MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Burkholderia rhizoxinica HKI 454 chromosome

Total Repeats: 62621

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
41001	NC_014722	GC	3	6	1814661	1814666	0 %	0 %	50 %	50 %	312796649
41002	NC_014722	GCG	2	6	1814703	1814708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312796649
41003	NC_014722	GC	5	10	1814727	1814736	0 %	0 %	50 %	50 %	312796649
41004	NC_014722	CG	3	6	1814748	1814753	0 %	0 %	50 %	50 %	312796649
41005	NC_014722	AAC	2	6	1814849	1814854	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312796649
41006	NC_014722	GT	3	6	1814871	1814876	0 %	50 %	50 %	0 %	312796649
41007	NC_014722	TCG	2	6	1814882	1814887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312796649
41008	NC_014722	CGCGG	2	10	1814893	1814902	0 %	0 %	60 %	40 %	312796649
41009	NC_014722	GCC	2	6	1814906	1814911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312796649
41010	NC_014722	CGCT	2	8	1814918	1814925	0 %	25 %	25 %	50 %	312796649
41011	NC_014722	GC	3	6	1814934	1814939	0 %	0 %	50 %	50 %	312796649
41012	NC_014722	ATC	2	6	1814941	1814946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312796649
41013	NC_014722	CG	5	10	1814989	1814998	0 %	0 %	50 %	50 %	312796649
41014	NC_014722	GC	4	8	1815042	1815049	0 %	0 %	50 %	50 %	312796649
41015	NC_014722	AGT	2	6	1815171	1815176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312796649
41016	NC_014722	GTG	2	6	1815226	1815231	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312796649
41017	NC_014722	CGC	2	6	1815252	1815257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312796649
41018	NC_014722	GTC	2	6	1815324	1815329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312796649
41019	NC_014722	GGC	2	6	1815362	1815367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312796649
41020	NC_014722	TCC	2	6	1815410	1815415	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312796649
41021	NC_014722	CGT	2	6	1815420	1815425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312796649
41022	NC_014722	CG	3	6	1815445	1815450	0 %	0 %	50 %	50 %	312796649
41023	NC_014722	AAT	2	6	1815507	1815512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312796649
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41028	NC_014722	CG	3	6	1815706	1815711	0 %	0 %	50 %	50 %	312796649
41029	NC_014722	GTC	2	6	1815724	1815729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312796649
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41033	NC_014722	GCCG	2	8	1815983	1815990	0 %	0 %	50 %	50 %	312796649
41034	NC_014722	CG	3	6	1816018	1816023	0 %	0 %	50 %	50 %	312796649
41035	NC_014722	GCC	2	6	1816045	1816050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312796649
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41037	NC_014722	GCGCA	2	10	1816245	1816254	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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41039	NC_014722	CGC	2	6	1816300	1816305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312796651
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41043	NC_014722	GC	3	6	1816382	1816387	0 %	0 %	50 %	50 %	312796651
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41045	NC_014722	CGA	3	9	1816423	1816431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312796651
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41055	NC_014722	CGC	2	6	1816806	1816811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312796651
41056	NC_014722	CGA	2	6	1816839	1816844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312796651
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41060	NC_014722	GCT	2	6	1817030	1817035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41061	NC_014722	TGCA	2	8	1817065	1817072	25 %	25 %	25 %	25 %	312796652
41062	NC_014722	GGCG	2	8	1817096	1817103	0 %	0 %	75 %	25 %	312796652
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41072	NC_014722	AC	3	6	1817679	1817684	50 %	0 %	0 %	50 %	312796652
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41085	NC_014722	CGT	2	6	1818129	1818134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312796653
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41087	NC_014722	CG	4	8	1818204	1818211	0 %	0 %	50 %	50 %	312796653
41088	NC_014722	CTG	3	9	1818212	1818220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312796653
