MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bifidobacterium longum subsp. longum JCM 1217 chromosome

Total Repeats: 52904

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015067	TGG	2	6	22397	22402	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690210
502	NC_015067	CCA	2	6	22415	22420	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690210
503	NC_015067	T	7	7	22473	22479	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_015067	GAG	2	6	22493	22498	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
505	NC_015067	GCCG	2	8	22500	22507	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
506	NC_015067	GTTT	2	8	22511	22518	0 %	75 %	25 %	0 %	322690211
507	NC_015067	GTG	2	6	22596	22601	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690211
508	NC_015067	GAT	2	6	22614	22619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690211
509	NC_015067	CGG	2	6	22622	22627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690211
510	NC_015067	GTC	2	6	22635	22640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690211
511	NC_015067	GTG	2	6	22678	22683	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690211
512	NC_015067	GAT	2	6	22686	22691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690211
513	NC_015067	GAT	2	6	22716	22721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690211
514	NC_015067	AGG	2	6	22729	22734	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322690211
515	NC_015067	TCG	2	6	22771	22776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690211
516	NC_015067	GAT	2	6	22779	22784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690211
517	NC_015067	GCT	2	6	23006	23011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690211
518	NC_015067	TCG	2	6	23194	23199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690211
519	NC_015067	TGG	2	6	23201	23206	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690211
520	NC_015067	CTC	2	6	23224	23229	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322690211
521	NC_015067	GTCC	2	8	23257	23264	0 %	25 %	25 %	50 %	322690211
522	NC_015067	TTC	2	6	23266	23271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322690211
523	NC_015067	TCC	2	6	23283	23288	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322690212
524	NC_015067	GTC	2	6	23327	23332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690212
525	NC_015067	GGCGT	2	10	23357	23366	0 %	20 %	60 %	20 %	322690212
526	NC_015067	CCCGG	2	10	23384	23393	0 %	0 %	40 %	60 %	322690212
527	NC_015067	GCC	2	6	23439	23444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690212
528	NC_015067	GCA	2	6	23470	23475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690212
529	NC_015067	CGC	2	6	23493	23498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690212
530	NC_015067	TCGCG	2	10	23545	23554	0 %	20 %	40 %	40 %	322690212
531	NC_015067	GCC	2	6	23574	23579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690212
532	NC_015067	CGC	2	6	23617	23622	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690212
533	NC_015067	GTCG	2	8	23624	23631	0 %	25 %	50 %	25 %	322690212
534	NC_015067	CGA	2	6	23713	23718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690212
535	NC_015067	GGC	2	6	23761	23766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690212
536	NC_015067	GGGCAG	2	12	23837	23848	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	322690212
537	NC_015067	ATC	2	6	23861	23866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690212
538	NC_015067	GGCC	2	8	23875	23882	0 %	0 %	50 %	50 %	322690212
539	NC_015067	TCG	2	6	24120	24125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690212
540	NC_015067	CGG	2	6	24132	24137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690212
541	NC_015067	CGG	2	6	24145	24150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690212
542	NC_015067	ACG	2	6	24306	24311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690212
543	NC_015067	ACG	2	6	24448	24453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690212
544	NC_015067	TCG	2	6	24567	24572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690212
545	NC_015067	GTC	2	6	24617	24622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690212
546	NC_015067	CGC	2	6	24664	24669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690212
547	NC_015067	GC	3	6	24668	24673	0 %	0 %	50 %	50 %	322690212
548	NC_015067	GGT	2	6	24800	24805	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
549	NC_015067	A	6	6	24831	24836	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_015067	TTCC	2	8	24881	24888	0 %	50 %	0 %	50 %	322690213
551	NC_015067	GC	3	6	24893	24898	0 %	0 %	50 %	50 %	322690213
552	NC_015067	CAG	2	6	24985	24990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690213
553	NC_015067	TCG	2	6	25032	25037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690213
554	NC_015067	CCT	2	6	25113	25118	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
555	NC_015067	CCCG	2	8	25153	25160	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
556	NC_015067	GAG	2	6	25167	25172	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
557	NC_015067	G	10	10	25174	25183	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
558	NC_015067	GCCG	2	8	25202	25209	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
559	NC_015067	GAG	2	6	25241	25246	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322690214
560	NC_015067	TCG	2	6	25281	25286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690214
561	NC_015067	TCT	2	6	25321	25326	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322690214
562	NC_015067	GTC	2	6	25334	25339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690214
563	NC_015067	AGC	2	6	25347	25352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690214
564	NC_015067	AGC	2	6	25411	25416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690214
