MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Burkholderia gladioli BSR3 chromosome 2

Total Repeats: 4343

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015376	AGGGC	2	10	1745	1754	20 %	0 %	60 %	20 %	330819135
2	NC_015376	AGGCC	2	10	3121	3130	20 %	0 %	40 %	40 %	330819136
3	NC_015376	TCGAA	2	10	3394	3403	40 %	20 %	20 %	20 %	330819136
4	NC_015376	TCGGA	2	10	3629	3638	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
5	NC_015376	TCACC	2	10	3866	3875	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
6	NC_015376	ACCTC	2	10	4835	4844	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
7	NC_015376	CCTCA	2	10	4976	4985	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
8	NC_015376	CCTCA	2	10	5076	5085	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
9	NC_015376	CGGCG	2	10	6338	6347	0 %	0 %	60 %	40 %	330819137
10	NC_015376	GATCG	2	10	6833	6842	20 %	20 %	40 %	20 %	330819137
11	NC_015376	CAGAC	2	10	7098	7107	40 %	0 %	20 %	40 %	330819138
12	NC_015376	CGCGG	2	10	9345	9354	0 %	0 %	60 %	40 %	330819140
13	NC_015376	TGAAC	2	10	9934	9943	40 %	20 %	20 %	20 %	330819141
14	NC_015376	CGATG	2	10	11500	11509	20 %	20 %	40 %	20 %	330819142
15	NC_015376	CGATG	2	10	11803	11812	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
16	NC_015376	GATCG	2	10	12186	12195	20 %	20 %	40 %	20 %	330819143
17	NC_015376	TCGAA	2	10	13590	13599	40 %	20 %	20 %	20 %	330819145
18	NC_015376	GGCGC	2	10	13624	13633	0 %	0 %	60 %	40 %	330819145
19	NC_015376	GATCC	2	10	13799	13808	20 %	20 %	20 %	40 %	330819145
20	NC_015376	TTCGC	2	10	14782	14791	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
21	NC_015376	TGCGT	2	10	14807	14816	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
22	NC_015376	TGAGG	2	10	15078	15087	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015376	AGGAC	2	10	15191	15200	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
24	NC_015376	GGCCG	2	10	15525	15534	0 %	0 %	60 %	40 %	330819147
25	NC_015376	TCGAT	2	10	17383	17392	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
26	NC_015376	TCGTG	2	10	18224	18233	0 %	40 %	40 %	20 %	330819150
27	NC_015376	CGGCA	2	10	19441	19450	20 %	0 %	40 %	40 %	330819151
28	NC_015376	GGCCG	2	10	22249	22258	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
29	NC_015376	CGAAC	2	10	22273	22282	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
30	NC_015376	AGCGC	2	10	22593	22602	20 %	0 %	40 %	40 %	330819153
31	NC_015376	TCGCC	2	10	25216	25225	0 %	20 %	20 %	60 %	330819155
32	NC_015376	CGCGG	2	10	25245	25254	0 %	0 %	60 %	40 %	330819155
33	NC_015376	GCGCC	2	10	26886	26895	0 %	0 %	40 %	60 %	330819157
34	NC_015376	GTCGC	2	10	27827	27836	0 %	20 %	40 %	40 %	330819158
35	NC_015376	CGAGC	2	10	28460	28469	20 %	0 %	40 %	40 %	330819158
36	NC_015376	GGCCG	2	10	29560	29569	0 %	0 %	60 %	40 %	330819160
37	NC_015376	GCCGC	2	10	30487	30496	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
38	NC_015376	GGCGC	2	10	32840	32849	0 %	0 %	60 %	40 %	330819164
39	NC_015376	GTGGC	2	10	33604	33613	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
40	NC_015376	GCGAG	2	10	34058	34067	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
41	NC_015376	TCCCC	2	10	34204	34213	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
42	NC_015376	ATCAG	2	10	35779	35788	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
43	NC_015376	GGACG	2	10	36697	36706	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
44	NC_015376	CCAGG	2	10	37200	37209	20 %	0 %	40 %	40 %	330819167
45	NC_015376	GGCCG	2	10	37332	37341	0 %	0 %	60 %	40 %	330819167
46	NC_015376	GCCGT	2	10	37783	37792	0 %	20 %	40 %	40 %	330819167
47	NC_015376	TTCGT	2	10	39698	39707	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
