MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Burkholderia rhizoxinica HKI 454 chromosome

Total Repeats: 2490

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014722	CGTAT	2	10	675	684	20 %	40 %	20 %	20 %	312794750
2	NC_014722	AGCGC	2	10	3491	3500	20 %	0 %	40 %	40 %	312794752
3	NC_014722	GACGC	2	10	5125	5134	20 %	0 %	40 %	40 %	312794752
4	NC_014722	GTGGG	2	10	9770	9779	0 %	20 %	80 %	0 %	312794756
5	NC_014722	AGCAC	2	10	10202	10211	40 %	0 %	20 %	40 %	312794756
6	NC_014722	TGAGC	2	10	12223	12232	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
7	NC_014722	CAAAC	2	10	13680	13689	60 %	0 %	0 %	40 %	312794759
8	NC_014722	GGCTA	2	10	16149	16158	20 %	20 %	40 %	20 %	312794762
9	NC_014722	GCCCT	2	10	17527	17536	0 %	20 %	20 %	60 %	312794762
10	NC_014722	TCGCT	2	10	17676	17685	0 %	40 %	20 %	40 %	312794762
11	NC_014722	CGAGA	2	10	18661	18670	40 %	0 %	40 %	20 %	312794763
12	NC_014722	GCTTT	2	10	20673	20682	0 %	60 %	20 %	20 %	312794764
13	NC_014722	CTTAT	2	10	20764	20773	20 %	60 %	0 %	20 %	312794764
14	NC_014722	GGAAC	2	10	24456	24465	40 %	0 %	40 %	20 %	312794767
15	NC_014722	AATCG	2	10	26631	26640	40 %	20 %	20 %	20 %	312794768
16	NC_014722	ATAAA	2	10	26720	26729	80 %	20 %	0 %	0 %	312794768
17	NC_014722	TGCCA	2	10	31985	31994	20 %	20 %	20 %	40 %	312794769
18	NC_014722	GCTCG	2	10	32898	32907	0 %	20 %	40 %	40 %	312794771
19	NC_014722	TCCTG	2	10	33073	33082	0 %	40 %	20 %	40 %	312794771
20	NC_014722	GCATC	2	10	33503	33512	20 %	20 %	20 %	40 %	312794771
21	NC_014722	CCATC	2	10	34055	34064	20 %	20 %	0 %	60 %	312794771
22	NC_014722	CGCAC	2	10	34767	34776	20 %	0 %	20 %	60 %	312794772
23	NC_014722	ATTTT	2	10	36285	36294	20 %	80 %	0 %	0 %	312794775
24	NC_014722	ACCGC	2	10	36528	36537	20 %	0 %	20 %	60 %	312794775
25	NC_014722	ACGTC	2	10	39606	39615	20 %	20 %	20 %	40 %	312794777
26	NC_014722	CAAAG	2	10	43061	43070	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
27	NC_014722	CAGCG	2	10	44476	44485	20 %	0 %	40 %	40 %	312794787
28	NC_014722	GCCGC	2	10	44505	44514	0 %	0 %	40 %	60 %	312794787
29	NC_014722	GTAGC	2	10	45928	45937	20 %	20 %	40 %	20 %	312794788
30	NC_014722	TGCGA	2	10	46205	46214	20 %	20 %	40 %	20 %	312794788
31	NC_014722	GCCAT	2	10	46221	46230	20 %	20 %	20 %	40 %	312794788
32	NC_014722	GCGCA	2	10	47922	47931	20 %	0 %	40 %	40 %	312794789
33	NC_014722	ATACG	2	10	48272	48281	40 %	20 %	20 %	20 %	312794789
34	NC_014722	GCACC	2	10	49445	49454	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
35	NC_014722	TGGCA	2	10	51143	51152	20 %	20 %	40 %	20 %	312794793
36	NC_014722	CTGAT	2	10	53886	53895	20 %	40 %	20 %	20 %	312794797
37	NC_014722	GAAAT	2	10	56849	56858	60 %	20 %	20 %	0 %	312794803
38	NC_014722	TCGAC	2	10	58320	58329	20 %	20 %	20 %	40 %	312794806
39	NC_014722	GCCCA	2	10	60896	60905	20 %	0 %	20 %	60 %	312794807
40	NC_014722	TTTCG	2	10	62239	62248	0 %	60 %	20 %	20 %	312794807
41	NC_014722	GGCCA	2	10	64116	64125	20 %	0 %	40 %	40 %	312794808
42	NC_014722	CACTT	2	10	67564	67573	20 %	40 %	0 %	40 %	312794812
43	NC_014722	TCGCC	2	10	68029	68038	0 %	20 %	20 %	60 %	312794813
44	NC_014722	CGGGT	2	10	69433	69442	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
45	NC_014722	CGGCG	2	10	69599	69608	0 %	0 %	60 %	40 %	312794816
