MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Burkholderia rhizoxinica HKI 454 plasmid pBRH01

Total Repeats: 17624

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_014718	TGGC	2	8	187893	187900	0 %	25 %	50 %	25 %	312602275
4002	NC_014718	CTGA	2	8	187932	187939	25 %	25 %	25 %	25 %	312602275
4003	NC_014718	TGG	2	6	187954	187959	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312602275
4004	NC_014718	GCT	2	6	187979	187984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602275
4005	NC_014718	TTG	2	6	188040	188045	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312602275
4006	NC_014718	CTTG	2	8	188058	188065	0 %	50 %	25 %	25 %	312602275
4007	NC_014718	GGT	2	6	188072	188077	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312602275
4008	NC_014718	GCA	2	6	188113	188118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602275
4009	NC_014718	CGG	2	6	188146	188151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602275
4010	NC_014718	GCG	2	6	188161	188166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602275
4011	NC_014718	TGC	2	6	188170	188175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602275
4012	NC_014718	GTT	2	6	188186	188191	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312602275
4013	NC_014718	CA	3	6	188235	188240	50 %	0 %	0 %	50 %	312602275
4014	NC_014718	ATC	2	6	188248	188253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312602275
4015	NC_014718	ATGC	2	8	188293	188300	25 %	25 %	25 %	25 %	312602276
4016	NC_014718	CGA	2	6	188337	188342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602276
4017	NC_014718	GGC	2	6	188371	188376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602276
4018	NC_014718	CGTG	2	8	188415	188422	0 %	25 %	50 %	25 %	312602276
4019	NC_014718	CGG	2	6	188424	188429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602276
4020	NC_014718	CGTG	2	8	188487	188494	0 %	25 %	50 %	25 %	312602276
4021	NC_014718	TCAG	2	8	188555	188562	25 %	25 %	25 %	25 %	312602276
4022	NC_014718	GGC	2	6	188601	188606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602276
4023	NC_014718	GTT	2	6	188655	188660	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312602276
4024	NC_014718	CGC	2	6	188687	188692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602276
4025	NC_014718	CCCGG	2	10	188731	188740	0 %	0 %	40 %	60 %	312602276
4026	NC_014718	CAAA	2	8	188748	188755	75 %	0 %	0 %	25 %	312602276
4027	NC_014718	AGC	2	6	188822	188827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602276
4028	NC_014718	TGGTG	2	10	188829	188838	0 %	40 %	60 %	0 %	312602276
4029	NC_014718	TGC	2	6	188930	188935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602276
4030	NC_014718	GGT	2	6	188949	188954	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312602276
4031	NC_014718	ACG	2	6	188981	188986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602276
4032	NC_014718	TCCG	2	8	189032	189039	0 %	25 %	25 %	50 %	312602276
4033	NC_014718	ATTTG	2	10	189117	189126	20 %	60 %	20 %	0 %	312602276
4034	NC_014718	TACA	2	8	189130	189137	50 %	25 %	0 %	25 %	312602276
4035	NC_014718	CGAT	2	8	189224	189231	25 %	25 %	25 %	25 %	312602277
4036	NC_014718	TGC	2	6	189264	189269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602277
4037	NC_014718	GAAA	2	8	189281	189288	75 %	0 %	25 %	0 %	312602277
4038	NC_014718	CGC	2	6	189308	189313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602277
4039	NC_014718	CG	3	6	189320	189325	0 %	0 %	50 %	50 %	312602277
4040	NC_014718	CCAG	2	8	189332	189339	25 %	0 %	25 %	50 %	312602277
4041	NC_014718	GCAT	2	8	189454	189461	25 %	25 %	25 %	25 %	312602277
4042	NC_014718	ACG	2	6	189486	189491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602277
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4045	NC_014718	ACG	2	6	189628	189633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602277
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4050	NC_014718	TCT	2	6	189832	189837	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312602277
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4052	NC_014718	CAGC	2	8	189962	189969	25 %	0 %	25 %	50 %	312602277
4053	NC_014718	CGG	2	6	190058	190063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602277
4054	NC_014718	GGC	2	6	190107	190112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602277
4055	NC_014718	CGAT	2	8	190123	190130	25 %	25 %	25 %	25 %	312602277
4056	NC_014718	CCGGA	2	10	190203	190212	20 %	0 %	40 %	40 %	312602277
4057	NC_014718	CCGG	2	8	190323	190330	0 %	0 %	50 %	50 %	312602277
4058	NC_014718	ATC	2	6	190347	190352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312602277
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4061	NC_014718	GCTA	2	8	190428	190435	25 %	25 %	25 %	25 %	312602277
4062	NC_014718	GCCG	2	8	190439	190446	0 %	0 %	50 %	50 %	312602277
4063	NC_014718	ACA	2	6	190447	190452	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312602277
4064	NC_014718	ATG	2	6	190494	190499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312602277
4065	NC_014718	CGT	2	6	190532	190537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602277
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4069	NC_014718	CGT	2	6	190747	190752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602278
4070	NC_014718	CGG	2	6	190831	190836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602278
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4082	NC_014718	TGG	2	6	191293	191298	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312602278
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4089	NC_014718	ACGCAG	2	12	191556	191567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602278
4090	NC_014718	TCA	2	6	191593	191598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312602278
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4093	NC_014718	CGC	2	6	191741	191746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602278
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4097	NC_014718	CG	3	6	191977	191982	0 %	0 %	50 %	50 %	312602278
4098	NC_014718	CG	3	6	192051	192056	0 %	0 %	50 %	50 %	312602278
4099	NC_014718	AGC	2	6	192151	192156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602278
