MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Borrelia bissettii DN127 plasmid lp28-4

Total Repeats: 410

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015917	ATA	2	6	11	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127153
2	NC_015917	AGT	2	6	25	30	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343127153
3	NC_015917	AGA	2	6	144	149	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343127153
4	NC_015917	TTC	2	6	166	171	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343127153
5	NC_015917	ATT	2	6	199	204	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127153
6	NC_015917	TCT	2	6	221	226	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343127153
7	NC_015917	AAT	2	6	230	235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127153
8	NC_015917	TTA	2	6	297	302	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127153
9	NC_015917	TCA	2	6	335	340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343127153
10	NC_015917	AGA	2	6	364	369	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343127153
11	NC_015917	TCT	2	6	386	391	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343127153
12	NC_015917	TCG	2	6	563	568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	343127153
13	NC_015917	TAT	2	6	646	651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127153
14	NC_015917	TTC	2	6	724	729	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343127153
15	NC_015917	TTC	2	6	733	738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343127153
16	NC_015917	TCT	2	6	875	880	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343127153
17	NC_015917	CTT	2	6	882	887	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343127153
18	NC_015917	ATT	2	6	970	975	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127153
19	NC_015917	CTT	2	6	984	989	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343127153
20	NC_015917	TAT	2	6	996	1001	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127153
21	NC_015917	AGT	2	6	1034	1039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343127153
22	NC_015917	TGT	2	6	1082	1087	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	343127153
23	NC_015917	AAT	2	6	1095	1100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127153
24	NC_015917	GTC	2	6	1156	1161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	343127153
25	NC_015917	GAA	2	6	1166	1171	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343127153
26	NC_015917	TTA	2	6	1208	1213	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127153
27	NC_015917	TAA	2	6	1227	1232	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127153
28	NC_015917	TTA	2	6	1477	1482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015917	TTA	2	6	1517	1522	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015917	ATT	2	6	1614	1619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015917	ACA	2	6	1725	1730	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	343127154
32	NC_015917	TCC	2	6	1858	1863	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_015917	CTA	2	6	1865	1870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_015917	ATC	2	6	2051	2056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343127155
35	NC_015917	TAA	2	6	2075	2080	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127155
36	NC_015917	ACA	2	6	2183	2188	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	343127155
37	NC_015917	AAC	3	9	2203	2211	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	343127155
38	NC_015917	GTT	2	6	2220	2225	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	343127155
39	NC_015917	TCA	2	6	2282	2287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343127155
40	NC_015917	TGA	2	6	2330	2335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343127155
41	NC_015917	AAG	2	6	2341	2346	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343127155
42	NC_015917	AAT	2	6	2496	2501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127155
43	NC_015917	CAA	2	6	2540	2545	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	343127155
44	NC_015917	TGA	2	6	2561	2566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343127155
45	NC_015917	AAG	2	6	2647	2652	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343127155
46	NC_015917	ACA	2	6	2742	2747	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	343127155
47	NC_015917	CTT	2	6	2770	2775	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343127155
48	NC_015917	AAG	2	6	2830	2835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343127155
49	NC_015917	GAA	2	6	2865	2870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343127155
50	NC_015917	AAT	2	6	2886	2891	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015917	ATT	2	6	2911	2916	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015917	TGT	2	6	2988	2993	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015917	ATA	2	6	3258	3263	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015917	ATT	2	6	3327	3332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015917	TGA	2	6	3404	3409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015917	ATC	2	6	3424	3429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343127157
57	NC_015917	TAA	2	6	3454	3459	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127157
58	NC_015917	ATT	2	6	3642	3647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015917	AAT	2	6	3699	3704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015917	TTA	2	6	3739	3744	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015917	ATT	2	6	3778	3783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015917	TAT	2	6	3830	3835	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015917	CTA	2	6	3863	3868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_015917	TAA	2	6	3875	3880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015917	ATA	2	6	3963	3968	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127158
66	NC_015917	ATT	2	6	4160	4165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127159
67	NC_015917	CCA	2	6	4185	4190	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	343127159
68	NC_015917	CAA	2	6	4205	4210	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	343127159