46	NC_014722	CAATC	2	10	70331	70340	40 %	20 %	0 %	40 %	312794818
47	NC_014722	TCGCC	2	10	71053	71062	0 %	20 %	20 %	60 %	312794818
48	NC_014722	ACGGG	2	10	71831	71840	20 %	0 %	60 %	20 %	312794819
49	NC_014722	GGCCC	2	10	72374	72383	0 %	0 %	40 %	60 %	312794819
50	NC_014722	CGGCG	2	10	73732	73741	0 %	0 %	60 %	40 %	312794820
51	NC_014722	CGAAG	2	10	78969	78978	40 %	0 %	40 %	20 %	312794825
52	NC_014722	CATTC	2	10	79145	79154	20 %	40 %	0 %	40 %	312794825
53	NC_014722	CCGGC	2	10	83481	83490	0 %	0 %	40 %	60 %	312794828
54	NC_014722	CGCGG	2	10	84849	84858	0 %	0 %	60 %	40 %	312794830
55	NC_014722	CGCAT	2	10	84876	84885	20 %	20 %	20 %	40 %	312794830
56	NC_014722	ACGCG	2	10	85457	85466	20 %	0 %	40 %	40 %	312794831
57	NC_014722	CGATG	2	10	87040	87049	20 %	20 %	40 %	20 %	312794832
58	NC_014722	GCGCT	2	10	87218	87227	0 %	20 %	40 %	40 %	312794832
59	NC_014722	GCGCA	2	10	88911	88920	20 %	0 %	40 %	40 %	312794833
60	NC_014722	GTTGC	2	10	90054	90063	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
61	NC_014722	CGGCG	2	10	91072	91081	0 %	0 %	60 %	40 %	312794835
62	NC_014722	CGCGT	2	10	91624	91633	0 %	20 %	40 %	40 %	312794835
63	NC_014722	GACCT	2	10	92853	92862	20 %	20 %	20 %	40 %	312794837
64	NC_014722	AGGTT	2	10	94050	94059	20 %	40 %	40 %	0 %	312794840
65	NC_014722	AGTCT	2	10	95606	95615	20 %	40 %	20 %	20 %	312794841
66	NC_014722	CGCGG	2	10	95628	95637	0 %	0 %	60 %	40 %	312794841
67	NC_014722	GCGCC	2	10	95648	95657	0 %	0 %	40 %	60 %	312794841
68	NC_014722	CAATG	2	10	96552	96561	40 %	20 %	20 %	20 %	312794843
69	NC_014722	GCCAC	2	10	96611	96620	20 %	0 %	20 %	60 %	312794843
70	NC_014722	GGGCC	2	10	97894	97903	0 %	0 %	60 %	40 %	312794844
71	NC_014722	GCGCC	2	10	98738	98747	0 %	0 %	40 %	60 %	312794845
72	NC_014722	CGCAC	2	10	99079	99088	20 %	0 %	20 %	60 %	312794845
73	NC_014722	GCGCA	2	10	99884	99893	20 %	0 %	40 %	40 %	312794846
74	NC_014722	GCAAC	2	10	100395	100404	40 %	0 %	20 %	40 %	312794847
75	NC_014722	GCGAC	2	10	100819	100828	20 %	0 %	40 %	40 %	312794848
76	NC_014722	TGCGG	2	10	101932	101941	0 %	20 %	60 %	20 %	312794850
77	NC_014722	ACGTC	2	10	102556	102565	20 %	20 %	20 %	40 %	312794851
78	NC_014722	TCGCC	2	10	102571	102580	0 %	20 %	20 %	60 %	312794851
79	NC_014722	AGCGC	2	10	103111	103120	20 %	0 %	40 %	40 %	312794851
80	NC_014722	GTTGC	2	10	103121	103130	0 %	40 %	40 %	20 %	312794851
81	NC_014722	GCTGA	2	10	108625	108634	20 %	20 %	40 %	20 %	312794855
82	NC_014722	ATCGA	2	10	108960	108969	40 %	20 %	20 %	20 %	312794856
83	NC_014722	TTGCG	2	10	110727	110736	0 %	40 %	40 %	20 %	312794858
84	NC_014722	TGGCG	2	10	111972	111981	0 %	20 %	60 %	20 %	312794858
85	NC_014722	GCCGC	2	10	112175	112184	0 %	0 %	40 %	60 %	312794858
86	NC_014722	CTTCG	2	10	112185	112194	0 %	40 %	20 %	40 %	312794858
87	NC_014722	TACAG	2	10	113221	113230	40 %	20 %	20 %	20 %	312794860
88	NC_014722	TGATT	2	10	113346	113355	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014722	TGACC	2	10	115314	115323	20 %	20 %	20 %	40 %	312794862
90	NC_014722	GGCGA	2	10	118002	118011	20 %	0 %	60 %	20 %	312794866
91	NC_014722	CGTGC	2	10	120010	120019	0 %	20 %	40 %	40 %	312794868
92	NC_014722	GTCCG	2	10	120136	120145	0 %	20 %	40 %	40 %	312794868
93	NC_014722	TCGCG	2	10	121554	121563	0 %	20 %	40 %	40 %	312794871
94	NC_014722	CGAGC	2	10	121594	121603	20 %	0 %	40 %	40 %	312794871
