MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Burkholderia rhizoxinica HKI 454 chromosome

Total Repeats: 62621

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_014722	GTGC	2	8	156599	156606	0 %	25 %	50 %	25 %	312794906
3502	NC_014722	GGC	2	6	156607	156612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312794906
3503	NC_014722	CGG	2	6	156614	156619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312794906
3504	NC_014722	CT	3	6	156663	156668	0 %	50 %	0 %	50 %	312794906
3505	NC_014722	TTC	2	6	156698	156703	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312794907
3506	NC_014722	GCAC	2	8	156878	156885	25 %	0 %	25 %	50 %	312794908
3507	NC_014722	AACAA	2	10	156887	156896	80 %	0 %	0 %	20 %	312794908
3508	NC_014722	GGC	2	6	156934	156939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312794908
3509	NC_014722	GCC	2	6	156952	156957	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312794908
3510	NC_014722	GTGC	2	8	157040	157047	0 %	25 %	50 %	25 %	312794908
3511	NC_014722	GTC	2	6	157059	157064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312794908
3512	NC_014722	CG	3	6	157089	157094	0 %	0 %	50 %	50 %	312794908
3513	NC_014722	TCG	2	6	157099	157104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312794908
3514	NC_014722	ATC	2	6	157114	157119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312794908
3515	NC_014722	TCGG	2	8	157159	157166	0 %	25 %	50 %	25 %	312794908
3516	NC_014722	ATC	2	6	157171	157176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312794908
3517	NC_014722	TCG	2	6	157202	157207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312794908
3518	NC_014722	CGT	2	6	157244	157249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312794908
3519	NC_014722	GCC	2	6	157314	157319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312794908
3520	NC_014722	CG	4	8	157412	157419	0 %	0 %	50 %	50 %	312794908
3521	NC_014722	CAT	2	6	157422	157427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312794908
3522	NC_014722	GGC	2	6	157458	157463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312794908
3523	NC_014722	CGA	2	6	157479	157484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312794908
3524	NC_014722	CGC	2	6	157521	157526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312794908
3525	NC_014722	CCGA	2	8	157543	157550	25 %	0 %	25 %	50 %	312794908
3526	NC_014722	GC	3	6	157569	157574	0 %	0 %	50 %	50 %	312794908
3527	NC_014722	GGC	2	6	157581	157586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312794908
3528	NC_014722	GCC	4	12	157611	157622	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312794908
3529	NC_014722	CGC	2	6	157667	157672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312794908
3530	NC_014722	CCA	2	6	157697	157702	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312794908
3531	NC_014722	TC	3	6	157766	157771	0 %	50 %	0 %	50 %	312794908
3532	NC_014722	CGC	2	6	157821	157826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312794908
3533	NC_014722	CGA	2	6	157898	157903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312794908
3534	NC_014722	CGC	2	6	157991	157996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312794908
3535	NC_014722	GAT	2	6	158016	158021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312794908
3536	NC_014722	GCT	2	6	158111	158116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312794908
3537	NC_014722	ATC	2	6	158119	158124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312794908
3538	NC_014722	GGCG	2	8	158148	158155	0 %	0 %	75 %	25 %	312794908
3539	NC_014722	GGAT	2	8	158161	158168	25 %	25 %	50 %	0 %	312794908
3540	NC_014722	GCA	2	6	158195	158200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312794908
3541	NC_014722	ATC	2	6	158245	158250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312794908
3542	NC_014722	GCA	2	6	158297	158302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312794908
3543	NC_014722	GTG	2	6	158316	158321	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312794908
3544	NC_014722	CAA	2	6	158361	158366	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312794908
3545	NC_014722	GGCA	2	8	158370	158377	25 %	0 %	50 %	25 %	312794908
3546	NC_014722	GC	3	6	158423	158428	0 %	0 %	50 %	50 %	312794908
3547	NC_014722	AGCG	2	8	158463	158470	25 %	0 %	50 %	25 %	312794908
3548	NC_014722	CGT	3	9	158529	158537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312794908
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3550	NC_014722	CG	4	8	158558	158565	0 %	0 %	50 %	50 %	312794908
3551	NC_014722	CCG	2	6	158589	158594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312794908
3552	NC_014722	CG	5	10	158593	158602	0 %	0 %	50 %	50 %	312794908
3553	NC_014722	GAA	2	6	158655	158660	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312794908
3554	NC_014722	GCCG	2	8	158697	158704	0 %	0 %	50 %	50 %	312794908
3555	NC_014722	CGC	2	6	158712	158717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312794908
3556	NC_014722	ATG	2	6	158788	158793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312794908
3557	NC_014722	TGC	2	6	158848	158853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312794908