48	NC_015376	GTTCG	2	10	40613	40622	0 %	40 %	40 %	20 %	330819168
49	NC_015376	CTGGC	2	10	42832	42841	0 %	20 %	40 %	40 %	330819170
50	NC_015376	GCGAG	2	10	43373	43382	20 %	0 %	60 %	20 %	330819171
51	NC_015376	GCGCG	2	10	46986	46995	0 %	0 %	60 %	40 %	330819175
52	NC_015376	GTCCG	2	10	47256	47265	0 %	20 %	40 %	40 %	330819175
53	NC_015376	GCCGG	2	10	47622	47631	0 %	0 %	60 %	40 %	330819176
54	NC_015376	TCCGA	2	10	48640	48649	20 %	20 %	20 %	40 %	330819176
55	NC_015376	GCGCC	2	10	51211	51220	0 %	0 %	40 %	60 %	330819178
56	NC_015376	TGCGC	2	10	52426	52435	0 %	20 %	40 %	40 %	330819179
57	NC_015376	TGGCG	2	10	52954	52963	0 %	20 %	60 %	20 %	330819180
58	NC_015376	TCGTG	2	10	53576	53585	0 %	40 %	40 %	20 %	330819181
59	NC_015376	CGCTG	2	10	54124	54133	0 %	20 %	40 %	40 %	330819182
60	NC_015376	TGCGC	2	10	54748	54757	0 %	20 %	40 %	40 %	330819183
61	NC_015376	TGGAT	2	10	55983	55992	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015376	GCCGC	2	10	56852	56861	0 %	0 %	40 %	60 %	330819184
63	NC_015376	ATCGG	2	10	57632	57641	20 %	20 %	40 %	20 %	330819184
64	NC_015376	GTGAC	2	10	58470	58479	20 %	20 %	40 %	20 %	330819184
65	NC_015376	CGAGC	2	10	59959	59968	20 %	0 %	40 %	40 %	330819184
66	NC_015376	ACGGC	2	10	60105	60114	20 %	0 %	40 %	40 %	330819184
67	NC_015376	GTGAC	2	10	60357	60366	20 %	20 %	40 %	20 %	330819184
68	NC_015376	GACAC	2	10	61016	61025	40 %	0 %	20 %	40 %	330819184
69	NC_015376	GCCGG	2	10	63016	63025	0 %	0 %	60 %	40 %	330819184
70	NC_015376	TGCCC	2	10	66378	66387	0 %	20 %	20 %	60 %	330819185
71	NC_015376	GATCG	2	10	67353	67362	20 %	20 %	40 %	20 %	330819185
72	NC_015376	CGGGA	2	10	67648	67657	20 %	0 %	60 %	20 %	330819185
73	NC_015376	TCGGC	2	10	67770	67779	0 %	20 %	40 %	40 %	330819185
74	NC_015376	CGATG	2	10	67911	67920	20 %	20 %	40 %	20 %	330819185
75	NC_015376	GGCCG	2	10	67933	67942	0 %	0 %	60 %	40 %	330819185
76	NC_015376	CGGCC	2	10	68594	68603	0 %	0 %	40 %	60 %	330819185
77	NC_015376	GACGC	2	10	68881	68890	20 %	0 %	40 %	40 %	330819185
78	NC_015376	GCTCG	2	10	70887	70896	0 %	20 %	40 %	40 %	330819185
79	NC_015376	GCCGC	2	10	71695	71704	0 %	0 %	40 %	60 %	330819185
80	NC_015376	ACTGG	2	10	72552	72561	20 %	20 %	40 %	20 %	330819185
81	NC_015376	GCGCT	2	10	74198	74207	0 %	20 %	40 %	40 %	330819186
82	NC_015376	CGTTG	2	10	74764	74773	0 %	40 %	40 %	20 %	330819186
83	NC_015376	CCTGG	2	10	75333	75342	0 %	20 %	40 %	40 %	330819187
84	NC_015376	CGACC	2	10	75501	75510	20 %	0 %	20 %	60 %	330819187
85	NC_015376	TCGCC	2	10	76810	76819	0 %	20 %	20 %	60 %	330819188
86	NC_015376	GCTGC	2	10	80766	80775	0 %	20 %	40 %	40 %	330819191
87	NC_015376	GCGAG	2	10	81842	81851	20 %	0 %	60 %	20 %	330819193
88	NC_015376	AAAGG	2	10	82596	82605	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015376	GCCGC	2	10	84149	84158	0 %	0 %	40 %	60 %	330819196
90	NC_015376	CAGCG	2	10	84183	84192	20 %	0 %	40 %	40 %	330819196
91	NC_015376	GGCGC	2	10	84250	84259	0 %	0 %	60 %	40 %	330819196
92	NC_015376	GCGTG	2	10	85209	85218	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
93	NC_015376	GCCTG	2	10	86318	86327	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
94	NC_015376	CAAGC	2	10	86703	86712	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
95	NC_015376	CGCGG	2	10	87592	87601	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
96	NC_015376	GGCTC	2	10	89995	90004	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
97	NC_015376	CGGCG	2	10	92201	92210	0 %	0 %	60 %	40 %	330819206
98	NC_015376	AGCGA	2	10	92497	92506	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
99	NC_015376	CTTGC	2	10	92887	92896	0 %	40 %	20 %	40 %	330819207
