MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Borrelia bissettii DN127 plasmid cp32-7

Total Repeats: 97

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015910	ATTT	3	12	573	584	25 %	75 %	0 %	0 %	343127061
2	NC_015910	ACAA	2	8	768	775	75 %	0 %	0 %	25 %	343127061
3	NC_015910	ATTA	2	8	944	951	50 %	50 %	0 %	0 %	343127061
4	NC_015910	AATT	2	8	1893	1900	50 %	50 %	0 %	0 %	343127062
5	NC_015910	ATAC	2	8	1928	1935	50 %	25 %	0 %	25 %	343127062
6	NC_015910	AAAG	2	8	2378	2385	75 %	0 %	25 %	0 %	343127063
7	NC_015910	TTAT	2	8	2517	2524	25 %	75 %	0 %	0 %	343127063
8	NC_015910	TGCT	2	8	2527	2534	0 %	50 %	25 %	25 %	343127063
9	NC_015910	GCAA	2	8	2675	2682	50 %	0 %	25 %	25 %	343127064
10	NC_015910	ATGT	2	8	3013	3020	25 %	50 %	25 %	0 %	343127064
11	NC_015910	GTAT	2	8	3038	3045	25 %	50 %	25 %	0 %	343127064
12	NC_015910	ATAA	2	8	3120	3127	75 %	25 %	0 %	0 %	343127064
13	NC_015910	CAAT	2	8	3202	3209	50 %	25 %	0 %	25 %	343127064
14	NC_015910	TAAA	2	8	3364	3371	75 %	25 %	0 %	0 %	343127065
15	NC_015910	TTTA	2	8	3891	3898	25 %	75 %	0 %	0 %	343127065
16	NC_015910	ATCA	2	8	4352	4359	50 %	25 %	0 %	25 %	343127066
17	NC_015910	AGTA	2	8	4784	4791	50 %	25 %	25 %	0 %	343127066
18	NC_015910	CTAC	2	8	4796	4803	25 %	25 %	0 %	50 %	343127066
19	NC_015910	TCAT	2	8	4843	4850	25 %	50 %	0 %	25 %	343127066
20	NC_015910	TAAG	2	8	5053	5060	50 %	25 %	25 %	0 %	343127067
21	NC_015910	TACT	2	8	5152	5159	25 %	50 %	0 %	25 %	343127067
22	NC_015910	AATG	2	8	5398	5405	50 %	25 %	25 %	0 %	343127067
23	NC_015910	AAAT	2	8	5539	5546	75 %	25 %	0 %	0 %	343127068
24	NC_015910	AGCA	2	8	6064	6071	50 %	0 %	25 %	25 %	343127069
25	NC_015910	AGTC	2	8	6528	6535	25 %	25 %	25 %	25 %	343127070
26	NC_015910	AGAA	2	8	7221	7228	75 %	0 %	25 %	0 %	343127071
27	NC_015910	CAAG	2	8	7294	7301	50 %	0 %	25 %	25 %	343127071
28	NC_015910	ATTT	2	8	8498	8505	25 %	75 %	0 %	0 %	343127073
29	NC_015910	CTTG	2	8	8800	8807	0 %	50 %	25 %	25 %	343127074
30	NC_015910	GTAA	2	8	9426	9433	50 %	25 %	25 %	0 %	343127075
31	NC_015910	TATG	2	8	9458	9465	25 %	50 %	25 %	0 %	343127075
32	NC_015910	AAAT	2	8	9488	9495	75 %	25 %	0 %	0 %	343127075
33	NC_015910	AACT	2	8	9787	9794	50 %	25 %	0 %	25 %	343127075
34	NC_015910	CTAA	2	8	9873	9880	50 %	25 %	0 %	25 %	343127075
35	NC_015910	AGGG	2	8	9883	9890	25 %	0 %	75 %	0 %	343127075
36	NC_015910	TAAT	2	8	10956	10963	50 %	50 %	0 %	0 %	343127076
37	NC_015910	ATTC	2	8	11669	11676	25 %	50 %	0 %	25 %	343127077
38	NC_015910	TCAA	2	8	12176	12183	50 %	25 %	0 %	25 %	343127078
39	NC_015910	GTTT	2	8	12460	12467	0 %	75 %	25 %	0 %	343127078
40	NC_015910	TAAT	2	8	13001	13008	50 %	50 %	0 %	0 %	343127080
41	NC_015910	AGAT	2	8	13680	13687	50 %	25 %	25 %	0 %	343127080
42	NC_015910	AACA	2	8	13709	13716	75 %	0 %	0 %	25 %	343127080
43	NC_015910	TATC	2	8	13891	13898	25 %	50 %	0 %	25 %	343127081
44	NC_015910	AAAC	2	8	14083	14090	75 %	0 %	0 %	25 %	343127081
45	NC_015910	ATTT	2	8	14099	14106	25 %	75 %	0 %	0 %	343127081
46	NC_015910	GAAT	2	8	14633	14640	50 %	25 %	25 %	0 %	343127082
47	NC_015910	AAAT	2	8	14852	14859	75 %	25 %	0 %	0 %	343127082
48	NC_015910	ACAT	2	8	15114	15121	50 %	25 %	0 %	25 %	343127082
49	NC_015910	CTCC	2	8	15654	15661	0 %	25 %	0 %	75 %	343127084
