MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bifidobacterium longum subsp. longum JCM 1217 chromosome

Total Repeats: 52904

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_015067	AGGT	2	8	177427	177434	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4002	NC_015067	TAG	2	6	177435	177440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4003	NC_015067	TCG	2	6	177460	177465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690330
4004	NC_015067	GC	3	6	177526	177531	0 %	0 %	50 %	50 %	322690330
4005	NC_015067	CA	3	6	177550	177555	50 %	0 %	0 %	50 %	322690330
4006	NC_015067	CG	3	6	177601	177606	0 %	0 %	50 %	50 %	322690330
4007	NC_015067	GCG	2	6	177657	177662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690330
4008	NC_015067	CGG	2	6	177691	177696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690330
4009	NC_015067	GAT	2	6	177749	177754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690330
4010	NC_015067	GC	3	6	177791	177796	0 %	0 %	50 %	50 %	322690330
4011	NC_015067	GCA	2	6	177841	177846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690330
4012	NC_015067	GCT	2	6	177859	177864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690330
4013	NC_015067	GCC	2	6	177880	177885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690330
4014	NC_015067	CCA	2	6	177909	177914	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690330
4015	NC_015067	CACC	2	8	177952	177959	25 %	0 %	0 %	75 %	322690330
4016	NC_015067	TCCGT	2	10	177964	177973	0 %	40 %	20 %	40 %	322690330
4017	NC_015067	AAGG	2	8	178022	178029	50 %	0 %	50 %	0 %	322690330
4018	NC_015067	AGCCCG	2	12	178035	178046	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	322690330
4019	NC_015067	GC	3	6	178066	178071	0 %	0 %	50 %	50 %	322690330
4020	NC_015067	GGC	2	6	178076	178081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690330
4021	NC_015067	TGGT	2	8	178119	178126	0 %	50 %	50 %	0 %	322690330
4022	NC_015067	ATG	2	6	178149	178154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690330
4023	NC_015067	CGG	2	6	178267	178272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690330
4024	NC_015067	TCG	2	6	178290	178295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690330
4025	NC_015067	CTG	2	6	178322	178327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690330
4026	NC_015067	GCCAA	2	10	178407	178416	40 %	0 %	20 %	40 %	322690330
4027	NC_015067	CAT	2	6	178453	178458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690330
4028	NC_015067	CTG	2	6	178514	178519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690330
4029	NC_015067	CG	3	6	178522	178527	0 %	0 %	50 %	50 %	322690330
4030	NC_015067	TTG	2	6	178529	178534	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322690330
4031	NC_015067	CTT	2	6	178578	178583	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322690330
4032	NC_015067	GCC	2	6	178591	178596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690330
4033	NC_015067	GCT	2	6	178601	178606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690330
4034	NC_015067	CTTCGA	2	12	178608	178619	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	322690330
4035	NC_015067	TGC	2	6	178711	178716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690330
4036	NC_015067	AGCA	2	8	178725	178732	50 %	0 %	25 %	25 %	322690330
4037	NC_015067	CGAC	2	8	178801	178808	25 %	0 %	25 %	50 %	322690330
4038	NC_015067	CT	3	6	178816	178821	0 %	50 %	0 %	50 %	322690330
4039	NC_015067	CTG	2	6	178833	178838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690330
4040	NC_015067	CTG	3	9	178845	178853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690330
4041	NC_015067	GCC	2	6	178868	178873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690330
4042	NC_015067	GC	3	6	178887	178892	0 %	0 %	50 %	50 %	322690330
4043	NC_015067	CCG	2	6	178893	178898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690330
4044	NC_015067	GCCG	2	8	178903	178910	0 %	0 %	50 %	50 %	322690330
4045	NC_015067	CGA	2	6	178960	178965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690330
4046	NC_015067	CGC	2	6	178984	178989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690330
4047	NC_015067	CTTG	2	8	179070	179077	0 %	50 %	25 %	25 %	322690330
4048	NC_015067	AAG	2	6	179141	179146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322690330
4049	NC_015067	GCG	2	6	179147	179152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690330
4050	NC_015067	GTG	2	6	179156	179161	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690330
4051	NC_015067	GCGA	2	8	179229	179236	25 %	0 %	50 %	25 %	322690330
4052	NC_015067	AGC	2	6	179283	179288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690330
4053	NC_015067	GAC	2	6	179408	179413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690330
4054	NC_015067	GAA	2	6	179452	179457	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322690330
4055	NC_015067	GCCG	2	8	179485	179492	0 %	0 %	50 %	50 %	322690330
4056	NC_015067	CGC	2	6	179505	179510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690330
4057	NC_015067	GCT	2	6	179543	179548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690330
4058	NC_015067	AAG	2	6	179573	179578	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322690330
4059	NC_015067	GCT	2	6	179630	179635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690330
