MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Burkholderia rhizoxinica HKI 454 plasmid pBRH02

Total Repeats: 3365

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_014723	GCT	2	6	103078	103083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330399565
2002	NC_014723	GTAG	2	8	103098	103105	25 %	25 %	50 %	0 %	330399565
2003	NC_014723	GT	3	6	103112	103117	0 %	50 %	50 %	0 %	330399565
2004	NC_014723	ATC	2	6	103299	103304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330399565
2005	NC_014723	CAG	2	6	103323	103328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330399565
2006	NC_014723	CTC	2	6	103458	103463	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330399565
2007	NC_014723	ATC	2	6	103510	103515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330399565
2008	NC_014723	CAG	2	6	103520	103525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330399565
2009	NC_014723	ACA	2	6	103528	103533	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330399565
2010	NC_014723	AGCCC	2	10	103541	103550	20 %	0 %	20 %	60 %	330399565
2011	NC_014723	ATG	2	6	103584	103589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330399565
2012	NC_014723	TCTG	2	8	103660	103667	0 %	50 %	25 %	25 %	330399565
2013	NC_014723	TGC	2	6	103716	103721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330399565
2014	NC_014723	T	8	8	103823	103830	0 %	100 %	0 %	0 %	330399565
2015	NC_014723	AGA	2	6	103866	103871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330399565
2016	NC_014723	TGGC	2	8	103874	103881	0 %	25 %	50 %	25 %	330399565
2017	NC_014723	GAA	2	6	103917	103922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330399565
2018	NC_014723	GACG	2	8	103965	103972	25 %	0 %	50 %	25 %	330399565
2019	NC_014723	GGC	2	6	103980	103985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330399565
2020	NC_014723	CGG	2	6	103998	104003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330399565
2021	NC_014723	GAAA	2	8	104043	104050	75 %	0 %	25 %	0 %	330399565
2022	NC_014723	GCC	2	6	104066	104071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2023	NC_014723	TA	3	6	104101	104106	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2024	NC_014723	A	7	7	104183	104189	100 %	0 %	0 %	0 %	330399566
2025	NC_014723	GCC	2	6	104206	104211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330399566
2026	NC_014723	TG	3	6	104231	104236	0 %	50 %	50 %	0 %	330399566
2027	NC_014723	A	6	6	104241	104246	100 %	0 %	0 %	0 %	330399566
2028	NC_014723	GCTG	2	8	104257	104264	0 %	25 %	50 %	25 %	330399567
2029	NC_014723	TGC	2	6	104287	104292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330399567
2030	NC_014723	TGC	2	6	104341	104346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330399567
2031	NC_014723	CG	3	6	104369	104374	0 %	0 %	50 %	50 %	330399567
2032	NC_014723	TTG	2	6	104402	104407	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330399567
2033	NC_014723	GAC	2	6	104460	104465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2034	NC_014723	ACCA	2	8	104510	104517	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2035	NC_014723	GCC	2	6	104525	104530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2036	NC_014723	CGG	2	6	104566	104571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2037	NC_014723	GAAC	2	8	104683	104690	50 %	0 %	25 %	25 %	330399568
2038	NC_014723	TGG	2	6	104868	104873	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330399569
2039	NC_014723	AAAT	2	8	104898	104905	75 %	25 %	0 %	0 %	330399569
2040	NC_014723	GTC	2	6	105088	105093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330399569
2041	NC_014723	CGG	2	6	105162	105167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330399569
2042	NC_014723	CGG	3	9	105258	105266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330399569
2043	NC_014723	GTT	2	6	105286	105291	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330399569
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2045	NC_014723	GGC	2	6	105457	105462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330399569
2046	NC_014723	GC	3	6	105649	105654	0 %	0 %	50 %	50 %	330399569
2047	NC_014723	CGGC	2	8	105662	105669	0 %	0 %	50 %	50 %	330399569
2048	NC_014723	GGC	2	6	105701	105706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330399569
2049	NC_014723	GTC	2	6	105791	105796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2050	NC_014723	GGCG	2	8	105814	105821	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
2051	NC_014723	GGTC	2	8	105931	105938	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2052	NC_014723	CGT	2	6	105986	105991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2053	NC_014723	AGCC	2	8	106002	106009	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2054	NC_014723	TTGG	2	8	106011	106018	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2055	NC_014723	GC	3	6	106273	106278	0 %	0 %	50 %	50 %	330399570
2056	NC_014723	AAG	2	6	106352	106357	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330399571
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2058	NC_014723	GCTC	2	8	106467	106474	0 %	25 %	25 %	50 %	330399571
2059	NC_014723	GCGG	2	8	106705	106712	0 %	0 %	75 %	25 %	330399571
2060	NC_014723	GC	3	6	106715	106720	0 %	0 %	50 %	50 %	330399571
2061	NC_014723	CGG	2	6	106809	106814	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330399571
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2063	NC_014723	CCGA	2	8	107068	107075	25 %	0 %	25 %	50 %	330399571
2064	NC_014723	TAT	2	6	107076	107081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330399571
2065	NC_014723	CAGC	2	8	107262	107269	25 %	0 %	25 %	50 %	330399571
2066	NC_014723	G	7	7	107299	107305	0 %	0 %	100 %	0 %	330399571
2067	NC_014723	GCAG	2	8	107316	107323	25 %	0 %	50 %	25 %	330399571
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2069	NC_014723	AGCCA	2	10	107461	107470	40 %	0 %	20 %	40 %	330399571
