MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Borrelia bissettii DN127 plasmid lp28-3

Total Repeats: 374

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015916	ATA	2	6	106	111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015916	TAT	2	6	155	160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015916	ATA	2	6	207	212	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015916	TAT	2	6	226	231	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015916	ATT	2	6	232	237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015916	ATT	2	6	280	285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343128142
7	NC_015916	ATC	2	6	408	413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343128142
8	NC_015916	ATA	2	6	505	510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015916	ATA	2	6	514	519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015916	ATT	2	6	525	530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015916	AAC	2	6	710	715	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_015916	ATT	2	6	738	743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015916	ATT	2	6	753	758	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015916	ATT	2	6	807	812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015916	TAA	2	6	835	840	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015916	ATT	2	6	857	862	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015916	AAC	2	6	925	930	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_015916	ATT	2	6	1065	1070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015916	AAT	2	6	1102	1107	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015916	TAT	2	6	1138	1143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015916	ATA	2	6	1202	1207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015916	ATT	2	6	1239	1244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015916	TTA	2	6	1245	1250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015916	ATA	2	6	1264	1269	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015916	CAG	2	6	1431	1436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	343128143
26	NC_015916	AAG	2	6	1449	1454	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343128143
27	NC_015916	AAG	3	9	1467	1475	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343128143
28	NC_015916	TAA	2	6	1480	1485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343128143
29	NC_015916	GAA	3	9	1571	1579	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343128143
30	NC_015916	ATA	2	6	1656	1661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343128143
31	NC_015916	TAA	2	6	1720	1725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343128143
32	NC_015916	GAC	2	6	1811	1816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	343128143
33	NC_015916	ATT	2	6	1903	1908	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343128143
34	NC_015916	TTA	2	6	1949	1954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343128143
35	NC_015916	ATA	2	6	1965	1970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343128143
36	NC_015916	GAA	2	6	2048	2053	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343128143
37	NC_015916	TTA	2	6	2238	2243	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015916	ATG	2	6	2265	2270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343128144
39	NC_015916	CAG	2	6	2289	2294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	343128144
40	NC_015916	TAA	2	6	2331	2336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343128144
41	NC_015916	TAA	2	6	2369	2374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015916	ACT	2	6	2379	2384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_015916	ATT	2	6	2431	2436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015916	TAT	2	6	2466	2471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015916	ATT	2	6	2554	2559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015916	TAA	2	6	2745	2750	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015916	ATG	2	6	2835	2840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015916	TTG	2	6	2890	2895	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015916	ATC	2	6	2953	2958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_015916	ACT	2	6	3133	3138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_015916	ATA	3	9	3192	3200	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015916	AAT	2	6	3225	3230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015916	TAA	2	6	3304	3309	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015916	ATT	2	6	3310	3315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015916	AGA	2	6	3540	3545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015916	ATT	2	6	3571	3576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015916	TAT	2	6	3618	3623	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015916	TTA	2	6	3671	3676	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015916	TAA	2	6	3743	3748	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015916	CTA	2	6	3845	3850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_015916	TCT	2	6	3882	3887	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_015916	ATA	2	6	3903	3908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015916	TAA	2	6	3948	3953	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015916	GCA	2	6	4004	4009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	343128145
65	NC_015916	ATT	3	9	4010	4018	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343128145
66	NC_015916	AAT	2	6	4036	4041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343128145
67	NC_015916	CTT	2	6	4122	4127	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343128145
68	NC_015916	CTT	2	6	4136	4141	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343128145
69	NC_015916	GCT	2	6	4172	4177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	343128145
70	NC_015916	ATA	2	6	4268	4273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343128145
