MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Burkholderia gladioli BSR3 plasmid bgla_4p

Total Repeats: 368

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015383	GATGA	2	10	739	748	40 %	20 %	40 %	0 %	330814454
2	NC_015383	GCGCC	2	10	1986	1995	0 %	0 %	40 %	60 %	330814456
3	NC_015383	AGATC	2	10	2709	2718	40 %	20 %	20 %	20 %	330814456
4	NC_015383	CCGCA	2	10	3675	3684	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
5	NC_015383	GATCA	2	10	5993	6002	40 %	20 %	20 %	20 %	330814458
6	NC_015383	GACGG	2	10	8096	8105	20 %	0 %	60 %	20 %	330814460
7	NC_015383	GACGT	2	10	8651	8660	20 %	20 %	40 %	20 %	330814461
8	NC_015383	CCGAG	2	10	10115	10124	20 %	0 %	40 %	40 %	330814462
9	NC_015383	CGCGG	2	10	13373	13382	0 %	0 %	60 %	40 %	330814466
10	NC_015383	ACGTG	2	10	16831	16840	20 %	20 %	40 %	20 %	330814468
11	NC_015383	GGCGC	2	10	17055	17064	0 %	0 %	60 %	40 %	330814468
12	NC_015383	CGGTC	2	10	17078	17087	0 %	20 %	40 %	40 %	330814468
13	NC_015383	CGATT	2	10	18835	18844	20 %	40 %	20 %	20 %	330814470
14	NC_015383	GCCCG	2	10	19267	19276	0 %	0 %	40 %	60 %	330814471
15	NC_015383	TGGAC	2	10	20851	20860	20 %	20 %	40 %	20 %	330814472
16	NC_015383	ACGCG	2	10	21356	21365	20 %	0 %	40 %	40 %	330814473
17	NC_015383	AGTGA	2	10	24787	24796	40 %	20 %	40 %	0 %	330814478
18	NC_015383	CATCT	2	10	25241	25250	20 %	40 %	0 %	40 %	330814478
19	NC_015383	GGTCG	2	10	26931	26940	0 %	20 %	60 %	20 %	330814480
20	NC_015383	CGGCC	2	10	31060	31069	0 %	0 %	40 %	60 %	330814486
21	NC_015383	TGGCT	2	10	32160	32169	0 %	40 %	40 %	20 %	330814487
22	NC_015383	GGCAA	2	10	33180	33189	40 %	0 %	40 %	20 %	330814491
23	NC_015383	AAAGG	2	10	35118	35127	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015383	GCCGG	2	10	35449	35458	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
25	NC_015383	AGGCG	2	10	44414	44423	20 %	0 %	60 %	20 %	330814501
26	NC_015383	ATCGG	2	10	44687	44696	20 %	20 %	40 %	20 %	330814501
27	NC_015383	CCCGG	2	10	45830	45839	0 %	0 %	40 %	60 %	330814503
28	NC_015383	TGCGC	2	10	49177	49186	0 %	20 %	40 %	40 %	330814507
29	NC_015383	CGGTT	2	10	49343	49352	0 %	40 %	40 %	20 %	330814507
30	NC_015383	GATGG	2	10	49523	49532	20 %	20 %	60 %	0 %	330814508
31	NC_015383	TCGAG	2	10	51016	51025	20 %	20 %	40 %	20 %	330814511
32	NC_015383	GCCGG	2	10	54528	54537	0 %	0 %	60 %	40 %	330814516
33	NC_015383	GCTGA	2	10	57538	57547	20 %	20 %	40 %	20 %	330814519
34	NC_015383	GCGCG	2	10	58853	58862	0 %	0 %	60 %	40 %	330814520
35	NC_015383	ATCAC	2	10	61320	61329	40 %	20 %	0 %	40 %	330814524
36	NC_015383	GCGCA	3	15	63303	63317	20 %	0 %	40 %	40 %	330814524
37	NC_015383	TGCAG	2	10	63514	63523	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
38	NC_015383	GCCGT	2	10	68465	68474	0 %	20 %	40 %	40 %	330814528
39	NC_015383	GTCGC	2	10	73230	73239	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
40	NC_015383	GAGTC	2	10	74168	74177	20 %	20 %	40 %	20 %	330814535
41	NC_015383	AGGGC	2	10	76508	76517	20 %	0 %	60 %	20 %	330814538
42	NC_015383	CTTCG	2	10	77268	77277	0 %	40 %	20 %	40 %	330814538
43	NC_015383	ACTTC	2	10	77403	77412	20 %	40 %	0 %	40 %	330814538
44	NC_015383	GCACG	2	10	78766	78775	20 %	0 %	40 %	40 %	330814540
45	NC_015383	CAGCG	2	10	79433	79442	20 %	0 %	40 %	40 %	330814540
46	NC_015383	TTTTC	2	10	79682	79691	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
