MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Buchnera aphidicola (Cinara tujafilina) chromosome

Total Repeats: 1656

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015662	GTTC	2	8	277	284	0 %	50 %	25 %	25 %	336233114
2	NC_015662	AAAT	2	8	555	562	75 %	25 %	0 %	0 %	336233114
3	NC_015662	ATCA	2	8	703	710	50 %	25 %	0 %	25 %	336233114
4	NC_015662	GTTC	2	8	766	773	0 %	50 %	25 %	25 %	336233114
5	NC_015662	AGTT	2	8	2600	2607	25 %	50 %	25 %	0 %	336233115
6	NC_015662	CTTT	2	8	2760	2767	0 %	75 %	0 %	25 %	336233115
7	NC_015662	AATT	2	8	2819	2826	50 %	50 %	0 %	0 %	336233115
8	NC_015662	TAAT	2	8	3094	3101	50 %	50 %	0 %	0 %	336233115
9	NC_015662	AAAT	2	8	3611	3618	75 %	25 %	0 %	0 %	336233115
10	NC_015662	ATTT	2	8	3955	3962	25 %	75 %	0 %	0 %	336233115
11	NC_015662	ATGT	2	8	4247	4254	25 %	50 %	25 %	0 %	336233115
12	NC_015662	ATAC	2	8	4418	4425	50 %	25 %	0 %	25 %	336233115
13	NC_015662	TAAA	2	8	4557	4564	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015662	ATTT	2	8	4573	4580	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015662	TGCT	2	8	4727	4734	0 %	50 %	25 %	25 %	336233116
16	NC_015662	TTAA	2	8	4975	4982	50 %	50 %	0 %	0 %	336233116
17	NC_015662	TGAT	2	8	5068	5075	25 %	50 %	25 %	0 %	336233116
18	NC_015662	ATTT	2	8	5172	5179	25 %	75 %	0 %	0 %	336233116
19	NC_015662	ATAA	2	8	5225	5232	75 %	25 %	0 %	0 %	336233116
20	NC_015662	TAAA	2	8	5403	5410	75 %	25 %	0 %	0 %	336233116
21	NC_015662	TTTC	2	8	6199	6206	0 %	75 %	0 %	25 %	336233117
22	NC_015662	ATAA	2	8	6540	6547	75 %	25 %	0 %	0 %	336233117
23	NC_015662	AAAT	2	8	6991	6998	75 %	25 %	0 %	0 %	336233117
24	NC_015662	ATTT	3	12	7748	7759	25 %	75 %	0 %	0 %	336233119
25	NC_015662	ATTT	2	8	7991	7998	25 %	75 %	0 %	0 %	336233119
26	NC_015662	AATT	2	8	8262	8269	50 %	50 %	0 %	0 %	336233120
27	NC_015662	TAAA	2	8	8493	8500	75 %	25 %	0 %	0 %	336233120
28	NC_015662	GTTT	2	8	8528	8535	0 %	75 %	25 %	0 %	336233120
29	NC_015662	GTTT	2	8	8715	8722	0 %	75 %	25 %	0 %	336233120
30	NC_015662	GGAT	2	8	8834	8841	25 %	25 %	50 %	0 %	336233120
31	NC_015662	TCAT	2	8	8974	8981	25 %	50 %	0 %	25 %	336233120
32	NC_015662	ATGG	2	8	9072	9079	25 %	25 %	50 %	0 %	336233120
33	NC_015662	ATTA	2	8	10102	10109	50 %	50 %	0 %	0 %	336233121
34	NC_015662	GAGC	2	8	10145	10152	25 %	0 %	50 %	25 %	336233121
35	NC_015662	TATT	2	8	10303	10310	25 %	75 %	0 %	0 %	336233121
36	NC_015662	AATT	2	8	10608	10615	50 %	50 %	0 %	0 %	336233121
37	NC_015662	TAAA	2	8	10776	10783	75 %	25 %	0 %	0 %	336233121
38	NC_015662	AAAT	2	8	10855	10862	75 %	25 %	0 %	0 %	336233121
39	NC_015662	GATT	2	8	11038	11045	25 %	50 %	25 %	0 %	336233121
40	NC_015662	AAAT	2	8	11168	11175	75 %	25 %	0 %	0 %	336233121
41	NC_015662	TCAA	2	8	12342	12349	50 %	25 %	0 %	25 %	336233123
42	NC_015662	AGGT	2	8	12524	12531	25 %	25 %	50 %	0 %	336233123
43	NC_015662	TTAT	2	8	12648	12655	25 %	75 %	0 %	0 %	336233123
44	NC_015662	TTAT	2	8	13726	13733	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015662	TATT	2	8	13766	13773	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015662	TTTA	2	8	14369	14376	25 %	75 %	0 %	0 %	336233124
47	NC_015662	TCTA	2	8	14659	14666	25 %	50 %	0 %	25 %	336233125
48	NC_015662	AATT	2	8	14758	14765	50 %	50 %	0 %	0 %	336233125