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41103	NC_014722	TGC	2	6	1818837	1818842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312796654
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41106	NC_014722	GTT	2	6	1819013	1819018	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312796654
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41109	NC_014722	CCGAC	2	10	1819065	1819074	20 %	0 %	20 %	60 %	312796655
41110	NC_014722	TGC	2	6	1819075	1819080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312796655
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41116	NC_014722	ACC	2	6	1819261	1819266	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312796655
41117	NC_014722	CGG	2	6	1819274	1819279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312796655
41118	NC_014722	CAC	3	9	1819290	1819298	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312796655
41119	NC_014722	ACC	2	6	1819338	1819343	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312796655
41120	NC_014722	CGA	2	6	1819364	1819369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312796655
41121	NC_014722	CG	3	6	1819406	1819411	0 %	0 %	50 %	50 %	312796655
41122	NC_014722	ACG	2	6	1819415	1819420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312796655
41123	NC_014722	C	6	6	1819423	1819428	0 %	0 %	0 %	100 %	312796655
41124	NC_014722	A	6	6	1819557	1819562	100 %	0 %	0 %	0 %	312796655
41125	NC_014722	CGCC	2	8	1819605	1819612	0 %	0 %	25 %	75 %	312796655
41126	NC_014722	GTGC	2	8	1819643	1819650	0 %	25 %	50 %	25 %	312796655
41127	NC_014722	CG	3	6	1819685	1819690	0 %	0 %	50 %	50 %	312796655
41128	NC_014722	CAG	2	6	1819691	1819696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312796655
41129	NC_014722	GC	3	6	1819786	1819791	0 %	0 %	50 %	50 %	312796655
41130	NC_014722	GC	3	6	1819797	1819802	0 %	0 %	50 %	50 %	312796655
41131	NC_014722	TCG	2	6	1819829	1819834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312796655
41132	NC_014722	AAC	2	6	1819922	1819927	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312796656
41133	NC_014722	CTT	2	6	1819948	1819953	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312796656
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41137	NC_014722	GCCG	2	8	1820245	1820252	0 %	0 %	50 %	50 %	312796656
41138	NC_014722	GC	3	6	1820267	1820272	0 %	0 %	50 %	50 %	312796656
41139	NC_014722	GC	3	6	1820280	1820285	0 %	0 %	50 %	50 %	312796656
41140	NC_014722	CGG	2	6	1820299	1820304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312796656
41141	NC_014722	CTCGCG	2	12	1820311	1820322	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	312796656
41142	NC_014722	GCC	2	6	1820390	1820395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312796656
41143	NC_014722	CGT	2	6	1820400	1820405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312796656
41144	NC_014722	CGC	2	6	1820409	1820414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312796656
41145	NC_014722	GGGT	2	8	1820435	1820442	0 %	25 %	75 %	0 %	312796656
41146	NC_014722	CG	3	6	1820503	1820508	0 %	0 %	50 %	50 %	312796656
41147	NC_014722	GCC	2	6	1820510	1820515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312796656
41148	NC_014722	TGGCT	2	10	1820534	1820543	0 %	40 %	40 %	20 %	312796656
41149	NC_014722	CGA	2	6	1820544	1820549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312796656
41150	NC_014722	GCC	2	6	1820572	1820577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312796656
41151	NC_014722	GAGTG	2	10	1820755	1820764	20 %	20 %	60 %	0 %	312796656
41152	NC_014722	GCG	3	9	1820821	1820829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312796656
41153	NC_014722	TCA	2	6	1820878	1820883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41154	NC_014722	GCC	2	6	1820885	1820890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
41155	NC_014722	CGAC	2	8	1820894	1820901	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
41156	NC_014722	GC	3	6	1820908	1820913	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41157	NC_014722	CG	3	6	1820944	1820949	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41158	NC_014722	CGC	2	6	1820956	1820961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
41159	NC_014722	CG	3	6	1821025	1821030	0 %	0 %	50 %	50 %	312796657
41160	NC_014722	ATC	2	6	1821044	1821049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312796657
41161	NC_014722	CG	3	6	1821053	1821058	0 %	0 %	50 %	50 %	312796657