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2077	NC_014723	CCGA	2	8	107953	107960	25 %	0 %	25 %	50 %	330399571
2078	NC_014723	G	6	6	107985	107990	0 %	0 %	100 %	0 %	330399571
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2082	NC_014723	CCGA	2	8	108250	108257	25 %	0 %	25 %	50 %	330399571
2083	NC_014723	GTG	2	6	108281	108286	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330399571
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2085	NC_014723	GCTTGA	2	12	108309	108320	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	330399571
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2091	NC_014723	CGG	2	6	108579	108584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330399571
2092	NC_014723	GCTTGA	2	12	108606	108617	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	330399571
2093	NC_014723	CGAG	2	8	108745	108752	25 %	0 %	50 %	25 %	330399571
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2097	NC_014723	GGC	3	9	108973	108981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330399571
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2104	NC_014723	GAG	3	9	109268	109276	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330399571
2105	NC_014723	TG	4	8	109346	109353	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2106	NC_014723	CGT	2	6	109388	109393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2107	NC_014723	GT	3	6	109392	109397	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2108	NC_014723	GT	3	6	109498	109503	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2109	NC_014723	GGT	2	6	109530	109535	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2110	NC_014723	CT	3	6	109594	109599	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2111	NC_014723	GGC	2	6	109663	109668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2112	NC_014723	TCGC	2	8	109675	109682	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2113	NC_014723	CGG	2	6	109745	109750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2114	NC_014723	GGTCG	2	10	109805	109814	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
2115	NC_014723	TGTC	2	8	109889	109896	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2116	NC_014723	GC	3	6	109998	110003	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2117	NC_014723	GTG	2	6	110045	110050	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2118	NC_014723	AAG	2	6	110077	110082	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2119	NC_014723	TGG	2	6	110147	110152	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2120	NC_014723	AAGC	2	8	110292	110299	50 %	0 %	25 %	25 %	330399572
2121	NC_014723	GGC	2	6	110536	110541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330399573
2122	NC_014723	CAG	2	6	110560	110565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330399573
2123	NC_014723	TG	3	6	110593	110598	0 %	50 %	50 %	0 %	330399573
2124	NC_014723	GCA	2	6	110665	110670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330399573
2125	NC_014723	CTG	2	6	110671	110676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330399573
2126	NC_014723	TCG	2	6	110697	110702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330399573
2127	NC_014723	GCT	2	6	110764	110769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2128	NC_014723	CA	3	6	110814	110819	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2129	NC_014723	TGC	2	6	110845	110850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2130	NC_014723	CAT	2	6	110899	110904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2131	NC_014723	CGG	2	6	111180	111185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330399574
2132	NC_014723	CGC	2	6	111207	111212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330399574
2133	NC_014723	GCC	2	6	111245	111250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330399574
2134	NC_014723	GT	3	6	111255	111260	0 %	50 %	50 %	0 %	330399574
2135	NC_014723	TGCC	2	8	111274	111281	0 %	25 %	25 %	50 %	330399574
2136	NC_014723	GAT	2	6	111310	111315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330399574
2137	NC_014723	ATC	2	6	111325	111330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330399574
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2139	NC_014723	TCAA	2	8	111562	111569	50 %	25 %	0 %	25 %	330399575
2140	NC_014723	GCA	2	6	111584	111589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330399575
2141	NC_014723	TGAC	2	8	111701	111708	25 %	25 %	25 %	25 %	330399575
2142	NC_014723	CAA	2	6	111742	111747	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330399575
2143	NC_014723	TCGC	2	8	111773	111780	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2144	NC_014723	CGC	2	6	111786	111791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2145	NC_014723	GCA	2	6	111801	111806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2146	NC_014723	AGC	2	6	111822	111827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2147	NC_014723	TCC	2	6	111874	111879	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2148	NC_014723	GC	3	6	112034	112039	0 %	0 %	50 %	50 %	330399576
2149	NC_014723	TCA	2	6	112102	112107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330399576
2150	NC_014723	CG	3	6	112126	112131	0 %	0 %	50 %	50 %	330399576
2151	NC_014723	GC	3	6	112148	112153	0 %	0 %	50 %	50 %	330399576
2152	NC_014723	CACC	2	8	112184	112191	25 %	0 %	0 %	75 %	330399576
2153	NC_014723	GAC	2	6	112208	112213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330399576
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2155	NC_014723	TTC	2	6	112285	112290	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330399576
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2157	NC_014723	AAC	2	6	112354	112359	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330399576
2158	NC_014723	CGCTT	2	10	112403	112412	0 %	40 %	20 %	40 %	330399577
