MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Burkholderia rhizoxinica HKI 454 chromosome

Total Repeats: 62621

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_014722	GCT	2	6	49738	49743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1002	NC_014722	GCCA	2	8	49794	49801	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1003	NC_014722	GTT	2	6	49895	49900	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312794792
1004	NC_014722	GC	3	6	49903	49908	0 %	0 %	50 %	50 %	312794792
1005	NC_014722	GCAT	2	8	49964	49971	25 %	25 %	25 %	25 %	312794792
1006	NC_014722	GC	3	6	50005	50010	0 %	0 %	50 %	50 %	312794792
1007	NC_014722	AGA	2	6	50013	50018	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312794792
1008	NC_014722	T	6	6	50109	50114	0 %	100 %	0 %	0 %	312794793
1009	NC_014722	CAA	2	6	50182	50187	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312794793
1010	NC_014722	GTAC	2	8	50225	50232	25 %	25 %	25 %	25 %	312794793
1011	NC_014722	GAT	2	6	50290	50295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312794793
1012	NC_014722	A	6	6	50298	50303	100 %	0 %	0 %	0 %	312794793
1013	NC_014722	ATTT	2	8	50354	50361	25 %	75 %	0 %	0 %	312794793
1014	NC_014722	CTG	2	6	50394	50399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312794793
1015	NC_014722	AGT	2	6	50410	50415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312794793
1016	NC_014722	GCGA	2	8	50507	50514	25 %	0 %	50 %	25 %	312794793
1017	NC_014722	T	6	6	50533	50538	0 %	100 %	0 %	0 %	312794793
1018	NC_014722	ACA	2	6	50539	50544	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312794793
1019	NC_014722	A	6	6	50718	50723	100 %	0 %	0 %	0 %	312794793
1020	NC_014722	G	6	6	50776	50781	0 %	0 %	100 %	0 %	312794793
1021	NC_014722	TGC	2	6	50798	50803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312794793
1022	NC_014722	GC	3	6	50846	50851	0 %	0 %	50 %	50 %	312794793
1023	NC_014722	ATT	2	6	50852	50857	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312794793
1024	NC_014722	TTGC	2	8	51009	51016	0 %	50 %	25 %	25 %	312794793
1025	NC_014722	GGA	2	6	51085	51090	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312794793
1026	NC_014722	TGGCA	2	10	51143	51152	20 %	20 %	40 %	20 %	312794793
1027	NC_014722	GGC	2	6	51155	51160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312794793
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1029	NC_014722	CTG	2	6	51286	51291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312794793
1030	NC_014722	GTT	2	6	51387	51392	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312794793
1031	NC_014722	T	6	6	51399	51404	0 %	100 %	0 %	0 %	312794793
1032	NC_014722	TGG	2	6	51479	51484	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312794793
1033	NC_014722	GGC	2	6	51587	51592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312794793
1034	NC_014722	ACC	2	6	51647	51652	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312794793
1035	NC_014722	AAG	2	6	51686	51691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312794793
1036	NC_014722	AGC	2	6	51733	51738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312794793
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1038	NC_014722	CTT	2	6	51766	51771	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312794793
1039	NC_014722	ACG	2	6	51837	51842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312794795
1040	NC_014722	TGC	2	6	51966	51971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312794795
1041	NC_014722	CGG	2	6	52011	52016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312794795
1042	NC_014722	TG	3	6	52032	52037	0 %	50 %	50 %	0 %	312794795
1043	NC_014722	TTGT	2	8	52094	52101	0 %	75 %	25 %	0 %	312794795
1044	NC_014722	GCTC	2	8	52156	52163	0 %	25 %	25 %	50 %	312794795
1045	NC_014722	ATC	2	6	52185	52190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312794795
1046	NC_014722	TGC	2	6	52236	52241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312794795
1047	NC_014722	GC	3	6	52240	52245	0 %	0 %	50 %	50 %	312794795
1048	NC_014722	CAT	2	6	52303	52308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312794795
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1051	NC_014722	TACT	2	8	52704	52711	25 %	50 %	0 %	25 %	312794796
1052	NC_014722	GCAC	2	8	52793	52800	25 %	0 %	25 %	50 %	312794796
1053	NC_014722	CCG	2	6	52933	52938	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312794796
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1056	NC_014722	GCGA	2	8	53254	53261	25 %	0 %	50 %	25 %	312794796
1057	NC_014722	GGT	2	6	53277	53282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312794796
1058	NC_014722	TAC	2	6	53332	53337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312794796
1059	NC_014722	TGA	2	6	53342	53347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312794796
1060	NC_014722	CA	3	6	53368	53373	50 %	0 %	0 %	50 %	312794796
1061	NC_014722	ACC	2	6	53418	53423	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312794796
1062	NC_014722	TAG	2	6	53516	53521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312794796
1063	NC_014722	GCCG	2	8	53603	53610	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1064	NC_014722	TAT	2	6	53668	53673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_014722	AAT	2	6	53683	53688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_014722	AGGC	2	8	53747	53754	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1067	NC_014722	CGA	2	6	53782	53787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1068	NC_014722	CTGAT	2	10	53886	53895	20 %	40 %	20 %	20 %	312794797
1069	NC_014722	TGGC	2	8	53950	53957	0 %	25 %	50 %	25 %	312794797
1070	NC_014722	TGC	2	6	53981	53986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312794797
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1073	NC_014722	GCT	2	6	54049	54054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312794797
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1078	NC_014722	GC	5	10	54282	54291	0 %	0 %	50 %	50 %	312794798
1079	NC_014722	TA	3	6	54366	54371	50 %	50 %	0 %	0 %	312794798
