MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Burkholderia rhizoxinica HKI 454 plasmid pBRH02

Total Repeats: 3365

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_014723	AACA	2	8	53440	53447	75 %	0 %	0 %	25 %	330399511
1002	NC_014723	GCAA	2	8	53546	53553	50 %	0 %	25 %	25 %	330399511
1003	NC_014723	GCA	2	6	53662	53667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330399511
1004	NC_014723	GCC	2	6	53677	53682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330399511
1005	NC_014723	CGGC	2	8	53744	53751	0 %	0 %	50 %	50 %	330399511
1006	NC_014723	GCGG	2	8	53819	53826	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1007	NC_014723	CAA	3	9	53876	53884	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1008	NC_014723	CGG	2	6	53941	53946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1009	NC_014723	CGG	2	6	53960	53965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1010	NC_014723	CAT	2	6	54028	54033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1011	NC_014723	AT	3	6	54066	54071	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_014723	ATTG	2	8	54082	54089	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_014723	CGC	2	6	54106	54111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1014	NC_014723	CATT	2	8	54129	54136	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1015	NC_014723	T	6	6	54135	54140	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_014723	GAA	2	6	54269	54274	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_014723	CTG	2	6	54337	54342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1018	NC_014723	GTC	2	6	54343	54348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1019	NC_014723	AT	3	6	54394	54399	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_014723	TGC	2	6	54484	54489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330399512
1021	NC_014723	TCT	2	6	54490	54495	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330399512
1022	NC_014723	CGGTA	2	10	54522	54531	20 %	20 %	40 %	20 %	330399512
1023	NC_014723	GCG	2	6	54620	54625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330399512
1024	NC_014723	ACT	2	6	54650	54655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330399512
1025	NC_014723	AGCA	2	8	54660	54667	50 %	0 %	25 %	25 %	330399512
1026	NC_014723	AGC	2	6	54676	54681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330399512
1027	NC_014723	CTG	2	6	54720	54725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330399512
1028	NC_014723	CAT	2	6	54773	54778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330399512
1029	NC_014723	GCC	2	6	54822	54827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330399512
1030	NC_014723	TC	3	6	54834	54839	0 %	50 %	0 %	50 %	330399512
1031	NC_014723	TAC	2	6	54846	54851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330399512
1032	NC_014723	ATC	2	6	54945	54950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330399512
1033	NC_014723	CTG	2	6	54960	54965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330399512
1034	NC_014723	GTACA	2	10	55009	55018	40 %	20 %	20 %	20 %	330399512
1035	NC_014723	CGA	2	6	55053	55058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330399512
1036	NC_014723	G	6	6	55143	55148	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_014723	TTTTCA	2	12	55210	55221	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1038	NC_014723	GTC	2	6	55227	55232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330399513
1039	NC_014723	AGC	2	6	55308	55313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330399513
1040	NC_014723	GC	3	6	55312	55317	0 %	0 %	50 %	50 %	330399513
1041	NC_014723	TGG	2	6	55327	55332	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330399513
1042	NC_014723	GCG	2	6	55365	55370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330399513
1043	NC_014723	CAG	2	6	55412	55417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330399513
1044	NC_014723	CTG	2	6	55441	55446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330399513
1045	NC_014723	CCAAG	2	10	55448	55457	40 %	0 %	20 %	40 %	330399513
1046	NC_014723	AC	3	6	55558	55563	50 %	0 %	0 %	50 %	330399513
1047	NC_014723	GAT	2	6	55583	55588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330399513
1048	NC_014723	ATC	2	6	55595	55600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330399513
1049	NC_014723	A	6	6	55609	55614	100 %	0 %	0 %	0 %	330399513
1050	NC_014723	TGA	2	6	55615	55620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330399513
1051	NC_014723	CTC	2	6	55649	55654	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330399513
1052	NC_014723	TTC	2	6	55672	55677	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330399513