2159	NC_014723	CGC	2	6	112512	112517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330399577
2160	NC_014723	TGC	2	6	112545	112550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330399577
2161	NC_014723	GCG	2	6	112560	112565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330399577
2162	NC_014723	GCC	2	6	112614	112619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330399577
2163	NC_014723	TTG	2	6	112694	112699	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330399577
2164	NC_014723	ATG	2	6	112707	112712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330399577
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2167	NC_014723	CGAG	2	8	112867	112874	25 %	0 %	50 %	25 %	330399577
2168	NC_014723	GCCGC	2	10	113008	113017	0 %	0 %	40 %	60 %	330399577
2169	NC_014723	CGCA	2	8	113057	113064	25 %	0 %	25 %	50 %	330399577
2170	NC_014723	GGC	2	6	113081	113086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330399577
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2176	NC_014723	CTT	2	6	113249	113254	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2177	NC_014723	AGT	2	6	113281	113286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330399578
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2180	NC_014723	GTT	2	6	113411	113416	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2181	NC_014723	GCC	2	6	113449	113454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330399579
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2193	NC_014723	GC	3	6	113875	113880	0 %	0 %	50 %	50 %	330399579
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2200	NC_014723	GCT	2	6	114045	114050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330399580
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2202	NC_014723	AGT	2	6	114284	114289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330399581
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2222	NC_014723	ATGT	2	8	115408	115415	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2223	NC_014723	GCC	2	6	115496	115501	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2224	NC_014723	CCG	2	6	115556	115561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2225	NC_014723	CG	3	6	115643	115648	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2226	NC_014723	GGC	2	6	115669	115674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2227	NC_014723	GT	3	6	115732	115737	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2228	NC_014723	CTG	2	6	115792	115797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2229	NC_014723	CGC	2	6	115869	115874	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2230	NC_014723	TTGT	2	8	115894	115901	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
2231	NC_014723	ATATTC	2	12	115978	115989	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2232	NC_014723	TGG	2	6	116014	116019	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2233	NC_014723	TGCC	2	8	116089	116096	0 %	25 %	25 %	50 %	330399584
2234	NC_014723	GCT	2	6	116118	116123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330399584
2235	NC_014723	AGC	2	6	116141	116146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330399584
2236	NC_014723	GCA	2	6	116177	116182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330399584
2237	NC_014723	GTT	2	6	116225	116230	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330399584
2238	NC_014723	CTT	2	6	116331	116336	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2239	NC_014723	CGG	2	6	116345	116350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2240	NC_014723	GC	3	6	116451	116456	0 %	0 %	50 %	50 %	330399585
2241	NC_014723	GCC	2	6	116459	116464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330399585
2242	NC_014723	CGC	2	6	116474	116479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330399585
2243	NC_014723	ATG	2	6	116488	116493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330399585
2244	NC_014723	GC	3	6	116503	116508	0 %	0 %	50 %	50 %	330399585
2245	NC_014723	CG	3	6	116533	116538	0 %	0 %	50 %	50 %	330399585
2246	NC_014723	GTC	2	6	116662	116667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2247	NC_014723	CGC	2	6	116688	116693	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330399586
2248	NC_014723	TCGC	2	8	116704	116711	0 %	25 %	25 %	50 %	330399586
2249	NC_014723	GA	3	6	116726	116731	50 %	0 %	50 %	0 %	330399586
2250	NC_014723	CAT	2	6	116787	116792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2251	NC_014723	CCG	2	6	116896	116901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2252	NC_014723	ATG	2	6	117107	117112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330399587
2253	NC_014723	CAT	2	6	117116	117121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330399587
2254	NC_014723	GCT	2	6	117136	117141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330399588
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2317	NC_014723	GTG	2	6	120334	120339	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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2373	NC_014723	AC	3	6	123511	123516	50 %	0 %	0 %	50 %	330399602
2374	NC_014723	GCT	2	6	123576	123581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330399602
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2377	NC_014723	CTG	2	6	123772	123777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2379	NC_014723	CTG	2	6	123840	123845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2381	NC_014723	CGA	2	6	124167	124172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2498	NC_014723	GGC	2	6	129931	129936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330399609
2499	NC_014723	GCCA	2	8	129960	129967	25 %	0 %	25 %	50 %	330399609
2500	NC_014723	TGGT	2	8	130005	130012	0 %	50 %	50 %	0 %	330399609

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