MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Borrelia bissettii DN127 plasmid lp54

Total Repeats: 178

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015919	AAAT	2	8	316	323	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015919	CTTT	2	8	383	390	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_015919	TAAT	2	8	500	507	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015919	AAAC	2	8	619	626	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_015919	ATTT	2	8	853	860	25 %	75 %	0 %	0 %	343127254
6	NC_015919	ATAC	2	8	995	1002	50 %	25 %	0 %	25 %	343127254
7	NC_015919	AGCA	2	8	1016	1023	50 %	0 %	25 %	25 %	343127254
8	NC_015919	AAAT	2	8	1231	1238	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015919	TAAT	2	8	1473	1480	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015919	AGCC	2	8	1582	1589	25 %	0 %	25 %	50 %	343127255
11	NC_015919	GAAA	2	8	1898	1905	75 %	0 %	25 %	0 %	343127255
12	NC_015919	TAAT	2	8	2040	2047	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015919	AAGA	2	8	2513	2520	75 %	0 %	25 %	0 %	343127256
14	NC_015919	CAAA	2	8	2597	2604	75 %	0 %	0 %	25 %	343127256
15	NC_015919	ATTT	2	8	2705	2712	25 %	75 %	0 %	0 %	343127256
16	NC_015919	TCAA	2	8	3662	3669	50 %	25 %	0 %	25 %	343127257
17	NC_015919	ATCA	2	8	3724	3731	50 %	25 %	0 %	25 %	343127257
18	NC_015919	CCAC	2	8	3796	3803	25 %	0 %	0 %	75 %	343127257
19	NC_015919	TAAA	2	8	4331	4338	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015919	TACA	2	8	4353	4360	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_015919	TAAA	2	8	4462	4469	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015919	AACA	2	8	4630	4637	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_015919	AGCA	2	8	4906	4913	50 %	0 %	25 %	25 %	343127258
24	NC_015919	TAAA	2	8	5218	5225	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015919	ACAA	2	8	5828	5835	75 %	0 %	0 %	25 %	343127260
26	NC_015919	GCAA	2	8	6096	6103	50 %	0 %	25 %	25 %	343127260
27	NC_015919	AAAC	2	8	6162	6169	75 %	0 %	0 %	25 %	343127260
28	NC_015919	AGGA	2	8	7085	7092	50 %	0 %	50 %	0 %	343127261
29	NC_015919	CAAA	2	8	7634	7641	75 %	0 %	0 %	25 %	343127262
30	NC_015919	CAAA	2	8	7824	7831	75 %	0 %	0 %	25 %	343127262
31	NC_015919	TTAC	2	8	8067	8074	25 %	50 %	0 %	25 %	343127262
32	NC_015919	ATAA	2	8	8292	8299	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015919	ATAA	2	8	8468	8475	75 %	25 %	0 %	0 %	343127263
34	NC_015919	ATCA	2	8	9169	9176	50 %	25 %	0 %	25 %	343127265
35	NC_015919	AAAC	2	8	9177	9184	75 %	0 %	0 %	25 %	343127265
36	NC_015919	TTAT	2	8	9436	9443	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015919	TATT	2	8	9513	9520	25 %	75 %	0 %	0 %	343127266
38	NC_015919	TAAG	2	8	10063	10070	50 %	25 %	25 %	0 %	343127266
39	NC_015919	CAAG	2	8	10450	10457	50 %	0 %	25 %	25 %	343127267
40	NC_015919	AAAC	2	8	10473	10480	75 %	0 %	0 %	25 %	343127267
41	NC_015919	TGAA	2	8	11514	11521	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015919	ATAA	3	12	11524	11535	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015919	TAAA	2	8	11589	11596	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015919	ACTT	2	8	11662	11669	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_015919	ATTA	2	8	11760	11767	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015919	GAAA	2	8	11976	11983	75 %	0 %	25 %	0 %	343127268
47	NC_015919	AAAT	2	8	12217	12224	75 %	25 %	0 %	0 %	343127268