41162	NC_014722	CTG	2	6	1821074	1821079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312796657
41163	NC_014722	AGC	2	6	1821093	1821098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312796657
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41167	NC_014722	CGT	2	6	1821316	1821321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312796657
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41172	NC_014722	CTT	2	6	1821595	1821600	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312796657
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41175	NC_014722	CGG	2	6	1821783	1821788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312796657
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41177	NC_014722	CGC	2	6	1821981	1821986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
41178	NC_014722	CGCAG	2	10	1822028	1822037	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
41179	NC_014722	CG	3	6	1822104	1822109	0 %	0 %	50 %	50 %	312796658
41180	NC_014722	ACC	2	6	1822148	1822153	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312796658
41181	NC_014722	CCG	2	6	1822177	1822182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312796658
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41183	NC_014722	CAA	2	6	1822213	1822218	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312796658
41184	NC_014722	A	7	7	1822217	1822223	100 %	0 %	0 %	0 %	312796658
41185	NC_014722	GCGA	2	8	1822227	1822234	25 %	0 %	50 %	25 %	312796658
41186	NC_014722	TGC	2	6	1822255	1822260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312796658
41187	NC_014722	AGC	2	6	1822285	1822290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312796658
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41189	NC_014722	CGC	2	6	1822460	1822465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312796658
41190	NC_014722	GCAT	2	8	1822466	1822473	25 %	25 %	25 %	25 %	312796658
41191	NC_014722	GC	3	6	1822621	1822626	0 %	0 %	50 %	50 %	312796658
41192	NC_014722	GCC	2	6	1822679	1822684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312796658
41193	NC_014722	TGGT	2	8	1822702	1822709	0 %	50 %	50 %	0 %	312796658
41194	NC_014722	GAT	2	6	1822781	1822786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312796658
41195	NC_014722	CCG	2	6	1822787	1822792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312796658
41196	NC_014722	TC	3	6	1822845	1822850	0 %	50 %	0 %	50 %	312796658
41197	NC_014722	CGC	2	6	1822940	1822945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312796658
41198	NC_014722	GCGT	2	8	1823034	1823041	0 %	25 %	50 %	25 %	312796658
41199	NC_014722	CGCC	2	8	1823171	1823178	0 %	0 %	25 %	75 %	312796658
41200	NC_014722	ATC	2	6	1823230	1823235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312796658
41201	NC_014722	GC	3	6	1823239	1823244	0 %	0 %	50 %	50 %	312796658
41202	NC_014722	GAC	2	6	1823247	1823252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312796658
41203	NC_014722	GCT	2	6	1823318	1823323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312796658
41204	NC_014722	GCCC	2	8	1823362	1823369	0 %	0 %	25 %	75 %	312796658
41205	NC_014722	CAG	2	6	1823391	1823396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312796658
41206	NC_014722	ACG	2	6	1823476	1823481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312796658
41207	NC_014722	CCAC	2	8	1823530	1823537	25 %	0 %	0 %	75 %	312796658
41208	NC_014722	GAA	2	6	1823574	1823579	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312796658
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41210	NC_014722	TCT	2	6	1823587	1823592	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312796658
41211	NC_014722	CGGCC	2	10	1823595	1823604	0 %	0 %	40 %	60 %	312796658
41212	NC_014722	CGT	2	6	1823613	1823618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312796658
41213	NC_014722	AGC	2	6	1823634	1823639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312796658
41214	NC_014722	CGA	2	6	1823651	1823656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312796658
41215	NC_014722	CTGG	2	8	1823807	1823814	0 %	25 %	50 %	25 %	312796658
41216	NC_014722	AGCAA	2	10	1823815	1823824	60 %	0 %	20 %	20 %	312796658
41217	NC_014722	AAG	2	6	1823856	1823861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312796658
41218	NC_014722	A	6	6	1823862	1823867	100 %	0 %	0 %	0 %	312796658
41219	NC_014722	A	6	6	1823956	1823961	100 %	0 %	0 %	0 %	312796658