50	NC_015910	AGGA	2	8	15748	15755	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015910	CTAT	2	8	15760	15767	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_015910	TAAC	2	8	15830	15837	50 %	25 %	0 %	25 %	343127085
53	NC_015910	CAAT	2	8	16524	16531	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_015910	ATAG	2	8	16882	16889	50 %	25 %	25 %	0 %	343127087
55	NC_015910	AGAT	2	8	16901	16908	50 %	25 %	25 %	0 %	343127087
56	NC_015910	TATT	2	8	17165	17172	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015910	AATA	2	8	17453	17460	75 %	25 %	0 %	0 %	343127088
58	NC_015910	ATCC	2	8	17473	17480	25 %	25 %	0 %	50 %	343127088
59	NC_015910	TTAA	2	8	17610	17617	50 %	50 %	0 %	0 %	343127088
60	NC_015910	TCTT	2	8	18315	18322	0 %	75 %	0 %	25 %	343127090
61	NC_015910	TACC	2	8	18997	19004	25 %	25 %	0 %	50 %	343127090
62	NC_015910	ATCA	2	8	19517	19524	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_015910	AACT	2	8	19905	19912	50 %	25 %	0 %	25 %	343127091
64	NC_015910	GAAA	2	8	20319	20326	75 %	0 %	25 %	0 %	343127091
65	NC_015910	AGAA	2	8	20363	20370	75 %	0 %	25 %	0 %	343127091
66	NC_015910	GAAA	2	8	20518	20525	75 %	0 %	25 %	0 %	343127091
67	NC_015910	TTTA	2	8	21237	21244	25 %	75 %	0 %	0 %	343127092
68	NC_015910	TCAA	2	8	21357	21364	50 %	25 %	0 %	25 %	343127093
69	NC_015910	TAAA	2	8	21964	21971	75 %	25 %	0 %	0 %	343127093
70	NC_015910	TAAA	2	8	22036	22043	75 %	25 %	0 %	0 %	343127093
71	NC_015910	ATGG	2	8	23043	23050	25 %	25 %	50 %	0 %	343127095
72	NC_015910	TATT	2	8	23488	23495	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015910	GATA	2	8	23960	23967	50 %	25 %	25 %	0 %	343127097
74	NC_015910	AATA	2	8	24167	24174	75 %	25 %	0 %	0 %	343127097
75	NC_015910	GATG	2	8	24248	24255	25 %	25 %	50 %	0 %	343127097
76	NC_015910	AGAA	2	8	24789	24796	75 %	0 %	25 %	0 %	343127097
77	NC_015910	AGAT	2	8	24961	24968	50 %	25 %	25 %	0 %	343127097
78	NC_015910	AAAT	2	8	25683	25690	75 %	25 %	0 %	0 %	343127099
79	NC_015910	TTTA	2	8	25714	25721	25 %	75 %	0 %	0 %	343127099
80	NC_015910	ACCA	2	8	26067	26074	50 %	0 %	0 %	50 %	343127099
81	NC_015910	GTTT	2	8	26087	26094	0 %	75 %	25 %	0 %	343127099
82	NC_015910	AAGA	2	8	26499	26506	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015910	AAAT	2	8	27245	27252	75 %	25 %	0 %	0 %	343127100
84	NC_015910	ATTA	2	8	28049	28056	50 %	50 %	0 %	0 %	343127101
85	NC_015910	TCTT	2	8	28097	28104	0 %	75 %	0 %	25 %	343127101
86	NC_015910	ATTT	2	8	28297	28304	25 %	75 %	0 %	0 %	343127102
87	NC_015910	TAAA	2	8	29222	29229	75 %	25 %	0 %	0 %	343127103
88	NC_015910	AGTT	2	8	29249	29256	25 %	50 %	25 %	0 %	343127103
89	NC_015910	CAAA	2	8	29427	29434	75 %	0 %	0 %	25 %	343127104
90	NC_015910	AAAT	2	8	29465	29472	75 %	25 %	0 %	0 %	343127104
91	NC_015910	AATT	2	8	29516	29523	50 %	50 %	0 %	0 %	343127104
92	NC_015910	TAGC	2	8	29623	29630	25 %	25 %	25 %	25 %	343127104
93	NC_015910	TGAT	2	8	29830	29837	25 %	50 %	25 %	0 %	343127104
94	NC_015910	AGCA	2	8	30191	30198	50 %	0 %	25 %	25 %	343127104
95	NC_015910	AAAT	2	8	30217	30224	75 %	25 %	0 %	0 %	343127104
96	NC_015910	TACA	2	8	30421	30428	50 %	25 %	0 %	25 %	343127104
97	NC_015910	TTAC	2	8	30583	30590	25 %	50 %	0 %	25 %	343127104

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.