MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bifidobacterium longum subsp. longum JCM 1217 chromosome

Total Repeats: 52904

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_015067	CCG	2	6	201074	201079	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690346
4502	NC_015067	CCG	2	6	201096	201101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690346
4503	NC_015067	CCG	2	6	201133	201138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690346
4504	NC_015067	AAGA	2	8	201169	201176	75 %	0 %	25 %	0 %	322690346
4505	NC_015067	CG	3	6	201206	201211	0 %	0 %	50 %	50 %	322690346
4506	NC_015067	TGC	2	6	201266	201271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690346
4507	NC_015067	GGA	2	6	201282	201287	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322690346
4508	NC_015067	TCA	2	6	201299	201304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690346
4509	NC_015067	TCG	2	6	201319	201324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690346
4510	NC_015067	CGGCAA	2	12	201408	201419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690346
4511	NC_015067	C	6	6	201480	201485	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4512	NC_015067	TGA	2	6	201488	201493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4513	NC_015067	GA	3	6	201525	201530	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4514	NC_015067	CA	3	6	201558	201563	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4515	NC_015067	CCG	2	6	201594	201599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690347
4516	NC_015067	TGG	2	6	201655	201660	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690347
4517	NC_015067	GAT	2	6	201692	201697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690347
4518	NC_015067	GATTC	2	10	201743	201752	20 %	40 %	20 %	20 %	322690347
4519	NC_015067	CCG	2	6	201848	201853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690347
4520	NC_015067	CTC	2	6	201907	201912	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	322690347
4521	NC_015067	GCA	2	6	201933	201938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690347
4522	NC_015067	CGG	2	6	201945	201950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690347
4523	NC_015067	GCC	2	6	201976	201981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690347
4524	NC_015067	TAC	2	6	201998	202003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690347
4525	NC_015067	CCA	2	6	202017	202022	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690347
4526	NC_015067	ACTG	2	8	202176	202183	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4527	NC_015067	GGGT	2	8	202185	202192	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
4528	NC_015067	ACC	2	6	202202	202207	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4529	NC_015067	TCG	2	6	202220	202225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4530	NC_015067	CAA	2	6	202255	202260	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4531	NC_015067	CAC	2	6	202289	202294	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690348
4532	NC_015067	GGTA	2	8	202301	202308	25 %	25 %	50 %	0 %	322690348
4533	NC_015067	CAT	2	6	202334	202339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690348
4534	NC_015067	TCG	2	6	202390	202395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690348
4535	NC_015067	GGA	2	6	202403	202408	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322690348
4536	NC_015067	CG	3	6	202414	202419	0 %	0 %	50 %	50 %	322690348
4537	NC_015067	GAC	2	6	202461	202466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690348
4538	NC_015067	CCG	2	6	202480	202485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690348
4539	NC_015067	AAGG	2	8	202503	202510	50 %	0 %	50 %	0 %	322690348
4540	NC_015067	ACC	2	6	202572	202577	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690348
4541	NC_015067	CGG	2	6	202649	202654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690348
4542	NC_015067	TGC	2	6	202684	202689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690348
4543	NC_015067	GC	3	6	202729	202734	0 %	0 %	50 %	50 %	322690348
4544	NC_015067	TGG	2	6	202797	202802	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690348
4545	NC_015067	GGC	2	6	202815	202820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690348
4546	NC_015067	CGA	2	6	202886	202891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690348
4547	NC_015067	ACCA	2	8	202965	202972	50 %	0 %	0 %	50 %	322690348
4548	NC_015067	CG	3	6	203011	203016	0 %	0 %	50 %	50 %	322690348
4549	NC_015067	ACTCCG	2	12	203032	203043	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	322690348
4550	NC_015067	ACA	2	6	203053	203058	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	322690348
4551	NC_015067	CG	3	6	203062	203067	0 %	0 %	50 %	50 %	322690348
4552	NC_015067	ACG	2	6	203098	203103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690348
4553	NC_015067	CGA	2	6	203144	203149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690348
4554	NC_015067	CCGC	2	8	203339	203346	0 %	0 %	25 %	75 %	322690348
4555	NC_015067	TTC	2	6	203409	203414	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322690348
4556	NC_015067	CGCC	2	8	203431	203438	0 %	0 %	25 %	75 %	322690348
4557	NC_015067	CAT	2	6	203495	203500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690348
4558	NC_015067	CGC	2	6	203501	203506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690348
4559	NC_015067	CGC	2	6	203591	203596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690348
4560	NC_015067	CGA	2	6	203600	203605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690348
4561	NC_015067	GCC	2	6	203631	203636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690348
4562	NC_015067	CCG	2	6	203653	203658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690348
4563	NC_015067	CGC	2	6	203726	203731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690348
4564	NC_015067	CGC	3	9	203762	203770	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690348
4565	NC_015067	AGG	2	6	203797	203802	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322690348
4566	NC_015067	GCT	2	6	203813	203818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690348
4567	NC_015067	GCA	2	6	203839	203844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690348
4568	NC_015067	GAA	2	6	203852	203857	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322690348
4569	NC_015067	CTCCC	2	10	203894	203903	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
4570	NC_015067	GGC	2	6	203957	203962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4571	NC_015067	GCC	2	6	203967	203972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4572	NC_015067	CCA	2	6	203973	203978	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4573	NC_015067	CA	3	6	203990	203995	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4574	NC_015067	ACC	2	6	204017	204022	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690349
4575	NC_015067	CCAG	2	8	204036	204043	25 %	0 %	25 %	50 %	322690349
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4580	NC_015067	CG	3	6	204165	204170	0 %	0 %	50 %	50 %	322690349
4581	NC_015067	ACC	2	6	204182	204187	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690349
