MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Bacillus subtilis subsp. spizizenii TU-B-10 chromosome

Total Repeats: 3232

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016047	CAAAT	2	10	1322	1331	60 %	20 %	0 %	20 %	350264101
2	NC_016047	AGTGA	2	10	4541	4550	40 %	20 %	40 %	0 %	350264104
3	NC_016047	TACAA	2	10	5646	5655	60 %	20 %	0 %	20 %	350264106
4	NC_016047	TTACC	2	10	7784	7793	20 %	40 %	0 %	40 %	350264108
5	NC_016047	ACAAA	2	10	8966	8975	80 %	0 %	0 %	20 %	350264108
6	NC_016047	TCGTG	2	10	10884	10893	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
7	NC_016047	GGACG	2	10	11756	11765	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
8	NC_016047	CCGTT	2	10	15498	15507	0 %	40 %	20 %	40 %	350264109
9	NC_016047	TAAAA	2	10	15651	15660	80 %	20 %	0 %	0 %	350264109
10	NC_016047	TAAAG	2	10	16246	16255	60 %	20 %	20 %	0 %	350264110
11	NC_016047	AATAA	2	10	19040	19049	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016047	TGCGG	2	10	20108	20117	0 %	20 %	60 %	20 %	350264113
13	NC_016047	AAAGC	2	10	20995	21004	60 %	0 %	20 %	20 %	350264114
14	NC_016047	CCAAG	2	10	21976	21985	40 %	0 %	20 %	40 %	350264114
15	NC_016047	GAAAT	2	10	27901	27910	60 %	20 %	20 %	0 %	350264119
16	NC_016047	TCGTG	2	10	31495	31504	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
17	NC_016047	GGACG	2	10	32367	32376	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
18	NC_016047	CTGAA	2	10	37154	37163	40 %	20 %	20 %	20 %	350264126
19	NC_016047	TTTTG	2	10	38379	38388	0 %	80 %	20 %	0 %	350264127
20	NC_016047	CAACA	2	10	41603	41612	60 %	0 %	0 %	40 %	350264131
21	NC_016047	AGATT	2	10	43011	43020	40 %	40 %	20 %	0 %	350264134
22	NC_016047	GAGAG	2	10	47593	47602	40 %	0 %	60 %	0 %	350264138
23	NC_016047	TGATA	2	10	47980	47989	40 %	40 %	20 %	0 %	350264139
24	NC_016047	ATAGG	2	10	48625	48634	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
25	NC_016047	GAAAG	2	10	49383	49392	60 %	0 %	40 %	0 %	350264140
26	NC_016047	CAAAG	2	10	49609	49618	60 %	0 %	20 %	20 %	350264140
27	NC_016047	CAAAG	2	10	49640	49649	60 %	0 %	20 %	20 %	350264140
28	NC_016047	TTTTG	2	10	50139	50148	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016047	GAAGC	2	10	50500	50509	40 %	0 %	40 %	20 %	350264141
30	NC_016047	TGTTT	2	10	51800	51809	0 %	80 %	20 %	0 %	350264143
31	NC_016047	GAAAA	2	10	52173	52182	80 %	0 %	20 %	0 %	350264143
32	NC_016047	CGGAT	2	10	53698	53707	20 %	20 %	40 %	20 %	350264146
33	NC_016047	AGGTG	2	10	57268	57277	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016047	TGAAG	2	10	57442	57451	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016047	GGAAT	2	10	59672	59681	40 %	20 %	40 %	0 %	350264153
36	NC_016047	ACTTC	2	10	60716	60725	20 %	40 %	0 %	40 %	350264155
37	NC_016047	AAACG	2	10	62650	62659	60 %	0 %	20 %	20 %	350264155
38	NC_016047	AAAGA	2	10	62789	62798	80 %	0 %	20 %	0 %	350264155
39	NC_016047	GAAGA	2	10	63671	63680	60 %	0 %	40 %	0 %	350264155
40	NC_016047	GGTCG	2	10	64213	64222	0 %	20 %	60 %	20 %	350264156
41	NC_016047	CGTTG	2	10	65489	65498	0 %	40 %	40 %	20 %	350264157
42	NC_016047	TGCTT	2	10	65675	65684	0 %	60 %	20 %	20 %	350264157
43	NC_016047	CTTGG	2	10	71361	71370	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
44	NC_016047	ATGAA	2	10	74657	74666	60 %	20 %	20 %	0 %	350264165
45	NC_016047	ATGAA	2	10	75720	75729	60 %	20 %	20 %	0 %	350264166
46	NC_016047	AAATC	2	10	75765	75774	60 %	20 %	0 %	20 %	350264166
47	NC_016047	TTATT	2	10	77097	77106	20 %	80 %	0 %	0 %	350264168
