MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bifidobacterium longum subsp. longum JCM 1217 chromosome

Total Repeats: 52904

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_015067	CCGC	2	8	134021	134028	0 %	0 %	25 %	75 %	322690294
3002	NC_015067	CGG	2	6	134040	134045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690294
3003	NC_015067	GGC	3	9	134118	134126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690294
3004	NC_015067	ACA	2	6	134162	134167	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322690294
3005	NC_015067	CGG	2	6	134172	134177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690294
3006	NC_015067	GAA	2	6	134202	134207	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322690294
3007	NC_015067	TTC	2	6	134230	134235	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322690294
3008	NC_015067	GCT	2	6	134373	134378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690294
3009	NC_015067	CGG	2	6	134409	134414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690294
3010	NC_015067	ACC	2	6	134464	134469	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690294
3011	NC_015067	GAG	2	6	134506	134511	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322690294
3012	NC_015067	GGC	2	6	134531	134536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690294
3013	NC_015067	CGG	2	6	134565	134570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690294
3014	NC_015067	ACG	2	6	134639	134644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690294
3015	NC_015067	GCG	2	6	134676	134681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690294
3016	NC_015067	GCGTGC	2	12	134684	134695	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	322690294
3017	NC_015067	GAC	2	6	134760	134765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690294
3018	NC_015067	GAT	2	6	134782	134787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690294
3019	NC_015067	CG	3	6	134790	134795	0 %	0 %	50 %	50 %	322690294
3020	NC_015067	CG	3	6	134817	134822	0 %	0 %	50 %	50 %	322690294
3021	NC_015067	CGG	2	6	134834	134839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690294
3022	NC_015067	CCT	2	6	134861	134866	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322690294
3023	NC_015067	CGT	2	6	134878	134883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690294
3024	NC_015067	GCT	2	6	134935	134940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3025	NC_015067	AGC	2	6	134994	134999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690295
3026	NC_015067	GACG	2	8	135016	135023	25 %	0 %	50 %	25 %	322690295
3027	NC_015067	GGC	2	6	135125	135130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690295
3028	NC_015067	TCG	2	6	135214	135219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690295
3029	NC_015067	CAT	2	6	135295	135300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690295
3030	NC_015067	GGT	2	6	135479	135484	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690295
3031	NC_015067	TCC	2	6	135519	135524	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322690295
3032	NC_015067	GAT	2	6	135560	135565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690295
3033	NC_015067	TGC	2	6	135573	135578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690295
3034	NC_015067	GCC	2	6	135635	135640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690295
3035	NC_015067	CCGT	2	8	135692	135699	0 %	25 %	25 %	50 %	322690295
3036	NC_015067	GAA	2	6	135731	135736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322690295
3037	NC_015067	GGA	2	6	135785	135790	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322690295
3038	NC_015067	CAG	2	6	135821	135826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690295
3039	NC_015067	GCG	2	6	135864	135869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690295
3040	NC_015067	CCA	2	6	135901	135906	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3041	NC_015067	GC	3	6	135927	135932	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3042	NC_015067	T	7	7	136016	136022	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3043	NC_015067	GGC	2	6	136032	136037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690296
3044	NC_015067	TCCAG	2	10	136073	136082	20 %	20 %	20 %	40 %	322690296
3045	NC_015067	CTT	2	6	136086	136091	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322690296
3046	NC_015067	GGC	2	6	136122	136127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690296
3047	NC_015067	CTC	2	6	136143	136148	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322690296
3048	NC_015067	CCCG	2	8	136169	136176	0 %	0 %	25 %	75 %	322690296
3049	NC_015067	GAA	2	6	136203	136208	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322690296
3050	NC_015067	CGG	2	6	136214	136219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690296
3051	NC_015067	CTC	2	6	136272	136277	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322690296
3052	NC_015067	GAT	2	6	136329	136334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690296
3053	NC_015067	ACC	2	6	136426	136431	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690296
3054	NC_015067	ACC	2	6	136450	136455	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690296
3055	NC_015067	GAC	2	6	136653	136658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690296
3056	NC_015067	GAC	2	6	136668	136673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690296
3057	NC_015067	GCA	2	6	136697	136702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690296
3058	NC_015067	GC	3	6	136729	136734	0 %	0 %	50 %	50 %	322690296
3059	NC_015067	GCA	2	6	136769	136774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690296
3060	NC_015067	CGCGC	2	10	136800	136809	0 %	0 %	40 %	60 %	322690296
3061	NC_015067	TAG	2	6	136816	136821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690296
3062	NC_015067	TGC	2	6	136823	136828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690296
3063	NC_015067	GCC	2	6	136855	136860	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690296
3064	NC_015067	CGA	2	6	136886	136891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690296
3065	NC_015067	GTC	2	6	136938	136943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690296
3066	NC_015067	ATCG	2	8	136956	136963	25 %	25 %	25 %	25 %	322690296
3067	NC_015067	CTC	2	6	137016	137021	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322690296
3068	NC_015067	GCCG	2	8	137031	137038	0 %	0 %	50 %	50 %	322690296
3069	NC_015067	CGGC	2	8	137051	137058	0 %	0 %	50 %	50 %	322690296
3070	NC_015067	GCG	2	6	137109	137114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690296
3071	NC_015067	TCG	2	6	137132	137137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690296
3072	NC_015067	CG	3	6	137153	137158	0 %	0 %	50 %	50 %	322690296
