MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Burkholderia rhizoxinica HKI 454 chromosome

Total Repeats: 7583

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014722	CGAA	2	8	494	501	50 %	0 %	25 %	25 %	312794750
2	NC_014722	CAAC	2	8	747	754	50 %	0 %	0 %	50 %	312794750
3	NC_014722	CGCA	2	8	922	929	25 %	0 %	25 %	50 %	312794750
4	NC_014722	GCCG	2	8	1650	1657	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_014722	GGCG	2	8	1678	1685	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
6	NC_014722	TGCG	2	8	2216	2223	0 %	25 %	50 %	25 %	312794751
7	NC_014722	CGAC	2	8	2492	2499	25 %	0 %	25 %	50 %	312794751
8	NC_014722	GACG	2	8	2529	2536	25 %	0 %	50 %	25 %	312794751
9	NC_014722	GACC	2	8	3879	3886	25 %	0 %	25 %	50 %	312794752
10	NC_014722	GCTC	3	12	5010	5021	0 %	25 %	25 %	50 %	312794752
11	NC_014722	GCAG	2	8	5034	5041	25 %	0 %	50 %	25 %	312794752
12	NC_014722	GCGG	2	8	5643	5650	0 %	0 %	75 %	25 %	312794752
13	NC_014722	AATA	2	8	5965	5972	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014722	TGTT	2	8	6249	6256	0 %	75 %	25 %	0 %	312794753
15	NC_014722	ATTT	2	8	6270	6277	25 %	75 %	0 %	0 %	312794753
16	NC_014722	TTTC	2	8	6608	6615	0 %	75 %	0 %	25 %	312794753
17	NC_014722	AGTC	2	8	7411	7418	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_014722	CATC	2	8	7501	7508	25 %	25 %	0 %	50 %	312794755
19	NC_014722	TCGA	2	8	8226	8233	25 %	25 %	25 %	25 %	312794755
20	NC_014722	CGTC	2	8	8356	8363	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
21	NC_014722	ACCG	2	8	8491	8498	25 %	0 %	25 %	50 %	312794756
22	NC_014722	CGCC	2	8	8628	8635	0 %	0 %	25 %	75 %	312794756
23	NC_014722	AAGC	2	8	9351	9358	50 %	0 %	25 %	25 %	312794756
24	NC_014722	CCCA	2	8	9368	9375	25 %	0 %	0 %	75 %	312794756
25	NC_014722	GCCT	2	8	9705	9712	0 %	25 %	25 %	50 %	312794756
26	NC_014722	GCCG	2	8	10265	10272	0 %	0 %	50 %	50 %	312794756
27	NC_014722	TGCG	2	8	10351	10358	0 %	25 %	50 %	25 %	312794756
28	NC_014722	GCAT	2	8	10506	10513	25 %	25 %	25 %	25 %	312794756
29	NC_014722	AGTC	2	8	10583	10590	25 %	25 %	25 %	25 %	312794756
30	NC_014722	AATC	2	8	10785	10792	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_014722	AGTG	2	8	11284	11291	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014722	GTTG	2	8	11302	11309	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014722	ATGG	2	8	11411	11418	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014722	AACC	2	8	11619	11626	50 %	0 %	0 %	50 %	312794758
35	NC_014722	ACAA	2	8	11631	11638	75 %	0 %	0 %	25 %	312794758
36	NC_014722	TAAA	2	8	12311	12318	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014722	GCTA	2	8	12348	12355	25 %	25 %	25 %	25 %	312794759
38	NC_014722	ATAC	2	8	12464	12471	50 %	25 %	0 %	25 %	312794759
39	NC_014722	GAAG	2	8	12634	12641	50 %	0 %	50 %	0 %	312794759
40	NC_014722	CGCT	2	8	13019	13026	0 %	25 %	25 %	50 %	312794759
41	NC_014722	CAGA	2	8	13177	13184	50 %	0 %	25 %	25 %	312794759
42	NC_014722	CAGC	2	8	13614	13621	25 %	0 %	25 %	50 %	312794759
43	NC_014722	AGGT	2	8	13797	13804	25 %	25 %	50 %	0 %	312794760
44	NC_014722	CAAA	2	8	13930	13937	75 %	0 %	0 %	25 %	312794760
45	NC_014722	TCCC	2	8	14140	14147	0 %	25 %	0 %	75 %	312794760
46	NC_014722	AAGA	2	8	14422	14429	75 %	0 %	25 %	0 %	312794760
