MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Borrelia bissettii DN127 plasmid lp25

Total Repeats: 721

Go To Repeat Summary Page

< Previous 12Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015922	AGG	2	6	16339	16344	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	343128181
502	NC_015922	ATT	2	6	16353	16358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343128181
503	NC_015922	TTTAA	2	10	16366	16375	40 %	60 %	0 %	0 %	343128181
504	NC_015922	A	7	7	16414	16420	100 %	0 %	0 %	0 %	343128181
505	NC_015922	TAA	2	6	16437	16442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343128181
506	NC_015922	A	7	7	16522	16528	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_015922	AATA	2	8	16547	16554	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
508	NC_015922	T	6	6	16562	16567	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
509	NC_015922	T	6	6	16573	16578	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_015922	A	6	6	16591	16596	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_015922	TG	3	6	16628	16633	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
512	NC_015922	ATT	2	6	16643	16648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
513	NC_015922	A	7	7	16675	16681	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_015922	AT	3	6	16693	16698	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_015922	TAA	2	6	16702	16707	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NC_015922	TAAAAA	2	12	16718	16729	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_015922	A	6	6	16732	16737	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_015922	A	10	10	16752	16761	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
519	NC_015922	TAA	2	6	16766	16771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_015922	A	6	6	16781	16786	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_015922	A	7	7	16792	16798	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_015922	TAA	2	6	16832	16837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343128182
523	NC_015922	TGA	2	6	16842	16847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343128182
524	NC_015922	T	6	6	16851	16856	0 %	100 %	0 %	0 %	343128182
525	NC_015922	TAAA	2	8	16919	16926	75 %	25 %	0 %	0 %	343128182
526	NC_015922	TA	3	6	16930	16935	50 %	50 %	0 %	0 %	343128182
527	NC_015922	TAAG	2	8	16999	17006	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
528	NC_015922	AT	3	6	17032	17037	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_015922	A	6	6	17044	17049	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_015922	TTA	2	6	17059	17064	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_015922	AATT	2	8	17093	17100	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_015922	A	6	6	17137	17142	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_015922	TAA	2	6	17146	17151	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
534	NC_015922	ATCT	2	8	17196	17203	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
535	NC_015922	A	6	6	17221	17226	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_015922	TAT	2	6	17227	17232	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_015922	A	6	6	17278	17283	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_015922	T	7	7	17388	17394	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
539	NC_015922	AAG	2	6	17403	17408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
540	NC_015922	A	6	6	17420	17425	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_015922	TTA	2	6	17439	17444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_015922	TAT	2	6	17509	17514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343128183
543	NC_015922	T	8	8	17514	17521	0 %	100 %	0 %	0 %	343128183
544	NC_015922	A	6	6	17682	17687	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_015922	TTTA	2	8	17699	17706	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_015922	AGT	2	6	17710	17715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
547	NC_015922	A	7	7	17736	17742	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_015922	TAAAA	2	10	17752	17761	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
549	NC_015922	GAT	2	6	17769	17774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
550	NC_015922	TAAA	2	8	17778	17785	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_015922	TAT	2	6	17792	17797	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_015922	CAA	2	6	17825	17830	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
553	NC_015922	CTT	2	6	17881	17886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
554	NC_015922	TAT	2	6	17898	17903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_015922	T	6	6	17932	17937	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_015922	AT	3	6	17938	17943	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_015922	AAT	2	6	17976	17981	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_015922	ATA	2	6	17991	17996	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
559	NC_015922	TTA	2	6	18019	18024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343128184
560	NC_015922	AAAATA	2	12	18028	18039	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	343128184
561	NC_015922	ATTTT	2	10	18044	18053	20 %	80 %	0 %	0 %	343128184
562	NC_015922	A	7	7	18057	18063	100 %	0 %	0 %	0 %	343128184
563	NC_015922	ATT	2	6	18078	18083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343128184
564	NC_015922	TAA	2	6	18107	18112	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343128184
565	NC_015922	TAA	2	6	18126	18131	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343128184
566	NC_015922	A	6	6	18195	18200	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_015922	TTATTT	2	12	18304	18315	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_015922	A	7	7	18388	18394	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_015922	A	8	8	18406	18413	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_015922	TTA	2	6	18414	18419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_015922	TAA	2	6	18425	18430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_015922	TAAAT	2	10	18440	18449	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_015922	GA	3	6	18479	18484	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
