MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bifidobacterium longum subsp. longum JCM 1217 chromosome

Total Repeats: 52904

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_015067	GAA	2	6	245854	245859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322690382
5502	NC_015067	CTT	2	6	245927	245932	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5503	NC_015067	GGC	2	6	246044	246049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5504	NC_015067	GCC	2	6	246053	246058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5505	NC_015067	CGC	2	6	246076	246081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5506	NC_015067	CGG	2	6	246106	246111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5507	NC_015067	TCA	2	6	246164	246169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5508	NC_015067	TCAC	2	8	246183	246190	25 %	25 %	0 %	50 %	322690383
5509	NC_015067	TTC	2	6	246205	246210	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322690383
5510	NC_015067	AGG	2	6	246249	246254	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322690383
5511	NC_015067	GCT	2	6	246276	246281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690383
5512	NC_015067	CGG	2	6	246318	246323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690383
5513	NC_015067	GAA	2	6	246325	246330	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322690383
5514	NC_015067	CG	3	6	246347	246352	0 %	0 %	50 %	50 %	322690383
5515	NC_015067	GCG	2	6	246357	246362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690383
5516	NC_015067	GCG	2	6	246381	246386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690383
5517	NC_015067	TCA	2	6	246440	246445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690383
5518	NC_015067	ATC	2	6	246494	246499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690383
5519	NC_015067	ATTC	2	8	246525	246532	25 %	50 %	0 %	25 %	322690383
5520	NC_015067	TCGC	2	8	246551	246558	0 %	25 %	25 %	50 %	322690383
5521	NC_015067	CAT	2	6	246576	246581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690383
5522	NC_015067	CGG	3	9	246591	246599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690383
5523	NC_015067	CAT	2	6	246612	246617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690383
5524	NC_015067	GCC	2	6	246671	246676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690383
5525	NC_015067	CCA	2	6	246714	246719	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690383
5526	NC_015067	AGC	2	6	246728	246733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690383
5527	NC_015067	TCG	2	6	246788	246793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690383
5528	NC_015067	CCA	2	6	246796	246801	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690383
5529	NC_015067	CG	3	6	246810	246815	0 %	0 %	50 %	50 %	322690383
5530	NC_015067	CAAT	2	8	246818	246825	50 %	25 %	0 %	25 %	322690383
5531	NC_015067	CAGC	2	8	246831	246838	25 %	0 %	25 %	50 %	322690383
5532	NC_015067	GC	3	6	246969	246974	0 %	0 %	50 %	50 %	322690383
5533	NC_015067	ATC	2	6	246983	246988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690383
5534	NC_015067	TGT	2	6	247077	247082	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5535	NC_015067	ACA	2	6	247089	247094	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5536	NC_015067	TTA	2	6	247128	247133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5537	NC_015067	CGC	2	6	247227	247232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5538	NC_015067	TGA	2	6	247285	247290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690384
5539	NC_015067	CGG	2	6	247585	247590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690384
5540	NC_015067	GCG	2	6	247603	247608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690384
5541	NC_015067	GC	3	6	247635	247640	0 %	0 %	50 %	50 %	322690384
5542	NC_015067	GCG	2	6	247691	247696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690384
5543	NC_015067	ATT	2	6	247721	247726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322690384
5544	NC_015067	CGG	2	6	247793	247798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690384
5545	NC_015067	CCA	2	6	247808	247813	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690384
5546	NC_015067	AGC	2	6	247839	247844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690384
5547	NC_015067	GGT	2	6	247864	247869	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690384
5548	NC_015067	CG	3	6	247882	247887	0 %	0 %	50 %	50 %	322690384
5549	NC_015067	GAT	3	9	247895	247903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690384
5550	NC_015067	CACCGG	2	12	247906	247917	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	322690384
5551	NC_015067	CGG	2	6	248020	248025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690384
5552	NC_015067	GTTCG	2	10	248039	248048	0 %	40 %	40 %	20 %	322690384
5553	NC_015067	TAC	2	6	248084	248089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690384
5554	NC_015067	AGC	2	6	248175	248180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690384
5555	NC_015067	CGC	2	6	248206	248211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690384
5556	NC_015067	CTC	2	6	248213	248218	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322690384
5557	NC_015067	CGGGTG	2	12	248250	248261	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	322690384
5558	NC_015067	GAT	2	6	248273	248278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690384
5559	NC_015067	TCC	2	6	248286	248291	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322690385
5560	NC_015067	GGC	2	6	248295	248300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690385
5561	NC_015067	CG	3	6	248304	248309	0 %	0 %	50 %	50 %	322690385
5562	NC_015067	TCG	2	6	248318	248323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690385
5563	NC_015067	GGT	2	6	248431	248436	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690385
5564	NC_015067	AAC	2	6	248441	248446	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322690385
