MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bacillus subtilis subsp. spizizenii TU-B-10 chromosome

Total Repeats: 89233

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_016047	CA	3	6	145998	146003	50 %	0 %	0 %	50 %	350264235
3002	NC_016047	CGAA	2	8	146007	146014	50 %	0 %	25 %	25 %	350264235
3003	NC_016047	TTG	2	6	146015	146020	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	350264235
3004	NC_016047	TGC	2	6	146064	146069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	350264235
3005	NC_016047	AGA	2	6	146076	146081	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	350264235
3006	NC_016047	TGA	2	6	146136	146141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350264235
3007	NC_016047	AAAG	2	8	146161	146168	75 %	0 %	25 %	0 %	350264235
3008	NC_016047	TCT	2	6	146199	146204	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	350264235
3009	NC_016047	GAA	2	6	146245	146250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	350264235
3010	NC_016047	GATT	2	8	146274	146281	25 %	50 %	25 %	0 %	350264235
3011	NC_016047	AAC	2	6	146358	146363	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	350264235
3012	NC_016047	CCG	2	6	146383	146388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	350264235
3013	NC_016047	GAT	2	6	146440	146445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350264235
3014	NC_016047	TCT	2	6	146586	146591	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	350264235
3015	NC_016047	GGA	2	6	146593	146598	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	350264235
3016	NC_016047	A	7	7	146601	146607	100 %	0 %	0 %	0 %	350264235
3017	NC_016047	A	6	6	146687	146692	100 %	0 %	0 %	0 %	350264236
3018	NC_016047	AAG	2	6	146751	146756	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	350264236
3019	NC_016047	GAA	2	6	146823	146828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	350264236
3020	NC_016047	GCA	2	6	146848	146853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	350264236
3021	NC_016047	CAT	2	6	146873	146878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	350264236
3022	NC_016047	TAAAT	2	10	146897	146906	60 %	40 %	0 %	0 %	350264236
3023	NC_016047	GAT	2	6	146955	146960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350264236
3024	NC_016047	A	6	6	146964	146969	100 %	0 %	0 %	0 %	350264236
3025	NC_016047	TA	3	6	146995	147000	50 %	50 %	0 %	0 %	350264236
3026	NC_016047	GTT	2	6	147087	147092	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	350264236
3027	NC_016047	CAA	2	6	147164	147169	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	350264236
3028	NC_016047	TGA	2	6	147355	147360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3029	NC_016047	AAT	2	6	147361	147366	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3030	NC_016047	GTT	2	6	147456	147461	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	350264237
3031	NC_016047	CAT	2	6	147465	147470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	350264237
3032	NC_016047	CAG	2	6	147482	147487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	350264237
3033	NC_016047	TACAT	2	10	147501	147510	40 %	40 %	0 %	20 %	350264237
3034	NC_016047	ATCA	2	8	147529	147536	50 %	25 %	0 %	25 %	350264237
3035	NC_016047	CTT	2	6	147606	147611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	350264237
3036	NC_016047	GAA	2	6	147644	147649	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3037	NC_016047	AGG	2	6	147900	147905	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3038	NC_016047	GAAAAG	2	12	147971	147982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	350264238
3039	NC_016047	AAACAA	2	12	148012	148023	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	350264238
3040	NC_016047	AGG	2	6	148036	148041	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3041	NC_016047	GTT	2	6	148094	148099	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	350264239
3042	NC_016047	ACAT	2	8	148109	148116	50 %	25 %	0 %	25 %	350264239
3043	NC_016047	AAG	2	6	148155	148160	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	350264239
3044	NC_016047	AGA	2	6	148171	148176	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	350264239
3045	NC_016047	GAA	3	9	148199	148207	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	350264239
3046	NC_016047	ATT	2	6	148226	148231	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	350264239
3047	NC_016047	CGT	2	6	148388	148393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	350264239
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3049	NC_016047	TAAG	2	8	148415	148422	50 %	25 %	25 %	0 %	350264239
3050	NC_016047	GCT	3	9	148441	148449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3051	NC_016047	TGC	2	6	148626	148631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3052	NC_016047	GCT	2	6	148651	148656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3053	NC_016047	GCT	2	6	148747	148752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3054	NC_016047	CCA	2	6	148810	148815	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3055	NC_016047	CGC	2	6	148822	148827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3056	NC_016047	TTTG	2	8	148834	148841	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3057	NC_016047	AAT	2	6	148863	148868	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3058	NC_016047	TTAT	2	8	148883	148890	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3059	NC_016047	AGG	2	6	148994	148999	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3060	NC_016047	CGA	2	6	149054	149059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	350264240
