MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Burkholderia rhizoxinica HKI 454 plasmid pBRH02

Total Repeats: 3365

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_014723	CTG	2	6	77748	77753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1502	NC_014723	TGTT	2	8	77780	77787	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_014723	AT	3	6	77845	77850	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_014723	TCGC	2	8	77905	77912	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1505	NC_014723	GTG	2	6	78020	78025	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_014723	GCT	2	6	78086	78091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1507	NC_014723	ATC	2	6	78155	78160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1508	NC_014723	CCA	2	6	78163	78168	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1509	NC_014723	CTTA	2	8	78222	78229	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1510	NC_014723	TGCT	2	8	78250	78257	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1511	NC_014723	ATT	2	6	78388	78393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330399540
1512	NC_014723	CAC	2	6	78397	78402	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330399540
1513	NC_014723	CGA	2	6	78441	78446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330399540
1514	NC_014723	GC	3	6	78459	78464	0 %	0 %	50 %	50 %	330399540
1515	NC_014723	AGG	2	6	78470	78475	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330399540
1516	NC_014723	CGA	2	6	78498	78503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330399540
1517	NC_014723	CAG	2	6	78544	78549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330399540
1518	NC_014723	GGA	2	6	78590	78595	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330399540
1519	NC_014723	CGA	2	6	78606	78611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1520	NC_014723	GGC	2	6	78710	78715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1521	NC_014723	GCG	2	6	78771	78776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330399541
1522	NC_014723	GTG	2	6	78777	78782	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330399541
1523	NC_014723	AGC	2	6	78831	78836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330399541
1524	NC_014723	GCA	2	6	78853	78858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330399541
1525	NC_014723	CGCA	2	8	78869	78876	25 %	0 %	25 %	50 %	330399541
1526	NC_014723	GAG	2	6	79121	79126	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330399541
1527	NC_014723	GTGC	2	8	79163	79170	0 %	25 %	50 %	25 %	330399541
1528	NC_014723	GA	3	6	79306	79311	50 %	0 %	50 %	0 %	330399541
1529	NC_014723	GGC	2	6	79442	79447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330399541
1530	NC_014723	CCA	2	6	79457	79462	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330399541
1531	NC_014723	CCGA	2	8	79520	79527	25 %	0 %	25 %	50 %	330399541
1532	NC_014723	CGA	2	6	79531	79536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330399541
1533	NC_014723	GCC	2	6	79541	79546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330399541
1534	NC_014723	CG	3	6	79558	79563	0 %	0 %	50 %	50 %	330399541
1535	NC_014723	AGC	2	6	79677	79682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330399541
1536	NC_014723	AGC	2	6	79770	79775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330399541
1537	NC_014723	TGAT	2	8	79830	79837	25 %	50 %	25 %	0 %	330399541
1538	NC_014723	GGT	2	6	79906	79911	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330399541
1539	NC_014723	CAT	2	6	79925	79930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330399541
1540	NC_014723	TGG	2	6	79953	79958	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330399541
1541	NC_014723	CGA	2	6	80002	80007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330399541
1542	NC_014723	A	7	7	80033	80039	100 %	0 %	0 %	0 %	330399541
1543	NC_014723	CG	3	6	80080	80085	0 %	0 %	50 %	50 %	330399541
1544	NC_014723	CAA	2	6	80162	80167	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1545	NC_014723	GCT	2	6	80192	80197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1546	NC_014723	CCG	2	6	80213	80218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1547	NC_014723	CG	3	6	80217	80222	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1548	NC_014723	GAT	2	6	80228	80233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_014723	CATCT	2	10	80261	80270	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
1550	NC_014723	A	6	6	80295	80300	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_014723	TAA	2	6	80397	80402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_014723	AGT	2	6	80468	80473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_014723	ACA	2	6	80511	80516	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1554	NC_014723	GCC	2	6	80589	80594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1555	NC_014723	TGC	2	6	80640	80645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1556	NC_014723	TG	3	6	80761	80766	0 %	50 %	50 %	0 %	330399542