47	NC_014722	AGTC	2	8	14656	14663	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_014722	ACAA	2	8	14823	14830	75 %	0 %	0 %	25 %	312794761
49	NC_014722	GAAT	2	8	15139	15146	50 %	25 %	25 %	0 %	312794761
50	NC_014722	AGCC	2	8	15694	15701	25 %	0 %	25 %	50 %	312794762
51	NC_014722	CCGA	2	8	16082	16089	25 %	0 %	25 %	50 %	312794762
52	NC_014722	GCTC	2	8	16499	16506	0 %	25 %	25 %	50 %	312794762
53	NC_014722	AGGC	2	8	16671	16678	25 %	0 %	50 %	25 %	312794762
54	NC_014722	GTTC	2	8	17021	17028	0 %	50 %	25 %	25 %	312794762
55	NC_014722	GCCG	2	8	17125	17132	0 %	0 %	50 %	50 %	312794762
56	NC_014722	CAGC	2	8	17472	17479	25 %	0 %	25 %	50 %	312794762
57	NC_014722	ATCA	2	8	17637	17644	50 %	25 %	0 %	25 %	312794762
58	NC_014722	GATG	2	8	17690	17697	25 %	25 %	50 %	0 %	312794762
59	NC_014722	AGCA	2	8	17712	17719	50 %	0 %	25 %	25 %	312794762
60	NC_014722	TCGC	2	8	17913	17920	0 %	25 %	25 %	50 %	312794763
61	NC_014722	GCCC	2	8	18333	18340	0 %	0 %	25 %	75 %	312794763
62	NC_014722	CTGC	2	8	18801	18808	0 %	25 %	25 %	50 %	312794763
63	NC_014722	GGCT	2	8	18988	18995	0 %	25 %	50 %	25 %	312794763
64	NC_014722	CAGC	2	8	19602	19609	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
65	NC_014722	GACC	2	8	19668	19675	25 %	0 %	25 %	50 %	312794764
66	NC_014722	TTCT	2	8	20106	20113	0 %	75 %	0 %	25 %	312794764
67	NC_014722	ACCA	2	8	20364	20371	50 %	0 %	0 %	50 %	312794764
68	NC_014722	CTTT	2	8	20421	20428	0 %	75 %	0 %	25 %	312794764
69	NC_014722	AACC	2	8	20491	20498	50 %	0 %	0 %	50 %	312794764
70	NC_014722	ATTT	2	8	20789	20796	25 %	75 %	0 %	0 %	312794764
71	NC_014722	AGCA	2	8	21018	21025	50 %	0 %	25 %	25 %	312794764
72	NC_014722	TCCA	2	8	21288	21295	25 %	25 %	0 %	50 %	312794764
73	NC_014722	TCGA	2	8	21448	21455	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_014722	TCTT	2	8	21733	21740	0 %	75 %	0 %	25 %	312794765
75	NC_014722	TCTG	2	8	23202	23209	0 %	50 %	25 %	25 %	312794766
76	NC_014722	AACG	2	8	24637	24644	50 %	0 %	25 %	25 %	312794767
77	NC_014722	TTGA	2	8	24763	24770	25 %	50 %	25 %	0 %	312794767
78	NC_014722	GCTT	2	8	25690	25697	0 %	50 %	25 %	25 %	312794767
79	NC_014722	ATCC	2	8	25840	25847	25 %	25 %	0 %	50 %	312794767
80	NC_014722	AACA	2	8	26580	26587	75 %	0 %	0 %	25 %	312794768
81	NC_014722	ATTG	2	8	26590	26597	25 %	50 %	25 %	0 %	312794768
82	NC_014722	TTTG	2	8	26679	26686	0 %	75 %	25 %	0 %	312794768
83	NC_014722	TCCT	2	8	27718	27725	0 %	50 %	0 %	50 %	312794769
84	NC_014722	ACGT	2	8	28152	28159	25 %	25 %	25 %	25 %	312794769
85	NC_014722	AGCA	2	8	28270	28277	50 %	0 %	25 %	25 %	312794769
86	NC_014722	GCTG	2	8	29309	29316	0 %	25 %	50 %	25 %	312794769
87	NC_014722	GCCC	2	8	30309	30316	0 %	0 %	25 %	75 %	312794769
88	NC_014722	GGCT	2	8	30386	30393	0 %	25 %	50 %	25 %	312794769
89	NC_014722	CAGC	2	8	31317	31324	25 %	0 %	25 %	50 %	312794769
90	NC_014722	CCGG	2	8	31607	31614	0 %	0 %	50 %	50 %	312794769
91	NC_014722	TGGC	2	8	31627	31634	0 %	25 %	50 %	25 %	312794769
92	NC_014722	TAAG	2	8	31830	31837	50 %	25 %	25 %	0 %	312794769
93	NC_014722	CCCT	2	8	32119	32126	0 %	25 %	0 %	75 %	312794770
94	NC_014722	CTTT	2	8	32417	32424	0 %	75 %	0 %	25 %	312794770
95	NC_014722	GGCC	2	8	33241	33248	0 %	0 %	50 %	50 %	312794771
96	NC_014722	TGCG	2	8	33843	33850	0 %	25 %	50 %	25 %	312794771