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1082	NC_014722	GTC	2	6	54475	54480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312794798
1083	NC_014722	GCTC	2	8	54516	54523	0 %	25 %	25 %	50 %	312794798
1084	NC_014722	CGA	3	9	54525	54533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312794798
1085	NC_014722	TCG	2	6	54551	54556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312794799
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1087	NC_014722	CATGCT	2	12	54579	54590	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	312794799
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1089	NC_014722	AAAT	2	8	54677	54684	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_014722	ATT	2	6	54698	54703	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_014722	A	6	6	54774	54779	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_014722	T	6	6	54784	54789	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_014722	TAAT	2	8	54821	54828	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_014722	A	7	7	54857	54863	100 %	0 %	0 %	0 %	312794800
1095	NC_014722	TTC	2	6	54885	54890	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312794800
1096	NC_014722	GCC	2	6	54894	54899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312794800
1097	NC_014722	TCG	2	6	54904	54909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312794800
1098	NC_014722	ATT	2	6	54985	54990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312794800
1099	NC_014722	A	6	6	55014	55019	100 %	0 %	0 %	0 %	312794800
1100	NC_014722	AAAT	2	8	55058	55065	75 %	25 %	0 %	0 %	312794800
1101	NC_014722	ATAAAA	2	12	55136	55147	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	312794800
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1103	NC_014722	A	6	6	55175	55180	100 %	0 %	0 %	0 %	312794800
1104	NC_014722	GCTT	2	8	55200	55207	0 %	50 %	25 %	25 %	312794800
1105	NC_014722	AG	3	6	55246	55251	50 %	0 %	50 %	0 %	312794800
1106	NC_014722	ATT	2	6	55306	55311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312794800
1107	NC_014722	GCG	2	6	55319	55324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312794800
1108	NC_014722	GGC	2	6	55366	55371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312794800
1109	NC_014722	AT	3	6	55392	55397	50 %	50 %	0 %	0 %	312794800
1110	NC_014722	ATTT	2	8	55411	55418	25 %	75 %	0 %	0 %	312794800
1111	NC_014722	GCT	2	6	55453	55458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312794800
1112	NC_014722	ATG	2	6	55468	55473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312794800
1113	NC_014722	CGG	2	6	55509	55514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312794800
1114	NC_014722	GC	4	8	55537	55544	0 %	0 %	50 %	50 %	312794800
1115	NC_014722	ATG	2	6	55597	55602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312794800
1116	NC_014722	AC	3	6	55635	55640	50 %	0 %	0 %	50 %	312794800
1117	NC_014722	CAT	2	6	55695	55700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312794800
1118	NC_014722	CTC	2	6	55733	55738	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312794800
1119	NC_014722	A	7	7	55757	55763	100 %	0 %	0 %	0 %	312794800
1120	NC_014722	A	6	6	55777	55782	100 %	0 %	0 %	0 %	312794800
1121	NC_014722	CAA	2	6	55822	55827	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312794800
1122	NC_014722	A	6	6	55855	55860	100 %	0 %	0 %	0 %	312794800
1123	NC_014722	TGC	2	6	55878	55883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312794800
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1125	NC_014722	A	6	6	55974	55979	100 %	0 %	0 %	0 %	312794800
1126	NC_014722	GGAA	2	8	55992	55999	50 %	0 %	50 %	0 %	312794800
1127	NC_014722	GAA	2	6	56007	56012	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312794800
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1129	NC_014722	A	7	7	56053	56059	100 %	0 %	0 %	0 %	312794800
1130	NC_014722	AAG	2	6	56077	56082	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312794800
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1133	NC_014722	GCA	2	6	56212	56217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312794800
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1153	NC_014722	T	7	7	56982	56988	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1154	NC_014722	T	7	7	57067	57073	0 %	100 %	0 %	0 %	312794804
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1164	NC_014722	CGC	2	6	57629	57634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1165	NC_014722	ATC	2	6	57637	57642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1245	NC_014722	CGA	2	6	61619	61624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312794807
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1248	NC_014722	ATC	2	6	61913	61918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312794807
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1256	NC_014722	CTT	2	6	62158	62163	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312794807
1257	NC_014722	TCG	2	6	62220	62225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312794807
1258	NC_014722	TGA	2	6	62233	62238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312794807
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1260	NC_014722	GTCG	2	8	62258	62265	0 %	25 %	50 %	25 %	312794807
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1263	NC_014722	CAT	2	6	62336	62341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312794807
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1378	NC_014722	GC	3	6	67915	67920	0 %	0 %	50 %	50 %	312794813
1379	NC_014722	GCC	2	6	67930	67935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312794813
1380	NC_014722	CG	3	6	67965	67970	0 %	0 %	50 %	50 %	312794813
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1382	NC_014722	CAG	2	6	68057	68062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312794813
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1493	NC_014722	CAGG	2	8	73141	73148	25 %	0 %	50 %	25 %	312794820
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1500	NC_014722	GCT	2	6	73417	73422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312794820

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