1557	NC_014723	AC	4	8	80794	80801	50 %	0 %	0 %	50 %	330399542
1558	NC_014723	TGCGT	2	10	80882	80891	0 %	40 %	40 %	20 %	330399542
1559	NC_014723	CGA	3	9	80926	80934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330399542
1560	NC_014723	CGC	2	6	80941	80946	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330399542
1561	NC_014723	GGC	2	6	81013	81018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1562	NC_014723	CG	3	6	81040	81045	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1563	NC_014723	GCAA	2	8	81103	81110	50 %	0 %	25 %	25 %	330399543
1564	NC_014723	AAT	2	6	81132	81137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330399543
1565	NC_014723	GGT	2	6	81142	81147	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330399543
1566	NC_014723	GCCCA	2	10	81174	81183	20 %	0 %	20 %	60 %	330399543
1567	NC_014723	GAGC	2	8	81231	81238	25 %	0 %	50 %	25 %	330399543
1568	NC_014723	GTCTA	2	10	81298	81307	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1569	NC_014723	CAG	2	6	81344	81349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1570	NC_014723	GTAC	2	8	81492	81499	25 %	25 %	25 %	25 %	330399544
1571	NC_014723	CTG	2	6	81509	81514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330399544
1572	NC_014723	GGC	2	6	81571	81576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330399544
1573	NC_014723	CGG	2	6	81633	81638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330399544
1574	NC_014723	CGCAA	2	10	81646	81655	40 %	0 %	20 %	40 %	330399544
1575	NC_014723	GTC	2	6	81679	81684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330399544
1576	NC_014723	CCA	2	6	81740	81745	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1577	NC_014723	TGC	2	6	81788	81793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1578	NC_014723	GAG	2	6	81814	81819	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1579	NC_014723	CAT	2	6	81896	81901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1580	NC_014723	TGC	2	6	81916	81921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1581	NC_014723	GTC	2	6	81926	81931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1582	NC_014723	GCA	2	6	81948	81953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1583	NC_014723	GTC	2	6	81975	81980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1584	NC_014723	GC	3	6	82014	82019	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1585	NC_014723	T	6	6	82045	82050	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1586	NC_014723	GGC	2	6	82090	82095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1587	NC_014723	CG	3	6	82204	82209	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1588	NC_014723	GAGC	2	8	82274	82281	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1589	NC_014723	CCG	2	6	82437	82442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330399545
1590	NC_014723	CAA	2	6	82474	82479	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330399545
1591	NC_014723	CAG	2	6	82519	82524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330399545
1592	NC_014723	GTAA	2	8	82526	82533	50 %	25 %	25 %	0 %	330399545
1593	NC_014723	GC	3	6	82572	82577	0 %	0 %	50 %	50 %	330399545
1594	NC_014723	TAA	2	6	82600	82605	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330399545
1595	NC_014723	GCT	2	6	82759	82764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330399545
1596	NC_014723	AAGCC	2	10	82770	82779	40 %	0 %	20 %	40 %	330399545
1597	NC_014723	GCT	2	6	82914	82919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330399546
1598	NC_014723	AAT	2	6	82960	82965	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330399546
1599	NC_014723	CGA	2	6	82973	82978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330399547
1600	NC_014723	ATC	2	6	83093	83098	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330399547
1601	NC_014723	A	6	6	83140	83145	100 %	0 %	0 %	0 %	330399547
1602	NC_014723	GGGT	2	8	83227	83234	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
1603	NC_014723	CGAA	2	8	83274	83281	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1604	NC_014723	CAT	2	6	83323	83328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1605	NC_014723	CGAC	2	8	83329	83336	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1606	NC_014723	GCA	2	6	83395	83400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1607	NC_014723	G	6	6	83461	83466	0 %	0 %	100 %	0 %	330399548
1608	NC_014723	CAG	2	6	83477	83482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330399548