71	NC_015916	TAA	2	6	4324	4329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015916	TAT	3	9	4330	4338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015916	ATT	2	6	4358	4363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015916	TAT	2	6	4541	4546	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015916	TAT	2	6	4564	4569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015916	TAA	2	6	4576	4581	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015916	AAT	2	6	4583	4588	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015916	TTA	2	6	4606	4611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015916	TAA	2	6	4652	4657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015916	TTA	2	6	4808	4813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015916	TTG	2	6	4839	4844	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015916	ATA	2	6	4863	4868	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015916	ATT	2	6	4889	4894	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015916	CTT	2	6	4901	4906	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_015916	TTA	2	6	4951	4956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015916	TTA	2	6	4999	5004	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015916	AAT	2	6	5027	5032	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015916	AAT	2	6	5122	5127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015916	TTA	2	6	5373	5378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015916	TTA	3	9	5404	5412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015916	ATA	2	6	5413	5418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015916	TTC	2	6	5506	5511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_015916	ATA	2	6	5516	5521	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015916	TCT	2	6	5567	5572	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_015916	CTT	3	9	5863	5871	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_015916	ATT	2	6	5937	5942	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015916	ATA	2	6	5996	6001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015916	TAC	3	9	6095	6103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_015916	CAT	2	6	6139	6144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_015916	TAT	2	6	6172	6177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015916	TAA	2	6	6178	6183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015916	ACT	2	6	6228	6233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_015916	ATT	2	6	6300	6305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015916	TTC	2	6	6334	6339	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_015916	ATA	2	6	6431	6436	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015916	ACT	2	6	6473	6478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_015916	CTA	2	6	6487	6492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_015916	AGT	2	6	6518	6523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015916	TGT	2	6	6695	6700	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	343128147
110	NC_015916	AAT	2	6	6762	6767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343128147
111	NC_015916	GAA	2	6	6768	6773	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343128147
112	NC_015916	AGA	2	6	6782	6787	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343128147
113	NC_015916	GAA	2	6	6792	6797	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343128147
114	NC_015916	GAA	2	6	6825	6830	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343128147
115	NC_015916	AAG	2	6	6850	6855	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343128147
116	NC_015916	TAA	2	6	6905	6910	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343128147
117	NC_015916	ATA	2	6	6934	6939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343128147
118	NC_015916	ATG	2	6	7045	7050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343128147
119	NC_015916	AAT	2	6	7061	7066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343128147
120	NC_015916	ATA	2	6	7092	7097	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343128147
121	NC_015916	AAG	2	6	7222	7227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343128147
122	NC_015916	ATG	2	6	7276	7281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343128147
123	NC_015916	ATG	2	6	7414	7419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343128147
124	NC_015916	AAT	2	6	7491	7496	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343128147
125	NC_015916	TAA	2	6	7517	7522	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343128147
126	NC_015916	GAT	2	6	7575	7580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015916	AAT	2	6	7618	7623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_015916	ATA	2	6	7740	7745	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015916	TTA	2	6	7756	7761	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_015916	AAG	2	6	7775	7780	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015916	ATT	2	6	7783	7788	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015916	AAT	2	6	7881	7886	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_015916	TCT	2	6	7900	7905	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_015916	TAA	2	6	8000	8005	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015916	TCT	2	6	8006	8011	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_015916	ATT	2	6	8067	8072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_015916	TTC	2	6	8073	8078	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_015916	AAC	2	6	8121	8126	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_015916	AAT	2	6	8254	8259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343128148
140	NC_015916	TTA	2	6	8272	8277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343128148
141	NC_015916	TCT	2	6	8346	8351	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343128148
142	NC_015916	ATT	2	6	8384	8389	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343128148
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268	NC_015916	AAT	2	6	17684	17689	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
269	NC_015916	TCT	2	6	17758	17763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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271	NC_015916	TAA	3	9	17964	17972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
272	NC_015916	TAA	3	9	18001	18009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
273	NC_015916	TTG	2	6	18022	18027	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
274	NC_015916	TAA	2	6	18087	18092	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
275	NC_015916	AGA	2	6	18249	18254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
276	NC_015916	TAA	2	6	18291	18296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
277	NC_015916	AGA	2	6	18309	18314	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
278	NC_015916	AGG	2	6	18339	18344	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
279	NC_015916	AAG	2	6	18417	18422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
280	NC_015916	TTG	2	6	18474	18479	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
281	NC_015916	TAA	2	6	18496	18501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
282	NC_015916	ATT	2	6	18711	18716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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294	NC_015916	TAA	2	6	19579	19584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
295	NC_015916	TAA	2	6	19851	19856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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312	NC_015916	ATT	2	6	21361	21366	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.