MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bifidobacterium longum subsp. longum JCM 1217 chromosome

Total Repeats: 52904

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_015067	GGC	2	6	154614	154619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690309
3502	NC_015067	GC	3	6	154633	154638	0 %	0 %	50 %	50 %	322690309
3503	NC_015067	CG	3	6	154671	154676	0 %	0 %	50 %	50 %	322690309
3504	NC_015067	TC	3	6	155021	155026	0 %	50 %	0 %	50 %	322690310
3505	NC_015067	CGT	2	6	155095	155100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690310
3506	NC_015067	ACG	2	6	155172	155177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690310
3507	NC_015067	CGA	2	6	155212	155217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690310
3508	NC_015067	ACT	2	6	155307	155312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690310
3509	NC_015067	CAA	2	6	155341	155346	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322690310
3510	NC_015067	CCGC	2	8	155395	155402	0 %	0 %	25 %	75 %	322690310
3511	NC_015067	CCA	2	6	155443	155448	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690310
3512	NC_015067	GGT	2	6	155449	155454	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690310
3513	NC_015067	CGC	2	6	155479	155484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690310
3514	NC_015067	GGA	2	6	155515	155520	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322690310
3515	NC_015067	GAC	2	6	155552	155557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690310
3516	NC_015067	AGC	2	6	155559	155564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690310
3517	NC_015067	TGT	2	6	155565	155570	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322690310
3518	NC_015067	CGG	2	6	155614	155619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690310
3519	NC_015067	CGC	2	6	155626	155631	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690310
3520	NC_015067	CAT	2	6	155644	155649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690310
3521	NC_015067	GGT	2	6	155653	155658	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690310
3522	NC_015067	CCGG	2	8	155725	155732	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3523	NC_015067	CGC	2	6	155753	155758	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3524	NC_015067	CCA	2	6	155765	155770	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3525	NC_015067	ATC	2	6	155801	155806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3526	NC_015067	CAC	2	6	155844	155849	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690311
3527	NC_015067	GTC	2	6	155860	155865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690311
3528	NC_015067	ACGCC	2	10	155901	155910	20 %	0 %	20 %	60 %	322690311
3529	NC_015067	GC	3	6	155917	155922	0 %	0 %	50 %	50 %	322690311
3530	NC_015067	TCA	2	6	155961	155966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690311
3531	NC_015067	CGC	2	6	156065	156070	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690311
3532	NC_015067	TCA	2	6	156093	156098	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690311
3533	NC_015067	CAG	2	6	156131	156136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690311
3534	NC_015067	AAGG	2	8	156146	156153	50 %	0 %	50 %	0 %	322690311
3535	NC_015067	GTC	2	6	156164	156169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690311
3536	NC_015067	CCGC	2	8	156240	156247	0 %	0 %	25 %	75 %	322690311
3537	NC_015067	CG	3	6	156297	156302	0 %	0 %	50 %	50 %	322690311
3538	NC_015067	CGA	2	6	156319	156324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690311
3539	NC_015067	CCG	2	6	156327	156332	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690311
3540	NC_015067	CAT	3	9	156337	156345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690311
3541	NC_015067	CG	3	6	156399	156404	0 %	0 %	50 %	50 %	322690311
3542	NC_015067	CCG	2	6	156408	156413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690311
3543	NC_015067	CTT	2	6	156427	156432	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322690311
3544	NC_015067	CGC	2	6	156492	156497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690311
3545	NC_015067	TGG	2	6	156524	156529	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690311
3546	NC_015067	CTA	2	6	156535	156540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690311
3547	NC_015067	CAC	2	6	156604	156609	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690311
3548	NC_015067	GAC	2	6	156641	156646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690311
3549	NC_015067	CCG	2	6	156710	156715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690311
3550	NC_015067	CAC	2	6	156751	156756	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690311
3551	NC_015067	CG	3	6	156771	156776	0 %	0 %	50 %	50 %	322690311
3552	NC_015067	GC	3	6	156784	156789	0 %	0 %	50 %	50 %	322690311
3553	NC_015067	GAG	2	6	156845	156850	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322690311
3554	NC_015067	CAC	2	6	156905	156910	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690311
3555	NC_015067	TGG	2	6	156938	156943	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690311
3556	NC_015067	GCA	2	6	156952	156957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690311
3557	NC_015067	GCG	2	6	156960	156965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690311
3558	NC_015067	GCG	2	6	157032	157037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690311
3559	NC_015067	TCGC	2	8	157130	157137	0 %	25 %	25 %	50 %	322690311
3560	NC_015067	CACCGC	2	12	157153	157164	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	322690311
3561	NC_015067	TGG	2	6	157184	157189	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690311
