MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bacillus subtilis BSn5 chromosome

Total Repeats: 86692

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014976	TAA	2	6	1405	1410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014976	ACTTT	2	10	1459	1468	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_014976	TAG	2	6	1498	1503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014976	CTT	2	6	1600	1605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_014976	AGTA	2	8	1631	1638	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014976	GCA	2	6	1648	1653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_014976	TAA	2	6	1692	1697	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014976	A	6	6	1707	1712	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014976	T	6	6	1717	1722	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014976	A	6	6	1723	1728	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014976	TCC	2	6	1814	1819	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	321311378
12	NC_014976	T	6	6	1825	1830	0 %	100 %	0 %	0 %	321311378
13	NC_014976	TAA	2	6	1835	1840	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	321311378
14	NC_014976	GCAT	2	8	1870	1877	25 %	25 %	25 %	25 %	321311378
15	NC_014976	TGA	2	6	1898	1903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	321311378
16	NC_014976	TA	3	6	1915	1920	50 %	50 %	0 %	0 %	321311378
17	NC_014976	T	7	7	1924	1930	0 %	100 %	0 %	0 %	321311378
18	NC_014976	TAGC	2	8	2010	2017	25 %	25 %	25 %	25 %	321311378
19	NC_014976	TCA	2	6	2063	2068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	321311378
20	NC_014976	AAT	2	6	2069	2074	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	321311378
21	NC_014976	GTAC	2	8	2083	2090	25 %	25 %	25 %	25 %	321311378
22	NC_014976	T	6	6	2116	2121	0 %	100 %	0 %	0 %	321311378
23	NC_014976	CCA	2	6	2131	2136	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	321311378
24	NC_014976	CTT	2	6	2154	2159	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	321311378
25	NC_014976	CTG	2	6	2197	2202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	321311378
26	NC_014976	ATAA	2	8	2221	2228	75 %	25 %	0 %	0 %	321311378
27	NC_014976	TGA	2	6	2238	2243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	321311378
28	NC_014976	TCC	2	6	2288	2293	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	321311378
29	NC_014976	GCC	2	6	2297	2302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	321311378
30	NC_014976	GCG	2	6	2361	2366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	321311378
31	NC_014976	CA	3	6	2422	2427	50 %	0 %	0 %	50 %	321311378
32	NC_014976	CCT	3	9	2507	2515	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	321311379
33	NC_014976	CATG	2	8	2538	2545	25 %	25 %	25 %	25 %	321311379
34	NC_014976	T	6	6	2573	2578	0 %	100 %	0 %	0 %	321311379
35	NC_014976	ATA	2	6	2580	2585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	321311379
36	NC_014976	TCC	2	6	2656	2661	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	321311379
37	NC_014976	A	6	6	2668	2673	100 %	0 %	0 %	0 %	321311379
38	NC_014976	GT	3	6	2679	2684	0 %	50 %	50 %	0 %	321311379
39	NC_014976	AGC	2	6	2692	2697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	321311379
40	NC_014976	CCTG	2	8	2698	2705	0 %	25 %	25 %	50 %	321311379
41	NC_014976	TA	3	6	2706	2711	50 %	50 %	0 %	0 %	321311379
42	NC_014976	CAG	2	6	2727	2732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	321311379
43	NC_014976	T	7	7	2881	2887	0 %	100 %	0 %	0 %	321311379
44	NC_014976	TTA	2	6	2921	2926	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	321311379
45	NC_014976	TGG	2	6	2961	2966	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	321311379
46	NC_014976	ATA	2	6	2982	2987	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	321311379
47	NC_014976	T	7	7	2999	3005	0 %	100 %	0 %	0 %	321311379
48	NC_014976	ATG	2	6	3172	3177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	321311379
49	NC_014976	T	6	6	3223	3228	0 %	100 %	0 %	0 %	321311380
50	NC_014976	T	7	7	3440	3446	0 %	100 %	0 %	0 %	321311380
51	NC_014976	A	6	6	3449	3454	100 %	0 %	0 %	0 %	321311380
52	NC_014976	GCA	2	6	3469	3474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	321311380
53	NC_014976	AATG	2	8	3545	3552	50 %	25 %	25 %	0 %	321311380
54	NC_014976	A	6	6	3617	3622	100 %	0 %	0 %	0 %	321311380
55	NC_014976	CA	3	6	3663	3668	50 %	0 %	0 %	50 %	321311380
56	NC_014976	AAAT	2	8	3685	3692	75 %	25 %	0 %	0 %	321311380
57	NC_014976	T	6	6	3726	3731	0 %	100 %	0 %	0 %	321311380
58	NC_014976	TCA	2	6	3911	3916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	321311380
59	NC_014976	TCTT	2	8	3995	4002	0 %	75 %	0 %	25 %	321311380
60	NC_014976	CGT	2	6	4011	4016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	321311380
61	NC_014976	CTG	2	6	4051	4056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	321311380
62	NC_014976	AGC	2	6	4126	4131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	321311380
63	NC_014976	TCA	2	6	4178	4183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	321311380
64	NC_014976	T	6	6	4232	4237	0 %	100 %	0 %	0 %	321311380
65	NC_014976	T	6	6	4290	4295	0 %	100 %	0 %	0 %	321311381
66	NC_014976	GGA	2	6	4422	4427	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	321311381
67	NC_014976	TGA	2	6	4493	4498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	321311381
68	NC_014976	TG	3	6	4501	4506	0 %	50 %	50 %	0 %	321311381
69	NC_014976	CAC	2	6	4517	4522	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	321311381
70	NC_014976	ATA	2	6	4523	4528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	321311381
71	NC_014976	TGC	2	6	4565	4570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	321311381
72	NC_014976	T	6	6	4630	4635	0 %	100 %	0 %	0 %	321311381
73	NC_014976	GCTGGG	2	12	4883	4894	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	321311381
74	NC_014976	TGT	2	6	4905	4910	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	321311381
75	NC_014976	TTC	2	6	4950	4955	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	321311381