4060	NC_015067	CAGC	2	8	179693	179700	25 %	0 %	25 %	50 %	322690330
4061	NC_015067	GCGA	2	8	179732	179739	25 %	0 %	50 %	25 %	322690330
4062	NC_015067	CAG	2	6	179825	179830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690330
4063	NC_015067	GAT	2	6	179840	179845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690330
4064	NC_015067	GGC	2	6	179878	179883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690330
4065	NC_015067	GAC	2	6	179897	179902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690330
4066	NC_015067	CTT	2	6	179934	179939	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322690330
4067	NC_015067	GCAG	2	8	180043	180050	25 %	0 %	50 %	25 %	322690330
4068	NC_015067	AGCC	2	8	180143	180150	25 %	0 %	25 %	50 %	322690330
4069	NC_015067	CCAGCC	3	18	180145	180162	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	322690330
4070	NC_015067	GGCGA	2	10	180224	180233	20 %	0 %	60 %	20 %	322690330
4071	NC_015067	CGA	2	6	180247	180252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690330
4072	NC_015067	A	6	6	180275	180280	100 %	0 %	0 %	0 %	322690330
4073	NC_015067	GAT	2	6	180299	180304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690330
4074	NC_015067	GAA	2	6	180307	180312	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322690330
4075	NC_015067	AAG	2	6	180335	180340	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322690330
4076	NC_015067	AAT	2	6	180351	180356	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322690330
4077	NC_015067	GGC	2	6	180430	180435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690331
4078	NC_015067	GC	3	6	180457	180462	0 %	0 %	50 %	50 %	322690331
4079	NC_015067	GC	3	6	180504	180509	0 %	0 %	50 %	50 %	322690331
4080	NC_015067	TGA	2	6	180658	180663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690331
4081	NC_015067	CG	3	6	180676	180681	0 %	0 %	50 %	50 %	322690331
4082	NC_015067	CGG	2	6	180707	180712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690331
4083	NC_015067	CCA	3	9	180838	180846	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690331
4084	NC_015067	CGA	2	6	180935	180940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690331
4085	NC_015067	GGGCA	2	10	180950	180959	20 %	0 %	60 %	20 %	322690331
4086	NC_015067	GCG	2	6	181013	181018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690332
4087	NC_015067	GAT	2	6	181046	181051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690332
4088	NC_015067	GC	3	6	181052	181057	0 %	0 %	50 %	50 %	322690332
4089	NC_015067	CGT	2	6	181068	181073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690332
4090	NC_015067	GCC	2	6	181098	181103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690332
4091	NC_015067	GC	3	6	181136	181141	0 %	0 %	50 %	50 %	322690332
4092	NC_015067	TCA	2	6	181240	181245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690332
4093	NC_015067	AGA	2	6	181357	181362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322690332
4094	NC_015067	CAAC	2	8	181408	181415	50 %	0 %	0 %	50 %	322690332
4095	NC_015067	TCTT	2	8	181611	181618	0 %	75 %	0 %	25 %	322690332
4096	NC_015067	CGC	2	6	181633	181638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690332
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4098	NC_015067	GCG	3	9	181659	181667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690332
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4101	NC_015067	GCCA	2	8	181768	181775	25 %	0 %	25 %	50 %	322690332
4102	NC_015067	CTT	2	6	181780	181785	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322690332
4103	NC_015067	GTG	2	6	181791	181796	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690332
4104	NC_015067	TGG	2	6	181801	181806	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690332
4105	NC_015067	GCG	2	6	181866	181871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690332
4106	NC_015067	CAG	2	6	181874	181879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690332
4107	NC_015067	TGA	2	6	181888	181893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690332
4108	NC_015067	GTTGC	2	10	181910	181919	0 %	40 %	40 %	20 %	322690332
4109	NC_015067	TGC	2	6	181985	181990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690332
4110	NC_015067	GTT	2	6	182051	182056	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322690332
4111	NC_015067	TCG	2	6	182086	182091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690332
4112	NC_015067	GCA	2	6	182101	182106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690332
4113	NC_015067	AAG	2	6	182306	182311	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4114	NC_015067	AAC	2	6	182329	182334	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4115	NC_015067	G	7	7	182465	182471	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4116	NC_015067	TCG	3	9	182543	182551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4117	NC_015067	GAA	2	6	182621	182626	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322690333
4118	NC_015067	CGC	2	6	182703	182708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690333
4119	NC_015067	TC	3	6	182761	182766	0 %	50 %	0 %	50 %	322690333
4120	NC_015067	TGA	2	6	182803	182808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4121	NC_015067	TGG	2	6	182821	182826	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4122	NC_015067	TGC	2	6	182833	182838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4123	NC_015067	TCT	2	6	183082	183087	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322690334