47	NC_015383	CGGGA	2	10	80302	80311	20 %	0 %	60 %	20 %	330814542
48	NC_015383	ACGTG	2	10	81479	81488	20 %	20 %	40 %	20 %	330814542
49	NC_015383	GCGAG	2	10	81783	81792	20 %	0 %	60 %	20 %	330814542
50	NC_015383	GCTGT	2	10	83646	83655	0 %	40 %	40 %	20 %	330814545
51	NC_015383	CGATT	2	10	86435	86444	20 %	40 %	20 %	20 %	330814547
52	NC_015383	CGGAC	2	10	88409	88418	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
53	NC_015383	GCGCA	2	10	89571	89580	20 %	0 %	40 %	40 %	330814549
54	NC_015383	GGCCT	2	10	89998	90007	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
55	NC_015383	CGAAA	2	10	90590	90599	60 %	0 %	20 %	20 %	330814551
56	NC_015383	CGGTT	2	10	91020	91029	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
57	NC_015383	TGCGC	2	10	92868	92877	0 %	20 %	40 %	40 %	330814554
58	NC_015383	TGCCG	2	10	93507	93516	0 %	20 %	40 %	40 %	330814554
59	NC_015383	CACGC	2	10	93733	93742	20 %	0 %	20 %	60 %	330814554
60	NC_015383	AGCGA	2	10	94055	94064	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
61	NC_015383	GTCCG	2	10	94415	94424	0 %	20 %	40 %	40 %	330814555
62	NC_015383	ATGCA	2	10	94569	94578	40 %	20 %	20 %	20 %	330814555
63	NC_015383	GATCG	2	10	94581	94590	20 %	20 %	40 %	20 %	330814555
64	NC_015383	GGGTC	2	10	94658	94667	0 %	20 %	60 %	20 %	330814555
65	NC_015383	CGCGG	2	10	95715	95724	0 %	0 %	60 %	40 %	330814556
66	NC_015383	CGGCG	2	10	95931	95940	0 %	0 %	60 %	40 %	330814556
67	NC_015383	GCGCA	2	10	96754	96763	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
68	NC_015383	ACTGA	2	10	97398	97407	40 %	20 %	20 %	20 %	330814557
69	NC_015383	GCAGG	2	10	98611	98620	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
70	NC_015383	CGCGC	2	10	99746	99755	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
71	NC_015383	CCCCG	2	10	100238	100247	0 %	0 %	20 %	80 %	330814558
72	NC_015383	CGGCG	2	10	100639	100648	0 %	0 %	60 %	40 %	330814558
73	NC_015383	CAGCC	2	10	102540	102549	20 %	0 %	20 %	60 %	330814559
74	NC_015383	AAGCG	2	10	105933	105942	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
75	NC_015383	AGCCA	2	10	106565	106574	40 %	0 %	20 %	40 %	330814564
76	NC_015383	TCGAC	2	10	107247	107256	20 %	20 %	20 %	40 %	330814564
77	NC_015383	GCCAG	2	10	107429	107438	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
78	NC_015383	TGGGC	2	10	107589	107598	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
79	NC_015383	CGGCG	2	10	108866	108875	0 %	0 %	60 %	40 %	330814565
80	NC_015383	AGCGG	2	10	112905	112914	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
81	NC_015383	CGTCG	2	10	113670	113679	0 %	20 %	40 %	40 %	330814569
82	NC_015383	TCCGT	2	10	114117	114126	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
83	NC_015383	GTTCA	2	10	116147	116156	20 %	40 %	20 %	20 %	330814571
84	NC_015383	GGATG	2	10	117693	117702	20 %	20 %	60 %	0 %	330814572
85	NC_015383	TCCCA	2	10	117850	117859	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
86	NC_015383	AAGCG	2	10	119668	119677	40 %	0 %	40 %	20 %	330814576
87	NC_015383	TGCGC	2	10	120204	120213	0 %	20 %	40 %	40 %	330814576
88	NC_015383	GTGGC	2	10	120405	120414	0 %	20 %	60 %	20 %	330814576
89	NC_015383	AGCCG	2	10	120540	120549	20 %	0 %	40 %	40 %	330814576
90	NC_015383	GGCAG	2	10	122098	122107	20 %	0 %	60 %	20 %	330814577
91	NC_015383	TGCCG	2	10	123608	123617	0 %	20 %	40 %	40 %	330814579