3558	NC_014722	CGA	2	6	158912	158917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312794908
3559	NC_014722	GCC	2	6	158918	158923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312794908
3560	NC_014722	GGC	2	6	159046	159051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312794908
3561	NC_014722	CGG	3	9	159077	159085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312794908
3562	NC_014722	CACG	2	8	159137	159144	25 %	0 %	25 %	50 %	312794908
3563	NC_014722	GCA	3	9	159167	159175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312794908
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3565	NC_014722	GC	3	6	159244	159249	0 %	0 %	50 %	50 %	312794908
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3572	NC_014722	CTG	2	6	159417	159422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312794908
3573	NC_014722	TAG	2	6	159544	159549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312794908
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3575	NC_014722	CG	3	6	159604	159609	0 %	0 %	50 %	50 %	312794908
3576	NC_014722	GCGCG	2	10	159627	159636	0 %	0 %	60 %	40 %	312794908
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3579	NC_014722	TCG	2	6	159748	159753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312794908
3580	NC_014722	CGT	2	6	159785	159790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312794908
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3582	NC_014722	TCA	2	6	159830	159835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312794908
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3586	NC_014722	CGA	2	6	160071	160076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312794909
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3588	NC_014722	TGAC	2	8	160116	160123	25 %	25 %	25 %	25 %	312794909
3589	NC_014722	ACG	2	6	160187	160192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312794909
3590	NC_014722	CGT	2	6	160242	160247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312794909
3591	NC_014722	CGGCG	2	10	160348	160357	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
3592	NC_014722	TGGCGG	2	12	160380	160391	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
3593	NC_014722	CGC	2	6	160394	160399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3594	NC_014722	ACC	2	6	160441	160446	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312794910
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3597	NC_014722	TGC	2	6	160534	160539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312794910
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3602	NC_014722	CG	3	6	160668	160673	0 %	0 %	50 %	50 %	312794910
3603	NC_014722	GC	3	6	160684	160689	0 %	0 %	50 %	50 %	312794910
3604	NC_014722	CGA	2	6	160703	160708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312794910
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3606	NC_014722	GCG	2	6	160858	160863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312794910
3607	NC_014722	GCGA	2	8	160938	160945	25 %	0 %	50 %	25 %	312794910
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3609	NC_014722	GCT	2	6	161012	161017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312794910
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3612	NC_014722	AGCC	2	8	161140	161147	25 %	0 %	25 %	50 %	312794910
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3618	NC_014722	CCG	2	6	161233	161238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312794910
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3622	NC_014722	CG	3	6	161397	161402	0 %	0 %	50 %	50 %	312794910
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3636	NC_014722	CGG	2	6	161832	161837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3637	NC_014722	TCG	2	6	161852	161857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3731	NC_014722	GC	3	6	165233	165238	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3732	NC_014722	GGCA	2	8	165275	165282	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3733	NC_014722	GC	3	6	165443	165448	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3734	NC_014722	TCCC	2	8	165475	165482	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
3735	NC_014722	TCGT	2	8	165522	165529	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3736	NC_014722	CTT	2	6	165537	165542	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3742	NC_014722	TGCAA	2	10	165765	165774	40 %	20 %	20 %	20 %	312794913
3743	NC_014722	GC	3	6	165782	165787	0 %	0 %	50 %	50 %	312794913
3744	NC_014722	CA	3	6	165850	165855	50 %	0 %	0 %	50 %	312794913
3745	NC_014722	GGC	2	6	165873	165878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312794913
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3749	NC_014722	GAT	2	6	166167	166172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3998	NC_014722	GGC	2	6	177777	177782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312794931
3999	NC_014722	CGCCAG	2	12	177789	177800	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	312794931
4000	NC_014722	CGC	2	6	177801	177806	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312794931

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