1053	NC_014723	CCA	2	6	55819	55824	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330399513
1054	NC_014723	TGA	2	6	55830	55835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330399513
1055	NC_014723	GTC	2	6	55865	55870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330399513
1056	NC_014723	TGC	2	6	55917	55922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1057	NC_014723	GGC	2	6	56012	56017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1058	NC_014723	AC	3	6	56030	56035	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1059	NC_014723	CAACG	2	10	56044	56053	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
1060	NC_014723	GAA	2	6	56069	56074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_014723	GTA	2	6	56075	56080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_014723	TCTT	2	8	56140	56147	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1063	NC_014723	TTC	2	6	56149	56154	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1064	NC_014723	CAA	2	6	56165	56170	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1065	NC_014723	CGT	2	6	56240	56245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1066	NC_014723	GCA	2	6	56256	56261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1067	NC_014723	GCGGG	2	10	56411	56420	0 %	0 %	80 %	20 %	330399514
1068	NC_014723	GGTAT	2	10	56421	56430	20 %	40 %	40 %	0 %	330399514
1069	NC_014723	TTG	2	6	56438	56443	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330399514
1070	NC_014723	CG	3	6	56469	56474	0 %	0 %	50 %	50 %	330399514
1071	NC_014723	CGGT	2	8	56487	56494	0 %	25 %	50 %	25 %	330399514
1072	NC_014723	TACG	2	8	56729	56736	25 %	25 %	25 %	25 %	330399514
1073	NC_014723	GGC	2	6	56766	56771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330399514
1074	NC_014723	GCTA	2	8	56807	56814	25 %	25 %	25 %	25 %	330399514
1075	NC_014723	TC	3	6	56861	56866	0 %	50 %	0 %	50 %	330399515
1076	NC_014723	GCC	2	6	56879	56884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330399515
1077	NC_014723	TCAGC	2	10	56920	56929	20 %	20 %	20 %	40 %	330399515
1078	NC_014723	CG	3	6	56970	56975	0 %	0 %	50 %	50 %	330399515
1079	NC_014723	CCGCCA	2	12	57041	57052	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	330399515
1080	NC_014723	CG	3	6	57099	57104	0 %	0 %	50 %	50 %	330399515
1081	NC_014723	GCAA	2	8	57297	57304	50 %	0 %	25 %	25 %	330399516
1082	NC_014723	GC	4	8	57308	57315	0 %	0 %	50 %	50 %	330399516
1083	NC_014723	TGA	2	6	57374	57379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330399516
1084	NC_014723	GCA	2	6	57424	57429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330399516
1085	NC_014723	AGGA	2	8	57520	57527	50 %	0 %	50 %	0 %	330399516
1086	NC_014723	GTTGT	2	10	57550	57559	0 %	60 %	40 %	0 %	330399516
1087	NC_014723	ATC	2	6	57610	57615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330399516
1088	NC_014723	AGAA	2	8	57639	57646	75 %	0 %	25 %	0 %	330399517
1089	NC_014723	GGCA	2	8	57744	57751	25 %	0 %	50 %	25 %	330399517
1090	NC_014723	CCAC	2	8	57845	57852	25 %	0 %	0 %	75 %	330399517
1091	NC_014723	CAA	2	6	57958	57963	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330399518
1092	NC_014723	CGAG	2	8	57964	57971	25 %	0 %	50 %	25 %	330399518
1093	NC_014723	GCTT	2	8	58017	58024	0 %	50 %	25 %	25 %	330399518
1094	NC_014723	GCC	2	6	58025	58030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330399518
1095	NC_014723	TCG	2	6	58059	58064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330399518
1096	NC_014723	ACC	2	6	58076	58081	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330399518
1097	NC_014723	CAA	2	6	58135	58140	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330399518
1098	NC_014723	CTG	2	6	58148	58153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330399518
1099	NC_014723	CAC	2	6	58312	58317	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330399518
1100	NC_014723	AGG	2	6	58338	58343	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330399518
1101	NC_014723	TTG	2	6	58434	58439	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330399518
1102	NC_014723	TAACG	2	10	58444	58453	40 %	20 %	20 %	20 %	330399518
1103	NC_014723	TGTA	2	8	58467	58474	25 %	50 %	25 %	0 %	330399518
1104	NC_014723	GAA	2	6	58484	58489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330399518
1105	NC_014723	CCGA	2	8	58558	58565	25 %	0 %	25 %	50 %	330399519
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1108	NC_014723	CGA	2	6	58754	58759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330399519
1109	NC_014723	GCC	2	6	58826	58831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330399519