3073	NC_015067	GC	3	6	137186	137191	0 %	0 %	50 %	50 %	322690296
3074	NC_015067	TCG	2	6	137251	137256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690296
3075	NC_015067	TCG	2	6	137338	137343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690296
3076	NC_015067	TTTGG	2	10	137395	137404	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
3077	NC_015067	GAC	2	6	137423	137428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3078	NC_015067	TC	3	6	137437	137442	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3079	NC_015067	CAA	2	6	137467	137472	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3080	NC_015067	ATAC	2	8	137612	137619	50 %	25 %	0 %	25 %	322690297
3081	NC_015067	ACA	2	6	137640	137645	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322690297
3082	NC_015067	TCA	2	6	137720	137725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690298
3083	NC_015067	TTC	2	6	137824	137829	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322690298
3084	NC_015067	CGA	2	6	137883	137888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690298
3085	NC_015067	GAC	2	6	137905	137910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690298
3086	NC_015067	CAT	2	6	137937	137942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690298
3087	NC_015067	GAA	2	6	138073	138078	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322690298
3088	NC_015067	CCGC	2	8	138096	138103	0 %	0 %	25 %	75 %	322690298
3089	NC_015067	GCA	2	6	138174	138179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690298
3090	NC_015067	GCC	2	6	138244	138249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690298
3091	NC_015067	GCT	2	6	138311	138316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690298
3092	NC_015067	GAG	2	6	138358	138363	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322690298
3093	NC_015067	CTA	2	6	138405	138410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690298
3094	NC_015067	AAG	2	6	138412	138417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322690298
3095	NC_015067	GCC	2	6	138465	138470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690298
3096	NC_015067	GCT	2	6	138471	138476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690298
3097	NC_015067	AAC	2	6	138538	138543	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322690298
3098	NC_015067	CGA	2	6	138633	138638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690298
3099	NC_015067	CCAT	2	8	138662	138669	25 %	25 %	0 %	50 %	322690298
3100	NC_015067	GCC	2	6	138694	138699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690298
3101	NC_015067	GCC	2	6	138706	138711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690298
3102	NC_015067	TAC	2	6	138748	138753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690298
3103	NC_015067	ACT	2	6	138779	138784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690298
3104	NC_015067	GCC	2	6	138787	138792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690298
3105	NC_015067	TTC	2	6	138805	138810	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322690298
3106	NC_015067	CTA	2	6	138831	138836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690298
3107	NC_015067	GC	3	6	138842	138847	0 %	0 %	50 %	50 %	322690298
3108	NC_015067	GCCG	2	8	138850	138857	0 %	0 %	50 %	50 %	322690298
3109	NC_015067	CTG	2	6	138871	138876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690298
3110	NC_015067	CGC	2	6	138877	138882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690298
3111	NC_015067	CAA	2	6	138885	138890	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322690298
3112	NC_015067	ACT	3	9	138911	138919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690298
3113	NC_015067	CCG	2	6	138923	138928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690298
3114	NC_015067	GGT	2	6	138954	138959	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690298
3115	NC_015067	CTGC	2	8	138997	139004	0 %	25 %	25 %	50 %	322690298
3116	NC_015067	CCG	3	9	139064	139072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690298
3117	NC_015067	GCC	2	6	139087	139092	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690298
3118	NC_015067	GCC	2	6	139165	139170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690298
3119	NC_015067	CCG	2	6	139204	139209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690298
3120	NC_015067	GC	3	6	139257	139262	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3121	NC_015067	AGT	2	6	139267	139272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3122	NC_015067	CCGC	2	8	139307	139314	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3123	NC_015067	CCG	2	6	139397	139402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3124	NC_015067	CGA	2	6	139407	139412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3125	NC_015067	AGC	2	6	139417	139422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3126	NC_015067	AGC	2	6	139436	139441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3127	NC_015067	TGA	2	6	139474	139479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690299
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3129	NC_015067	CGC	3	9	139550	139558	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690299
3130	NC_015067	CCG	2	6	139611	139616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690299
3131	NC_015067	TTC	2	6	139618	139623	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322690299
3132	NC_015067	GCT	2	6	139631	139636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690299
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3135	NC_015067	CAGGT	2	10	139734	139743	20 %	20 %	40 %	20 %	322690299
3136	NC_015067	GCT	2	6	139769	139774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690299
3137	NC_015067	CTG	2	6	139857	139862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690299
3138	NC_015067	GCC	2	6	139896	139901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690299
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3140	NC_015067	CGT	2	6	140027	140032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690299
3141	NC_015067	CTG	2	6	140057	140062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690299
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3143	NC_015067	CAT	2	6	140101	140106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690299
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3153	NC_015067	CCT	2	6	140646	140651	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322690299
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3161	NC_015067	TGC	2	6	141036	141041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690299
