	10	40586	40595	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_016146	CAAAA	2	10	41156	41165	80 %	0 %	0 %	20 %	357420742
46	NC_016146	TTCTA	2	10	43131	43140	20 %	60 %	0 %	20 %	357420742
47	NC_016146	AATGA	2	10	43354	43363	60 %	20 %	20 %	0 %	357420742
48	NC_016146	AGAAA	2	10	44841	44850	80 %	0 %	20 %	0 %	357420744
49	NC_016146	GTTAT	2	10	45457	45466	20 %	60 %	20 %	0 %	357420744
50	NC_016146	GAAAT	2	10	46942	46951	60 %	20 %	20 %	0 %	357420744
51	NC_016146	AGTTT	2	10	47148	47157	20 %	60 %	20 %	0 %	357420744
52	NC_016146	GATTT	2	10	47374	47383	20 %	60 %	20 %	0 %	357420745
53	NC_016146	GAATA	2	10	47686	47695	60 %	20 %	20 %	0 %	357420745
54	NC_016146	AAAAG	2	10	47768	47777	80 %	0 %	20 %	0 %	357420745
55	NC_016146	ATTTA	2	10	49883	49892	40 %	60 %	0 %	0 %	357420745
56	NC_016146	AAAAT	2	10	49954	49963	80 %	20 %	0 %	0 %	357420745
57	NC_016146	AAAAG	2	10	50338	50347	80 %	0 %	20 %	0 %	357420746
58	NC_016146	ATTTA	2	10	51350	51359	40 %	60 %	0 %	0 %	357420747
59	NC_016146	GATTT	2	10	53047	53056	20 %	60 %	20 %	0 %	357420749
60	NC_016146	TGAAT	2	10	53904	53913	40 %	40 %	20 %	0 %	357420750
61	NC_016146	AATTA	2	10	55002	55011	60 %	40 %	0 %	0 %	357420750
62	NC_016146	GAAAA	2	10	56154	56163	80 %	0 %	20 %	0 %	357420751
63	NC_016146	TTATT	2	10	56721	56730	20 %	80 %	0 %	0 %	357420751
64	NC_016146	ATAGA	2	10	56982	56991	60 %	20 %	20 %	0 %	357420751
65	NC_016146	TTTTA	2	10	57650	57659	20 %	80 %	0 %	0 %	357420752
66	NC_016146	AAATT	2	10	57964	57973	60 %	40 %	0 %	0 %	357420753
67	NC_016146	TTTGT	2	10	60508	60517	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_016146	GAATA	2	10	61181	61190	60 %	20 %	20 %	0 %	357420756
69	NC_016146	ATTGG	2	10	62080	62089	20 %	40 %	40 %	0 %	357420757
70	NC_016146	GCGGA	2	10	63205	63214	20 %	0 %	60 %	20 %	357420758
71	NC_016146	ATTGC	2	10	64242	64251	20 %	40 %	20 %	20 %	357420759
72	NC_016146	TAAAA	2	10	64390	64399	80 %	20 %	0 %	0 %	357420759
73	NC_016146	ATTTT	2	10	65275	65284	20 %	80 %	0 %	0 %	357420761
74	NC_016146	AAAAT	2	10	66960	66969	80 %	20 %	0 %	0 %	357420762
75	NC_016146	ATCGT	2	10	67655	67664	20 %	40 %	20 %	20 %	357420763
76	NC_016146	CATTT	2	10	68141	68150	20 %	60 %	0 %	20 %	357420763
77	NC_016146	TTTAT	2	10	68232	68241	20 %	80 %	0 %	0 %	357420763
78	NC_016146	AACGT	2	10	74218	74227	40 %	20 %	20 %	20 %	357420766
79	NC_016146	TTGTT	2	10	75353	75362	0 %	80 %	20 %	0 %	357420767
80	NC_016146	TTTGA	2	10	75750	75759	20 %	60 %	20 %	0 %	357420767
81	NC_016146	ATGAA	2	10	76246	76255	60 %	20 %	20 %	0 %	357420767
82	NC_016146	TACAA	2	10	76377	76386	60 %	20 %	0 %	20 %	357420767
83	NC_016146	TTGGA	2	10	76451	76460	20 %	40 %	40 %	0 %	357420767
84	NC_016146	TAAAT	2	10	76675	76684	60 %	40 %	0 %	0 %	357420767
85	NC_016146	ATCCA	2	10	76753	76762	40 %	20 %	0 %	40 %	357420767
86	NC_016146	CTTTT	2	10	77223	77232	0 %	80 %	0 %	20 %	357420768
87	NC_016146	ATAAA	2	10	77918	77927	80 %	20 %	0 %	0 %	357420768
88	NC_016146	ATGAT	2	10	79922	79931	40 %	40 %	20 %	0 %	357420770
89	NC_016146	TTCAT	2	10	80567	80576	20 %	60 %	0 %	20 %	357420770
90	NC_016146	AAATT	2	10	81532	81541	60 %	40 %	0 %	0 %	357420772
91	NC_016146	AGAAA	2	10	81772	81781	80 %	0 %	20 %	0 %	357420773
92	NC_016146	CTAGA	2	10	82440	82449	40 %	20 %	20 %	20 %	357420774