3061	NC_016047	CGT	2	6	149130	149135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	350264240
3062	NC_016047	AGAT	2	8	149179	149186	50 %	25 %	25 %	0 %	350264240
3063	NC_016047	TGA	2	6	149282	149287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350264240
3064	NC_016047	AGA	2	6	149290	149295	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	350264240
3065	NC_016047	AC	3	6	149346	149351	50 %	0 %	0 %	50 %	350264240
3066	NC_016047	CTG	2	6	149458	149463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	350264240
3067	NC_016047	AG	3	6	149473	149478	50 %	0 %	50 %	0 %	350264240
3068	NC_016047	CGAT	2	8	149503	149510	25 %	25 %	25 %	25 %	350264240
3069	NC_016047	TCTA	2	8	149511	149518	25 %	50 %	0 %	25 %	350264240
3070	NC_016047	AAG	2	6	149629	149634	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	350264240
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3072	NC_016047	AGA	3	9	149729	149737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	350264240
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3074	NC_016047	GAA	2	6	149853	149858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	350264240
3075	NC_016047	ATG	2	6	149862	149867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350264240
3076	NC_016047	GAA	2	6	149898	149903	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	350264240
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3078	NC_016047	GT	3	6	149983	149988	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3079	NC_016047	TTA	2	6	149989	149994	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3080	NC_016047	AGG	2	6	150017	150022	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3081	NC_016047	ATC	2	6	150104	150109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	350264241
3082	NC_016047	AAC	2	6	150124	150129	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	350264241
3083	NC_016047	A	6	6	150165	150170	100 %	0 %	0 %	0 %	350264241
3084	NC_016047	GCT	2	6	150215	150220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	350264241
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3086	NC_016047	ATT	2	6	150277	150282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	350264241
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3088	NC_016047	AC	3	6	150324	150329	50 %	0 %	0 %	50 %	350264241
3089	NC_016047	TAT	2	6	150331	150336	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	350264241
3090	NC_016047	GTG	2	6	150354	150359	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	350264241
3091	NC_016047	AAG	2	6	150416	150421	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3092	NC_016047	T	7	7	150453	150459	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3093	NC_016047	TA	3	6	150476	150481	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3094	NC_016047	GA	3	6	150482	150487	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3095	NC_016047	GAG	2	6	150507	150512	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3096	NC_016047	TCCT	2	8	150699	150706	0 %	50 %	0 %	50 %	350264242
3097	NC_016047	GAT	2	6	150830	150835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350264242
3098	NC_016047	GAA	2	6	150872	150877	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	350264242
3099	NC_016047	GA	3	6	150884	150889	50 %	0 %	50 %	0 %	350264242
3100	NC_016047	TC	3	6	150949	150954	0 %	50 %	0 %	50 %	350264242
3101	NC_016047	AG	3	6	150969	150974	50 %	0 %	50 %	0 %	350264242
3102	NC_016047	ATT	2	6	151010	151015	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	350264242
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3104	NC_016047	CA	3	6	151120	151125	50 %	0 %	0 %	50 %	350264242
3105	NC_016047	GCA	2	6	151139	151144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	350264242
3106	NC_016047	TGA	2	6	151164	151169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350264242
3107	NC_016047	GAA	2	6	151304	151309	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	350264242
3108	NC_016047	AAG	2	6	151437	151442	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3109	NC_016047	CTT	2	6	151490	151495	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3110	NC_016047	TCT	2	6	151510	151515	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3111	NC_016047	CGA	2	6	151521	151526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3112	NC_016047	GCA	2	6	151545	151550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3113	NC_016047	CAGG	2	8	151559	151566	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3114	NC_016047	A	6	6	151600	151605	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3115	NC_016047	ATT	2	6	151638	151643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3116	NC_016047	A	6	6	151696	151701	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3117	NC_016047	GA	4	8	151722	151729	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3118	NC_016047	AGA	2	6	151752	151757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3119	NC_016047	G	6	6	151789	151794	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3120	