MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Borrelia bissettii DN127 plasmid lp54

Total Repeats: 74

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015919	ATTTA	2	10	923	932	40 %	60 %	0 %	0 %	343127254
2	NC_015919	ATTTA	2	10	1214	1223	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015919	AGCAA	2	10	1653	1662	60 %	0 %	20 %	20 %	343127255
4	NC_015919	GGCAT	2	10	2503	2512	20 %	20 %	40 %	20 %	343127256
5	NC_015919	TAAAT	2	10	4299	4308	60 %	40 %	0 %	0 %	343127257
6	NC_015919	TAAAA	2	10	4686	4695	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015919	TTAAA	2	10	4935	4944	60 %	40 %	0 %	0 %	343127258
8	NC_015919	AAGAA	2	10	5130	5139	80 %	0 %	20 %	0 %	343127258
9	NC_015919	AATAA	2	10	5141	5150	80 %	20 %	0 %	0 %	343127258
10	NC_015919	AAATA	2	10	5306	5315	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015919	CAATT	2	10	5784	5793	40 %	40 %	0 %	20 %	343127260
12	NC_015919	CAAAA	2	10	7870	7879	80 %	0 %	0 %	20 %	343127262
13	NC_015919	AAGAG	2	10	8772	8781	60 %	0 %	40 %	0 %	343127264
14	NC_015919	AAACT	2	10	9381	9390	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_015919	ATTTT	2	10	9408	9417	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015919	TGAAA	2	10	9611	9620	60 %	20 %	20 %	0 %	343127266
17	NC_015919	AGTAA	2	10	10662	10671	60 %	20 %	20 %	0 %	343127267
18	NC_015919	TACTT	2	10	11733	11742	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_015919	AACAA	2	10	12321	12330	80 %	0 %	0 %	20 %	343127268
20	NC_015919	CAAAA	2	10	12359	12368	80 %	0 %	0 %	20 %	343127268
21	NC_015919	TAAAA	2	10	12719	12728	80 %	20 %	0 %	0 %	343127268
22	NC_015919	TCCAT	2	10	13932	13941	20 %	40 %	0 %	40 %	343127270
23	NC_015919	TTAAA	2	10	13951	13960	60 %	40 %	0 %	0 %	343127270
24	NC_015919	GATTT	2	10	14290	14299	20 %	60 %	20 %	0 %	343127270
25	NC_015919	AAAAT	2	10	14941	14950	80 %	20 %	0 %	0 %	343127271
26	NC_015919	TTAAA	2	10	15096	15105	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015919	GGTTG	2	10	16026	16035	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015919	TTTCT	2	10	16113	16122	0 %	80 %	0 %	20 %	343127274
29	NC_015919	AAAAT	2	10	16744	16753	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015919	TTTTG	2	10	16836	16845	0 %	80 %	20 %	0 %	343127275
31	NC_015919	ATTTT	2	10	17217	17226	20 %	80 %	0 %	0 %	343127275
32	NC_015919	ATAAA	3	15	17404	17418	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015919	ATTTT	2	10	17522	17531	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015919	TATTT	2	10	17881	17890	20 %	80 %	0 %	0 %	343127277
35	NC_015919	AATGA	2	10	19618	19627	60 %	20 %	20 %	0 %	343127279
36	NC_015919	CAAAA	2	10	20067	20076	80 %	0 %	0 %	20 %	343127279
37	NC_015919	TAATT	2	10	20447	20456	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015919	AATTA	2	10	23151	23160	60 %	40 %	0 %	0 %	343127283
39	NC_015919	AAAGA	2	10	24947	24956	80 %	0 %	20 %	0 %	343127286
40	NC_015919	TTAAT	2	10	25198	25207	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015919	CCAAA	2	10	28547	28556	60 %	0 %	0 %	40 %	343127290
42	NC_015919	AAATT	2	10	29818	29827	60 %	40 %	0 %	0 %	343127293
43	NC_015919	TTTTA	2	10	30348	30357	20 %	80 %	0 %	0 %	343127294
44	NC_015919	TAATG	2	10	31899	31908	40 %	40 %	20 %	0 %	343127296
45	NC_015919	AAATA	2	10	33830	33839	80 %	20 %	0 %	0 %	343127299
46	NC_015919	AAATC	2	10	34463	34472	60 %	20 %	0 %	20 %	343127300
47	NC_015919	TTAAT	2	10	35911	35920	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015919	TTTTC	2	10	37486	37495	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
49	NC_015919	TTTAT	2	10	38973	38982	20 %	80 %	0 %	0 %	343127305
50	NC_015919	CTTTT	2	10	39238	39247	0 %	80 %	0 %	20 %	343127306
51	NC_015919	TAATT	2	10	39510	39519	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015919	TTTAA	2	10	40678	40687	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015919	TAATA	2	10	41537	41546	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015919	AGATG	2	10	41644	41653	40 %	20 %	40 %	0 %	343127309
55	NC_015919	TTAAT	2	10	41802	41811	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015919	TCTTT	2	10	42875	42884	0 %	80 %	0 %	20 %	343127311
57	NC_015919	TGTAT	2	10	43280	43289	20 %	60 %	20 %	0 %	343127312
58	NC_015919	GTTTT	2	10	43859	43868	0 %	80 %	20 %	0 %	343127312
59	NC_015919	TTTTA	2	10	47214	47223	20 %	80 %	0 %	0 %	343127315
60	NC_015919	GTTTA	2	10	47568	47577	20 %	60 %	20 %	0 %	343127315
61	NC_015919	TTCTT	2	10	47753	47762	0 %	80 %	0 %	20 %	343127316
62	NC_015919	ATAGT	2	10	47880	47889	40 %	40 %	20 %	0 %	343127317
63	NC_015919	GTTTG	2	10	48013	48022	0 %	60 %	40 %	0 %	343127317
64	NC_015919	ATTAA	2	10	48580	48589	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015919	TAGAT	2	10	48600	48609	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015919	CGTTT	2	10	48818	48827	0 %	60 %	20 %	20 %	343127318
67	NC_015919	TTTGC	2	10	48906	48915	0 %	60 %	20 %	20 %	343127318
68	NC_015919	GTTTA	2	10	49478	49487	20 %	60 %	20 %	0 %	343127318
69	NC_015919	CTTTT	2	10	49929	49938	0 %	80 %	0 %	20 %	343127319
70	NC_015919	TTTGA	2	10	50426	50435	20 %	60 %	20 %	0 %	343127319
71	NC_015919	AGTTT	2	10	50731	50740	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015919	ATTTT	2	10	52287	52296	20 %	80 %	0 %	0 %	343127321
73	NC_015919	TAAAA	2	10	52869	52878	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015919	AAAAG	2	10	54423	54432	80 %	0 %	20 %	0 %	343127323

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.