MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Burkholderia rhizoxinica HKI 454 chromosome

Total Repeats: 62621

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_014722	CAT	2	6	22933	22938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312794766
502	NC_014722	TCA	2	6	22974	22979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312794766
503	NC_014722	GTC	2	6	22997	23002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312794766
504	NC_014722	AAC	2	6	23145	23150	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312794766
505	NC_014722	TCTG	2	8	23202	23209	0 %	50 %	25 %	25 %	312794766
506	NC_014722	CCT	2	6	23215	23220	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312794766
507	NC_014722	AGC	2	6	23279	23284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312794766
508	NC_014722	T	6	6	23314	23319	0 %	100 %	0 %	0 %	312794766
509	NC_014722	TTGCCT	2	12	23520	23531	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	312794766
510	NC_014722	AC	4	8	23534	23541	50 %	0 %	0 %	50 %	312794766
511	NC_014722	TCC	2	6	23688	23693	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312794766
512	NC_014722	CAC	2	6	23735	23740	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312794766
513	NC_014722	ACC	2	6	23750	23755	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312794766
514	NC_014722	CAT	2	6	23809	23814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312794766
515	NC_014722	GGC	2	6	23824	23829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312794766
516	NC_014722	CA	3	6	24022	24027	50 %	0 %	0 %	50 %	312794766
517	NC_014722	CTT	2	6	24151	24156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312794766
518	NC_014722	CTC	2	6	24170	24175	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
519	NC_014722	CAG	2	6	24187	24192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
520	NC_014722	AG	5	10	24326	24335	50 %	0 %	50 %	0 %	312794767
521	NC_014722	AGC	2	6	24388	24393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312794767
522	NC_014722	GGAAC	2	10	24456	24465	40 %	0 %	40 %	20 %	312794767
523	NC_014722	AGA	2	6	24561	24566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312794767
524	NC_014722	GA	3	6	24569	24574	50 %	0 %	50 %	0 %	312794767
525	NC_014722	ACG	2	6	24598	24603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312794767
526	NC_014722	AACG	2	8	24637	24644	50 %	0 %	25 %	25 %	312794767
527	NC_014722	AGC	2	6	24653	24658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312794767
528	NC_014722	CAA	2	6	24752	24757	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312794767
529	NC_014722	TTGA	2	8	24763	24770	25 %	50 %	25 %	0 %	312794767
530	NC_014722	CAG	2	6	24887	24892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312794767
531	NC_014722	TGC	2	6	25015	25020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312794767
532	NC_014722	AAC	2	6	25068	25073	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312794767
533	NC_014722	T	6	6	25188	25193	0 %	100 %	0 %	0 %	312794767
534	NC_014722	GCG	2	6	25268	25273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312794767
535	NC_014722	CGC	2	6	25325	25330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312794767
536	NC_014722	GCTGAA	2	12	25460	25471	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	312794767
537	NC_014722	CAG	2	6	25536	25541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312794767
538	NC_014722	TCC	2	6	25573	25578	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312794767
539	NC_014722	GCTT	2	8	25690	25697	0 %	50 %	25 %	25 %	312794767
540	NC_014722	AAT	2	6	25720	25725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312794767
541	NC_014722	T	7	7	25810	25816	0 %	100 %	0 %	0 %	312794767
542	NC_014722	ATCC	2	8	25840	25847	25 %	25 %	0 %	50 %	312794767
543	NC_014722	GT	3	6	25930	25935	0 %	50 %	50 %	0 %	312794768
544	NC_014722	C	6	6	26074	26079	0 %	0 %	0 %	100 %	312794768
545	NC_014722	ATC	2	6	26106	26111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312794768
546	NC_014722	TCA	2	6	26146	26151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312794768
547	NC_014722	CGA	2	6	26203	26208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312794768
548	NC_014722	TG	3	6	26217	26222	0 %	50 %	50 %	0 %	312794768
549	NC_014722	AACGGG	2	12	26228	26239	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	312794768
550	NC_014722	CCG	2	6	26290	26295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312794768
551	NC_014722	TCG	2	6	26335	26340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312794768
552	NC_014722	GGC	2	6	26375	26380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312794768
553	NC_014722	TCG	2	6	26409	26414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312794768
554	NC_014722	GAT	2	6	26459	26464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312794768
555	NC_014722	CA	3	6	26479	26484	50 %	0 %	0 %	50 %	312794768
556	NC_014722	CCT	2	6	26518	26523	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312794768
557	NC_014722	CTT	3	9	26527	26535	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312794768
558	NC_014722	GCT	2	6	26548	26553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312794768
559	NC_014722	AACA	2	8	26580	26587	75 %	0 %	0 %	25 %	312794768
560	NC_014722	ATTG	2	8	26590	26597	25 %	50 %	25 %	0 %	312794768
561	NC_014722	AATCG	2	10	26631	26640	40 %	20 %	20 %	20 %	312794768
562	NC_014722	TA	3	6	26673	26678	50 %	50 %	0 %	0 %	312794768
563	NC_014722	TTTG	2	8	26679	26686	0 %	75 %	25 %	0 %	312794768
564	NC_014722	ATAAA	2	10	26720	26729	80 %	20 %	0 %	0 %	312794768
565	NC_014722	CG	3	6	26785	26790	0 %	0 %	50 %	50 %	312794768
566	NC_014722	T	7	7	26870	26876	0 %	100 %	0 %	0 %	312794768
567	NC_014722	CAG	2	6	26911	26916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312794768
568	NC_014722	TTG	2	6	27019	27024	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312794768
569	NC_014722	CGT	2	6	27084	27089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312794768
570	NC_014722	GT	3	6	27160	27165	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
571	NC_014722	CTG	2	6	27198	27203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312794769
572	NC_014722	CGC	2	6	27234	27239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312794769
573	NC_014722	CAA	2	6	27313	27318	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312794769
574	NC_014722	CAG	2	6	27369	27374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312794769