48	NC_016047	AAAGT	2	10	79127	79136	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016047	GGGCG	2	10	79604	79613	0 %	0 %	80 %	20 %	350264169
50	NC_016047	GATCA	2	10	81658	81667	40 %	20 %	20 %	20 %	350264171
51	NC_016047	AGGAA	2	10	86353	86362	60 %	0 %	40 %	0 %	350264175
52	NC_016047	AAGAG	2	10	88625	88634	60 %	0 %	40 %	0 %	350264179
53	NC_016047	TCGTG	2	10	91686	91695	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
54	NC_016047	GGACG	2	10	92381	92390	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
55	NC_016047	ACCAT	2	10	95921	95930	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
56	NC_016047	AATAG	2	10	96114	96123	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016047	TCGTG	2	10	97543	97552	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
58	NC_016047	GGACG	2	10	98238	98247	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
59	NC_016047	TATAA	2	10	101362	101371	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_016047	GCTGA	2	10	106769	106778	20 %	20 %	40 %	20 %	350264185
61	NC_016047	AAATG	2	10	106957	106966	60 %	20 %	20 %	0 %	350264185
62	NC_016047	TGTCT	2	10	108124	108133	0 %	60 %	20 %	20 %	350264186
63	NC_016047	ATTGA	2	10	108233	108242	40 %	40 %	20 %	0 %	350264186
64	NC_016047	CTTAT	2	10	109035	109044	20 %	60 %	0 %	20 %	350264187
65	NC_016047	ACATG	2	10	111097	111106	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
66	NC_016047	AGAAA	2	10	113506	113515	80 %	0 %	20 %	0 %	350264193
67	NC_016047	TCAGA	2	10	114843	114852	40 %	20 %	20 %	20 %	350264194
68	NC_016047	ACCAA	2	10	115050	115059	60 %	0 %	0 %	40 %	350264195
69	NC_016047	GAAAC	2	10	116073	116082	60 %	0 %	20 %	20 %	350264196
70	NC_016047	TGAAA	2	10	117149	117158	60 %	20 %	20 %	0 %	350264198
71	NC_016047	TGAAC	2	10	117239	117248	40 %	20 %	20 %	20 %	350264198
72	NC_016047	TTACG	2	10	120014	120023	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
73	NC_016047	TAATC	2	10	120639	120648	40 %	40 %	0 %	20 %	350264203
74	NC_016047	TTGAA	2	10	120739	120748	40 %	40 %	20 %	0 %	350264204
75	NC_016047	ACGAT	2	10	122788	122797	40 %	20 %	20 %	20 %	350264206
76	NC_016047	CGTAA	2	10	124268	124277	40 %	20 %	20 %	20 %	350264206
77	NC_016047	AACTG	2	10	124552	124561	40 %	20 %	20 %	20 %	350264206
78	NC_016047	ACTTC	2	10	124622	124631	20 %	40 %	0 %	40 %	350264206
79	NC_016047	GTGAA	2	10	125720	125729	40 %	20 %	40 %	0 %	350264207
80	NC_016047	GCAAA	2	10	127671	127680	60 %	0 %	20 %	20 %	350264207
81	NC_016047	ATCAA	2	10	127930	127939	60 %	20 %	0 %	20 %	350264207
82	NC_016047	GTAAA	2	10	129185	129194	60 %	20 %	20 %	0 %	350264207
83	NC_016047	CAATT	2	10	131243	131252	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
84	NC_016047	TCATT	2	10	134511	134520	20 %	60 %	0 %	20 %	350264213
85	NC_016047	CAAAA	2	10	135449	135458	80 %	0 %	0 %	20 %	350264214
86	NC_016047	AATCA	2	10	136776	136785	60 %	20 %	0 %	20 %	350264216
87	NC_016047	AAAGT	2	10	140053	140062	60 %	20 %	20 %	0 %	350264222
88	NC_016047	CAAAC	2	10	144046	144055	60 %	0 %	0 %	40 %	350264232
89	NC_016047	GAAAC	2	10	145869	145878	60 %	0 %	20 %	20 %	350264234
90	NC_016047	TAAAT	2	10	146897	146906	60 %	40 %	0 %	0 %	350264236
91	NC_016047	TACAT	2	10	147501	147510	40 %	40 %	0 %	20 %	350264237
92	NC_016047	ATGGA	2	10	152626	152635	40 %	20 %	40 %	0 %	350264243
93	NC_016047	TTGTG	2	10	153859	153868	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
94	NC_016047	TGCTT	2	10	154638	154647	0 %	60 %	20 %	20 %	350264246
95	NC_016047	TCCAT	2	10	155801	155810	20 %	40 %	0 %	40 %	350264248
96	NC_016047	GGAGC	2	10	157133	157142	20 %	0 %	60 %	20 %	350264250
