MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Buchnera aphidicola (Cinara tujafilina) chromosome

Total Repeats: 17007

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_015662	A	8	8	28904	28911	100 %	0 %	0 %	0 %	336233131
1002	NC_015662	TCT	2	6	28923	28928	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336233131
1003	NC_015662	ATT	2	6	28953	28958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336233131
1004	NC_015662	TCT	2	6	28973	28978	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336233131
1005	NC_015662	AAAT	2	8	28994	29001	75 %	25 %	0 %	0 %	336233131
1006	NC_015662	TA	3	6	29062	29067	50 %	50 %	0 %	0 %	336233131
1007	NC_015662	A	6	6	29108	29113	100 %	0 %	0 %	0 %	336233131
1008	NC_015662	ACA	2	6	29142	29147	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336233131
1009	NC_015662	ATTA	2	8	29162	29169	50 %	50 %	0 %	0 %	336233131
1010	NC_015662	ATT	2	6	29180	29185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336233131
1011	NC_015662	CTT	2	6	29215	29220	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336233131
1012	NC_015662	T	6	6	29232	29237	0 %	100 %	0 %	0 %	336233131
1013	NC_015662	TAA	2	6	29249	29254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336233131
1014	NC_015662	ATAA	2	8	29264	29271	75 %	25 %	0 %	0 %	336233131
1015	NC_015662	GAA	2	6	29298	29303	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336233131
1016	NC_015662	C	6	6	29311	29316	0 %	0 %	0 %	100 %	336233131
1017	NC_015662	TTCT	2	8	29327	29334	0 %	75 %	0 %	25 %	336233131
1018	NC_015662	T	6	6	29346	29351	0 %	100 %	0 %	0 %	336233131
1019	NC_015662	TCC	2	6	29384	29389	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336233131
1020	NC_015662	GCT	2	6	29424	29429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336233131
1021	NC_015662	T	9	9	29441	29449	0 %	100 %	0 %	0 %	336233131
1022	NC_015662	TAA	2	6	29461	29466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336233131
1023	NC_015662	AGAA	2	8	29492	29499	75 %	0 %	25 %	0 %	336233131
1024	NC_015662	GTT	2	6	29524	29529	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336233131
1025	NC_015662	T	6	6	29538	29543	0 %	100 %	0 %	0 %	336233131
1026	NC_015662	T	9	9	29551	29559	0 %	100 %	0 %	0 %	336233131
1027	NC_015662	T	7	7	29589	29595	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_015662	A	6	6	29598	29603	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_015662	ATT	2	6	29619	29624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_015662	TAA	2	6	29633	29638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_015662	AAT	3	9	29668	29676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_015662	T	7	7	29731	29737	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_015662	ATT	2	6	29774	29779	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1035	NC_015662	T	6	6	29851	29856	0 %	100 %	0 %	0 %	336233132
1036	NC_015662	CTA	2	6	29881	29886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336233132
1037	NC_015662	TAATCC	2	12	29903	29914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336233132
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1039	NC_015662	TTA	2	6	29935	29940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336233132
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1041	NC_015662	T	8	8	30001	30008	0 %	100 %	0 %	0 %	336233132
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1043	NC_015662	T	8	8	30059	30066	0 %	100 %	0 %	0 %	336233132
1044	NC_015662	TAA	2	6	30160	30165	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_015662	TA	3	6	30167	30172	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_015662	TAA	2	6	30183	30188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_015662	T	6	6	30201	30206	0 %	100 %	0 %	0 %	336233133
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1058	NC_015662	T	7	7	30504	30510	0 %	100 %	0 %	0 %	336233133
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1061	NC_015662	TCAT	2	8	30571	30578	25 %	50 %	0 %	25 %	336233133
1062	NC_015662	T	9	9	30646	30654	0 %	100 %	0 %	0 %	336233133
1063	NC_015662	T	6	6	30663	30668	0 %	100 %	0 %	0 %	336233133
1064	NC_015662	ATT	2	6	30669	30674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336233133
1065	NC_015662	ATT	3	9	30690	30698	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_015662	TCT	2	6	30705	30710	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1067	NC_015662	TA	3	6	30711	30716	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1069	NC_015662	TTA	2	6	30776	30781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_015662	ATT	2	6	30808	30813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1073	NC_015662	TA	3	6	30845	30850	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_015662	AT	4	8	30870	30877	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_015662	ATT	3	9	30905	30913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336233134
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1077	NC_015662	TTGGT	2	10	30967	30976	0 %	60 %	40 %	0 %	336233134
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1098	NC_015662	AT	3	6	31574	31579	50 %	50 %	0 %	0 %	336233134
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1101	NC_015662	ATTTT	2	10	31694	31703	20 %	80 %	0 %	0 %	336233135
1102	NC_015662	T	6	6	31700	31705	0 %	100 %	0 %	0 %	336233135
1103	NC_015662	TAT	2	6	31717	31722	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336233135
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1105	NC_015662	TCA	2	6	31758	31763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336233135
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1107	NC_015662	TGG	2	6	31786	31791	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336233135
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1111	NC_015662	TA	3	6	31984	31989	50 %	50 %	0 %	0 %	336233135
1112	NC_015662	ATTT	2	8	31993	32000	25 %	75 %	0 %	0 %	336233135
1113	NC_015662	T	7	7	31998	32004	0 %	100 %	0 %	0 %	336233135
1114	NC_015662	AAT	2	6	32023	32028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_015662	TAA	2	6	32037	32042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_015662	GT	3	6	32060	32065	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_015662	AT	4	8	32069	32076	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_015662	ATA	2	6	32080	32085	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_015662	T	7	7	32107	32113	0 %	100 %	0 %	0 %	336233136
1120	NC_015662	T	7	7	32119	32125	0 %	100 %	0 %	0 %	336233136
1121	NC_015662	T	7	7	32194	32200	0 %	100 %	0 %	0 %	336233136
1122	NC_015662	CAT	2	6	32246	32251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336233136
1123	NC_015662	T	8	8	32309	32316	0 %	100 %	0 %	0 %	336233136
1124	NC_015662	TTA	2	6	32321	32326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336233136
1125	NC_015662	TATT	2	8	32333	32340	25 %	75 %	0 %	0 %	336233136
1126	NC_015662	TCAT	2	8	32431	32438	25 %	50 %	0 %	25 %	336233136
1127	NC_015662	AT	4	8	32453	32460	50 %	50 %	0 %	0 %	336233136
1128	NC_015662	A	6	6	32466	32471	100 %	0 %	0 %	0 %	336233136
1129	NC_015662	T	7	7	32499	32505	0 %	100 %	0 %	0 %	336233136
1130	NC_015662	CTT	2	6	32516	32521	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336233136
1131	NC_015662	TCT	2	6	32551	32556	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336233136
1132	NC_015662	T	6	6	32560	32565	0 %	100 %	0 %	0 %	336233136
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