MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bacillus coagulans 36D1 chromosome

Total Repeats: 73465

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_016023	AAG	2	6	46011	46016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347750486
1002	NC_016023	TCT	2	6	46027	46032	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347750486
1003	NC_016023	ATC	2	6	46044	46049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347750487
1004	NC_016023	TTC	3	9	46060	46068	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347750487
1005	NC_016023	CTTG	2	8	46113	46120	0 %	50 %	25 %	25 %	347750487
1006	NC_016023	CAAC	2	8	46161	46168	50 %	0 %	0 %	50 %	347750487
1007	NC_016023	TGGTT	2	10	46179	46188	0 %	60 %	40 %	0 %	347750487
1008	NC_016023	TTG	2	6	46239	46244	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347750487
1009	NC_016023	CGG	2	6	46257	46262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347750487
1010	NC_016023	CCT	2	6	46278	46283	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347750487
1011	NC_016023	CTT	2	6	46290	46295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347750487
1012	NC_016023	ATT	2	6	46309	46314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347750487
1013	NC_016023	TGC	2	6	46337	46342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347750487
1014	NC_016023	AAT	2	6	46347	46352	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347750487
1015	NC_016023	CAT	2	6	46369	46374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347750487
1016	NC_016023	CAC	2	6	46384	46389	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347750487
1017	NC_016023	GGCA	2	8	46394	46401	25 %	0 %	50 %	25 %	347750487
1018	NC_016023	GA	3	6	46441	46446	50 %	0 %	50 %	0 %	347750487
1019	NC_016023	GAC	2	6	46450	46455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347750487
1020	NC_016023	ATC	2	6	46475	46480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347750487
1021	NC_016023	TCAG	2	8	46508	46515	25 %	25 %	25 %	25 %	347750487
1022	NC_016023	GATT	2	8	46521	46528	25 %	50 %	25 %	0 %	347750487
1023	NC_016023	GAT	2	6	46531	46536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347750487
1024	NC_016023	TGGTC	2	10	46566	46575	0 %	40 %	40 %	20 %	347750487
1025	NC_016023	TTTTC	2	10	46593	46602	0 %	80 %	0 %	20 %	347750487
1026	NC_016023	AC	3	6	46653	46658	50 %	0 %	0 %	50 %	347750487
1027	NC_016023	CAT	2	6	46663	46668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347750487
1028	NC_016023	ATA	3	9	46697	46705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347750487
1029	NC_016023	T	7	7	46957	46963	0 %	100 %	0 %	0 %	347750487
1030	NC_016023	TCC	2	6	46967	46972	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347750487
1031	NC_016023	AGC	2	6	47003	47008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347750487
1032	NC_016023	ACCC	2	8	47051	47058	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
1033	NC_016023	C	6	6	47056	47061	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1034	NC_016023	TACA	2	8	47067	47074	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1035	NC_016023	CTGC	2	8	47090	47097	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1036	NC_016023	TGC	2	6	47114	47119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1037	NC_016023	GGC	2	6	47143	47148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1038	NC_016023	AT	3	6	47177	47182	50 %	50 %	0 %	0 %	347750488
1039	NC_016023	CAT	2	6	47206	47211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347750488
1040	NC_016023	TTTA	2	8	47212	47219	25 %	75 %	0 %	0 %	347750488
1041	NC_016023	T	6	6	47225	47230	0 %	100 %	0 %	0 %	347750488
1042	NC_016023	TTTGA	2	10	47314	47323	20 %	60 %	20 %	0 %	347750488
1043	NC_016023	T	6	6	47353	47358	0 %	100 %	0 %	0 %	347750488
1044	NC_016023	GAA	2	6	47438	47443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347750488
1045	NC_016023	TCA	2	6	47453	47458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347750488
1046	NC_016023	TTG	2	6	47478	47483	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347750488
1047	NC_016023	GAT	2	6	47506	47511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347750488
1048	NC_016023	TGA	2	6	47514	47519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347750488
1049	NC_016023	ATC	2	6	47543	47548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347750488
1050	NC_016023	ATTC	2	8	47572	47579	25 %	50 %	0 %	25 %	347750488
1051	NC_016023	CTC	2	6	47586	47591	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1052	NC_016023	TTC	2	6	47600	47605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1053	NC_016023	GAT	2	6	47697	47702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_016023	TAA	2	6	47876	47881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347750489
1055	NC_016023	GGCT	2	8	48001	48008	0 %	25 %	50 %	25 %	347750489
1056	NC_016023	TA	3	6	48044	48049	50 %	50 %	0 %	0 %	347750489
1057	NC_016023	CCG	2	6	48055	48060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347750489
1058	NC_016023	TCT	2	6	48237	48242	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347750489
1059	NC_016023	ATC	2	6	48246	48251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347750489