5565	NC_015067	AGC	2	6	248459	248464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690385
5566	NC_015067	TCACG	2	10	248538	248547	20 %	20 %	20 %	40 %	322690385
5567	NC_015067	TGG	2	6	248556	248561	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690385
5568	NC_015067	GCC	2	6	248563	248568	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690385
5569	NC_015067	TCG	2	6	248603	248608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690385
5570	NC_015067	CGG	2	6	248652	248657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690385
5571	NC_015067	GC	3	6	248681	248686	0 %	0 %	50 %	50 %	322690385
5572	NC_015067	CCAGC	2	10	248756	248765	20 %	0 %	20 %	60 %	322690385
5573	NC_015067	GGC	2	6	248791	248796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690385
5574	NC_015067	GTG	2	6	248807	248812	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690385
5575	NC_015067	TCC	2	6	248834	248839	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322690385
5576	NC_015067	CG	4	8	248889	248896	0 %	0 %	50 %	50 %	322690385
5577	NC_015067	GGC	2	6	248902	248907	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690385
5578	NC_015067	CGG	2	6	248928	248933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690385
5579	NC_015067	CGG	2	6	248952	248957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690385
5580	NC_015067	CTC	2	6	248986	248991	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322690385
5581	NC_015067	GGT	2	6	249021	249026	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690385
5582	NC_015067	GCG	2	6	249044	249049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690385
5583	NC_015067	CGT	2	6	249057	249062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690385
5584	NC_015067	GCC	2	6	249076	249081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690385
5585	NC_015067	CAG	2	6	249175	249180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690385
5586	NC_015067	GAT	2	6	249304	249309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690385
5587	NC_015067	GGC	2	6	249352	249357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690385
5588	NC_015067	GCT	2	6	249360	249365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690385
5589	NC_015067	GC	3	6	249383	249388	0 %	0 %	50 %	50 %	322690385
5590	NC_015067	GGC	2	6	249389	249394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690385
5591	NC_015067	CGCGGT	2	12	249429	249440	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	322690385
5592	NC_015067	GTC	2	6	249484	249489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690385
5593	NC_015067	CGG	2	6	249516	249521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690385
5594	NC_015067	CGG	2	6	249573	249578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690385
5595	NC_015067	CGG	2	6	249617	249622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690385
5596	NC_015067	CGG	2	6	249646	249651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690385
5597	NC_015067	AGT	2	6	249689	249694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690385
5598	NC_015067	CGG	2	6	249836	249841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5599	NC_015067	CTAT	2	8	249842	249849	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5600	NC_015067	GT	3	6	249972	249977	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5601	NC_015067	AGA	2	6	249983	249988	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5602	NC_015067	AGC	2	6	250014	250019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5603	NC_015067	CAA	2	6	250065	250070	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5604	NC_015067	T	7	7	250099	250105	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5605	NC_015067	GTG	2	6	250130	250135	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5606	NC_015067	CAC	2	6	250148	250153	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690386
5607	NC_015067	ACG	2	6	250180	250185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690386
5608	NC_015067	CCA	2	6	250189	250194	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690386
5609	NC_015067	TCGGGC	2	12	250215	250226	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	322690386
5610	NC_015067	TCG	2	6	250246	250251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690386
5611	NC_015067	CGA	2	6	250262	250267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690386
5612	NC_015067	AAT	2	6	250359	250364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	322690386
5613	NC_015067	CGGC	2	8	250476	250483	0 %	0 %	50 %	50 %	322690386
5614	NC_015067	AGC	2	6	250519	250524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690386
5615	NC_015067	CGG	2	6	250526	250531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690386
5616	NC_015067	CAT	2	6	250547	250552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690386
5617	NC_015067	TGC	2	6	250561	250566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690386
5618	NC_015067	CAC	2	6	250574	250579	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690386
5619	NC_015067	CG	4	8	250580	250587	0 %	0 %	50 %	50 %	322690386
5620	NC_015067	CG	3	6	250595	250600	0 %	0 %	50 %	50 %	322690386
5621	NC_015067	ATT	2	6	250650	250655	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	322690386
5622	NC_015067	CGG	2	6	250691	250696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690386
5623	NC_015067	CCA	2	6	250697	250702	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690386
5624	NC_015067	CGCC	2	8	250709	250716	0 %	0 %	25 %	75 %	322690386
5625	NC_015067	CGA	2	6	250763	250768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690386
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5630	NC_015067	CGC	2	6	251019	251024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690386
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5632	NC_015067	CGA	2	6	251078	251083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690386
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5643	NC_015067	TTGC	2	8	251544	251551	0 %	50 %	25 %	25 %	322690386