575	NC_014722	CGG	2	6	27378	27383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312794769
576	NC_014722	GAT	2	6	27585	27590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312794769
577	NC_014722	ATC	2	6	27622	27627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312794769
578	NC_014722	CCG	2	6	27656	27661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312794769
579	NC_014722	CTC	2	6	27710	27715	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312794769
580	NC_014722	TCCT	2	8	27718	27725	0 %	50 %	0 %	50 %	312794769
581	NC_014722	CTT	2	6	27765	27770	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312794769
582	NC_014722	CGG	2	6	27897	27902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312794769
583	NC_014722	AATGGC	2	12	28012	28023	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	312794769
584	NC_014722	CTG	2	6	28126	28131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312794769
585	NC_014722	ACGT	2	8	28152	28159	25 %	25 %	25 %	25 %	312794769
586	NC_014722	AGCA	2	8	28270	28277	50 %	0 %	25 %	25 %	312794769
587	NC_014722	TAG	2	6	28283	28288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312794769
588	NC_014722	GAC	2	6	28579	28584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312794769
589	NC_014722	ATC	2	6	28615	28620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312794769
590	NC_014722	G	6	6	28635	28640	0 %	0 %	100 %	0 %	312794769
591	NC_014722	TTC	2	6	28765	28770	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312794769
592	NC_014722	GCC	2	6	28780	28785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312794769
593	NC_014722	TG	3	6	28802	28807	0 %	50 %	50 %	0 %	312794769
594	NC_014722	CAG	2	6	28854	28859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312794769
595	NC_014722	GAT	2	6	28875	28880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312794769
596	NC_014722	ACC	2	6	28990	28995	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312794769
597	NC_014722	GGC	2	6	29024	29029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312794769
598	NC_014722	TGG	2	6	29078	29083	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312794769
599	NC_014722	CAG	2	6	29171	29176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312794769
600	NC_014722	CTT	2	6	29179	29184	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312794769
601	NC_014722	ACA	2	6	29214	29219	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312794769
602	NC_014722	GCTG	2	8	29309	29316	0 %	25 %	50 %	25 %	312794769
603	NC_014722	GCG	2	6	29433	29438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312794769
604	NC_014722	TCT	2	6	29472	29477	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312794769
605	NC_014722	GAT	2	6	29584	29589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312794769
606	NC_014722	ATT	2	6	29758	29763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312794769
607	NC_014722	TTG	2	6	29909	29914	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312794769
608	NC_014722	GCT	2	6	29941	29946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312794769
609	NC_014722	CGA	2	6	30079	30084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312794769
610	NC_014722	CAT	2	6	30088	30093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312794769
611	NC_014722	ATC	3	9	30187	30195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312794769
612	NC_014722	TC	3	6	30234	30239	0 %	50 %	0 %	50 %	312794769
613	NC_014722	CT	3	6	30262	30267	0 %	50 %	0 %	50 %	312794769
614	NC_014722	GCCC	2	8	30309	30316	0 %	0 %	25 %	75 %	312794769
615	NC_014722	GGCT	2	8	30386	30393	0 %	25 %	50 %	25 %	312794769
616	NC_014722	TGT	2	6	30394	30399	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312794769
617	NC_014722	ACA	2	6	30411	30416	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312794769
618	NC_014722	GGA	2	6	30446	30451	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312794769
619	NC_014722	TCT	2	6	30474	30479	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312794769
620	NC_014722	GCG	2	6	30486	30491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312794769
621	NC_014722	CGA	2	6	30492	30497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312794769
622	NC_014722	ATG	2	6	30587	30592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312794769
623	NC_014722	CGG	3	9	30640	30648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312794769
624	NC_014722	CGA	2	6	30658	30663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312794769
625	NC_014722	ATT	2	6	30739	30744	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312794769
626	NC_014722	CCG	2	6	30758	30763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312794769
627	NC_014722	GCC	2	6	30793	30798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312794769
628	NC_014722	TTG	2	6	30890	30895	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312794769
629	NC_014722	CAT	2	6	30997	31002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312794769
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651	NC_014722	GCT	2	6	32099	32104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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697	NC_014722	CGCAC	2	10	34767	34776	20 %	0 %	20 %	60 %	312794772
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758	NC_014722	ATCA	2	8	37988	37995	50 %	25 %	0 %	25 %	312794776
759	NC_014722	ATC	2	6	38072	38077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312794776
760	NC_014722	GATC	2	8	38212	38219	25 %	25 %	25 %	25 %	312794776
761	NC_014722	AGT	2	6	38280	38285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312794776
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763	NC_014722	TTA	2	6	38349	38354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312794776
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766	NC_014722	A	6	6	38608	38613	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
767	NC_014722	CAA	2	6	38619	38624	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
768	NC_014722	TCT	2	6	38675	38680	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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997	NC_014722	GCA	2	6	49436	49441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
998	NC_014722	GCACC	2	10	49445	49454	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
999	NC_014722	GAT	2	6	49463	49468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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