95	NC_014722	GCGTG	2	10	121901	121910	0 %	20 %	60 %	20 %	312794872
96	NC_014722	CGCAG	2	10	122274	122283	20 %	0 %	40 %	40 %	312794873
97	NC_014722	GGCGA	2	10	123169	123178	20 %	0 %	60 %	20 %	312794874
98	NC_014722	CGCTG	2	10	123322	123331	0 %	20 %	40 %	40 %	312794875
99	NC_014722	AATGC	2	10	123894	123903	40 %	20 %	20 %	20 %	312794876
100	NC_014722	TGGGC	2	10	124142	124151	0 %	20 %	60 %	20 %	312794877
101	NC_014722	TAGCC	2	10	124483	124492	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
102	NC_014722	ACATG	2	10	124552	124561	40 %	20 %	20 %	20 %	312794879
103	NC_014722	AAATG	2	10	125146	125155	60 %	20 %	20 %	0 %	312794881
104	NC_014722	CGGCG	2	10	125347	125356	0 %	0 %	60 %	40 %	312794882
105	NC_014722	GTTGC	2	10	126996	127005	0 %	40 %	40 %	20 %	312794883
106	NC_014722	CAAGT	2	10	127146	127155	40 %	20 %	20 %	20 %	312794883
107	NC_014722	TTCGA	2	10	127992	128001	20 %	40 %	20 %	20 %	312794884
108	NC_014722	CAGGC	2	10	128065	128074	20 %	0 %	40 %	40 %	312794884
109	NC_014722	GCAGC	2	10	129370	129379	20 %	0 %	40 %	40 %	312794886
110	NC_014722	CGCGA	2	10	130003	130012	20 %	0 %	40 %	40 %	312794886
111	NC_014722	TGCAA	2	10	130051	130060	40 %	20 %	20 %	20 %	312794887
112	NC_014722	GCAGC	2	10	130580	130589	20 %	0 %	40 %	40 %	312794887
113	NC_014722	GCCGG	2	10	131319	131328	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
114	NC_014722	GGGCG	2	10	131764	131773	0 %	0 %	80 %	20 %	312794888
115	NC_014722	GCGGT	2	10	131996	132005	0 %	20 %	60 %	20 %	312794888
116	NC_014722	ACGCG	2	10	134398	134407	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
117	NC_014722	GGCGC	2	10	135570	135579	0 %	0 %	60 %	40 %	312794893
118	NC_014722	CGCGC	2	10	136969	136978	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
119	NC_014722	ATGAA	2	10	137596	137605	60 %	20 %	20 %	0 %	312794895
120	NC_014722	CTCGA	2	10	138033	138042	20 %	20 %	20 %	40 %	312794895
121	NC_014722	CGAAG	2	10	138779	138788	40 %	0 %	40 %	20 %	312794896
122	NC_014722	GCGCG	2	10	141507	141516	0 %	0 %	60 %	40 %	312794898
123	NC_014722	CGATG	2	10	141804	141813	20 %	20 %	40 %	20 %	312794898
124	NC_014722	CTGGA	2	10	142378	142387	20 %	20 %	40 %	20 %	312794898
125	NC_014722	GGCAT	2	10	142550	142559	20 %	20 %	40 %	20 %	312794898
126	NC_014722	GGCGC	2	10	143660	143669	0 %	0 %	60 %	40 %	312794900
127	NC_014722	GCTCG	2	10	144243	144252	0 %	20 %	40 %	40 %	312794900
128	NC_014722	CGGGC	2	10	144947	144956	0 %	0 %	60 %	40 %	312794900
129	NC_014722	GGGCG	2	10	144958	144967	0 %	0 %	80 %	20 %	312794900
130	NC_014722	TGGCG	2	10	145400	145409	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
131	NC_014722	GCGCG	2	10	146671	146680	0 %	0 %	60 %	40 %	312794901
132	NC_014722	CCAGT	2	10	147860	147869	20 %	20 %	20 %	40 %	312794902
133	NC_014722	CGGAA	2	10	148171	148180	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
134	NC_014722	CGAAC	2	10	148954	148963	40 %	0 %	20 %	40 %	312794903
135	NC_014722	GCGCT	2	10	151236	151245	0 %	20 %	40 %	40 %	312794903
136	NC_014722	GCATG	2	10	151696	151705	20 %	20 %	40 %	20 %	312794903
137	NC_014722	CACGC	2	10	155451	155460	20 %	0 %	20 %	60 %	312794905
138	NC_014722	GCGCT	2	10	155807	155816	0 %	20 %	40 %	40 %	312794906
139	NC_014722	GGTCA	2	10	156175	156184	20 %	20 %	40 %	20 %	312794906