97	NC_016047	AAAGC	2	10	157237	157246	60 %	0 %	20 %	20 %	350264250
98	NC_016047	ATCCA	2	10	157314	157323	40 %	20 %	0 %	40 %	350264250
99	NC_016047	TGGTT	2	10	159300	159309	0 %	60 %	40 %	0 %	350264253
100	NC_016047	GGAAA	2	10	160375	160384	60 %	0 %	40 %	0 %	350264254
101	NC_016047	TCGTG	2	10	162081	162090	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
102	NC_016047	GGACG	2	10	162776	162785	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
103	NC_016047	TTTTG	2	10	166785	166794	0 %	80 %	20 %	0 %	350264256
104	NC_016047	TAACG	2	10	167841	167850	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
105	NC_016047	GAAAA	2	10	167875	167884	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
106	NC_016047	TTATT	2	10	168352	168361	20 %	80 %	0 %	0 %	350264258
107	NC_016047	CGAAT	2	10	169349	169358	40 %	20 %	20 %	20 %	350264260
108	NC_016047	AGAAC	2	10	169720	169729	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
109	NC_016047	AAATC	2	10	171155	171164	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
110	NC_016047	CAAAA	2	10	171533	171542	80 %	0 %	0 %	20 %	350264264
111	NC_016047	AAAAG	2	10	172567	172576	80 %	0 %	20 %	0 %	350264264
112	NC_016047	GAAGA	2	10	173006	173015	60 %	0 %	40 %	0 %	350264264
113	NC_016047	TTTGA	2	10	175866	175875	20 %	60 %	20 %	0 %	350264268
114	NC_016047	CAACT	2	10	176252	176261	40 %	20 %	0 %	40 %	350264269
115	NC_016047	GAATA	2	10	176436	176445	60 %	20 %	20 %	0 %	350264269
116	NC_016047	GAAGC	2	10	177349	177358	40 %	0 %	40 %	20 %	350264269
117	NC_016047	CGCTC	2	10	177589	177598	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
118	NC_016047	AGAAA	2	10	180198	180207	80 %	0 %	20 %	0 %	350264276
119	NC_016047	TTTAC	2	10	183085	183094	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
120	NC_016047	CCTTT	2	10	183733	183742	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
121	NC_016047	GAAAA	2	10	186037	186046	80 %	0 %	20 %	0 %	350264286
122	NC_016047	CAAGA	2	10	186586	186595	60 %	0 %	20 %	20 %	350264286
123	NC_016047	TTTAA	2	10	186998	187007	40 %	60 %	0 %	0 %	350264287
124	NC_016047	TGAAT	2	10	187516	187525	40 %	40 %	20 %	0 %	350264287
125	NC_016047	CTCAT	2	10	187672	187681	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
126	NC_016047	GCTAA	2	10	189202	189211	40 %	20 %	20 %	20 %	350264289
127	NC_016047	GGAGC	2	10	190887	190896	20 %	0 %	60 %	20 %	350264290
128	NC_016047	TGAAA	2	10	193078	193087	60 %	20 %	20 %	0 %	350264292
129	NC_016047	AGCGG	2	10	194940	194949	20 %	0 %	60 %	20 %	350264294
130	NC_016047	CAAGA	2	10	195653	195662	60 %	0 %	20 %	20 %	350264295
131	NC_016047	CGATG	2	10	196254	196263	20 %	20 %	40 %	20 %	350264297
132	NC_016047	AGACA	2	10	198324	198333	60 %	0 %	20 %	20 %	350264301
133	NC_016047	ACGGA	2	10	198557	198566	40 %	0 %	40 %	20 %	350264301
134	NC_016047	AAAAT	2	10	198821	198830	80 %	20 %	0 %	0 %	350264301
135	NC_016047	TAAAA	2	10	199739	199748	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_016047	AAAAC	2	10	200204	200213	80 %	0 %	0 %	20 %	350264303
137	NC_016047	AAGAT	2	10	200858	200867	60 %	20 %	20 %	0 %	350264305
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393	NC_016047	TAATG	2	10	564628	564637	40 %	40 %	20 %	0 %	350264644
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395	NC_016047	GTCGG	2	10	566389	566398	0 %	20 %	60 %	20 %	350264647
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400	NC_016047	TCGTA	2	10	571385	571394	20 %	40 %	20 %	20 %	350264653
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