5644	NC_015067	GGC	2	6	251598	251603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690386
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5647	NC_015067	GCT	2	6	251696	251701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690386
5648	NC_015067	ACG	2	6	251704	251709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690386
5649	NC_015067	CTG	2	6	251808	251813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5650	NC_015067	CAG	2	6	251823	251828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5651	NC_015067	CGA	2	6	251859	251864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690387
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5653	NC_015067	CG	3	6	252030	252035	0 %	0 %	50 %	50 %	322690387
5654	NC_015067	TCA	2	6	252141	252146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690387
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5658	NC_015067	TGCG	2	8	252350	252357	0 %	25 %	50 %	25 %	322690387
5659	NC_015067	GCAT	2	8	252368	252375	25 %	25 %	25 %	25 %	322690387
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5662	NC_015067	CGG	2	6	252446	252451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690387
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5684	NC_015067	GCG	2	6	253630	253635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690388
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5688	NC_015067	GCT	2	6	253700	253705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690388
5689	NC_015067	GAA	2	6	253732	253737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5690	NC_015067	GGC	2	6	253876	253881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690389
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5721	NC_015067	GCCG	2	8	255429	255436	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5722	NC_015067	AG	3	6	255464	255469	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5723	NC_015067	GATT	2	8	255488	255495	25 %	50 %	25 %	0 %	322690390
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5732	NC_015067	GGT	2	6	255957	255962	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690390
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5734	NC_015067	CTG	2	6	255970	255975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690390
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5742	NC_015067	CCGC	2	8	256115	256122	0 %	0 %	25 %	75 %	322690390
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5745	NC_015067	CTG	2	6	256213	256218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690390
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5866	NC_015067	TGA	2	6	260985	260990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690394
5867	NC_015067	ATC	2	6	261074	261079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690394
5868	NC_015067	GTG	2	6	261110	261115	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690394
5869	NC_015067	CGG	2	6	261160	261165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690394
5870	NC_015067	ACCG	2	8	261199	261206	25 %	0 %	25 %	50 %	322690394
5871	NC_015067	TAC	2	6	261221	261226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690394
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5873	NC_015067	CCG	2	6	261303	261308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690394
5874	NC_015067	GCC	2	6	261392	261397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690394
5875	NC_015067	GGT	2	6	261406	261411	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690394
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5879	NC_015067	CGA	2	6	261490	261495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690394
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5887	NC_015067	GCGCC	2	10	261700	261709	0 %	0 %	40 %	60 %	322690394
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5897	NC_015067	GCAA	2	8	262270	262277	50 %	0 %	25 %	25 %	322690395
5898	NC_015067	GTG	2	6	262312	262317	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690395
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5901	NC_015067	CGG	2	6	262635	262640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690395
5902	NC_015067	GCTCGA	2	12	262665	262676	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	322690395
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5922	NC_015067	ACG	2	6	263435	263440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690395
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5924	NC_015067	ACTTC	2	10	263483	263492	20 %	40 %	0 %	40 %	322690395
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5926	NC_015067	GCGT	2	8	263525	263532	0 %	25 %	50 %	25 %	322690395
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5929	NC_015067	CCG	3	9	263921	263929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690396
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5939	NC_015067	TGC	2	6	264424	264429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690396
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5945	NC_015067	TGG	2	6	264689	264694	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5946	NC_015067	AGG	2	6	264730	264735	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5984	NC_015067	CG	3	6	266373	266378	0 %	0 %	50 %	50 %	322690398
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5987	NC_015067	GCT	2	6	266636	266641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690398
5988	NC_015067	TCG	2	6	266700	266705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690398
5989	NC_015067	CTA	2	6	266711	266716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690398
5990	NC_015067	CGT	2	6	266771	266776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690398
5991	NC_015067	AAG	2	6	266835	266840	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322690398
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5999	NC_015067	CGGT	2	8	267279	267286	0 %	25 %	50 %	25 %	322690399
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