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4102	NC_014718	CGC	3	9	192229	192237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602278
4103	NC_014718	CG	4	8	192281	192288	0 %	0 %	50 %	50 %	312602278
4104	NC_014718	GTCGC	2	10	192303	192312	0 %	20 %	40 %	40 %	312602278
4105	NC_014718	GCT	2	6	192359	192364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602278
4106	NC_014718	GGC	2	6	192365	192370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602278
4107	NC_014718	GCAT	2	8	192586	192593	25 %	25 %	25 %	25 %	312602278
4108	NC_014718	ATCC	2	8	192663	192670	25 %	25 %	0 %	50 %	312602278
4109	NC_014718	GCT	2	6	192691	192696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602278
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4112	NC_014718	GGGCC	2	10	192924	192933	0 %	0 %	60 %	40 %	312602278
4113	NC_014718	GC	3	6	192973	192978	0 %	0 %	50 %	50 %	312602278
4114	NC_014718	CCG	2	6	192987	192992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602278
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4117	NC_014718	GCA	2	6	193198	193203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602279
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4120	NC_014718	GCCG	2	8	193267	193274	0 %	0 %	50 %	50 %	312602279
4121	NC_014718	CGC	2	6	193278	193283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602279
4122	NC_014718	GTG	2	6	193289	193294	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312602279
4123	NC_014718	AGC	2	6	193320	193325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602279
4124	NC_014718	GCT	2	6	193357	193362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602279
4125	NC_014718	TGA	2	6	193407	193412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312602279
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4127	NC_014718	GCT	2	6	193489	193494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602279
4128	NC_014718	GCA	2	6	193507	193512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602279
4129	NC_014718	TCG	2	6	193526	193531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602279
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4147	NC_014718	GCTC	2	8	194257	194264	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4148	NC_014718	CGC	2	6	194270	194275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4149	NC_014718	GCGA	2	8	194400	194407	25 %	0 %	50 %	25 %	312602280
4150	NC_014718	CG	3	6	194461	194466	0 %	0 %	50 %	50 %	312602280
4151	NC_014718	GC	3	6	194467	194472	0 %	0 %	50 %	50 %	312602280
4152	NC_014718	TGCG	2	8	194604	194611	0 %	25 %	50 %	25 %	312602280
4153	NC_014718	GTGGAT	5	30	194612	194641	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	312602280
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4160	NC_014718	CGC	2	6	194833	194838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602280
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4164	NC_014718	GATC	2	8	195083	195090	25 %	25 %	25 %	25 %	312602280
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4178	NC_014718	GC	3	6	195521	195526	0 %	0 %	50 %	50 %	312602280
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4180	NC_014718	AGCGC	2	10	195563	195572	20 %	0 %	40 %	40 %	312602280
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4182	NC_014718	GC	3	6	195647	195652	0 %	0 %	50 %	50 %	312602280
4183	NC_014718	GCT	2	6	195674	195679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602280
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4188	NC_014718	GC	3	6	196025	196030	0 %	0 %	50 %	50 %	312602280
4189	NC_014718	CAG	2	6	196066	196071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602280
4190	NC_014718	CAG	2	6	196158	196163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602280
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4193	NC_014718	CAC	2	6	196445	196450	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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4195	NC_014718	CGGC	2	8	196642	196649	0 %	0 %	50 %	50 %	312602281
4196	NC_014718	TGC	2	6	196652	196657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4198	NC_014718	AAT	2	6	196835	196840	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4199	NC_014718	GCA	2	6	196866	196871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4200	NC_014718	CG	4	8	196971	196978	0 %	0 %	50 %	50 %	312602282
4201	NC_014718	TGC	2	6	197091	197096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602282
4202	NC_014718	CGA	2	6	197128	197133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602282
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4231	NC_014718	CTG	2	6	198388	198393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602284
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4233	NC_014718	TGC	2	6	198476	198481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602284
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4236	NC_014718	CTGCG	2	10	198614	198623	0 %	20 %	40 %	40 %	312602284
4237	NC_014718	CG	3	6	198622	198627	0 %	0 %	50 %	50 %	312602284
4238	NC_014718	CGGC	2	8	198683	198690	0 %	0 %	50 %	50 %	312602284
4239	NC_014718	GCC	2	6	198718	198723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602284
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4241	NC_014718	GCC	2	6	198794	198799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602284
4242	NC_014718	CCG	2	6	198804	198809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602284
4243	NC_014718	CGG	2	6	198813	198818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602284
4244	NC_014718	GCA	2	6	198840	198845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602284
4245	NC_014718	TGCCG	2	10	198953	198962	0 %	20 %	40 %	40 %	312602284
4246	NC_014718	GC	4	8	198972	198979	0 %	0 %	50 %	50 %	312602284
4247	NC_014718	GGC	2	6	198983	198988	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602284
4248	NC_014718	GCC	2	6	199001	199006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602284
4249	NC_014718	GC	3	6	199008	199013	0 %	0 %	50 %	50 %	312602284
4250	NC_014718	GGC	2	6	199045	199050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602284
