MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Burkholderia rhizoxinica HKI 454 plasmid pBRH01

Total Repeats: 17624

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_014718	GCTT	2	8	118252	118259	0 %	50 %	25 %	25 %	312602207
2502	NC_014718	TTCG	2	8	118285	118292	0 %	50 %	25 %	25 %	312602207
2503	NC_014718	GCAAG	2	10	118392	118401	40 %	0 %	40 %	20 %	312602207
2504	NC_014718	GGC	2	6	118416	118421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602207
2505	NC_014718	GCC	2	6	118457	118462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602207
2506	NC_014718	CTT	2	6	118470	118475	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312602207
2507	NC_014718	TTGC	2	8	118495	118502	0 %	50 %	25 %	25 %	312602207
2508	NC_014718	AATT	2	8	118508	118515	50 %	50 %	0 %	0 %	312602207
2509	NC_014718	GGC	2	6	118526	118531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602207
2510	NC_014718	GTT	2	6	118557	118562	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312602207
2511	NC_014718	GTGAT	2	10	118610	118619	20 %	40 %	40 %	0 %	312602207
2512	NC_014718	CCG	2	6	118624	118629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602207
2513	NC_014718	TTG	2	6	118712	118717	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312602207
2514	NC_014718	TCA	2	6	118791	118796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312602207
2515	NC_014718	TACT	2	8	118822	118829	25 %	50 %	0 %	25 %	312602207
2516	NC_014718	GCA	2	6	118887	118892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602207
2517	NC_014718	AGT	2	6	118959	118964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312602207
2518	NC_014718	GGCGC	2	10	119037	119046	0 %	0 %	60 %	40 %	312602207
2519	NC_014718	CTG	2	6	119089	119094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602207
2520	NC_014718	GCA	4	12	119139	119150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602207
2521	NC_014718	GTGA	2	8	119281	119288	25 %	25 %	50 %	0 %	312602207
2522	NC_014718	T	6	6	119305	119310	0 %	100 %	0 %	0 %	312602207
2523	NC_014718	GGA	2	6	119331	119336	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312602207
2524	NC_014718	GGCT	2	8	119354	119361	0 %	25 %	50 %	25 %	312602207
2525	NC_014718	TGCG	2	8	119432	119439	0 %	25 %	50 %	25 %	312602207
2526	NC_014718	CG	3	6	119502	119507	0 %	0 %	50 %	50 %	312602207
2527	NC_014718	AGCG	2	8	119508	119515	25 %	0 %	50 %	25 %	312602207
2528	NC_014718	GTG	2	6	119527	119532	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312602207
2529	NC_014718	AGG	2	6	119562	119567	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312602207
2530	NC_014718	GA	3	6	119654	119659	50 %	0 %	50 %	0 %	312602207
2531	NC_014718	CGCTG	2	10	119673	119682	0 %	20 %	40 %	40 %	312602207
2532	NC_014718	GAACAT	2	12	119686	119697	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	312602207
2533	NC_014718	GTG	2	6	119726	119731	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312602207
2534	NC_014718	CGG	2	6	119735	119740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602207
2535	NC_014718	GCT	2	6	119760	119765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602207
2536	NC_014718	GCT	2	6	119823	119828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602207
2537	NC_014718	GCA	2	6	119949	119954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602207
2538	NC_014718	AC	3	6	119996	120001	50 %	0 %	0 %	50 %	312602207
2539	NC_014718	GCA	2	6	120006	120011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602207
2540	NC_014718	TGC	2	6	120020	120025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602207
2541	NC_014718	TTG	2	6	120043	120048	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312602207
2542	NC_014718	GC	4	8	120190	120197	0 %	0 %	50 %	50 %	312602207
2543	NC_014718	GTC	2	6	120283	120288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602207
2544	NC_014718	GGCG	2	8	120309	120316	0 %	0 %	75 %	25 %	312602207
2545	NC_014718	GCG	2	6	120406	120411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602207
2546	NC_014718	GGC	2	6	120417	120422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602207
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2548	NC_014718	CGA	2	6	120636	120641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602207
2549	NC_014718	GGC	2	6	120718	120723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602207
2550	NC_014718	TCA	2	6	120728	120733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312602207
2551	NC_014718	GCCA	2	8	120841	120848	25 %	0 %	25 %	50 %	312602207
2552	NC_014718	TGG	2	6	120891	120896	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312602207
2553	NC_014718	GCAGA	2	10	120943	120952	40 %	0 %	40 %	20 %	312602207
2554	NC_014718	CAG	2	6	121099	121104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602207
2555	NC_014718	TGG	2	6	121140	121145	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312602207
2556	NC_014718	GC	3	6	121231	121236	0 %	0 %	50 %	50 %	312602207
2557	NC_014718	TCAAG	2	10	121308	121317	40 %	20 %	20 %	20 %	312602207
2558	NC_014718	ACG	2	6	121382	121387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602207
2559	NC_014718	GGT	2	6	121389	121394	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312602207
2560	NC_014718	TGG	2	6	121439	121444	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312602207