92	NC_015383	CGCGA	2	10	125525	125534	20 %	0 %	40 %	40 %	330814580
93	NC_015383	TCGCG	2	10	126421	126430	0 %	20 %	40 %	40 %	330814581
94	NC_015383	CGGTT	2	10	127222	127231	0 %	40 %	40 %	20 %	330814582
95	NC_015383	AAGCG	2	10	132553	132562	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
96	NC_015383	CAAAC	2	10	132664	132673	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
97	NC_015383	GCGAG	2	10	132850	132859	20 %	0 %	60 %	20 %	330814587
98	NC_015383	GTCGC	2	10	135477	135486	0 %	20 %	40 %	40 %	330814589
99	NC_015383	ATGGA	2	10	136028	136037	40 %	20 %	40 %	0 %	330814589
100	NC_015383	TCACG	2	10	136854	136863	20 %	20 %	20 %	40 %	330814589
101	NC_015383	TGCGT	2	10	137068	137077	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
102	NC_015383	ACGCA	2	10	139897	139906	40 %	0 %	20 %	40 %	330814592
103	NC_015383	GACTG	2	10	140511	140520	20 %	20 %	40 %	20 %	330814592
104	NC_015383	ATCGC	2	10	140758	140767	20 %	20 %	20 %	40 %	330814592
105	NC_015383	TCGCG	2	10	141014	141023	0 %	20 %	40 %	40 %	330814592
106	NC_015383	GGCCG	2	10	141338	141347	0 %	0 %	60 %	40 %	330814593
107	NC_015383	CGCGG	2	10	141607	141616	0 %	0 %	60 %	40 %	330814593
108	NC_015383	GCGAA	2	10	141748	141757	40 %	0 %	40 %	20 %	330814593
109	NC_015383	GCTGG	2	10	142208	142217	0 %	20 %	60 %	20 %	330814593
110	NC_015383	GTTCG	2	10	144336	144345	0 %	40 %	40 %	20 %	330814595
111	NC_015383	GTCAT	2	10	145060	145069	20 %	40 %	20 %	20 %	330814595
112	NC_015383	TCGAA	2	10	146115	146124	40 %	20 %	20 %	20 %	330814596
113	NC_015383	TCTTT	2	10	146225	146234	0 %	80 %	0 %	20 %	330814596
114	NC_015383	TCGAT	2	10	146252	146261	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
115	NC_015383	CGTGA	2	10	147358	147367	20 %	20 %	40 %	20 %	330814597
116	NC_015383	CGCAA	2	10	147901	147910	40 %	0 %	20 %	40 %	330814598
117	NC_015383	GGGGC	2	10	148613	148622	0 %	0 %	80 %	20 %	330814598
118	NC_015383	TGCGG	2	10	149348	149357	0 %	20 %	60 %	20 %	330814599
119	NC_015383	CACGC	2	10	151461	151470	20 %	0 %	20 %	60 %	330814600
120	NC_015383	TCGGT	2	10	152284	152293	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
121	NC_015383	CGGCG	2	10	153108	153117	0 %	0 %	60 %	40 %	330814601
122	NC_015383	GCGCG	2	10	153289	153298	0 %	0 %	60 %	40 %	330814601
123	NC_015383	GCCGA	2	10	154481	154490	20 %	0 %	40 %	40 %	330814602
124	NC_015383	GCGTC	2	10	155022	155031	0 %	20 %	40 %	40 %	330814602
125	NC_015383	CGGCG	2	10	155079	155088	0 %	0 %	60 %	40 %	330814602
126	NC_015383	GTGAC	2	10	155339	155348	20 %	20 %	40 %	20 %	330814602
127	NC_015383	CGAGC	2	10	155704	155713	20 %	0 %	40 %	40 %	330814602
128	NC_015383	GCCGC	2	10	155871	155880	0 %	0 %	40 %	60 %	330814602
129	NC_015383	GATTG	2	10	156932	156941	20 %	40 %	40 %	0 %	330814603
130	NC_015383	TCGCG	2	10	159223	159232	0 %	20 %	40 %	40 %	330814605
131	NC_015383	CGATG	2	10	159528	159537	20 %	20 %	40 %	20 %	330814605
132	NC_015383	ATCGA	2	10	159936	159945	40 %	20 %	20 %	20 %	330814606
133	NC_015383	GCACG	2	10	160606	160615	20 %	0 %	40 %	40 %	330814607
134	NC_015383	TGGCG	2	10	161407	161416	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
135	NC_015383	AAAGC	2	10	164323	164332	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
136	NC_015383	CTCTC	2	10	164382	164391	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
137	NC_015383	TGATG	2	10	165563	165572	20 %	40 %	40 %	0 %	330814610