48	NC_015919	AGAA	2	8	13011	13018	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015919	TCAA	2	8	13713	13720	50 %	25 %	0 %	25 %	343127270
50	NC_015919	TAAA	2	8	14263	14270	75 %	25 %	0 %	0 %	343127270
51	NC_015919	TAAA	2	8	14347	14354	75 %	25 %	0 %	0 %	343127270
52	NC_015919	ATAA	2	8	14414	14421	75 %	25 %	0 %	0 %	343127271
53	NC_015919	AAAG	2	8	14744	14751	75 %	0 %	25 %	0 %	343127271
54	NC_015919	CCAA	2	8	14769	14776	50 %	0 %	0 %	50 %	343127271
55	NC_015919	CTTT	2	8	14857	14864	0 %	75 %	0 %	25 %	343127271
56	NC_015919	ATTT	2	8	14951	14958	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015919	AAAG	2	8	15068	15075	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015919	TTAA	2	8	15257	15264	50 %	50 %	0 %	0 %	343127272
59	NC_015919	TAAA	2	8	15369	15376	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015919	TATT	2	8	15394	15401	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015919	GAAA	2	8	15817	15824	75 %	0 %	25 %	0 %	343127273
62	NC_015919	AGTT	2	8	16605	16612	25 %	50 %	25 %	0 %	343127274
63	NC_015919	ATTT	2	8	16786	16793	25 %	75 %	0 %	0 %	343127275
64	NC_015919	TTTA	2	8	17363	17370	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015919	ATTT	2	8	17625	17632	25 %	75 %	0 %	0 %	343127276
66	NC_015919	ATAA	2	8	17643	17650	75 %	25 %	0 %	0 %	343127276
67	NC_015919	TGTT	2	8	17975	17982	0 %	75 %	25 %	0 %	343127277
68	NC_015919	ATTT	2	8	18108	18115	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015919	TTAA	2	8	18150	18157	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015919	TTAA	2	8	18206	18213	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015919	AAAG	2	8	18703	18710	75 %	0 %	25 %	0 %	343127278
72	NC_015919	TCAA	2	8	19631	19638	50 %	25 %	0 %	25 %	343127279
73	NC_015919	GCAA	2	8	19945	19952	50 %	0 %	25 %	25 %	343127279
74	NC_015919	TTTG	2	8	19983	19990	0 %	75 %	25 %	0 %	343127279
75	NC_015919	TAAA	2	8	20301	20308	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015919	AATG	2	8	20490	20497	50 %	25 %	25 %	0 %	343127280
77	NC_015919	CAAG	2	8	20547	20554	50 %	0 %	25 %	25 %	343127280
78	NC_015919	AGAA	2	8	20563	20570	75 %	0 %	25 %	0 %	343127280
79	NC_015919	ATGT	2	8	21037	21044	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015919	CTTT	2	8	21239	21246	0 %	75 %	0 %	25 %	343127282
81	NC_015919	TTGT	2	8	21772	21779	0 %	75 %	25 %	0 %	343127283
82	NC_015919	ATTT	2	8	22730	22737	25 %	75 %	0 %	0 %	343127283
83	NC_015919	GTTT	2	8	23201	23208	0 %	75 %	25 %	0 %	343127283
84	NC_015919	TTTG	2	8	23396	23403	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015919	TAAA	2	8	23440	23447	75 %	25 %	0 %	0 %	343127284
86	NC_015919	TGTT	2	8	24157	24164	0 %	75 %	25 %	0 %	343127285
87	NC_015919	TGAG	2	8	24502	24509	25 %	25 %	50 %	0 %	343127286
88	NC_015919	TAAA	2	8	24619	24626	75 %	25 %	0 %	0 %	343127286
89	NC_015919	GATT	2	8	24875	24882	25 %	50 %	25 %	0 %	343127286
90	NC_015919	TTTC	2	8	24960	24967	0 %	75 %	0 %	25 %	343127286
91	NC_015919	TAAT	2	8	25297	25304	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015919	TAAT	2	8	25407	25414	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015919	GCTT	2	8	25621	25628	0 %	50 %	25 %	25 %	343127287
94	NC_015919	GAAA	2	8	25643	25650	75 %	0 %	25 %	0 %	343127287
95	NC_015919	ATTT	2	8	26028	26035	25 %	75 %	0 %	0 %	343127287
96	NC_015919	CAAA	2	8	26194	26201	75 %	0 %	0 %	25 %	343127287