3562	NC_015067	CGG	2	6	157201	157206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690311
3563	NC_015067	CGTGA	2	10	157334	157343	20 %	20 %	40 %	20 %	322690311
3564	NC_015067	TGG	2	6	157353	157358	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690311
3565	NC_015067	GAT	2	6	157381	157386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690311
3566	NC_015067	GCC	2	6	157415	157420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690311
3567	NC_015067	GCCG	2	8	157424	157431	0 %	0 %	50 %	50 %	322690311
3568	NC_015067	GCC	3	9	157550	157558	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690311
3569	NC_015067	GCCGCG	2	12	157560	157571	0 %	0 %	50 %	50 %	322690311
3570	NC_015067	CTT	2	6	157606	157611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322690311
3571	NC_015067	GCC	2	6	157617	157622	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690311
3572	NC_015067	CGC	2	6	157639	157644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690311
3573	NC_015067	GCC	2	6	157647	157652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690311
3574	NC_015067	GCTC	2	8	157668	157675	0 %	25 %	25 %	50 %	322690311
3575	NC_015067	TCGT	2	8	157808	157815	0 %	50 %	25 %	25 %	322690311
3576	NC_015067	CCA	2	6	157845	157850	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690311
3577	NC_015067	GGGGC	2	10	157878	157887	0 %	0 %	80 %	20 %	322690311
3578	NC_015067	CCG	2	6	157938	157943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690311
3579	NC_015067	CG	3	6	157953	157958	0 %	0 %	50 %	50 %	322690311
3580	NC_015067	GCG	2	6	158004	158009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690311
3581	NC_015067	ACG	2	6	158055	158060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690311
3582	NC_015067	CGG	2	6	158131	158136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690311
3583	NC_015067	CTG	2	6	158183	158188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690311
3584	NC_015067	GC	3	6	158340	158345	0 %	0 %	50 %	50 %	322690311
3585	NC_015067	GAA	2	6	158348	158353	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322690311
3586	NC_015067	CTG	2	6	158357	158362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690311
3587	NC_015067	GCG	2	6	158415	158420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3588	NC_015067	GCC	2	6	158560	158565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3589	NC_015067	GGC	2	6	158586	158591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3590	NC_015067	CTCG	2	8	158592	158599	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3591	NC_015067	CTGG	2	8	158638	158645	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3592	NC_015067	TGA	2	6	158686	158691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3593	NC_015067	GCA	2	6	158789	158794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690312
3594	NC_015067	GCC	2	6	158825	158830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690312
3595	NC_015067	CGT	2	6	158838	158843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690312
3596	NC_015067	GCG	2	6	158893	158898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690312
3597	NC_015067	CAC	2	6	158907	158912	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690312
3598	NC_015067	AC	3	6	159037	159042	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3599	NC_015067	CG	3	6	159058	159063	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3600	NC_015067	CCG	2	6	159064	159069	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3601	NC_015067	GC	3	6	159097	159102	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3602	NC_015067	CAC	2	6	159153	159158	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3603	NC_015067	GTCA	2	8	159171	159178	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3604	NC_015067	A	6	6	159186	159191	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3605	NC_015067	GAC	2	6	159290	159295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3606	NC_015067	CA	3	6	159345	159350	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3607	NC_015067	GC	4	8	159447	159454	0 %	0 %	50 %	50 %	322690313
3608	NC_015067	TGG	2	6	159468	159473	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690313
3609	NC_015067	TCG	2	6	159498	159503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690313
3610	NC_015067	TTC	2	6	159550	159555	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322690313
3611	NC_015067	AAG	2	6	159602	159607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322690313
3612	NC_015067	TGA	2	6	159639	159644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690313
3613	NC_015067	TCA	2	6	159696	159701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690313
3614	NC_015067	CCA	2	6	159738	159743	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690313
3615	NC_015067	ATC	2	6	159782	159787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690313
3616	NC_015067	CGG	3	9	159865	159873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690313
3617	NC_015067	CTG	2	6	159890	159895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690313
3618	NC_015067	GAC	2	6	159911	159916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690313
3619	NC_015067	CCA	2	6	159924	159929	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690313
3620	NC_015067	TTCAGG	2	12	159930	159941	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	322690313
3621	NC_015067	CCA	2	6	159942	159947	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690313
3622	NC_015067	ACC	2	6	159957	159962	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690313
3623	NC_015067	GGT	2	6	159965	159970	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690313
3624	NC_015067	GAC	2	6	159971	159976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690313