574	NC_015922	AAG	2	6	18487	18492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
575	NC_015922	A	6	6	18506	18511	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
576	NC_015922	ATA	3	9	18515	18523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
577	NC_015922	TAGAA	2	10	18550	18559	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
578	NC_015922	ATA	2	6	18590	18595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
579	NC_015922	A	6	6	18601	18606	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
580	NC_015922	GT	4	8	18631	18638	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
581	NC_015922	TTA	2	6	18673	18678	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
582	NC_015922	GTT	2	6	18696	18701	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
583	NC_015922	T	6	6	18756	18761	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_015922	TAA	2	6	18772	18777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
585	NC_015922	A	6	6	18815	18820	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
586	NC_015922	CTTT	2	8	18830	18837	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
587	NC_015922	AAG	2	6	18842	18847	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
588	NC_015922	G	7	7	18926	18932	0 %	0 %	100 %	0 %	343128185
589	NC_015922	T	6	6	18938	18943	0 %	100 %	0 %	0 %	343128185
590	NC_015922	T	7	7	18952	18958	0 %	100 %	0 %	0 %	343128185
591	NC_015922	TA	3	6	18999	19004	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
592	NC_015922	AT	3	6	19023	19028	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_015922	TGG	2	6	19039	19044	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
594	NC_015922	TAA	2	6	19086	19091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
595	NC_015922	TA	3	6	19106	19111	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
596	NC_015922	AT	3	6	19120	19125	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
597	NC_015922	A	6	6	19146	19151	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
598	NC_015922	AGA	2	6	19187	19192	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
599	NC_015922	AATT	2	8	19204	19211	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
600	NC_015922	TTG	2	6	19266	19271	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
601	NC_015922	AGA	2	6	19315	19320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
602	NC_015922	TAAAA	2	10	19344	19353	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
603	NC_015922	A	6	6	19357	19362	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
604	NC_015922	AGA	2	6	19380	19385	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
605	NC_015922	AGA	2	6	19426	19431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
606	NC_015922	A	6	6	19431	19436	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
607	NC_015922	AGAA	2	8	19443	19450	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
608	NC_015922	A	6	6	19449	19454	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_015922	TTTTA	2	10	19456	19465	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_015922	TTA	2	6	19482	19487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_015922	AGCA	2	8	19497	19504	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
612	NC_015922	TA	3	6	19557	19562	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
613	NC_015922	AAC	2	6	19580	19585	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
614	NC_015922	ATT	2	6	19600	19605	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_015922	ATTT	2	8	19630	19637	25 %	75 %	0 %	0 %	343128186
616	NC_015922	ACA	2	6	19650	19655	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	343128186
617	NC_015922	T	7	7	19701	19707	0 %	100 %	0 %	0 %	343128186
618	NC_015922	ATT	2	6	19708	19713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343128186
619	NC_015922	T	7	7	19756	19762	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
620	NC_015922	TAA	2	6	19836	19841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
621	NC_015922	TAG	3	9	19865	19873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
622	NC_015922	TAA	2	6	19913	19918	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_015922	TAAA	2	8	19943	19950	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
624	NC_015922	TAA	2	6	19953	19958	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
625	NC_015922	AC	3	6	19991	19996	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
626	NC_015922	T	7	7	20022	20028	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
627	NC_015922	TTG	2	6	20032	20037	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
628	NC_015922	TTA	2	6	20058	20063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
629	NC_015922	TTA	2	6	20135	20140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
630	NC_015922	TA	3	6	20161	20166	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
631	NC_015922	TAA	2	6	20244	20249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
632	NC_015922	TAA	3	9	20305	20313	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
633	NC_015922	TAA	3	9	20383	20391	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
634	NC_015922	AAT	2	6	20393	20398	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
635	NC_015922	T	6	6	20408	20413	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
636	NC_015922	ATA	2	6	20414	20419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
637	NC_015922	AT	3	6	20459	20464	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
638	NC_015922	AATT	2	8	20468	20475	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
639	NC_015922	AAT	2	6	20491	20496	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
640	NC_015922	AGAT	2	8	20512	20519	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
641	NC_015922	A	6	6	20534	20539	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
642	NC_015922	TAA	2	6	20540	20545	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
643	NC_015922	AT	5	10	20549	20558	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
644	NC_015922	A	7	7	20579	20585	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
645	NC_015922	A	7	7	20607	20613	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
646	NC_015922	TGA	3	9	20625	20633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