76	NC_014976	TGG	2	6	5011	5016	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	321311381
77	NC_014976	ATC	3	9	5076	5084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	321311381
78	NC_014976	TCA	2	6	5110	5115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	321311381
79	NC_014976	CCG	2	6	5119	5124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	321311381
80	NC_014976	CTT	2	6	5139	5144	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	321311381
81	NC_014976	GCT	2	6	5198	5203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	321311381
82	NC_014976	TTC	2	6	5235	5240	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	321311381
83	NC_014976	TGC	2	6	5266	5271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	321311381
84	NC_014976	ATC	2	6	5316	5321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	321311381
85	NC_014976	AGC	2	6	5329	5334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	321311381
86	NC_014976	ACA	2	6	5365	5370	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	321311381
87	NC_014976	A	7	7	5383	5389	100 %	0 %	0 %	0 %	321311381
88	NC_014976	TTCG	2	8	5445	5452	0 %	50 %	25 %	25 %	321311381
89	NC_014976	TTA	2	6	5455	5460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	321311381
90	NC_014976	ATT	2	6	5550	5555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	321311381
91	NC_014976	TTGTT	2	10	5583	5592	0 %	80 %	20 %	0 %	321311381
92	NC_014976	AAT	2	6	5619	5624	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	321311381
93	NC_014976	TGC	2	6	5726	5731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_014976	T	6	6	5754	5759	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014976	CAA	2	6	5811	5816	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_014976	GAT	2	6	5841	5846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014976	TTCT	2	8	5885	5892	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
98	NC_014976	TA	3	6	5916	5921	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014976	TAT	2	6	5946	5951	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014976	TTTA	2	8	5952	5959	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014976	TA	3	6	6011	6016	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_014976	T	6	6	6059	6064	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014976	TAC	2	6	6084	6089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_014976	AGAA	2	8	6093	6100	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014976	ACA	2	6	6126	6131	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_014976	ATG	2	6	6154	6159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_014976	TTGA	2	8	6193	6200	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014976	TCT	2	6	6255	6260	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	321311382
109	NC_014976	CGT	2	6	6316	6321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	321311382
110	NC_014976	GGA	2	6	6425	6430	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	321311383
111	NC_014976	C	6	6	6447	6452	0 %	0 %	0 %	100 %	321311383
112	NC_014976	ATA	2	6	6471	6476	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	321311383
113	NC_014976	AAG	2	6	6484	6489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	321311383
114	NC_014976	AGA	3	9	6559	6567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	321311383
115	NC_014976	CCT	2	6	6590	6595	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	321311383
116	NC_014976	A	6	6	6655	6660	100 %	0 %	0 %	0 %	321311383
117	NC_014976	A	6	6	6662	6667	100 %	0 %	0 %	0 %	321311383
118	NC_014976	CCT	2	6	6669	6674	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_014976	ATT	2	6	6699	6704	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_014976	CAGT	2	8	6734	6741	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
121	NC_014976	GTT	2	6	6751	6756	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_014976	TTG	2	6	6773	6778	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_014976	TTG	2	6	6804	6809	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014976	CAA	2	6	6868	6873	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	321311384
125	NC_014976	GTAAT	2	10	6940	6949	40 %	40 %	20 %	0 %	321311384
126	NC_014976	TA	3	6	6954	6959	50 %	50 %	0 %	0 %	321311384
127	NC_014976	GAA	2	6	6978	6983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	321311384
128	NC_014976	TAAA	2	8	7000	7007	75 %	25 %	0 %	0 %	321311384
129	NC_014976	T	6	6	7078	7083	0 %	100 %	0 %	0 %	321311384
130	NC_014976	ACAT	2	8	7100	7107	50 %	25 %	0 %	25 %	321311384
131	NC_014976	TGGG	2	8	7115	7122	0 %	25 %	75 %	0 %	321311384
132	NC_014976	GCA	2	6	7164	7169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	321311384
133	NC_014976	ATA	2	6	7237	7242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	321311384
134	NC_014976	GAGAA	2	10	7277	7286	60 %	0 %	40 %	0 %	321311384
135	NC_014976	T	6	6	7290	7295	0 %	100 %	0 %	0 %	321311384
136	NC_014976	A	6	6	7296	7301	100 %	0 %	0 %	0 %	321311384
137	NC_014976	AATG	2	8	7317	7324	50 %	25 %	25 %	0 %	321311384
138	NC_014976	ATT	2	6	7336	7341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	321311384
139	NC_014976	ATGA	2	8	7447	7454	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_014976	ATC	2	6	7510	7515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	321311385
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261	NC_014976	AGTA	2	8	12824	12831	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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264	NC_014976	A	7	7	12958	12964	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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273	NC_014976	TGC	2	6	13270	13275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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277	NC_014976	GCA	3	9	13483	13491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	321311394
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282	NC_014976	TA	3	6	13690	13695	50 %	50 %	0 %	0 %	321311394
283	NC_014976	TACA	2	8	13716	13723	50 %	25 %	0 %	25 %	321311394
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