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3165	NC_015067	TCCAG	2	10	141115	141124	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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3198	NC_015067	GCAG	2	8	142278	142285	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3199	NC_015067	GCGG	2	8	142289	142296	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3200	NC_015067	GGC	2	6	142324	142329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3201	NC_015067	GCC	2	6	142358	142363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3202	NC_015067	AGG	2	6	142492	142497	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3203	NC_015067	ATT	2	6	142544	142549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3204	NC_015067	ATG	2	6	142647	142652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3205	NC_015067	T	7	7	142659	142665	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3206	NC_015067	CAA	2	6	142728	142733	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3207	NC_015067	AAC	3	9	142745	142753	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3208	NC_015067	CGCC	2	8	142775	142782	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3209	NC_015067	GCA	2	6	142823	142828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690301
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3213	NC_015067	ACT	2	6	142971	142976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690301
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3215	NC_015067	CTG	2	6	143021	143026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690301
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3230	NC_015067	GGC	3	9	143678	143686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690301
3231	NC_015067	ACCA	2	8	143699	143706	50 %	0 %	0 %	50 %	322690301
3232	NC_015067	TGCTCA	2	12	143715	143726	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	322690301
3233	NC_015067	CCTG	2	8	143766	143773	0 %	25 %	25 %	50 %	322690301
3234	NC_015067	GCC	2	6	143790	143795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690301
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3237	NC_015067	TCG	2	6	143826	143831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690301
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3239	NC_015067	GGT	2	6	143864	143869	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690301
3240	NC_015067	AGA	2	6	143880	143885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322690301
3241	NC_015067	CTT	2	6	143887	143892	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322690301
3242	NC_015067	CCTG	2	8	143962	143969	0 %	25 %	25 %	50 %	322690301
3243	NC_015067	CTCCGG	2	12	143995	144006	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	322690301
3244	NC_015067	GCC	2	6	144023	144028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690301
3245	NC_015067	TCG	2	6	144030	144035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690301
3246	NC_015067	TGC	2	6	144125	144130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690301
3247	NC_015067	AAAT	2	8	144354	144361	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3248	NC_015067	GCA	2	6	144381	144386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690302
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3273	NC_015067	TGT	2	6	145499	145504	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3275	NC_015067	AAC	2	6	145529	145534	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3277	NC_015067	GCG	2	6	145821	145826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3278	NC_015067	ACT	2	6	145836	145841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3357	NC_015067	GGTTG	2	10	148938	148947	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
3358	NC_015067	CTG	2	6	148965	148970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3359	NC_015067	TG	3	6	148969	148974	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3360	NC_015067	ATG	2	6	148995	149000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3362	NC_015067	GCT	2	6	149083	149088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690305
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3365	NC_015067	CGG	3	9	149246	149254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690305
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3367	NC_015067	GAT	2	6	149277	149282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690305
3368	NC_015067	CGC	2	6	149302	149307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690305
3369	NC_015067	TCA	2	6	149347	149352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690305
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3372	NC_015067	CGA	2	6	149546	149551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690305
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3374	NC_015067	ATC	2	6	149613	149618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690305
3375	NC_015067	CCGCAT	2	12	149738	149749	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	322690305
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3380	NC_015067	CGAG	2	8	149946	149953	25 %	0 %	50 %	25 %	322690305
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3383	NC_015067	TC	3	6	150242	150247	0 %	50 %	0 %	50 %	322690306
3384	NC_015067	CGG	2	6	150257	150262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690306
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3484	NC_015067	AGC	2	6	154036	154041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690309
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3486	NC_015067	TCG	2	6	154066	154071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690309
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3488	NC_015067	GTC	2	6	154254	154259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690309
3489	NC_015067	GTG	2	6	154321	154326	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690309
3490	NC_015067	ACG	2	6	154361	154366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690309
3491	NC_015067	CCGCGT	2	12	154376	154387	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	322690309
3492	NC_015067	TCG	2	6	154405	154410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690309
3493	NC_015067	CTC	2	6	154416	154421	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322690309
3494	NC_015067	GC	4	8	154422	154429	0 %	0 %	50 %	50 %	322690309
3495	NC_015067	GCCG	2	8	154464	154471	0 %	0 %	50 %	50 %	322690309
3496	NC_015067	GCA	2	6	154475	154480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690309
3497	NC_015067	GAT	2	6	154497	154502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690309
3498	NC_015067	TGC	3	9	154526	154534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690309
3499	NC_015067	CCA	2	6	154535	154540	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690309
3500	NC_015067	GTT	2	6	154607	154612	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322690309

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