647	NC_015922	TTA	2	6	20645	20650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
648	NC_015922	CAT	2	6	20695	20700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
649	NC_015922	ACAA	2	8	20702	20709	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
650	NC_015922	TAC	2	6	20747	20752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
651	NC_015922	TGA	2	6	20767	20772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
652	NC_015922	TA	3	6	20777	20782	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
653	NC_015922	AAGA	2	8	20803	20810	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
654	NC_015922	A	6	6	20810	20815	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
655	NC_015922	GAT	2	6	20818	20823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
656	NC_015922	GCA	2	6	20825	20830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
657	NC_015922	TTGCTA	2	12	20864	20875	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
658	NC_015922	A	7	7	20901	20907	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
659	NC_015922	AGAA	2	8	20949	20956	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
660	NC_015922	A	6	6	20955	20960	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
661	NC_015922	A	6	6	20975	20980	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
662	NC_015922	ATT	2	6	21028	21033	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
663	NC_015922	T	6	6	21032	21037	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
664	NC_015922	T	7	7	21080	21086	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
665	NC_015922	AAT	2	6	21100	21105	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
666	NC_015922	AGA	2	6	21202	21207	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
667	NC_015922	TTA	2	6	21257	21262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
668	NC_015922	TGTTT	2	10	21265	21274	0 %	80 %	20 %	0 %	343128187
669	NC_015922	TA	3	6	21311	21316	50 %	50 %	0 %	0 %	343128187
670	NC_015922	AGA	2	6	21319	21324	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343128187
671	NC_015922	TAA	2	6	21345	21350	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343128187
672	NC_015922	TTA	2	6	21381	21386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343128187
673	NC_015922	A	7	7	21401	21407	100 %	0 %	0 %	0 %	343128187
674	NC_015922	ATA	2	6	21540	21545	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
675	NC_015922	TAA	2	6	21567	21572	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
676	NC_015922	A	6	6	21571	21576	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
677	NC_015922	TAA	2	6	21591	21596	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
678	NC_015922	ATA	2	6	21646	21651	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
679	NC_015922	T	6	6	21673	21678	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
680	NC_015922	AGA	2	6	21709	21714	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343128188
681	NC_015922	TTATT	2	10	21727	21736	20 %	80 %	0 %	0 %	343128188
682	NC_015922	ATT	2	6	21745	21750	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343128188
683	NC_015922	A	7	7	21758	21764	100 %	0 %	0 %	0 %	343128188
684	NC_015922	TAAT	2	8	21781	21788	50 %	50 %	0 %	0 %	343128188
685	NC_015922	A	6	6	21871	21876	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
686	NC_015922	ATA	2	6	21934	21939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343128189
687	NC_015922	TTG	2	6	21955	21960	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	343128189
688	NC_015922	T	9	9	21970	21978	0 %	100 %	0 %	0 %	343128189
689	NC_015922	TA	3	6	22043	22048	50 %	50 %	0 %	0 %	343128189
690	NC_015922	TAA	2	6	22061	22066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343128189
691	NC_015922	ATA	2	6	22105	22110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343128189
692	NC_015922	AGG	2	6	22239	22244	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	343128189
693	NC_015922	T	6	6	22246	22251	0 %	100 %	0 %	0 %	343128189
694	NC_015922	TTGA	2	8	22255	22262	25 %	50 %	25 %	0 %	343128189
695	NC_015922	TC	3	6	22346	22351	0 %	50 %	0 %	50 %	343128189
696	NC_015922	TAT	2	6	22354	22359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343128189
697	NC_015922	ATG	2	6	22375	22380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343128189
698	NC_015922	TTC	3	9	22430	22438	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343128189
699	NC_015922	T	8	8	22442	22449	0 %	100 %	0 %	0 %	343128189
700	NC_015922	T	7	7	22454	22460	0 %	100 %	0 %	0 %	343128189
701	NC_015922	ATC	2	6	22496	22501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343128189
702	NC_015922	T	6	6	22512	22517	0 %	100 %	0 %	0 %	343128189
703	NC_015922	TTA	2	6	22524	22529	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343128189
704	NC_015922	T	6	6	22534	22539	0 %	100 %	0 %	0 %	343128189
705	NC_015922	T	6	6	22553	22558	0 %	100 %	0 %	0 %	343128189
706	NC_015922	ATT	2	6	22562	22567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343128189
707	NC_015922	AAAT	2	8	22612	22619	75 %	25 %	0 %	0 %	343128189
708	NC_015922	TATAA	2	10	22662	22671	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
709	NC_015922	AAT	3	9	22675	22683	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
710	NC_015922	AAT	2	6	22691	22696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
711	NC_015922	TAA	3	9	22711	22719	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
712	NC_015922	TAT	2	6	22729	22734	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
713	NC_015922	T	6	6	22758	22763	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
714	NC_015922	TTG	2	6	22783	22788	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
715	NC_015922	GAG	2	6	22805	22810	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
716	NC_015922	GAATG	2	10	22811	22820	40 %	20 %	40 %	0 %	343128190
717	NC_015922	GA	3	6	22852	22857	50 %	0 %	50 %	0 %	343128190
718	NC_015922	GTA	2	6	22905	22910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343128190
719	NC_015922	TAA	2	6	22912	22917	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343128190
720	NC_015922	ATT	2	6	22944	22949	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343128190
721	NC_015922	AAT	2	6	23020	23025	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343128190

< Previous 12Next >