565	NC_015067	ATG	2	6	25557	25562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690214
566	NC_015067	CG	3	6	25593	25598	0 %	0 %	50 %	50 %	322690214
567	NC_015067	TTC	2	6	25629	25634	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322690214
568	NC_015067	CCT	2	6	25678	25683	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322690214
569	NC_015067	ATG	2	6	25722	25727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690214
570	NC_015067	GCA	2	6	25750	25755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690214
571	NC_015067	GGA	2	6	25805	25810	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322690214
572	NC_015067	GTC	2	6	25829	25834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690214
573	NC_015067	TTC	2	6	25902	25907	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322690214
574	NC_015067	TCG	2	6	25926	25931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690214
575	NC_015067	GCC	2	6	25958	25963	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690214
576	NC_015067	CGT	2	6	26002	26007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690214
577	NC_015067	GCGGAC	2	12	26039	26050	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	322690214
578	NC_015067	TCG	2	6	26052	26057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690214
579	NC_015067	CCGCGG	2	12	26058	26069	0 %	0 %	50 %	50 %	322690214
580	NC_015067	TCA	2	6	26077	26082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690214
581	NC_015067	TGG	2	6	26086	26091	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690214
582	NC_015067	TGC	2	6	26107	26112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690214
583	NC_015067	TGCGCA	2	12	26134	26145	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	322690214
584	NC_015067	CTC	2	6	26180	26185	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322690214
585	NC_015067	CAG	2	6	26228	26233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690214
586	NC_015067	GTA	2	6	26237	26242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
587	NC_015067	TG	3	6	26338	26343	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
588	NC_015067	TTG	2	6	26348	26353	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
589	NC_015067	CCG	2	6	26355	26360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
590	NC_015067	CGT	2	6	26392	26397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690215
591	NC_015067	GCC	2	6	26446	26451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690215
592	NC_015067	CATC	2	8	26475	26482	25 %	25 %	0 %	50 %	322690215
593	NC_015067	CCG	2	6	26530	26535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690215
594	NC_015067	CAG	3	9	26626	26634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690215
595	NC_015067	CAT	2	6	26661	26666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690215
596	NC_015067	GTG	2	6	26705	26710	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690215
597	NC_015067	ATG	2	6	26729	26734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690215
598	NC_015067	GTC	2	6	26747	26752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690215
599	NC_015067	GTC	2	6	26771	26776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690215
600	NC_015067	GGCCA	2	10	26795	26804	20 %	0 %	40 %	40 %	322690215
601	NC_015067	CGA	2	6	26853	26858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690215
602	NC_015067	GCG	2	6	26872	26877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690215
603	NC_015067	CGC	2	6	26889	26894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690215
604	NC_015067	GCT	2	6	26904	26909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690215
605	NC_015067	GTC	2	6	26926	26931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690215
606	NC_015067	CCTA	2	8	27128	27135	25 %	25 %	0 %	50 %	322690215
607	NC_015067	CCG	2	6	27168	27173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690215
608	NC_015067	GTG	2	6	27175	27180	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690215
609	NC_015067	TCG	2	6	27240	27245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
610	NC_015067	CCA	2	6	27272	27277	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
611	NC_015067	GCC	2	6	27286	27291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690216
612	NC_015067	CGA	2	6	27306	27311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690216
613	NC_015067	CGC	2	6	27339	27344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690216
614	NC_015067	CGA	2	6	27351	27356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690216
615	NC_015067	GCC	2	6	27364	27369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690216
616	NC_015067	CCG	2	6	27377	27382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690216
617	NC_015067	GAA	2	6	27402	27407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322690216
618	NC_015067	GTG	2	6	27439	27444	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690216
619	NC_015067	CGA	2	6	27468	27473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690216
620	NC_015067	TGC	2	6	27524	27529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690216
621	NC_015067	TGGCCG	2	12	27620	27631	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	322690216
622	NC_015067	TC	3	6	27653	27658	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
623	NC_015067	GCG	2	6	27689	27694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
624	NC_015067	CGA	2	6	27698	27703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
625	NC_015067	CCAGC	2	10	27801	27810	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
626	NC_015067	GACC	2	8	27822	27829	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
627	NC_015067	TTG	2	6	27884	27889	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
628	NC_015067	CAGG	2	8	27939	27946	25 %	0 %	50 %	25 %	322690217
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