100	NC_015376	GCCGC	2	10	93575	93584	0 %	0 %	40 %	60 %	330819208
101	NC_015376	CCGTG	2	10	94845	94854	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
102	NC_015376	CTGGT	2	10	95502	95511	0 %	40 %	40 %	20 %	330819209
103	NC_015376	GGGCT	2	10	97199	97208	0 %	20 %	60 %	20 %	330819210
104	NC_015376	CGCGC	2	10	98413	98422	0 %	0 %	40 %	60 %	330819211
105	NC_015376	CGGCG	2	10	98790	98799	0 %	0 %	60 %	40 %	330819211
106	NC_015376	CGCGC	2	10	98944	98953	0 %	0 %	40 %	60 %	330819211
107	NC_015376	TGGCG	2	10	99234	99243	0 %	20 %	60 %	20 %	330819211
108	NC_015376	GGCCG	2	10	99342	99351	0 %	0 %	60 %	40 %	330819211
109	NC_015376	CGAGG	2	10	100216	100225	20 %	0 %	60 %	20 %	330819212
110	NC_015376	GCCGC	2	10	100318	100327	0 %	0 %	40 %	60 %	330819212
111	NC_015376	AGGCC	2	10	100458	100467	20 %	0 %	40 %	40 %	330819212
112	NC_015376	GCATG	2	10	101526	101535	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
113	NC_015376	ATCCG	2	10	101633	101642	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
114	NC_015376	GCGCG	2	10	102710	102719	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
115	NC_015376	TGGCC	2	10	102948	102957	0 %	20 %	40 %	40 %	330819215
116	NC_015376	GCCAC	2	10	104017	104026	20 %	0 %	20 %	60 %	330819216
117	NC_015376	GCGCT	2	10	104157	104166	0 %	20 %	40 %	40 %	330819216
118	NC_015376	CGGCT	2	10	104568	104577	0 %	20 %	40 %	40 %	330819216
119	NC_015376	ATCGA	2	10	108324	108333	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
120	NC_015376	TCGCG	2	10	108348	108357	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
121	NC_015376	AACCC	2	10	108436	108445	40 %	0 %	0 %	60 %	330819221
122	NC_015376	GGCCG	2	10	108915	108924	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
123	NC_015376	CCGGC	2	10	110254	110263	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
124	NC_015376	TGGCG	2	10	110693	110702	0 %	20 %	60 %	20 %	330819225
125	NC_015376	GCCGG	2	10	110858	110867	0 %	0 %	60 %	40 %	330819225
126	NC_015376	CCGGC	2	10	111147	111156	0 %	0 %	40 %	60 %	330819225
127	NC_015376	ACGCG	2	10	111752	111761	20 %	0 %	40 %	40 %	330819226
128	NC_015376	CCCGG	2	10	111790	111799	0 %	0 %	40 %	60 %	330819226
129	NC_015376	CCCAG	2	10	112341	112350	20 %	0 %	20 %	60 %	330819227
130	NC_015376	GGCGC	2	10	113370	113379	0 %	0 %	60 %	40 %	330819228
131	NC_015376	TTTCT	2	10	113867	113876	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
132	NC_015376	CTGGA	2	10	114121	114130	20 %	20 %	40 %	20 %	330819229
133	NC_015376	CAGGA	2	10	115235	115244	40 %	0 %	40 %	20 %	330819230
134	NC_015376	CGGCG	2	10	115276	115285	0 %	0 %	60 %	40 %	330819230
135	NC_015376	GCGCG	2	10	115612	115621	0 %	0 %	60 %	40 %	330819230
136	NC_015376	GGGCA	2	10	115655	115664	20 %	0 %	60 %	20 %	330819230
137	NC_015376	CAAGC	2	10	115823	115832	40 %	0 %	20 %	40 %	330819230
138	NC_015376	GTCCT	2	10	117548	117557	0 %	40 %	20 %	40 %	330819231
139	NC_015376	TCCCG	2	10	117606	117615	0 %	20 %	20 %	60 %	330819232
140	NC_015376	GACCA	2	10	119175	119184	40 %	0 %	20 %	40 %	330819233
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144	NC_015376	GGCCG	2	10	122989	122998	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
145	NC_015376	GACAT	2	10	123132	123141	40 %	20 %	20 %	20 %	330819238
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149	NC_015376	CGGCG	2	10	127521	127530	0 %	0 %	60 %	40 %	330819241
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152	NC_015376	GCCGA	2	10	129731	129740	20 %	0 %	40 %	40 %	330819244
153	NC_015376	TGAGC	2	10	131067	131076	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
154	NC_015376	GGCAA	2	10	131118	131127	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
