MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Burkholderia rhizoxinica HKI 454 plasmid pBRH02

Total Repeats: 3365

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_014723	CGCGC	2	10	26160	26169	0 %	0 %	40 %	60 %	330399477
502	NC_014723	TGC	2	6	26218	26223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330399477
503	NC_014723	GCT	2	6	26238	26243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330399477
504	NC_014723	TCT	2	6	26342	26347	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330399477
505	NC_014723	TCT	2	6	26360	26365	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330399477
506	NC_014723	AGCG	2	8	26389	26396	25 %	0 %	50 %	25 %	330399477
507	NC_014723	A	6	6	26400	26405	100 %	0 %	0 %	0 %	330399477
508	NC_014723	TAG	2	6	26473	26478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330399477
509	NC_014723	AGCC	2	8	26534	26541	25 %	0 %	25 %	50 %	330399477
510	NC_014723	AGC	3	9	26545	26553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330399477
511	NC_014723	GTC	2	6	26557	26562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330399477
512	NC_014723	GCC	2	6	26576	26581	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330399477
513	NC_014723	ATGG	2	8	26597	26604	25 %	25 %	50 %	0 %	330399477
514	NC_014723	ACG	2	6	26617	26622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330399477
515	NC_014723	CAG	2	6	26640	26645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330399477
516	NC_014723	GCG	2	6	26708	26713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330399477
517	NC_014723	ACG	2	6	26740	26745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330399477
518	NC_014723	TGCC	2	8	26752	26759	0 %	25 %	25 %	50 %	330399477
519	NC_014723	TCG	2	6	26764	26769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330399477
520	NC_014723	GCG	2	6	26773	26778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330399477
521	NC_014723	CTTGT	2	10	26791	26800	0 %	60 %	20 %	20 %	330399477
522	NC_014723	TC	3	6	26947	26952	0 %	50 %	0 %	50 %	330399477
523	NC_014723	CTG	2	6	27013	27018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330399477
524	NC_014723	TCG	2	6	27063	27068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330399477
525	NC_014723	ACA	2	6	27074	27079	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330399477
526	NC_014723	TCG	2	6	27127	27132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330399477
527	NC_014723	ATGA	2	8	27235	27242	50 %	25 %	25 %	0 %	330399477
528	NC_014723	ACG	2	6	27251	27256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330399477
529	NC_014723	AGC	2	6	27352	27357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
530	NC_014723	CGTC	2	8	27372	27379	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
531	NC_014723	TCGAT	2	10	27412	27421	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
532	NC_014723	GTG	2	6	27502	27507	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
533	NC_014723	TGT	2	6	27508	27513	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
534	NC_014723	GC	3	6	27514	27519	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
535	NC_014723	TGA	2	6	27523	27528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
536	NC_014723	TCGCA	2	10	27537	27546	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
537	NC_014723	T	7	7	27613	27619	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_014723	GCGA	2	8	27767	27774	25 %	0 %	50 %	25 %	330399478
539	NC_014723	TCC	2	6	27803	27808	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330399478
540	NC_014723	CT	3	6	27835	27840	0 %	50 %	0 %	50 %	330399478
541	NC_014723	TAC	2	6	27872	27877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330399478
542	NC_014723	AGT	2	6	28007	28012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330399478
543	NC_014723	ATTG	2	8	28107	28114	25 %	50 %	25 %	0 %	330399478
544	NC_014723	TACCGA	2	12	28169	28180	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	330399478
545	NC_014723	GCT	2	6	28184	28189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330399478
546	NC_014723	CTGC	2	8	28267	28274	0 %	25 %	25 %	50 %	330399478
547	NC_014723	ACG	2	6	28384	28389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330399478
548	NC_014723	GCA	2	6	28446	28451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330399478
549	NC_014723	GCC	2	6	28537	28542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330399478
550	NC_014723	AGC	2	6	28694	28699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330399478
551	NC_014723	A	6	6	28887	28892	100 %	0 %	0 %	0 %	330399478
552	NC_014723	CGG	2	6	28893	28898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330399479
553	NC_014723	CAA	2	6	28913	28918	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330399479
554	NC_014723	GCA	2	6	29021	29026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330399479
555	NC_014723	GAA	2	6	29180	29185	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330399479
556	NC_014723	GAAC	2	8	29206	29213	50 %	0 %	25 %	25 %	330399479
557	NC_014723	GCAA	2	8	29606	29613	50 %	0 %	25 %	25 %	330399479
558	NC_014723	AGT	2	6	29629	29634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330399479
559	NC_014723	TGA	2	6	29659	29664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330399479
560	NC_014723	A	8	8	29753	29760	100 %	0 %	0 %	0 %	330399479
561	NC_014723	GGAAA	2	10	29810	29819	60 %	0 %	40 %	0 %	330399479
562	NC_014723	CG	3	6	29867	29872	0 %	0 %	50 %	50 %	330399479
563	NC_014723	AGCA	2	8	29943	29950	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
564	NC_014723	CAAA	2	8	30036	30043	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
565	NC_014723	CTGG	2	8	30050	30057	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
566	NC_014723	CAAA	2	8	30188	30195	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
567	NC_014723	CGG	2	6	30202	30207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