97	NC_014722	GATA	2	8	34410	34417	50 %	25 %	25 %	0 %	312794772
98	NC_014722	TCGC	2	8	34419	34426	0 %	25 %	25 %	50 %	312794772
99	NC_014722	GCCC	2	8	34495	34502	0 %	0 %	25 %	75 %	312794772
100	NC_014722	GCAA	2	8	35325	35332	50 %	0 %	25 %	25 %	312794774
101	NC_014722	CCGC	2	8	36039	36046	0 %	0 %	25 %	75 %	312794775
102	NC_014722	CAAC	2	8	36217	36224	50 %	0 %	0 %	50 %	312794775
103	NC_014722	CGCC	2	8	37882	37889	0 %	0 %	25 %	75 %	312794776
104	NC_014722	ATCA	2	8	37988	37995	50 %	25 %	0 %	25 %	312794776
105	NC_014722	GATC	2	8	38212	38219	25 %	25 %	25 %	25 %	312794776
106	NC_014722	CTGT	2	8	38338	38345	0 %	50 %	25 %	25 %	312794776
107	NC_014722	CCGC	2	8	38960	38967	0 %	0 %	25 %	75 %	312794777
108	NC_014722	ATTG	2	8	39213	39220	25 %	50 %	25 %	0 %	312794777
109	NC_014722	TGGC	2	8	39285	39292	0 %	25 %	50 %	25 %	312794777
110	NC_014722	ACGT	2	8	39401	39408	25 %	25 %	25 %	25 %	312794777
111	NC_014722	TAAA	2	8	39636	39643	75 %	25 %	0 %	0 %	312794777
112	NC_014722	TCGA	2	8	40099	40106	25 %	25 %	25 %	25 %	312794778
113	NC_014722	CCCG	2	8	40733	40740	0 %	0 %	25 %	75 %	312794780
114	NC_014722	TTCG	2	8	40882	40889	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
115	NC_014722	TAGC	2	8	42277	42284	25 %	25 %	25 %	25 %	312794783
116	NC_014722	AATA	2	8	42567	42574	75 %	25 %	0 %	0 %	312794784
117	NC_014722	AGGA	2	8	43479	43486	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_014722	CCGA	2	8	44048	44055	25 %	0 %	25 %	50 %	312794787
119	NC_014722	CGCC	2	8	44370	44377	0 %	0 %	25 %	75 %	312794787
120	NC_014722	CGTA	2	8	44386	44393	25 %	25 %	25 %	25 %	312794787
121	NC_014722	GTCG	2	8	44830	44837	0 %	25 %	50 %	25 %	312794787
122	NC_014722	CAGC	2	8	44978	44985	25 %	0 %	25 %	50 %	312794787
123	NC_014722	CGAG	2	8	45006	45013	25 %	0 %	50 %	25 %	312794787
124	NC_014722	ATCG	2	8	45079	45086	25 %	25 %	25 %	25 %	312794788
125	NC_014722	TGCG	2	8	45105	45112	0 %	25 %	50 %	25 %	312794788
126	NC_014722	ACAA	2	8	45203	45210	75 %	0 %	0 %	25 %	312794788
127	NC_014722	CGAC	2	8	46149	46156	25 %	0 %	25 %	50 %	312794788
128	NC_014722	GCGT	2	8	46402	46409	0 %	25 %	50 %	25 %	312794788
129	NC_014722	CGTG	2	8	46428	46435	0 %	25 %	50 %	25 %	312794788
130	NC_014722	GCAA	2	8	46646	46653	50 %	0 %	25 %	25 %	312794788
131	NC_014722	CATC	2	8	46826	46833	25 %	25 %	0 %	50 %	312794788
132	NC_014722	GCCG	2	8	46984	46991	0 %	0 %	50 %	50 %	312794788
133	NC_014722	ACTG	2	8	48473	48480	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
134	NC_014722	TCCT	2	8	48485	48492	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_014722	ATGC	2	8	48850	48857	25 %	25 %	25 %	25 %	312794791
136	NC_014722	CATT	2	8	49257	49264	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
137	NC_014722	CAAA	2	8	49372	49379	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
138	NC_014722	GCCA	2	8	49794	49801	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
139	NC_014722	GCAT	2	8	49964	49971	25 %	25 %	25 %	25 %	312794792
140	NC_014722	GTAC	2	8	50225	50232	25 %	25 %	25 %	25 %	312794793
141	NC_014722	ATTT	2	8	50354	50361	25 %	75 %	0 %	0 %	312794793
142	NC_014722	GCGA	2	8	50507	50514	25 %	0 %	50 %	25 %	312794793
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