4582	NC_015067	CCG	2	6	204237	204242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690349
4583	NC_015067	TGC	2	6	204243	204248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690349
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4586	NC_015067	GCG	2	6	204351	204356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690349
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4590	NC_015067	GC	3	6	204897	204902	0 %	0 %	50 %	50 %	322690349
4591	NC_015067	CCG	2	6	204912	204917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690349
4592	NC_015067	GTG	2	6	204923	204928	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690349
4593	NC_015067	CGA	2	6	204949	204954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690349
4594	NC_015067	CTGGC	2	10	204962	204971	0 %	20 %	40 %	40 %	322690349
4595	NC_015067	TCA	2	6	205026	205031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690349
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4599	NC_015067	TCG	2	6	205164	205169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690349
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4601	NC_015067	GTGG	2	8	205243	205250	0 %	25 %	75 %	0 %	322690349
4602	NC_015067	GAA	2	6	205421	205426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322690349
4603	NC_015067	GAA	2	6	205444	205449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	322690349
4604	NC_015067	TGCCGG	2	12	205462	205473	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	322690349
4605	NC_015067	ACC	2	6	205493	205498	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690349
4606	NC_015067	CAC	2	6	205504	205509	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690349
4607	NC_015067	TGA	2	6	205529	205534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690349
4608	NC_015067	TAG	2	6	205698	205703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4609	NC_015067	CGC	2	6	205748	205753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4610	NC_015067	CGG	2	6	205754	205759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4611	NC_015067	CTGA	2	8	205807	205814	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4612	NC_015067	GGT	2	6	205865	205870	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690350
4613	NC_015067	GGC	2	6	206003	206008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690350
4614	NC_015067	ACC	2	6	206024	206029	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	322690350
4615	NC_015067	AGCC	2	8	206067	206074	25 %	0 %	25 %	50 %	322690350
4616	NC_015067	CGG	2	6	206092	206097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690350
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4620	NC_015067	GCT	2	6	206258	206263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4621	NC_015067	ATT	2	6	206299	206304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4622	NC_015067	AT	3	6	206319	206324	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4624	NC_015067	TGA	2	6	206382	206387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690351
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4626	NC_015067	GCTG	2	8	206473	206480	0 %	25 %	50 %	25 %	322690351
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4747	NC_015067	ATG	2	6	212037	212042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690356
4748	NC_015067	CCAG	2	8	212084	212091	25 %	0 %	25 %	50 %	322690356
4749	NC_015067	CGG	2	6	212112	212117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690356
4750	NC_015067	TGG	2	6	212161	212166	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	322690356
4751	NC_015067	CACC	2	8	212240	212247	25 %	0 %	0 %	75 %	322690356
4752	NC_015067	CG	3	6	212267	212272	0 %	0 %	50 %	50 %	322690356
4753	NC_015067	CTT	2	6	212291	212296	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322690356
4754	NC_015067	CTT	2	6	212314	212319	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	322690356
4755	NC_015067	GTA	2	6	212333	212338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	322690356
4756	NC_015067	CAGTGG	2	12	212356	212367	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	322690356
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4759	NC_015067	GCT	2	6	212644	212649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690356
4760	NC_015067	TTG	2	6	212664	212669	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	322690356
4761	NC_015067	CAT	2	6	212711	212716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4762	NC_015067	TTC	2	6	212718	212723	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4763	NC_015067	CAA	2	6	212744	212749	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4764	NC_015067	AAT	2	6	212758	212763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4765	NC_015067	GCC	2	6	212977	212982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690357
4766	NC_015067	AGC	2	6	212987	212992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	322690357
4767	NC_015067	CTG	2	6	213028	213033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	322690357
4768	NC_015067	GCCTG	2	10	213041	213050	0 %	20 %	40 %	40 %	322690357
4769	NC_015067	TTTTC	2	10	213068	213077	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
4770	NC_015067	AAAAG	2	10	213094	213103	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
4771	NC_015067	GGCA	2	8	213109	213116	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4772	NC_015067	GAG	2	6	213190	213195	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4773	NC_015067	GCT	2	6	213197	213202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4774	NC_015067	GC	4	8	213214	213221	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4775	NC_015067	CGG	2	6	213372	213377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	322690358
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4779	NC_015067	GCC	2	6	213628	213633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690358
4780	NC_015067	GCC	2	6	213694	213699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690358
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4805	NC_015067	TGA	2	6	214848	214853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4807	NC_015067	GCG	2	6	215007	215012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4811	NC_015067	TCA	2	6	215222	215227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4868	NC_015067	GGA	2	6	217937	217942	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322690360
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4992	NC_015067	AGGA	2	8	224258	224265	50 %	0 %	50 %	0 %	322690365
4993	NC_015067	CGC	2	6	224281	224286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690365
4994	NC_015067	GAAC	2	8	224362	224369	50 %	0 %	25 %	25 %	322690365
4995	NC_015067	CAT	2	6	224380	224385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	322690365
4996	NC_015067	CGC	2	6	224402	224407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	322690365
4997	NC_015067	AC	3	6	224425	224430	50 %	0 %	0 %	50 %	322690365
4998	NC_015067	GGA	2	6	224434	224439	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	322690365
4999	NC_015067	TAA	2	6	224479	224484	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5000	NC_015067	CAA	2	6	224493	224498	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

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