MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Blattabacterium sp. (Mastotermes darwiniensis) str. MADAR chromosome

Total Repeats: 8505

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016146	AGA	2	6	84	89	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357420709
2	NC_016146	CAT	2	6	141	146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357420709
3	NC_016146	TAG	2	6	191	196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357420709
4	NC_016146	GAA	2	6	280	285	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357420709
5	NC_016146	GAA	2	6	317	322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357420709
6	NC_016146	ATA	2	6	374	379	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357420709
7	NC_016146	ATT	2	6	418	423	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357420709
8	NC_016146	GAA	2	6	472	477	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357420709
9	NC_016146	TCC	2	6	491	496	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357420709
10	NC_016146	AGA	2	6	604	609	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357420709
11	NC_016146	AGA	2	6	624	629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357420709
12	NC_016146	ATG	2	6	731	736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357420709
13	NC_016146	ATG	2	6	892	897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357420709
14	NC_016146	TGA	2	6	903	908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357420709
15	NC_016146	AGA	2	6	942	947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357420709
16	NC_016146	AGG	2	6	969	974	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357420709
17	NC_016146	TGA	2	6	1071	1076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357420709
18	NC_016146	TCA	2	6	1104	1109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357420709
19	NC_016146	GAT	2	6	1263	1268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016146	TAT	2	6	1285	1290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357420710
21	NC_016146	AGA	2	6	1522	1527	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357420710
22	NC_016146	TAC	2	6	1558	1563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357420710
23	NC_016146	AGA	2	6	1570	1575	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357420710
24	NC_016146	TTC	2	6	1705	1710	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420710
25	NC_016146	ATC	2	6	1716	1721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357420710
26	NC_016146	GAA	2	6	1871	1876	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357420710
27	NC_016146	AGA	2	6	1904	1909	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357420710
28	NC_016146	ATT	2	6	1911	1916	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357420710
29	NC_016146	ATG	2	6	2162	2167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357420710
30	NC_016146	TTA	2	6	2187	2192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357420710
31	NC_016146	GAT	2	6	2324	2329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357420710
32	NC_016146	AGA	2	6	2338	2343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357420710
33	NC_016146	TAT	2	6	2365	2370	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357420710
34	NC_016146	GGA	2	6	2453	2458	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357420710
35	NC_016146	AGC	2	6	2473	2478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357420710
36	NC_016146	AAT	2	6	2498	2503	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357420710
37	NC_016146	GAT	2	6	2606	2611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357420710
38	NC_016146	AAG	2	6	2631	2636	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357420710
39	NC_016146	TAT	2	6	2668	2673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357420710
40	NC_016146	GAA	2	6	2756	2761	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357420710
41	NC_016146	TAG	2	6	2841	2846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357420710
42	NC_016146	TTA	2	6	2852	2857	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357420710
43	NC_016146	CTT	2	6	2907	2912	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420710
44	NC_016146	CTT	2	6	2942	2947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420710
45	NC_016146	AGG	2	6	2953	2958	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357420710
46	NC_016146	ATC	2	6	2994	2999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357420710
47	NC_016146	CAG	2	6	3048	3053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357420710
48	NC_016146	AAC	2	6	3144	3149	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357420710
49	NC_016146	AGA	2	6	3158	3163	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357420710
50	NC_016146	ATT	2	6	3350	3355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357420710
51	NC_016146	AAT	2	6	3443	3448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357420710
52	NC_016146	TAC	2	6	3657	3662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357420710
53	NC_016146	AAT	2	6	3707	3712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357420710
54	NC_016146	CTT	2	6	3723	3728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420710
55	NC_016146	AGA	2	6	3742	3747	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357420710
56	NC_016146	AAG	2	6	3753	3758	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357420710
57	NC_016146	TTG	2	6	3822	3827	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357420710
58	NC_016146	GAA	2	6	3836	3841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357420710
59	NC_016146	AAG	2	6	3922	3927	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357420711
60	NC_016146	ATT	2	6	3994	3999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357420711
61	NC_016146	AGT	2	6	4088	4093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357420711
62	NC_016146	AGA	2	6	4196	4201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357420711
63	NC_016146	GAA	2	6	4255	4260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357420711
64	NC_016146	ATT	2	6	4451	4456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357420711
65	NC_016146	ATT	2	6	4463	4468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357420711
66	NC_016146	GAT	2	6	4469	4474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357420711
67	NC_016146	AGG	2	6	4475	4480	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357420711
68	NC_016146	TTA	2	6	4618	4623	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357420711
69	NC_016146	ACA	2	6	4791	4796	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357420711
70	NC_016146	TAA	2	6	4804	4809	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357420711
71	NC_016146	AAT	2	6	4862	4867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357420711
72	NC_016146	TTC	2	6	4940	4945	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420711
73	NC_016146	ATG	2	6	4957	4962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357420711
74	NC_016146	CAT	2	6	4976	4981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357420711
75	NC_016146	TAT	2	6	5011	5016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357420711
76	NC_016146	ATT	2	6	5108	5113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357420711
77	NC_016146	CAT	2	6	5184	5189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357420711
78	NC_016146	TTA	2	6	5223	5228	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357420711
79	NC_016146	ATT	2	6	5271	5276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357420711
80	NC_016146	TGG	2	6	5426	5431	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357420711
81	NC_016146	TAA	2	6	5455	5460	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357420711
82	NC_016146	CTT	2	6	5633	5638	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420712
83	NC_016146	TAT	2	6	5658	5663	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357420712
84	NC_016146	TAT	2	6	5756	5761	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357420712
85	NC_016146	AAT	2	6	5787	5792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357420712