1060	NC_016023	GTT	2	6	48285	48290	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347750489
1061	NC_016023	CTG	2	6	48414	48419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347750489
1062	NC_016023	T	6	6	48486	48491	0 %	100 %	0 %	0 %	347750489
1063	NC_016023	TGT	2	6	48518	48523	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347750489
1064	NC_016023	CCTT	2	8	48651	48658	0 %	50 %	0 %	50 %	347750490
1065	NC_016023	CCGG	2	8	48664	48671	0 %	0 %	50 %	50 %	347750490
1066	NC_016023	ATG	2	6	48682	48687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347750490
1067	NC_016023	T	6	6	48757	48762	0 %	100 %	0 %	0 %	347750490
1068	NC_016023	CAT	2	6	48782	48787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347750490
1069	NC_016023	TTTGC	2	10	48818	48827	0 %	60 %	20 %	20 %	347750490
1070	NC_016023	AAT	2	6	48962	48967	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347750490
1071	NC_016023	TTC	2	6	48988	48993	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347750490
1072	NC_016023	AATGG	2	10	49048	49057	40 %	20 %	40 %	0 %	347750490
1073	NC_016023	TCT	2	6	49194	49199	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347750491
1074	NC_016023	CAT	2	6	49207	49212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347750491
1075	NC_016023	T	7	7	49226	49232	0 %	100 %	0 %	0 %	347750491
1076	NC_016023	TGC	2	6	49259	49264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347750491
1077	NC_016023	GAA	2	6	49302	49307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347750491
1078	NC_016023	CTG	2	6	49414	49419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347750491
1079	NC_016023	T	6	6	49426	49431	0 %	100 %	0 %	0 %	347750491
1080	NC_016023	AT	3	6	49452	49457	50 %	50 %	0 %	0 %	347750491
1081	NC_016023	TGC	2	6	49473	49478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347750491
1082	NC_016023	TGC	2	6	49482	49487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347750491
1083	NC_016023	GTC	2	6	49577	49582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347750491
1084	NC_016023	CAAT	2	8	49618	49625	50 %	25 %	0 %	25 %	347750491
1085	NC_016023	A	6	6	49632	49637	100 %	0 %	0 %	0 %	347750491
1086	NC_016023	CAG	2	6	49700	49705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347750491
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1088	NC_016023	AAGTCA	2	12	49723	49734	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	347750491
1089	NC_016023	ATCA	2	8	49753	49760	50 %	25 %	0 %	25 %	347750492
1090	NC_016023	TGC	2	6	49817	49822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347750492
1091	NC_016023	GTT	2	6	49830	49835	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347750492
1092	NC_016023	CTG	2	6	49921	49926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347750492
1093	NC_016023	GCT	2	6	49947	49952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347750492
1094	NC_016023	TGC	2	6	50005	50010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347750492
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1097	NC_016023	GCT	2	6	50261	50266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347750492
1098	NC_016023	GCT	2	6	50275	50280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347750492
1099	NC_016023	CTT	2	6	50297	50302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347750492
1100	NC_016023	CTG	2	6	50365	50370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347750492
1101	NC_016023	GCT	2	6	50404	50409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347750492
1102	NC_016023	TCT	2	6	50411	50416	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347750492
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1104	NC_016023	TCA	2	6	50570	50575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347750492
1105	NC_016023	GCTG	2	8	50598	50605	0 %	25 %	50 %	25 %	347750492
1106	NC_016023	GCT	2	6	50720	50725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347750492
1107	NC_016023	CTG	2	6	50814	50819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347750492
1108	NC_016023	TTG	2	6	50888	50893	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347750492
1109	NC_016023	GGT	2	6	50917	50922	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347750492
1110	NC_016023	GCA	2	6	50933	50938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347750492
1111	NC_016023	CTT	2	6	50948	50953	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347750492
1112	NC_016023	GAA	2	6	51117	51122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347750492
1113	NC_016023	T	6	6	51130	51135	0 %	100 %	0 %	0 %	347750492
1114	NC_016023	CCG	2	6	51158	51163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347750492
1115	NC_016023	TCT	2	6	51194	51199	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347750492
1116	NC_016023	GCG	2	6	51222	51227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347750492
1117	NC_016023	CTG	2	6	51261	51266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347750492
1118	NC_016023	T	6	6	51291	51296	0 %	100 %	0 %	0 %	347750492
1119	NC_016023	CAT	2	6	51328	51333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347750492