49	NC_015662	ATTT	2	8	15447	15454	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015662	AATT	2	8	15479	15486	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015662	GTAT	2	8	15539	15546	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015662	AAAT	2	8	15568	15575	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015662	ATAA	2	8	15666	15673	75 %	25 %	0 %	0 %	336233126
54	NC_015662	AATT	2	8	15829	15836	50 %	50 %	0 %	0 %	336233126
55	NC_015662	ATTT	2	8	16111	16118	25 %	75 %	0 %	0 %	336233126
56	NC_015662	TGTA	2	8	16138	16145	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015662	GTCA	2	8	16246	16253	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
58	NC_015662	AAAG	2	8	16517	16524	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015662	TAAT	2	8	17345	17352	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015662	GGTT	2	8	17911	17918	0 %	50 %	50 %	0 %	336233128
61	NC_015662	TAAA	2	8	18368	18375	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015662	GGTG	2	8	18974	18981	0 %	25 %	75 %	0 %	336233129
63	NC_015662	ATTT	2	8	19606	19613	25 %	75 %	0 %	0 %	336233129
64	NC_015662	TAAT	2	8	19660	19667	50 %	50 %	0 %	0 %	336233129
65	NC_015662	GTTC	2	8	20034	20041	0 %	50 %	25 %	25 %	336233129
66	NC_015662	TACC	2	8	20077	20084	25 %	25 %	0 %	50 %	336233129
67	NC_015662	ATTC	2	8	20876	20883	25 %	50 %	0 %	25 %	336233129
68	NC_015662	ATTT	2	8	20938	20945	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015662	AAAG	2	8	20948	20955	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015662	AATT	2	8	21159	21166	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015662	AAAT	2	8	21518	21525	75 %	25 %	0 %	0 %	336233130
72	NC_015662	AAAT	2	8	22041	22048	75 %	25 %	0 %	0 %	336233130
73	NC_015662	ATTG	2	8	22708	22715	25 %	50 %	25 %	0 %	336233130
74	NC_015662	ATCC	2	8	23219	23226	25 %	25 %	0 %	50 %	336233130
75	NC_015662	TGTT	2	8	23325	23332	0 %	75 %	25 %	0 %	336233130
76	NC_015662	ATTA	2	8	23352	23359	50 %	50 %	0 %	0 %	336233130
77	NC_015662	TTGT	2	8	24016	24023	0 %	75 %	25 %	0 %	336233130
78	NC_015662	TTTC	2	8	25472	25479	0 %	75 %	0 %	25 %	336233130
79	NC_015662	GCAT	2	8	25842	25849	25 %	25 %	25 %	25 %	336233131
80	NC_015662	ATTT	2	8	26503	26510	25 %	75 %	0 %	0 %	336233131
81	NC_015662	AGAA	2	8	26990	26997	75 %	0 %	25 %	0 %	336233131
82	NC_015662	TATT	2	8	27312	27319	25 %	75 %	0 %	0 %	336233131
83	NC_015662	TATT	2	8	27352	27359	25 %	75 %	0 %	0 %	336233131
84	NC_015662	GATA	2	8	27759	27766	50 %	25 %	25 %	0 %	336233131
85	NC_015662	TTAA	2	8	27861	27868	50 %	50 %	0 %	0 %	336233131
86	NC_015662	TCTT	2	8	28145	28152	0 %	75 %	0 %	25 %	336233131
87	NC_015662	ATTT	2	8	28312	28319	25 %	75 %	0 %	0 %	336233131
88	NC_015662	CGAC	2	8	28374	28381	25 %	0 %	25 %	50 %	336233131
89	NC_015662	AAAT	2	8	28424	28431	75 %	25 %	0 %	0 %	336233131
90	NC_015662	AAAT	2	8	28537	28544	75 %	25 %	0 %	0 %	336233131
91	NC_015662	AAAT	2	8	28994	29001	75 %	25 %	0 %	0 %	336233131
92	NC_015662	ATTA	2	8	29162	29169	50 %	50 %	0 %	0 %	336233131
93	NC_015662	ATAA	2	8	29264	29271	75 %	25 %	0 %	0 %	336233131
94	NC_015662	TTCT	2	8	29327	29334	0 %	75 %	0 %	25 %	336233131
95	NC_015662	AGAA	2	8	29492	29499	75 %	0 %	25 %	0 %	336233131
96	NC_015662	ATTA	2	8	30468	30475	50 %	50 %	0 %	0 %	336233133
97	NC_015662	TCAT	2	8	30571	30578	25 %	50 %	0 %	25 %	336233133
98	NC_015662	ATTT	2	8	31039	31046	25 %	75 %	0 %	0 %	336233134
99	NC_015662	ATGA	2	8	31060	31067	50 %	25 %	25 %	0 %	336233134
100	NC_015662	ATTT	2	8	31993	32000	25 %	75 %	0 %	0 %	336233135
101	NC_015662	TATT	2	8	32333	32340	25 %	75 %	0 %	0 %	336233136