138	NC_015383	GAAAG	2	10	166238	166247	60 %	0 %	40 %	0 %	330814611
139	NC_015383	TCGGC	2	10	168266	168275	0 %	20 %	40 %	40 %	330814614
140	NC_015383	CTTTC	2	10	169578	169587	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
141	NC_015383	GGCGC	2	10	169965	169974	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
142	NC_015383	GTGCA	2	10	171200	171209	20 %	20 %	40 %	20 %	330814615
143	NC_015383	GCGGG	2	10	174004	174013	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
144	NC_015383	CAGCC	2	10	175077	175086	20 %	0 %	20 %	60 %	330814617
145	NC_015383	TGGGC	2	10	175949	175958	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
146	NC_015383	CAACG	2	10	177333	177342	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
147	NC_015383	CGTGG	2	10	177720	177729	0 %	20 %	60 %	20 %	330814620
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149	NC_015383	TCGAT	2	10	181947	181956	20 %	40 %	20 %	20 %	330814625
150	NC_015383	CGCGT	2	10	185265	185274	0 %	20 %	40 %	40 %	330814626
151	NC_015383	TGCGC	2	10	187820	187829	0 %	20 %	40 %	40 %	330814627
152	NC_015383	ATCCG	2	10	188787	188796	20 %	20 %	20 %	40 %	330814628
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154	NC_015383	GGGCC	2	10	190239	190248	0 %	0 %	60 %	40 %	330814628
155	NC_015383	GCCGC	2	10	190665	190674	0 %	0 %	40 %	60 %	330814628
156	NC_015383	GGGCC	2	10	190879	190888	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
157	NC_015383	GCGCC	2	10	191275	191284	0 %	0 %	40 %	60 %	330814629
158	NC_015383	CGAGC	2	10	191301	191310	20 %	0 %	40 %	40 %	330814629
159	NC_015383	GGGCC	2	10	191416	191425	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
160	NC_015383	GGGCC	2	10	192215	192224	0 %	0 %	60 %	40 %	330814630
161	NC_015383	GCCTG	2	10	192407	192416	0 %	20 %	40 %	40 %	330814630
162	NC_015383	GCGCA	2	10	193643	193652	20 %	0 %	40 %	40 %	330814631
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164	NC_015383	CGCGC	2	10	195200	195209	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
165	NC_015383	AAGGC	2	10	195943	195952	40 %	0 %	40 %	20 %	330814632
166	NC_015383	CGGCT	2	10	195975	195984	0 %	20 %	40 %	40 %	330814632
167	NC_015383	GCCGG	2	10	196074	196083	0 %	0 %	60 %	40 %	330814632
168	NC_015383	GTGCG	2	10	196114	196123	0 %	20 %	60 %	20 %	330814632
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171	NC_015383	GGGGC	2	10	200085	200094	0 %	0 %	80 %	20 %	330814634
172	NC_015383	CGCGC	2	10	201973	201982	0 %	0 %	40 %	60 %	330814634
173	NC_015383	GCCGG	2	10	202436	202445	0 %	0 %	60 %	40 %	330814634
174	NC_015383	CGGCG	2	10	202478	202487	0 %	0 %	60 %	40 %	330814634
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176	NC_015383	GCGCA	2	10	205241	205250	20 %	0 %	40 %	40 %	330814634
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178	NC_015383	CTCGC	2	10	206584	206593	0 %	20 %	20 %	60 %	330814635
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190	NC_015383	CCGCG	2	10	209942	209951	0 %	0 %	40 %	60 %	330814635
191	NC_015383	CCGGG	2	10	213737	213746	0 %	0 %	60 %	40 %	330814635
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196	NC_015383	ATCGC	2	10	215665	215674	20 %	20 %	20 %	40 %	330814635
197	NC_015383	ATGCC	2	10	216392	216401	20 %	20 %	20 %	40 %	330814635
198	NC_015383	GCGCC	2	10	216674	216683	0 %	0 %	40 %	60 %	330814635