69	NC_015917	ATA	2	6	4267	4272	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127159
70	NC_015917	TAA	2	6	4292	4297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127159
71	NC_015917	AAG	2	6	4342	4347	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343127159
72	NC_015917	AAC	2	6	4539	4544	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	343127159
73	NC_015917	AAG	2	6	4561	4566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343127159
74	NC_015917	ATA	2	6	4581	4586	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127159
75	NC_015917	GAA	2	6	4650	4655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343127159
76	NC_015917	ATT	2	6	4777	4782	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127159
77	NC_015917	ATG	2	6	4900	4905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343127159
78	NC_015917	ACT	2	6	4913	4918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343127159
79	NC_015917	TGA	2	6	4967	4972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343127159
80	NC_015917	ATA	2	6	5113	5118	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015917	TTA	2	6	5160	5165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015917	TTA	2	6	5222	5227	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015917	TGT	2	6	5281	5286	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015917	TAA	2	6	5365	5370	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015917	TAC	3	9	5712	5720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343127160
86	NC_015917	ATA	2	6	5732	5737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127160
87	NC_015917	TCT	2	6	5794	5799	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343127160
88	NC_015917	TCT	2	6	5834	5839	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343127160
89	NC_015917	CAG	2	6	5886	5891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	343127160
90	NC_015917	CTT	2	6	5895	5900	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343127160
91	NC_015917	GCT	2	6	5936	5941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	343127160
92	NC_015917	ATT	2	6	5959	5964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127160
93	NC_015917	AGT	2	6	5966	5971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343127160
94	NC_015917	TCT	3	9	5996	6004	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343127160
95	NC_015917	TTC	2	6	6037	6042	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343127160
96	NC_015917	CTT	2	6	6054	6059	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343127160
97	NC_015917	ATT	2	6	6235	6240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015917	TAA	2	6	6241	6246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015917	TTA	2	6	6352	6357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127161
100	NC_015917	ATC	2	6	6454	6459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343127161
101	NC_015917	ATA	2	6	6520	6525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127162
102	NC_015917	AGA	2	6	6564	6569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015917	AAG	2	6	6620	6625	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015917	AAG	2	6	6702	6707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015917	AGT	2	6	6815	6820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015917	AGA	2	6	6936	6941	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015917	ATA	2	6	7010	7015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015917	TAA	3	9	7083	7091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015917	AAT	2	6	7212	7217	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015917	CAA	2	6	7222	7227	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_015917	TAC	2	6	7252	7257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_015917	AAT	2	6	7337	7342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015917	GAA	2	6	7357	7362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015917	TTA	2	6	7379	7384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015917	ATT	2	6	7438	7443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015917	TAA	2	6	7455	7460	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015917	TAT	3	9	7608	7616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127163
118	NC_015917	TAG	2	6	7624	7629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343127163
119	NC_015917	TTA	2	6	7630	7635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127163
120	NC_015917	AAT	2	6	7699	7704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127163
121	NC_015917	TTC	2	6	7721	7726	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343127163
122	NC_015917	ATT	2	6	8014	8019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015917	TCA	2	6	8088	8093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_015917	TGT	2	6	8138	8143	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015917	TGG	2	6	8147	8152	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015917	GAT	2	6	8214	8219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015917	TAA	2	6	8268	8273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_015917	ATT	2	6	8368	8373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015917	TAA	2	6	8377	8382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_015917	ATT	2	6	8458	8463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015917	GTT	2	6	8464	8469	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015917	ATT	2	6	8563	8568	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_015917	TAT	2	6	8624	8629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015917	TAA	2	6	8632	8637	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015917	ATT	3	9	8694	8702	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015917	GCT	2	6	8856	8861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_015917	ATA	2	6	8949	8954	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_015917	ATT	2	6	9035	9040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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272	NC_015917	TCT	2	6	18014	18019	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
273	NC_015917	TAA	2	6	18347	18352	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.