2561	NC_014718	GCT	2	6	121674	121679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602207
2562	NC_014718	CGACA	2	10	121699	121708	40 %	0 %	20 %	40 %	312602207
2563	NC_014718	CTT	2	6	121710	121715	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312602207
2564	NC_014718	GCT	2	6	121734	121739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602207
2565	NC_014718	CAC	2	6	121767	121772	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312602207
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2568	NC_014718	C	6	6	121911	121916	0 %	0 %	0 %	100 %	312602207
2569	NC_014718	TCCA	2	8	121928	121935	25 %	25 %	0 %	50 %	312602207
2570	NC_014718	TCG	2	6	122032	122037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602207
2571	NC_014718	GGCGAT	2	12	122055	122066	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	312602207
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2573	NC_014718	AAC	2	6	122171	122176	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312602207
2574	NC_014718	ATC	2	6	122270	122275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312602207
2575	NC_014718	GTAG	2	8	122293	122300	25 %	25 %	50 %	0 %	312602207
2576	NC_014718	TGC	2	6	122345	122350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602207
2577	NC_014718	AAT	2	6	122353	122358	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312602207
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2579	NC_014718	TGT	2	6	122405	122410	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312602207
2580	NC_014718	TGCC	2	8	122508	122515	0 %	25 %	25 %	50 %	312602207
2581	NC_014718	A	7	7	122614	122620	100 %	0 %	0 %	0 %	312602207
2582	NC_014718	CTAAT	2	10	122623	122632	40 %	40 %	0 %	20 %	312602207
2583	NC_014718	AG	3	6	122652	122657	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2584	NC_014718	GCT	2	6	122698	122703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2585	NC_014718	GTC	2	6	122717	122722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2586	NC_014718	TCA	2	6	122738	122743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2587	NC_014718	T	7	7	122765	122771	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2588	NC_014718	T	6	6	122782	122787	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2589	NC_014718	CAC	2	6	122807	122812	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2590	NC_014718	ATTT	2	8	122880	122887	25 %	75 %	0 %	0 %	312602208
2591	NC_014718	GAT	2	6	122917	122922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312602208
2592	NC_014718	TTG	2	6	122930	122935	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312602208
2593	NC_014718	ATG	3	9	122956	122964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312602208
2594	NC_014718	GCG	2	6	123136	123141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2595	NC_014718	GC	3	6	123148	123153	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2596	NC_014718	GTTCT	2	10	123197	123206	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
2597	NC_014718	TCG	2	6	123277	123282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2598	NC_014718	CG	3	6	123322	123327	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2599	NC_014718	CAT	2	6	123368	123373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312602209
2600	NC_014718	CGC	2	6	123398	123403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602209
2601	NC_014718	CAA	2	6	123405	123410	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312602209
2602	NC_014718	AACGT	2	10	123460	123469	40 %	20 %	20 %	20 %	312602209
2603	NC_014718	GCC	2	6	123504	123509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602209
2604	NC_014718	TCGC	2	8	123550	123557	0 %	25 %	25 %	50 %	312602209
2605	NC_014718	CG	3	6	123637	123642	0 %	0 %	50 %	50 %	312602209
2606	NC_014718	GC	3	6	123808	123813	0 %	0 %	50 %	50 %	312602209
2607	NC_014718	GTC	2	6	123876	123881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602209
2608	NC_014718	GAC	2	6	123948	123953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602209
2609	NC_014718	CGT	2	6	123963	123968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602209
2610	NC_014718	CAT	2	6	123975	123980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312602209
2611	NC_014718	CGG	2	6	124037	124042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602209
2612	NC_014718	GCA	2	6	124048	124053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602209
2613	NC_014718	GAA	2	6	124094	124099	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312602209
2614	NC_014718	TG	3	6	124105	124110	0 %	50 %	50 %	0 %	312602209
2615	NC_014718	CCT	2	6	124204	124209	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312602209
2616	NC_014718	AGA	2	6	124235	124240	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312602209
2617	NC_014718	GTGG	2	8	124270	124277	0 %	25 %	75 %	0 %	312602209
2618	NC_014718	GCG	2	6	124321	124326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602209
2619	NC_014718	GATGG	2	10	124339	124348	20 %	20 %	60 %	0 %	312602209
2620	NC_014718	CTA	2	6	124352	124357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312602209
2621	NC_014718	GCCT	2	8	124365	124372	0 %	25 %	25 %	50 %	312602209