1110	NC_014723	CG	3	6	58875	58880	0 %	0 %	50 %	50 %	330399519
1111	NC_014723	TGA	2	6	58925	58930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330399519
1112	NC_014723	GCA	2	6	58934	58939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330399519
1113	NC_014723	TCA	2	6	58954	58959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330399519
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1115	NC_014723	GGAA	2	8	58984	58991	50 %	0 %	50 %	0 %	330399519
1116	NC_014723	GGA	2	6	59006	59011	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330399519
1117	NC_014723	TGG	2	6	59032	59037	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330399519
1118	NC_014723	GGCGT	2	10	59104	59113	0 %	20 %	60 %	20 %	330399519
1119	NC_014723	GC	3	6	59114	59119	0 %	0 %	50 %	50 %	330399519
1120	NC_014723	TGAT	2	8	59195	59202	25 %	50 %	25 %	0 %	330399519
1121	NC_014723	AAG	2	6	59218	59223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330399519
1122	NC_014723	TGC	2	6	59231	59236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330399520
1123	NC_014723	TGGC	2	8	59252	59259	0 %	25 %	50 %	25 %	330399520
1124	NC_014723	ATC	2	6	59260	59265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330399520
1125	NC_014723	CAC	2	6	59311	59316	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330399520
1126	NC_014723	GAC	2	6	59362	59367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330399520
1127	NC_014723	CAG	2	6	59386	59391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330399520
1128	NC_014723	GAA	2	6	59455	59460	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330399520
1129	NC_014723	CAA	2	6	59463	59468	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330399520
1130	NC_014723	AGGC	2	8	59498	59505	25 %	0 %	50 %	25 %	330399520
1131	NC_014723	GGC	2	6	59508	59513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330399520
1132	NC_014723	GCC	2	6	59667	59672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330399520
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1134	NC_014723	GGC	2	6	59710	59715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330399520
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1136	NC_014723	GC	3	6	59736	59741	0 %	0 %	50 %	50 %	330399520
1137	NC_014723	GGC	2	6	59770	59775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330399520
1138	NC_014723	CTG	2	6	59858	59863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330399520
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1143	NC_014723	GCGT	2	8	60146	60153	0 %	25 %	50 %	25 %	330399520
1144	NC_014723	GCC	2	6	60155	60160	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330399520
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1229	NC_014723	T	6	6	64170	64175	0 %	100 %	0 %	0 %	330399523
1230	NC_014723	ACA	2	6	64233	64238	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330399523
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1239	NC_014723	A	6	6	64575	64580	100 %	0 %	0 %	0 %	330399523
1240	NC_014723	AAC	2	6	64592	64597	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330399523
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1246	NC_014723	TGAC	2	8	64830	64837	25 %	25 %	25 %	25 %	330399525
1247	NC_014723	CAA	2	6	64936	64941	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330399525
1248	NC_014723	GCT	2	6	64948	64953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330399525
1249	NC_014723	GCTG	2	8	65061	65068	0 %	25 %	50 %	25 %	330399526
1250	NC_014723	GGC	2	6	65146	65151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330399526
1251	NC_014723	CGG	2	6	65190	65195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330399526
1252	NC_014723	TAC	2	6	65214	65219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330399526
1253	NC_014723	TCA	2	6	65222	65227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330399526
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1255	NC_014723	T	6	6	65278	65283	0 %	100 %	0 %	0 %	330399526
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1364	NC_014723	AGC	2	6	71411	71416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330399534
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1370	NC_014723	ATG	2	6	71663	71668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330399534
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1377	NC_014723	GAAA	2	8	71942	71949	75 %	0 %	25 %	0 %	330399534
1378	NC_014723	A	6	6	71974	71979	100 %	0 %	0 %	0 %	330399534
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1500	NC_014723	CTTA	2	8	77730	77737	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding

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