3625	NC_015067	AGA	2	6	159984	159989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322690313
3626	NC_015067	GAAG	2	8	160069	160076	50 %	0 %	50 %	0 %	322690313
3627	NC_015067	GAA	2	6	160090	160095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322690313
3628	NC_015067	CTC	3	9	160102	160110	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322690313
3629	NC_015067	CCA	2	6	160116	160121	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690313
3630	NC_015067	CTG	2	6	160220	160225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690313
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3632	NC_015067	TGC	2	6	160254	160259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690313
3633	NC_015067	ACG	2	6	160260	160265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690313
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3635	NC_015067	TCG	2	6	160302	160307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690313
3636	NC_015067	CCG	2	6	160326	160331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690313
3637	NC_015067	GGT	2	6	160358	160363	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690313
3638	NC_015067	GCC	2	6	160412	160417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690313
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3641	NC_015067	ATCG	2	8	160523	160530	25 %	25 %	25 %	25 %	322690313
3642	NC_015067	TCT	2	6	160563	160568	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322690313
3643	NC_015067	CCGT	2	8	160589	160596	0 %	25 %	25 %	50 %	322690313
3644	NC_015067	TCGC	2	8	160629	160636	0 %	25 %	25 %	50 %	322690313
3645	NC_015067	ACA	2	6	160638	160643	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322690313
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3647	NC_015067	GGT	2	6	160796	160801	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690313
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3649	NC_015067	ACA	2	6	160944	160949	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322690313
3650	NC_015067	CGA	2	6	160963	160968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690313
3651	NC_015067	GAAG	2	8	161005	161012	50 %	0 %	50 %	0 %	322690313
3652	NC_015067	GAC	2	6	161024	161029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690313
3653	NC_015067	TGA	2	6	161061	161066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690313
3654	NC_015067	CCG	2	6	161067	161072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690313
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3673	NC_015067	CGA	2	6	161616	161621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690314
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3678	NC_015067	AGT	3	9	161862	161870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690314
3679	NC_015067	CT	3	6	161932	161937	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3680	NC_015067	GAC	3	9	162047	162055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690315
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3704	NC_015067	CGA	2	6	162967	162972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690315
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3720	NC_015067	TCGGC	2	10	163833	163842	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
3721	NC_015067	GA	4	8	163859	163866	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3722	NC_015067	CTG	2	6	163911	163916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690317
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3724	NC_015067	TCTGG	2	10	164031	164040	0 %	40 %	40 %	20 %	322690317
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3740	NC_015067	CAC	3	9	164732	164740	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690317
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3744	NC_015067	GGCG	2	8	164855	164862	0 %	0 %	75 %	25 %	322690317
3745	NC_015067	GTC	2	6	164889	164894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690317
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3759	NC_015067	GC	3	6	165369	165374	0 %	0 %	50 %	50 %	322690318
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3839	NC_015067	TG	3	6	169537	169542	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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3850	NC_015067	ACT	2	6	169940	169945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690322
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3853	NC_015067	GCTG	2	8	170052	170059	0 %	25 %	50 %	25 %	322690322
3854	NC_015067	CTT	2	6	170073	170078	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322690322
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3861	NC_015067	CAT	2	6	170283	170288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690322
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3863	NC_015067	TAAG	2	8	170382	170389	50 %	25 %	25 %	0 %	322690322
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3865	NC_015067	ACA	2	6	170488	170493	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3991	NC_015067	GTG	2	6	177019	177024	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690329
3992	NC_015067	TCG	2	6	177031	177036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690329
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3995	NC_015067	GC	3	6	177174	177179	0 %	0 %	50 %	50 %	322690329
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3998	NC_015067	CCT	2	6	177254	177259	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3999	NC_015067	AAAG	2	8	177292	177299	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4000	NC_015067	TAA	2	6	177304	177309	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

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