93	NC_016146	AAGGG	2	10	83323	83332	40 %	0 %	60 %	0 %	357420774
94	NC_016146	TTTTC	2	10	83339	83348	0 %	80 %	0 %	20 %	357420774
95	NC_016146	TTTTC	2	10	83433	83442	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
96	NC_016146	ATACA	2	10	84224	84233	60 %	20 %	0 %	20 %	357420775
97	NC_016146	TAAAT	2	10	86380	86389	60 %	40 %	0 %	0 %	357420777
98	NC_016146	ATTTT	2	10	87368	87377	20 %	80 %	0 %	0 %	357420778
99	NC_016146	ATCGT	2	10	88106	88115	20 %	40 %	20 %	20 %	357420779
100	NC_016146	TTTTA	2	10	88896	88905	20 %	80 %	0 %	0 %	357420780
101	NC_016146	TTTTG	2	10	90005	90014	0 %	80 %	20 %	0 %	357420781
102	NC_016146	GATAA	2	10	91689	91698	60 %	20 %	20 %	0 %	357420782
103	NC_016146	TGTTT	2	10	93971	93980	0 %	80 %	20 %	0 %	357420784
104	NC_016146	AATAT	2	10	95845	95854	60 %	40 %	0 %	0 %	357420786
105	NC_016146	TGGAT	2	10	95933	95942	20 %	40 %	40 %	0 %	357420786
106	NC_016146	TAACA	2	10	96518	96527	60 %	20 %	0 %	20 %	357420787
107	NC_016146	TTTCA	2	10	97238	97247	20 %	60 %	0 %	20 %	357420787
108	NC_016146	AAATC	2	10	97631	97640	60 %	20 %	0 %	20 %	357420788
109	NC_016146	ACAAT	2	10	100148	100157	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
110	NC_016146	TGGAT	2	10	104089	104098	20 %	40 %	40 %	0 %	357420793
111	NC_016146	GTATT	2	10	104512	104521	20 %	60 %	20 %	0 %	357420793
112	NC_016146	TTTTG	2	10	105313	105322	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
113	NC_016146	TGGAT	2	10	105410	105419	20 %	40 %	40 %	0 %	357420794
114	NC_016146	TAATA	2	10	106089	106098	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_016146	AAAAG	2	10	106181	106190	80 %	0 %	20 %	0 %	357420795
116	NC_016146	GAATG	2	10	106244	106253	40 %	20 %	40 %	0 %	357420795
117	NC_016146	TAAAA	2	10	107248	107257	80 %	20 %	0 %	0 %	357420795
118	NC_016146	AAAAT	2	10	107349	107358	80 %	20 %	0 %	0 %	357420795
119	NC_016146	TAGAA	2	10	109346	109355	60 %	20 %	20 %	0 %	357420797
120	NC_016146	CTTTA	2	10	109778	109787	20 %	60 %	0 %	20 %	357420797
121	NC_016146	ATTTT	2	10	110637	110646	20 %	80 %	0 %	0 %	357420798
122	NC_016146	TCTTT	2	10	110832	110841	0 %	80 %	0 %	20 %	357420798
123	NC_016146	TAAAT	2	10	111977	111986	60 %	40 %	0 %	0 %	357420799
124	NC_016146	ATAAA	2	10	112394	112403	80 %	20 %	0 %	0 %	357420801
125	NC_016146	TATTT	2	10	114541	114550	20 %	80 %	0 %	0 %	357420803
126	NC_016146	ATGAA	2	10	116363	116372	60 %	20 %	20 %	0 %	357420805
127	NC_016146	TTCAT	2	10	116905	116914	20 %	60 %	0 %	20 %	357420806
128	NC_016146	CTTTT	2	10	118125	118134	0 %	80 %	0 %	20 %	357420807
129	NC_016146	TCATA	2	10	118315	118324	40 %	40 %	0 %	20 %	357420807
130	NC_016146	TTTTC	2	10	118942	118951	0 %	80 %	0 %	20 %	357420808
131	NC_016146	GTTAT	2	10	119098	119107	20 %	60 %	20 %	0 %	357420808
132	NC_016146	TATTT	2	10	119216	119225	20 %	80 %	0 %	0 %	357420809
133	NC_016146	ATTCC	2	10	119645	119654	20 %	40 %	0 %	40 %	357420809
134	NC_016146	CGCAT	2	10	120080	120089	20 %	20 %	20 %	40 %	357420809
135	NC_016146	ATTTC	2	10	120174	120183	20 %	60 %	0 %	20 %	357420809
136	NC_016146	CTTTT	2	10	120687	120696	0 %	80 %	0 %	20 %	357420810
137	NC_016146	TATTC	2	10	121935	121944	20 %	60 %	0 %	20 %	357420811
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