102	NC_015662	TCAT	2	8	32431	32438	25 %	50 %	0 %	25 %	336233136
103	NC_015662	ATTG	2	8	32584	32591	25 %	50 %	25 %	0 %	336233136
104	NC_015662	CTAT	2	8	32656	32663	25 %	50 %	0 %	25 %	336233137
105	NC_015662	TTAT	2	8	33103	33110	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015662	ATGA	2	8	33158	33165	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015662	ATTT	2	8	33703	33710	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015662	TATC	2	8	33857	33864	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
109	NC_015662	ACTT	2	8	33986	33993	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
110	NC_015662	ATTT	2	8	33997	34004	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015662	TAAT	2	8	34036	34043	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015662	AATA	2	8	34140	34147	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015662	ATAA	2	8	34346	34353	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015662	TAAT	2	8	34366	34373	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015662	TTTA	2	8	35344	35351	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015662	TAAA	2	8	35448	35455	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015662	ATTT	2	8	35456	35463	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015662	TAAT	2	8	35526	35533	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_015662	TAAT	2	8	35741	35748	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015662	TTTA	2	8	35791	35798	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015662	TAAA	2	8	35969	35976	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015662	ATTG	2	8	36537	36544	25 %	50 %	25 %	0 %	336233139
123	NC_015662	TAAA	2	8	36983	36990	75 %	25 %	0 %	0 %	336233139
124	NC_015662	ACAA	2	8	37685	37692	75 %	0 %	0 %	25 %	336233140
125	NC_015662	TAAT	2	8	38085	38092	50 %	50 %	0 %	0 %	336233140
126	NC_015662	TAAA	2	8	38661	38668	75 %	25 %	0 %	0 %	336233140
127	NC_015662	ACAG	2	8	38797	38804	50 %	0 %	25 %	25 %	336233140
128	NC_015662	TAAA	2	8	38835	38842	75 %	25 %	0 %	0 %	336233140
129	NC_015662	ATTA	2	8	38935	38942	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_015662	TAAT	2	8	39022	39029	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015662	ATTA	3	12	39048	39059	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015662	ATTT	2	8	39065	39072	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_015662	CTTG	2	8	39810	39817	0 %	50 %	25 %	25 %	336233141
134	NC_015662	TTTA	2	8	40064	40071	25 %	75 %	0 %	0 %	336233141
135	NC_015662	TGCT	2	8	40079	40086	0 %	50 %	25 %	25 %	336233141
136	NC_015662	TAAG	2	8	41082	41089	50 %	25 %	25 %	0 %	336233141
137	NC_015662	AAAT	2	8	41192	41199	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_015662	TTAA	2	8	41240	41247	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_015662	AATT	2	8	41551	41558	50 %	50 %	0 %	0 %	336233142
140	NC_015662	TAAT	2	8	41697	41704	50 %	50 %	0 %	0 %	336233142
141	NC_015662	ATTA	2	8	41860	41867	50 %	50 %	0 %	0 %	336233142
142	NC_015662	TAAA	2	8	41940	41947	75 %	25 %	0 %	0 %	336233142
143	NC_015662	AGTT	2	8	42105	42112	25 %	50 %	25 %	0 %	336233142
144	NC_015662	AATT	2	8	42189	42196	50 %	50 %	0 %	0 %	336233142
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146	NC_015662	ATAA	2	8	42598	42605	75 %	25 %	0 %	0 %	336233142
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