97	NC_015919	ATAA	2	8	26906	26913	75 %	25 %	0 %	0 %	343127288
98	NC_015919	GAAT	2	8	27280	27287	50 %	25 %	25 %	0 %	343127288
99	NC_015919	TTAG	2	8	27324	27331	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015919	TTTG	2	8	27338	27345	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015919	ATTA	2	8	28310	28317	50 %	50 %	0 %	0 %	343127290
102	NC_015919	GGGC	2	8	28459	28466	0 %	0 %	75 %	25 %	343127290
103	NC_015919	GAAA	2	8	28640	28647	75 %	0 %	25 %	0 %	343127290
104	NC_015919	TGTT	2	8	29214	29221	0 %	75 %	25 %	0 %	343127291
105	NC_015919	CAAA	2	8	29947	29954	75 %	0 %	0 %	25 %	343127293
106	NC_015919	ATGC	2	8	30547	30554	25 %	25 %	25 %	25 %	343127294
107	NC_015919	TAAA	2	8	30700	30707	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015919	ATTA	2	8	30797	30804	50 %	50 %	0 %	0 %	343127295
109	NC_015919	AGCA	2	8	30841	30848	50 %	0 %	25 %	25 %	343127295
110	NC_015919	ATCA	2	8	31095	31102	50 %	25 %	0 %	25 %	343127295
111	NC_015919	CAAG	2	8	31289	31296	50 %	0 %	25 %	25 %	343127295
112	NC_015919	TGAA	2	8	31407	31414	50 %	25 %	25 %	0 %	343127295
113	NC_015919	AGCA	2	8	31914	31921	50 %	0 %	25 %	25 %	343127296
114	NC_015919	CAAT	2	8	32201	32208	50 %	25 %	0 %	25 %	343127296
115	NC_015919	TTAA	2	8	32309	32316	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015919	ACAT	2	8	32371	32378	50 %	25 %	0 %	25 %	343127297
117	NC_015919	CATT	2	8	32606	32613	25 %	50 %	0 %	25 %	343127297
118	NC_015919	CAAG	2	8	32739	32746	50 %	0 %	25 %	25 %	343127297
119	NC_015919	GTAC	2	8	32908	32915	25 %	25 %	25 %	25 %	343127298
120	NC_015919	AGCA	2	8	34481	34488	50 %	0 %	25 %	25 %	343127300
121	NC_015919	ATTA	2	8	34989	34996	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015919	GTAT	2	8	35144	35151	25 %	50 %	25 %	0 %	343127301
123	NC_015919	ACTT	2	8	35288	35295	25 %	50 %	0 %	25 %	343127301
124	NC_015919	ATGA	2	8	36445	36452	50 %	25 %	25 %	0 %	343127302
125	NC_015919	TTGC	2	8	36485	36492	0 %	50 %	25 %	25 %	343127302
126	NC_015919	TTTG	2	8	36657	36664	0 %	75 %	25 %	0 %	343127302
127	NC_015919	AGAC	2	8	36771	36778	50 %	0 %	25 %	25 %	343127302
128	NC_015919	GTTG	2	8	37609	37616	0 %	50 %	50 %	0 %	343127304
129	NC_015919	AGTG	2	8	38052	38059	25 %	25 %	50 %	0 %	343127304
130	NC_015919	ATTT	2	8	38494	38501	25 %	75 %	0 %	0 %	343127304
131	NC_015919	AAAT	2	8	39393	39400	75 %	25 %	0 %	0 %	343127306
132	NC_015919	TTGT	2	8	39614	39621	0 %	75 %	25 %	0 %	343127307
133	NC_015919	TTGT	2	8	40103	40110	0 %	75 %	25 %	0 %	343127307
134	NC_015919	TTTG	2	8	40286	40293	0 %	75 %	25 %	0 %	343127307
135	NC_015919	TAAA	2	8	40294	40301	75 %	25 %	0 %	0 %	343127307
136	NC_015919	ATTT	2	8	40353	40360	25 %	75 %	0 %	0 %	343127307
137	NC_015919	AATT	2	8	40458	40465	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_015919	TTTA	2	8	40823	40830	25 %	75 %	0 %	0 %	343127308
139	NC_015919	ATTT	2	8	41348	41355	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_015919	ATTT	2	8	41419	41426	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_015919	TTGC	2	8	41619	41626	0 %	50 %	25 %	25 %	343127309
142	NC_015919	GATT	2	8	41913	41920	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_015919	ATCT	2	8	42623	42630	25 %	50 %	0 %	25 %	343127311
144	NC_015919	AATT	2	8	42975	42982	50 %	50 %	0 %	0 %	343127311
145	NC_015919	TAAT	2	8	43024	43031	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_015919	ATTA	2	8	43033	43040	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.