41220	NC_014722	CG	3	6	1823988	1823993	0 %	0 %	50 %	50 %	312796658
41221	NC_014722	CGAC	2	8	1824101	1824108	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
41222	NC_014722	CAG	2	6	1824136	1824141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312796659
41223	NC_014722	AGAA	2	8	1824194	1824201	75 %	0 %	25 %	0 %	312796659
41224	NC_014722	CTGGAC	2	12	1824217	1824228	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	312796659
41225	NC_014722	CTG	2	6	1824268	1824273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312796659
41226	NC_014722	CGGG	2	8	1824422	1824429	0 %	0 %	75 %	25 %	312796659
41227	NC_014722	GAA	2	6	1824450	1824455	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312796659
41228	NC_014722	CTCA	2	8	1824537	1824544	25 %	25 %	0 %	50 %	312796659
41229	NC_014722	CCCG	2	8	1824669	1824676	0 %	0 %	25 %	75 %	312796659
41230	NC_014722	GAAC	2	8	1824717	1824724	50 %	0 %	25 %	25 %	312796659
41231	NC_014722	CCGG	2	8	1824725	1824732	0 %	0 %	50 %	50 %	312796659
41232	NC_014722	TCC	2	6	1824763	1824768	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312796659
41233	NC_014722	CGG	2	6	1824781	1824786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312796659
41234	NC_014722	CAT	2	6	1824787	1824792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312796659
41235	NC_014722	GCG	2	6	1824796	1824801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312796659
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41237	NC_014722	CGG	2	6	1824848	1824853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312796659
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41341	NC_014722	GCCG	2	8	1829545	1829552	0 %	0 %	50 %	50 %	312796662
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41354	NC_014722	CCCG	2	8	1830191	1830198	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
41355	NC_014722	CACCC	2	10	1830206	1830215	20 %	0 %	0 %	80 %	312796664
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41387	NC_014722	CA	3	6	1831555	1831560	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
41388	NC_014722	TAT	2	6	1831568	1831573	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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41465	NC_014722	TTGA	2	8	1834895	1834902	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
41466	NC_014722	CA	3	6	1834991	1834996	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
41467	NC_014722	GAA	2	6	1835000	1835005	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41468	NC_014722	GC	4	8	1835077	1835084	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41469	NC_014722	CGCTG	2	10	1835114	1835123	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
41470	NC_014722	GCGA	2	8	1835174	1835181	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
41471	NC_014722	ACCT	2	8	1835239	1835246	25 %	25 %	0 %	50 %	312796672
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41474	NC_014722	CGC	2	6	1835345	1835350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312796672
41475	NC_014722	CGAG	2	8	1835371	1835378	25 %	0 %	50 %	25 %	312796672
41476	NC_014722	CCA	2	6	1835383	1835388	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312796672
41477	NC_014722	GCT	2	6	1835431	1835436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312796672
41478	NC_014722	ACA	2	6	1835481	1835486	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41479	NC_014722	TTCA	2	8	1835547	1835554	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
41480	NC_014722	CTT	2	6	1835555	1835560	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41481	NC_014722	CTG	2	6	1835565	1835570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41482	NC_014722	AAT	2	6	1835786	1835791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312796673
41483	NC_014722	ATT	2	6	1835808	1835813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312796673
41484	NC_014722	AGG	2	6	1835955	1835960	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312796673
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41493	NC_014722	CGT	2	6	1836522	1836527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312796673
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41499	NC_014722	GCATCC	2	12	1836943	1836954	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	312796673
41500	NC_014722	CAC	2	6	1837028	1837033	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312796673

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