568	NC_014723	CGAC	2	8	30261	30268	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
569	NC_014723	TTG	2	6	30379	30384	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330399480
570	NC_014723	ACC	2	6	30474	30479	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330399480
571	NC_014723	CG	8	16	30539	30554	0 %	0 %	50 %	50 %	330399480
572	NC_014723	GCAC	2	8	30570	30577	25 %	0 %	25 %	50 %	330399480
573	NC_014723	CGC	2	6	30599	30604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330399480
574	NC_014723	CG	3	6	30611	30616	0 %	0 %	50 %	50 %	330399480
575	NC_014723	GCT	2	6	30623	30628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330399480
576	NC_014723	CG	3	6	30636	30641	0 %	0 %	50 %	50 %	330399480
577	NC_014723	GAT	2	6	30675	30680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330399480
578	NC_014723	CGGC	2	8	30688	30695	0 %	0 %	50 %	50 %	330399480
579	NC_014723	GGC	2	6	30726	30731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330399480
580	NC_014723	GCC	2	6	30774	30779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330399480
581	NC_014723	ATC	2	6	30878	30883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330399480
582	NC_014723	TA	4	8	30917	30924	50 %	50 %	0 %	0 %	330399480
583	NC_014723	TAA	2	6	31007	31012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330399480
584	NC_014723	TGT	2	6	31070	31075	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330399480
585	NC_014723	A	6	6	31098	31103	100 %	0 %	0 %	0 %	330399480
586	NC_014723	GCT	2	6	31133	31138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330399480
587	NC_014723	CGC	2	6	31176	31181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330399480
588	NC_014723	ACG	2	6	31207	31212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330399480
589	NC_014723	ACG	2	6	31243	31248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330399480
590	NC_014723	TCG	2	6	31264	31269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330399480
591	NC_014723	CAGCG	2	10	31410	31419	20 %	0 %	40 %	40 %	330399480
592	NC_014723	TCA	2	6	31439	31444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330399480
593	NC_014723	AGGA	2	8	31486	31493	50 %	0 %	50 %	0 %	330399480
594	NC_014723	GCA	2	6	31523	31528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330399480
595	NC_014723	CAGA	2	8	31588	31595	50 %	0 %	25 %	25 %	330399480
596	NC_014723	CGC	2	6	31609	31614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
597	NC_014723	CGAG	2	8	31619	31626	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
598	NC_014723	CAAG	2	8	31815	31822	50 %	0 %	25 %	25 %	330399481
599	NC_014723	GCA	2	6	31875	31880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330399481
600	NC_014723	TCGA	2	8	31912	31919	25 %	25 %	25 %	25 %	330399481
601	NC_014723	TGT	2	6	31935	31940	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330399481
602	NC_014723	CTT	2	6	31950	31955	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330399481
603	NC_014723	ATAA	2	8	32000	32007	75 %	25 %	0 %	0 %	330399481
604	NC_014723	ATA	2	6	32015	32020	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330399481
605	NC_014723	GGGC	2	8	32040	32047	0 %	0 %	75 %	25 %	330399481
606	NC_014723	CGG	2	6	32080	32085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330399481
607	NC_014723	GAT	2	6	32108	32113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330399481
608	NC_014723	GCA	2	6	32115	32120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330399481
609	NC_014723	AGC	2	6	32157	32162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330399481
610	NC_014723	TAC	2	6	32173	32178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330399481
611	NC_014723	ACG	2	6	32299	32304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330399482
612	NC_014723	CTG	2	6	32340	32345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330399482
613	NC_014723	GGTA	2	8	32374	32381	25 %	25 %	50 %	0 %	330399482
614	NC_014723	TCG	3	9	32410	32418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330399482
615	NC_014723	AAG	2	6	32488	32493	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330399482
616	NC_014723	CGG	2	6	32625	32630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330399483
617	NC_014723	GCC	2	6	32718	32723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
618	NC_014723	CCG	2	6	32760	32765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
619	NC_014723	AAC	2	6	32819	32824	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
620	NC_014723	CCA	2	6	32945	32950	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
621	NC_014723	GCA	2	6	32951	32956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
622	NC_014723	ATT	2	6	33073	33078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_014723	ATC	2	6	33166	33171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330399484
624	NC_014723	ATC	2	6	33216	33221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330399484
625	NC_014723	GGA	2	6	33242	33247	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330399484
626	NC_014723	TGC	2	6	33257	33262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330399484
627	NC_014723	GCT	2	6	33309	33314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330399484
628	NC_014723	GATT	2	8	33342	33349	25 %	50 %	25 %	0 %	330399484
629	NC_014723	ACG	2	6	33399	33404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330399485
630	NC_014723	CG	3	6	33423	33428	0 %	0 %	50 %	50 %	330399485
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889	NC_014723	GA	3	6	47127	47132	50 %	0 %	50 %	0 %	330399505
890	NC_014723	GAC	2	6	47149	47154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330399505
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892	NC_014723	GC	3	6	47273	47278	0 %	0 %	50 %	50 %	330399506
893	NC_014723	GC	4	8	47294	47301	0 %	0 %	50 %	50 %	330399506
894	NC_014723	CGTG	2	8	47380	47387	0 %	25 %	50 %	25 %	330399506
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