199	NC_015383	CCGCG	2	10	216941	216950	0 %	0 %	40 %	60 %	330814635
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204	NC_015383	CGCTC	2	10	218981	218990	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
205	NC_015383	GATCG	2	10	218992	219001	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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215	NC_015383	GCCAT	2	10	229781	229790	20 %	20 %	20 %	40 %	330814641
216	NC_015383	TGGGA	2	10	231891	231900	20 %	20 %	60 %	0 %	330814643
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220	NC_015383	GCCAG	2	10	235178	235187	20 %	0 %	40 %	40 %	330814646
221	NC_015383	CCTGA	2	10	237236	237245	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
222	NC_015383	CCATC	2	10	240643	240652	20 %	20 %	0 %	60 %	330814650
223	NC_015383	TCGAC	2	10	241007	241016	20 %	20 %	20 %	40 %	330814650
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227	NC_015383	GGGTC	2	10	243779	243788	0 %	20 %	60 %	20 %	330814650
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233	NC_015383	GCGCA	2	10	250776	250785	20 %	0 %	40 %	40 %	330814654
234	NC_015383	GGGTT	2	10	251026	251035	0 %	40 %	60 %	0 %	330814654
235	NC_015383	CCGAT	2	10	252108	252117	20 %	20 %	20 %	40 %	330814654
236	NC_015383	GATCG	2	10	253000	253009	20 %	20 %	40 %	20 %	330814655
237	NC_015383	CATCG	2	10	253255	253264	20 %	20 %	20 %	40 %	330814655
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241	NC_015383	TTCGC	2	10	258311	258320	0 %	40 %	20 %	40 %	330814660
242	NC_015383	ACGCG	2	10	258600	258609	20 %	0 %	40 %	40 %	330814660
243	NC_015383	TGGAC	2	10	258877	258886	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
244	NC_015383	CCGCG	2	10	260364	260373	0 %	0 %	40 %	60 %	330814661
245	NC_015383	TACCT	2	10	261638	261647	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
246	NC_015383	GAGCC	2	10	262978	262987	20 %	0 %	40 %	40 %	330814663
247	NC_015383	ATCGC	2	10	264542	264551	20 %	20 %	20 %	40 %	330814665
248	NC_015383	GCACG	2	10	266002	266011	20 %	0 %	40 %	40 %	330814665
249	NC_015383	GCGGT	2	10	267486	267495	0 %	20 %	60 %	20 %	330814667
250	NC_015383	GGGAC	2	10	267509	267518	20 %	0 %	60 %	20 %	330814667
251	NC_015383	CGTCG	2	10	268081	268090	0 %	20 %	40 %	40 %	330814667
252	NC_015383	TCTGA	2	10	269831	269840	20 %	40 %	20 %	20 %	330814668
253	NC_015383	TTCGC	2	10	270936	270945	0 %	40 %	20 %	40 %	330814668
254	NC_015383	GCTCA	2	10	272344	272353	20 %	20 %	20 %	40 %	330814668
255	NC_015383	TATCA	2	10	273062	273071	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
256	NC_015383	CCCCG	2	10	274218	274227	0 %	0 %	20 %	80 %	330814670
257	NC_015383	GCGAC	2	10	274884	274893	20 %	0 %	40 %	40 %	330814671
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261	NC_015383	GGCGC	2	10	279084	279093	0 %	0 %	60 %	40 %	330814674
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264	NC_015383	TGGCT	2	10	283247	283256	0 %	40 %	40 %	20 %	330814679
265	NC_015383	CCCCT	2	10	283560	283569	0 %	20 %	0 %	80 %	330814679
266	NC_015383	CGCGC	2	10	284864	284873	0 %	0 %	40 %	60 %	330814680
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268	NC_015383	CTCGC	2	10	285312	285321	0 %	20 %	20 %	60 %	330814680
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367	NC_015383	AGCGT	2	10	398879	398888	20 %	20 %	40 %	20 %	330814770
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.