NC_016047	TGA	2	6	151854	151859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3121	NC_016047	TCA	2	6	151920	151925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3122	NC_016047	GAC	2	6	151938	151943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3123	NC_016047	AC	3	6	151954	151959	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3124	NC_016047	GGA	2	6	151965	151970	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3125	NC_016047	TGA	2	6	151986	151991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3126	NC_016047	TGGC	2	8	152066	152073	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3127	NC_016047	GCT	2	6	152173	152178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3128	NC_016047	ATG	2	6	152214	152219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350264243
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3157	NC_016047	GTAT	2	8	153822	153829	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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3229	NC_016047	AC	3	6	156533	156538	50 %	0 %	0 %	50 %	350264249
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3234	NC_016047	T	6	6	156744	156749	0 %	100 %	0 %	0 %	350264250
3235	NC_016047	ATT	2	6	156841	156846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	350264250
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3242	NC_016047	GGAGC	2	10	157133	157142	20 %	0 %	60 %	20 %	350264250
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3244	NC_016047	AAAGC	2	10	157237	157246	60 %	0 %	20 %	20 %	350264250
3245	NC_016047	ATCCA	2	10	157314	157323	40 %	20 %	0 %	40 %	350264250
3246	NC_016047	GCT	2	6	157335	157340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	350264250
3247	NC_016047	AT	3	6	157378	157383	50 %	50 %	0 %	0 %	350264250
3248	NC_016047	TATG	2	8	157474	157481	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3249	NC_016047	ATA	2	6	157484	157489	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3250	NC_016047	GAT	2	6	157525	157530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350264251
3251	NC_016047	AGA	2	6	157534	157539	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	350264251
3252	NC_016047	TTC	2	6	157578	157583	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	350264251
3253	NC_016047	GAA	2	6	157772	157777	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	350264251
3254	NC_016047	A	7	7	157811	157817	100 %	0 %	0 %	0 %	350264251
3255	NC_016047	TCTT	2	8	157845	157852	0 %	75 %	0 %	25 %	350264251
3256	NC_016047	GGC	2	6	157871	157876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	350264251
3257	NC_016047	ATG	2	6	157982	157987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350264251
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3259	NC_016047	CTT	2	6	158068	158073	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	350264251
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3266	NC_016047	ATC	2	6	158514	158519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	350264251
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3272	NC_016047	T	6	6	158679	158684	0 %	100 %	0 %	0 %	350264252
3273	NC_016047	TAA	2	6	158711	158716	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	350264252
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3276	NC_016047	T	6	6	158835	158840	0 %	100 %	0 %	0 %	350264252
3277	NC_016047	TTC	2	6	158922	158927	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	350264252
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3279	NC_016047	T	6	6	158948	158953	0 %	100 %	0 %	0 %	350264252
3280	NC_016047	TTCA	2	8	158994	159001	25 %	50 %	0 %	25 %	350264252
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3359	NC_016047	GGA	2	6	162184	162189	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3362	NC_016047	AC	3	6	162404	162409	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3363	NC_016047	CAC	2	6	162419	162424	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3364	NC_016047	AGCC	2	8	162467	162474	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3365	NC_016047	GAT	2	6	162490	162495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3366	NC_016047	CCT	2	6	162546	162551	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3367	NC_016047	GGACG	2	10	162776	162785	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
3368	NC_016047	AAGC	2	8	162812	162819	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3369	NC_016047	CAC	2	6	162851	162856	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3370	NC_016047	GGA	2	6	162936	162941	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3371	NC_016047	GCG	2	6	162970	162975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3372	NC_016047	TC	3	6	163120	163125	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3373	NC_016047	CGG	2	6	163144	163149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3374	NC_016047	GGA	2	6	163176	163181	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3375	NC_016047	AGT	2	6	163297	163302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3376	NC_016047	AGA	2	6	163378	163383	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3377	NC_016047	CACG	2	8	163507	163514	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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