86	NC_016146	TCT	2	6	5800	5805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420712
87	NC_016146	TCA	2	6	5812	5817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357420712
88	NC_016146	AAC	2	6	5855	5860	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357420712
89	NC_016146	TTG	2	6	5867	5872	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357420712
90	NC_016146	AGA	2	6	5961	5966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357420712
91	NC_016146	ATT	2	6	5994	5999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357420712
92	NC_016146	ATT	2	6	6072	6077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357420713
93	NC_016146	TTC	2	6	6095	6100	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420713
94	NC_016146	TTA	2	6	6148	6153	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357420713
95	NC_016146	GAT	2	6	6157	6162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357420713
96	NC_016146	CCT	2	6	6342	6347	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357420713
97	NC_016146	TTC	2	6	6353	6358	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420713
98	NC_016146	CTT	2	6	6384	6389	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420713
99	NC_016146	TTA	2	6	6409	6414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357420713
100	NC_016146	ATA	2	6	6516	6521	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357420713
101	NC_016146	CAA	2	6	6682	6687	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357420713
102	NC_016146	AAG	2	6	6688	6693	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357420713
103	NC_016146	TAC	2	6	6715	6720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357420713
104	NC_016146	CTT	2	6	6895	6900	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420713
105	NC_016146	AAT	2	6	7011	7016	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357420713
106	NC_016146	TCT	2	6	7092	7097	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420713
107	NC_016146	CTT	2	6	7114	7119	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420713
108	NC_016146	TAG	2	6	7138	7143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357420713
109	NC_016146	ATA	2	6	7243	7248	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_016146	TTC	2	6	7320	7325	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420714
111	NC_016146	TCA	2	6	7374	7379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357420714
112	NC_016146	TAG	2	6	7409	7414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357420714
113	NC_016146	GGA	2	6	7429	7434	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357420714
114	NC_016146	TGT	2	6	7457	7462	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357420714
115	NC_016146	AGT	2	6	7482	7487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357420714
116	NC_016146	TCA	2	6	7535	7540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357420714
117	NC_016146	TAG	2	6	7610	7615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357420714
118	NC_016146	GAA	2	6	7798	7803	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357420714
119	NC_016146	TAA	2	6	7808	7813	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357420714
120	NC_016146	ATT	2	6	7868	7873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357420714
121	NC_016146	TTA	2	6	7897	7902	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357420714
122	NC_016146	TTG	2	6	8036	8041	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357420714
123	NC_016146	ATA	2	6	8141	8146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357420714
124	NC_016146	TCA	2	6	8217	8222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357420714
125	NC_016146	CTG	2	6	8228	8233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357420714
126	NC_016146	AAT	2	6	8373	8378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357420714
127	NC_016146	TAA	2	6	8490	8495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357420714
128	NC_016146	CAG	2	6	8594	8599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357420714
129	NC_016146	AAT	2	6	8622	8627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357420714
130	NC_016146	TAT	2	6	8670	8675	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357420714
131	NC_016146	GAA	2	6	8728	8733	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357420714
132	NC_016146	TAA	2	6	8861	8866	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357420715
133	NC_016146	ATA	2	6	8938	8943	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357420715
134	NC_016146	AGA	2	6	8966	8971	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357420715
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136	NC_016146	TAA	2	6	8992	8997	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357420715
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138	NC_016146	GTT	2	6	9076	9081	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357420715
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141	NC_016146	AGA	2	6	9239	9244	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357420715
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151	NC_016146	TAG	2	6	10159	10164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357420715
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156	NC_016146	ATC	2	6	10611	10616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
157	NC_016146	GAA	2	6	10666	10671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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159	NC_016146	AGC	2	6	10740	10745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
160	NC_016146	TAT	2	6	10770	10775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_016146	ATA	2	6	10901	10906	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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231	NC_016146	TAT	2	6	16358	16363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357420720
232	NC_016146	CTA	2	6	16375	16380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357420720
233	NC_016146	ATA	2	6	16398	16403	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357420720
234	NC_016146	TAT	2	6	16529	16534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
235	NC_016146	TAA	2	6	16573	16578	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357420721
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239	NC_016146	TCT	2	6	16814	16819	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420721
240	NC_016146	GAT	2	6	17021	17026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357420721
241	NC_016146	TTA	2	6	17063	17068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
242	NC_016146	TAT	2	6	17069	17074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
243	NC_016146	GTT	2	6	17100	17105	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357420722
244	NC_016146	ATA	2	6	17137	17142	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357420722
245	NC_016146	CCA	2	6	17159	17164	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357420722
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251	NC_016146	TGA	2	6	17394	17399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357420722
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255	NC_016146	CAA	2	6	17642	17647	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357420722
256	NC_016146	CAA	2	6	17665	17670	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357420722
257	NC_016146	ATC	2	6	17750	17755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357420722
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259	NC_016146	CTA	2	6	17935	17940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357420722
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263	NC_016146	AAT	3	9	18061	18069	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357420722
264	NC_016146	AAT	2	6	18082	18087	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357420722
265	NC_016146	CTT	2	6	18128	18133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357420722
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