1120	NC_016023	CTG	3	9	51342	51350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347750492
1121	NC_016023	CCTG	2	8	51384	51391	0 %	25 %	25 %	50 %	347750492
1122	NC_016023	TTA	2	6	51423	51428	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347750492
1123	NC_016023	ATG	2	6	51470	51475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347750492
1124	NC_016023	T	8	8	51524	51531	0 %	100 %	0 %	0 %	347750492
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1254	NC_016023	A	6	6	57667	57672	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1255	NC_016023	TCA	2	6	57684	57689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1256	NC_016023	TGCATC	2	12	57809	57820	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	347750499
1257	NC_016023	CTG	2	6	57967	57972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347750499
1258	NC_016023	GTTCA	2	10	57976	57985	20 %	40 %	20 %	20 %	347750499
1259	NC_016023	CAG	2	6	58000	58005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347750499
1260	NC_016023	GCG	2	6	58040	58045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347750499
1261	NC_016023	TTGG	2	8	58098	58105	0 %	50 %	50 %	0 %	347750499
1262	NC_016023	CAT	2	6	58113	58118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347750499
1263	NC_016023	CCT	2	6	58122	58127	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1264	NC_016023	TCA	2	6	58173	58178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347750500
1265	NC_016023	ATC	2	6	58309	58314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347750500
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1268	NC_016023	CCT	2	6	58430	58435	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347750500
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1277	NC_016023	TAA	2	6	58671	58676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347750501
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1281	NC_016023	TCC	2	6	58842	58847	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347750501
1282	NC_016023	ATGC	2	8	58948	58955	25 %	25 %	25 %	25 %	347750501
1283	NC_016023	AG	3	6	58979	58984	50 %	0 %	50 %	0 %	347750501
1284	NC_016023	TCA	2	6	58987	58992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347750501
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1286	NC_016023	T	6	6	59053	59058	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1287	NC_016023	ATT	2	6	59065	59070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1288	NC_016023	A	7	7	59108	59114	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1289	NC_016023	T	7	7	59115	59121	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1290	NC_016023	TAG	2	6	59124	59129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1291	NC_016023	TA	3	6	59277	59282	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1292	NC_016023	TAAAT	2	10	59306	59315	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1293	NC_016023	A	8	8	59322	59329	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1294	NC_016023	T	6	6	59347	59352	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1295	NC_016023	GTTA	2	8	59379	59386	25 %	50 %	25 %	0 %	347750502
1296	NC_016023	CCTT	2	8	59564	59571	0 %	50 %	0 %	50 %	347750502
1297	NC_016023	TTC	2	6	59581	59586	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347750502
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1311	NC_016023	GATT	2	8	60174	60181	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1312	NC_016023	AG	3	6	60223	60228	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1313	NC_016023	ATG	2	6	60410	60415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347750503
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1363	NC_016023	A	6	6	62974	62979	100 %	0 %	0 %	0 %	347750505
1364	NC_016023	A	7	7	63114	63120	100 %	0 %	0 %	0 %	347750505
1365	NC_016023	TCC	2	6	63121	63126	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347750505
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1369	NC_016023	CCG	2	6	63426	63431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347750506
1370	NC_016023	CGGAT	2	10	63494	63503	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1371	NC_016023	T	6	6	63640	63645	0 %	100 %	0 %	0 %	347750507
1372	NC_016023	ACA	2	6	63671	63676	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347750507
1373	NC_016023	GCT	2	6	63677	63682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347750507
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1375	NC_016023	GCC	2	6	63754	63759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347750507
1376	NC_016023	GCC	2	6	63773	63778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347750507
1377	NC_016023	CA	3	6	63834	63839	50 %	0 %	0 %	50 %	347750508
1378	NC_016023	T	6	6	63855	63860	0 %	100 %	0 %	0 %	347750508
1379	NC_016023	T	7	7	63865	63871	0 %	100 %	0 %	0 %	347750508
1380	NC_016023	CGC	2	6	63884	63889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347750508
1381	NC_016023	A	6	6	63962	63967	100 %	0 %	0 %	0 %	347750508
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1383	NC_016023	TGC	2	6	64076	64081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347750508
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