2622	NC_014718	A	6	6	124542	124547	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2623	NC_014718	GCC	2	6	124548	124553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2624	NC_014718	GAC	2	6	124554	124559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2625	NC_014718	GCC	2	6	124570	124575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2626	NC_014718	ATG	2	6	124578	124583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312602210
2627	NC_014718	TCA	2	6	124644	124649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312602210
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2747	NC_014718	CGC	2	6	131317	131322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602218
2748	NC_014718	GTC	2	6	131324	131329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602218
2749	NC_014718	GCA	2	6	131352	131357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602218
2750	NC_014718	CCTT	2	8	131432	131439	0 %	50 %	0 %	50 %	312602218
2751	NC_014718	TG	3	6	131450	131455	0 %	50 %	50 %	0 %	312602218
2752	NC_014718	GCC	3	9	131573	131581	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602218
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2757	NC_014718	GCA	2	6	131765	131770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602219
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2761	NC_014718	ATGC	2	8	131957	131964	25 %	25 %	25 %	25 %	312602221
2762	NC_014718	GCGCC	2	10	131991	132000	0 %	0 %	40 %	60 %	312602221
2763	NC_014718	CGC	3	9	132020	132028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602221
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2771	NC_014718	TCG	2	6	132213	132218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602221
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2774	NC_014718	TCG	2	6	132356	132361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602221
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2777	NC_014718	GTG	2	6	132450	132455	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2778	NC_014718	AGCG	2	8	132503	132510	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2779	NC_014718	GGC	2	6	132511	132516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2780	NC_014718	CTAG	2	8	132521	132528	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2781	NC_014718	GCG	2	6	132615	132620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602222
2782	NC_014718	TGC	2	6	132625	132630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602222
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2804	NC_014718	GCGTC	2	10	133762	133771	0 %	20 %	40 %	40 %	312602224
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2825	NC_014718	TGC	2	6	134522	134527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602225
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2831	NC_014718	GCGCT	2	10	134758	134767	0 %	20 %	40 %	40 %	312602225
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2838	NC_014718	GCG	2	6	135133	135138	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2839	NC_014718	CTG	2	6	135176	135181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2841	NC_014718	GCTG	2	8	135239	135246	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2842	NC_014718	CTG	2	6	135264	135269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2843	NC_014718	CG	3	6	135390	135395	0 %	0 %	50 %	50 %	312602226
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2852	NC_014718	ACG	2	6	135643	135648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602226
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2854	NC_014718	CAG	2	6	135753	135758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602226
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2857	NC_014718	CTCG	2	8	135839	135846	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2858	NC_014718	CAG	2	6	135903	135908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602227
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2861	NC_014718	CGGC	2	8	136039	136046	0 %	0 %	50 %	50 %	312602227
2862	NC_014718	AAGA	2	8	136050	136057	75 %	0 %	25 %	0 %	312602227
2863	NC_014718	GGC	2	6	136073	136078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602227
2864	NC_014718	GCGG	2	8	136082	136089	0 %	0 %	75 %	25 %	312602227
2865	NC_014718	GGCG	2	8	136100	136107	0 %	0 %	75 %	25 %	312602227
2866	NC_014718	GGT	2	6	136109	136114	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312602227
2867	NC_014718	GAC	2	6	136122	136127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602227
2868	NC_014718	CGG	2	6	136207	136212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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2993	NC_014718	GCC	2	6	140996	141001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602232
2994	NC_014718	AGC	2	6	141091	141096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602232
2995	NC_014718	TGCC	2	8	141108	141115	0 %	25 %	25 %	50 %	312602232
2996	NC_014718	CTCGG	2	10	141124	141133	0 %	20 %	40 %	40 %	312602232
2997	NC_014718	ACG	2	6	141145	141150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602232
2998	NC_014718	GGT	2	6	141189	141194	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312602232
2999	NC_014718	GCG	2	6	141195	141200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602232
3000	NC_014718	GCTT	2	8	141220	141227	0 %	50 %	25 %	25 %	312602232

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