1609	NC_014723	ATC	2	6	83563	83568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1610	NC_014723	A	6	6	83577	83582	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1611	NC_014723	CCTG	2	8	83626	83633	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1612	NC_014723	CCA	2	6	83695	83700	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330399549
1613	NC_014723	GCC	2	6	83749	83754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330399549
1614	NC_014723	CGAT	2	8	83822	83829	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1615	NC_014723	ATC	2	6	83864	83869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330399550
1616	NC_014723	CGAA	2	8	83922	83929	50 %	0 %	25 %	25 %	330399550
1617	NC_014723	CGG	2	6	83950	83955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330399550
1618	NC_014723	ACG	2	6	83976	83981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330399550
1619	NC_014723	GAAG	2	8	84049	84056	50 %	0 %	50 %	0 %	330399551
1620	NC_014723	CGC	2	6	84142	84147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330399551
1621	NC_014723	GCG	2	6	84158	84163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330399551
1622	NC_014723	CGA	3	9	84196	84204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330399551
1623	NC_014723	CTGC	2	8	84224	84231	0 %	25 %	25 %	50 %	330399551
1624	NC_014723	GAA	2	6	84326	84331	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330399551
1625	NC_014723	GGC	2	6	84500	84505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330399551
1626	NC_014723	CGG	2	6	84631	84636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330399551
1627	NC_014723	CTG	2	6	84647	84652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330399551
1628	NC_014723	GAA	2	6	84922	84927	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330399551
1629	NC_014723	CCG	2	6	84940	84945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330399551
1630	NC_014723	CAC	2	6	85061	85066	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330399551
1631	NC_014723	ACG	2	6	85196	85201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330399551
1632	NC_014723	CGG	2	6	85218	85223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330399551
1633	NC_014723	ATGGA	2	10	85238	85247	40 %	20 %	40 %	0 %	330399551
1634	NC_014723	CG	3	6	85348	85353	0 %	0 %	50 %	50 %	330399551
1635	NC_014723	CTG	2	6	85363	85368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330399551
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1639	NC_014723	CG	3	6	85639	85644	0 %	0 %	50 %	50 %	330399553
1640	NC_014723	GGC	2	6	85656	85661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330399553
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1652	NC_014723	ACC	2	6	86370	86375	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1653	NC_014723	ATCACC	2	12	86408	86419	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
1654	NC_014723	ATC	2	6	86436	86441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1666	NC_014723	CGAT	2	8	87179	87186	25 %	25 %	25 %	25 %	330399554
1667	NC_014723	AG	3	6	87366	87371	50 %	0 %	50 %	0 %	330399554
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1672	NC_014723	ATT	2	6	87570	87575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1722	NC_014723	CCA	2	6	89930	89935	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1725	NC_014723	TTA	2	6	90019	90024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1726	NC_014723	AC	3	6	90068	90073	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1728	NC_014723	A	6	6	90130	90135	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1737	NC_014723	GTT	2	6	90693	90698	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1738	NC_014723	CAT	2	6	90787	90792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1740	NC_014723	GCA	2	6	90859	90864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330399557
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1744	NC_014723	T	6	6	91087	91092	0 %	100 %	0 %	0 %	330399557
1745	NC_014723	CG	3	6	91120	91125	0 %	0 %	50 %	50 %	330399557
1746	NC_014723	ACC	2	6	91156	91161	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330399557
1747	NC_014723	TCGG	2	8	91240	91247	0 %	25 %	50 %	25 %	330399558
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1751	NC_014723	GAGC	2	8	91400	91407	25 %	0 %	50 %	25 %	330399558
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1755	NC_014723	CGC	2	6	91576	91581	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330399558
1756	NC_014723	GCGCT	2	10	91599	91608	0 %	20 %	40 %	40 %	330399558
1757	NC_014723	GT	3	6	91634	91639	0 %	50 %	50 %	0 %	330399558
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1888	NC_014723	GGC	2	6	97352	97357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1996	NC_014723	A	6	6	102651	102656	100 %	0 %	0 %	0 %	330399565
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