140	NC_014722	TCGTC	2	10	156210	156219	0 %	40 %	20 %	40 %	312794906
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142	NC_014722	GCGCG	2	10	159627	159636	0 %	0 %	60 %	40 %	312794908
143	NC_014722	CGGCG	2	10	160348	160357	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
144	NC_014722	CGGCG	2	10	161089	161098	0 %	0 %	60 %	40 %	312794910
145	NC_014722	TTGAG	2	10	161506	161515	20 %	40 %	40 %	0 %	312794910
146	NC_014722	GGCAT	2	10	162106	162115	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
147	NC_014722	TGACG	2	10	162152	162161	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
148	NC_014722	CATGC	2	10	163357	163366	20 %	20 %	20 %	40 %	312794911
149	NC_014722	CGCGC	2	10	163522	163531	0 %	0 %	40 %	60 %	312794911
150	NC_014722	GAATG	2	10	164015	164024	40 %	20 %	40 %	0 %	312794911
151	NC_014722	GCGTC	2	10	164349	164358	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
152	NC_014722	GTCTC	2	10	165096	165105	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
153	NC_014722	TGCAA	2	10	165765	165774	40 %	20 %	20 %	20 %	312794913
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156	NC_014722	CATGT	2	10	170197	170206	20 %	40 %	20 %	20 %	312794920
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176	NC_014722	GTCCG	2	10	186234	186243	0 %	20 %	40 %	40 %	312794939
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192	NC_014722	GGCGC	2	10	198772	198781	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
193	NC_014722	TTCAA	2	10	199552	199561	40 %	40 %	0 %	20 %	312794962
194	NC_014722	GTTAC	2	10	200084	200093	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
195	NC_014722	ACGGG	2	10	200683	200692	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
196	NC_014722	ACACA	2	10	200934	200943	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
197	NC_014722	TTATC	2	10	201715	201724	20 %	60 %	0 %	20 %	312794965
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201	NC_014722	GCGCC	2	10	208992	209001	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
202	NC_014722	TCGAC	2	10	209314	209323	20 %	20 %	20 %	40 %	312794978
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204	NC_014722	GCGAT	2	10	210439	210448	20 %	20 %	40 %	20 %	312794979
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210	NC_014722	GCATC	2	10	216583	216592	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
211	NC_014722	TCGAT	2	10	218107	218116	20 %	40 %	20 %	20 %	312794989
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226	NC_014722	ACCTT	2	10	233228	233237	20 %	40 %	0 %	40 %	312795006
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231	NC_014722	CATCG	2	10	238677	238686	20 %	20 %	20 %	40 %	312795011
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238	NC_014722	CTTCA	2	10	243516	243525	20 %	40 %	0 %	40 %	312795015
239	NC_014722	GCTGT	2	10	248362	248371	0 %	40 %	40 %	20 %	312795021
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242	NC_014722	CCGAC	2	10	249671	249680	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
243	NC_014722	CGGCG	2	10	250231	250240	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
244	NC_014722	TGTAC	2	10	251140	251149	20 %	40 %	20 %	20 %	312795024