155	NC_015376	TGCGC	2	10	131397	131406	0 %	20 %	40 %	40 %	330819246
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158	NC_015376	GCGAT	2	10	132266	132275	20 %	20 %	40 %	20 %	330819247
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161	NC_015376	GGCGC	2	10	137661	137670	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
162	NC_015376	TGCCG	2	10	139411	139420	0 %	20 %	40 %	40 %	330819255
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173	NC_015376	GCCCG	2	10	150398	150407	0 %	0 %	40 %	60 %	330819269
174	NC_015376	GCCGG	2	10	151778	151787	0 %	0 %	60 %	40 %	330819271
175	NC_015376	ACTGG	2	10	153299	153308	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
176	NC_015376	CGCGG	2	10	154537	154546	0 %	0 %	60 %	40 %	330819272
177	NC_015376	TCGAT	2	10	155035	155044	20 %	40 %	20 %	20 %	330819272
178	NC_015376	GCCGC	2	10	155382	155391	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
179	NC_015376	TCGGC	2	10	155636	155645	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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181	NC_015376	TCGCA	2	10	155928	155937	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
182	NC_015376	CATCG	2	10	156437	156446	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
183	NC_015376	GCAGC	3	15	157359	157373	20 %	0 %	40 %	40 %	330819274
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191	NC_015376	CGACC	2	10	165871	165880	20 %	0 %	20 %	60 %	330819280
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241	NC_015376	GCCGC	2	10	206640	206649	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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243	NC_015376	CGGCG	2	10	207739	207748	0 %	0 %	60 %	40 %	330819311
244	NC_015376	GCCGA	2	10	208019	208028	20 %	0 %	40 %	40 %	330819311
245	NC_015376	GATGT	2	10	208076	208085	20 %	40 %	40 %	0 %	330819311
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250	NC_015376	GAGCT	2	10	211565	211574	20 %	20 %	40 %	20 %	330819315
251	NC_015376	GGCGG	2	10	212230	212239	0 %	0 %	80 %	20 %	330819315
252	NC_015376	ATGAC	2	10	212635	212644	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
253	NC_015376	CATCG	2	10	212675	212684	20 %	20 %	20 %	40 %	330819316
254	NC_015376	GCATG	2	10	213346	213355	20 %	20 %	40 %	20 %	330819316
255	NC_015376	CACGG	2	10	213414	213423	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
256	NC_015376	GGCCG	2	10	214687	214696	0 %	0 %	60 %	40 %	330819317
257	NC_015376	AGCCG	2	10	214762	214771	20 %	0 %	40 %	40 %	330819317
258	NC_015376	CGCAG	2	10	215461	215470	20 %	0 %	40 %	40 %	330819317
259	NC_015376	GGGCA	2	10	216733	216742	20 %	0 %	60 %	20 %	330819318
260	NC_015376	CGCGG	2	10	217559	217568	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
261	NC_015376	GCCGA	2	10	218334	218343	20 %	0 %	40 %	40 %	330819319
262	NC_015376	GGCGC	2	10	219002	219011	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
263	NC_015376	CGGCG	2	10	219222	219231	0 %	0 %	60 %	40 %	330819320
264	NC_015376	GGTGA	2	10	219835	219844	20 %	20 %	60 %	0 %	330819320
265	NC_015376	CGCCT	2	10	221347	221356	0 %	20 %	20 %	60 %	330819323
266	NC_015376	CTTGA	2	10	221598	221607	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
267	NC_015376	GCCGG	2	10	221888	221897	0 %	0 %	60 %	40 %	330819324
268	NC_015376	CTTTT	2	10	223931	223940	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
269	NC_015376	TTCCG	2	10	224321	224330	0 %	40 %	20 %	40 %	330819326
270	NC_015376	ACGCC	2	10	224456	224465	20 %	0 %	20 %	60 %	330819326
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272	NC_015376	GGCGC	2	10	227946	227955	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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