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4261	NC_014718	CGG	2	6	199321	199326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602284
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4265	NC_014718	GCG	3	9	199430	199438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602284
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4267	NC_014718	GCC	3	9	199451	199459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602284
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4271	NC_014718	GCGCT	2	10	199561	199570	0 %	20 %	40 %	40 %	312602284
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4277	NC_014718	GGTG	2	8	199759	199766	0 %	25 %	75 %	0 %	312602284
4278	NC_014718	GAA	2	6	199798	199803	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312602284
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4283	NC_014718	TCG	2	6	199897	199902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602285
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4286	NC_014718	TGC	2	6	200012	200017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602285
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4298	NC_014718	ATC	2	6	200317	200322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312602285
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4302	NC_014718	TCGA	2	8	200464	200471	25 %	25 %	25 %	25 %	312602285
4303	NC_014718	GCC	2	6	200496	200501	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602285
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4312	NC_014718	GTC	2	6	201024	201029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602285
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4314	NC_014718	GAC	2	6	201075	201080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602285
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4316	NC_014718	GCGCG	2	10	201132	201141	0 %	0 %	60 %	40 %	312602285
4317	NC_014718	GATC	2	8	201167	201174	25 %	25 %	25 %	25 %	312602285
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4329	NC_014718	GATCAC	2	12	201585	201596	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	312602285
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4333	NC_014718	CAT	2	6	201824	201829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312602285
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4337	NC_014718	TGCG	2	8	202099	202106	0 %	25 %	50 %	25 %	312602285
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4345	NC_014718	GTT	2	6	202278	202283	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312602285
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4348	NC_014718	GTT	2	6	202418	202423	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312602285
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4353	NC_014718	TCG	2	6	202627	202632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602285
4354	NC_014718	GGC	2	6	202657	202662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602285
4355	NC_014718	TCT	2	6	202685	202690	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312602285
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4357	NC_014718	CAG	2	6	202755	202760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602285
4358	NC_014718	CGGT	2	8	202831	202838	0 %	25 %	50 %	25 %	312602285
4359	NC_014718	TGAAGG	2	12	202901	202912	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	312602285
4360	NC_014718	ACC	2	6	202984	202989	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312602285
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4362	NC_014718	GCG	2	6	203101	203106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602286
4363	NC_014718	CGC	2	6	203146	203151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602286
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4365	NC_014718	ACC	2	6	203190	203195	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312602286
4366	NC_014718	TTGT	2	8	203255	203262	0 %	75 %	25 %	0 %	312602286
4367	NC_014718	CG	3	6	203269	203274	0 %	0 %	50 %	50 %	312602286
4368	NC_014718	CG	3	6	203287	203292	0 %	0 %	50 %	50 %	312602286
4369	NC_014718	CGTT	2	8	203328	203335	0 %	50 %	25 %	25 %	312602286
4370	NC_014718	TGA	2	6	203337	203342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312602286
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4373	NC_014718	CGA	2	6	203731	203736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602286
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4392	NC_014718	CGT	2	6	204410	204415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4403	NC_014718	TGG	2	6	204983	204988	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312602287
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4411	NC_014718	GC	3	6	205127	205132	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4412	NC_014718	GC	3	6	205179	205184	0 %	0 %	50 %	50 %	312602288
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4429	NC_014718	CG	3	6	205691	205696	0 %	0 %	50 %	50 %	312602290
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4488	NC_014718	GAT	2	6	208184	208189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312602291
4489	NC_014718	GC	3	6	208243	208248	0 %	0 %	50 %	50 %	312602291
4490	NC_014718	GCCG	2	8	208280	208287	0 %	0 %	50 %	50 %	312602291
4491	NC_014718	GGC	2	6	208339	208344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602291
4492	NC_014718	AGC	2	6	208347	208352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602291
4493	NC_014718	CGA	2	6	208427	208432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602291
4494	NC_014718	ACC	2	6	208464	208469	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312602291
4495	NC_014718	TCG	2	6	208518	208523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602291
4496	NC_014718	GCC	2	6	208533	208538	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602291
4497	NC_014718	CG	3	6	208587	208592	0 %	0 %	50 %	50 %	312602291
4498	NC_014718	CG	4	8	208606	208613	0 %	0 %	50 %	50 %	312602291
4499	NC_014718	CCAG	2	8	208654	208661	25 %	0 %	25 %	50 %	312602291
4500	NC_014718	CAG	2	6	208724	208729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602291

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