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246	NC_014722	GAAAA	2	10	252316	252325	80 %	0 %	20 %	0 %	312795026
247	NC_014722	GCGCC	2	10	252576	252585	0 %	0 %	40 %	60 %	312795026
248	NC_014722	GCGAC	2	10	255510	255519	20 %	0 %	40 %	40 %	312795029
249	NC_014722	CGGCG	2	10	258778	258787	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
250	NC_014722	CGCTG	2	10	258966	258975	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
251	NC_014722	ATCCG	2	10	259015	259024	20 %	20 %	20 %	40 %	312795033
252	NC_014722	TGCAC	2	10	259051	259060	20 %	20 %	20 %	40 %	312795033
253	NC_014722	CGCTG	2	10	260498	260507	0 %	20 %	40 %	40 %	312795034
254	NC_014722	ACGGC	2	10	262050	262059	20 %	0 %	40 %	40 %	312795036
255	NC_014722	AGCGG	2	10	264298	264307	20 %	0 %	60 %	20 %	312795037
256	NC_014722	GGCGG	2	10	264315	264324	0 %	0 %	80 %	20 %	312795037
257	NC_014722	CGGTG	2	10	264698	264707	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
258	NC_014722	CGTTG	2	10	267032	267041	0 %	40 %	40 %	20 %	312795040
259	NC_014722	GCGCC	2	10	268703	268712	0 %	0 %	40 %	60 %	312795043
260	NC_014722	GCGAT	2	10	269281	269290	20 %	20 %	40 %	20 %	312795044
261	NC_014722	CGGGT	2	10	271264	271273	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
262	NC_014722	GCGAC	2	10	271501	271510	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
263	NC_014722	TTGAG	2	10	271707	271716	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
264	NC_014722	TCGTG	2	10	272820	272829	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
265	NC_014722	GCAGT	2	10	273620	273629	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
266	NC_014722	GGGAG	2	10	274310	274319	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
267	NC_014722	CTCAT	2	10	276314	276323	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
268	NC_014722	TGGCT	2	10	277288	277297	0 %	40 %	40 %	20 %	312795047
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380	NC_014722	GGACG	2	10	430648	430657	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
381	NC_014722	TTTTG	2	10	430763	430772	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
382	NC_014722	CGCGG	2	10	431136	431145	0 %	0 %	60 %	40 %	312795192
383	NC_014722	TCGGC	2	10	432446	432455	0 %	20 %	40 %	40 %	312795193
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398	NC_014722	GCGCG	2	10	446180	446189	0 %	0 %	60 %	40 %	312795204
399	NC_014722	ATGCG	2	10	446249	446258	20 %	20 %	40 %	20 %	312795204
400	NC_014722	CATGC	2	10	446677	446686	20 %	20 %	20 %	40 %	312795205
401	NC_014722	CGAGG	2	10	446792	446801	20 %	0 %	60 %	20 %	312795205
402	NC_014722	TGCGC	2	10	447863	447872	0 %	20 %	40 %	40 %	312795206
403	NC_014722	TGCTG	2	10	447899	447908	0 %	40 %	40 %	20 %	312795206
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407	NC_014722	TCACC	2	10	449877	449886	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
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497	NC_014722	CGGCA	2	10	541630	541639	20 %	0 %	40 %	40 %	312795319
498	NC_014722	TGCGC	2	10	542188	542197	0 %	20 %	40 %	40 %	312795321
499	NC_014722	AGCGC	2	10	542927	542936	20 %	0 %	40 %	40 %	312795322
500	NC_014722	GCCAC	2	10	543595	543604	20 %	0 %	20 %	60 %	312795324

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