4124	NC_015067	TC	3	6	183220	183225	0 %	50 %	0 %	50 %	322690334
4125	NC_015067	GAG	2	6	183238	183243	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322690334
4126	NC_015067	TGA	2	6	183255	183260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690334
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4142	NC_015067	ATG	2	6	184079	184084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690334
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4147	NC_015067	GA	3	6	184362	184367	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4148	NC_015067	GAA	3	9	184369	184377	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4149	NC_015067	GGAT	2	8	184462	184469	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4150	NC_015067	ACC	2	6	184486	184491	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4151	NC_015067	AAC	2	6	184515	184520	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4152	NC_015067	TTGCGT	2	12	184588	184599	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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4154	NC_015067	CAG	2	6	184640	184645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690335
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4232	NC_015067	GCG	2	6	188260	188265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4233	NC_015067	TGC	2	6	188370	188375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690340
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4245	NC_015067	CGA	2	6	188884	188889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690340
4246	NC_015067	TGCCC	2	10	188959	188968	0 %	20 %	20 %	60 %	322690340
4247	NC_015067	ATG	2	6	189011	189016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690340
4248	NC_015067	ACG	2	6	189054	189059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690340
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4250	NC_015067	CGAT	2	8	189141	189148	25 %	25 %	25 %	25 %	322690340
4251	NC_015067	TGCC	2	8	189204	189211	0 %	25 %	25 %	50 %	322690340
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4260	NC_015067	CTG	2	6	189826	189831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4261	NC_015067	TCG	2	6	189863	189868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4262	NC_015067	GCC	2	6	189947	189952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4263	NC_015067	GCA	2	6	189958	189963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4264	NC_015067	GAA	2	6	190077	190082	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4265	NC_015067	AGT	3	9	190122	190130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4266	NC_015067	CA	3	6	190268	190273	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4267	NC_015067	AGG	2	6	190278	190283	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4268	NC_015067	ATCA	2	8	190298	190305	50 %	25 %	0 %	25 %	322690341
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4278	NC_015067	AGG	2	6	190841	190846	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322690341
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4280	NC_015067	CGC	2	6	190869	190874	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690341
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4285	NC_015067	CGA	2	6	191109	191114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690341
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4303	NC_015067	TCG	2	6	192136	192141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690341
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4327	NC_015067	CCGTA	2	10	192911	192920	20 %	20 %	20 %	40 %	322690342
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4332	NC_015067	GTT	2	6	193281	193286	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322690342
4333	NC_015067	GTT	2	6	193296	193301	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322690342
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4335	NC_015067	TTG	2	6	193441	193446	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322690342
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4488	NC_015067	CG	3	6	200507	200512	0 %	0 %	50 %	50 %	322690346
4489	NC_015067	CAG	2	6	200518	200523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690346
4490	NC_015067	ATC	2	6	200602	200607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690346
4491	NC_015067	CACCG	2	10	200631	200640	20 %	0 %	20 %	60 %	322690346
4492	NC_015067	CAT	4	12	200646	200657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690346
4493	NC_015067	CAC	2	6	200685	200690	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690346
4494	NC_015067	GAG	2	6	200713	200718	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322690346
4495	NC_015067	GC	3	6	200747	200752	0 %	0 %	50 %	50 %	322690346
4496	NC_015067	TGC	2	6	200768	200773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690346
4497	NC_015067	CCA	2	6	200774	200779	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690346
4498	NC_015067	CCA	3	9	200849	200857	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690346
4499	NC_015067	CGA	2	6	200934	200939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690346
4500	NC_015067	GTT	2	6	201009	201014	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322690346

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