MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Burkholderia rhizoxinica HKI 454 plasmid pBRH01

Total Repeats: 17624

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_014718	GA	4	8	47445	47452	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_014718	GCAAA	2	10	47456	47465	60 %	0 %	20 %	20 %	312602139
1003	NC_014718	GGA	2	6	47525	47530	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312602139
1004	NC_014718	CTG	2	6	47586	47591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602139
1005	NC_014718	GCT	2	6	47597	47602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602139
1006	NC_014718	GCAGC	2	10	47637	47646	20 %	0 %	40 %	40 %	312602139
1007	NC_014718	CGG	2	6	47677	47682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602139
1008	NC_014718	GTC	2	6	47702	47707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602139
1009	NC_014718	GAT	2	6	47726	47731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312602139
1010	NC_014718	CTCG	2	8	47841	47848	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1011	NC_014718	AGC	2	6	47899	47904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602140
1012	NC_014718	ACGT	2	8	47946	47953	25 %	25 %	25 %	25 %	312602140
1013	NC_014718	GCC	2	6	47963	47968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602140
1014	NC_014718	TGCGT	2	10	47984	47993	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1015	NC_014718	GGCG	2	8	48003	48010	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1016	NC_014718	CG	3	6	48057	48062	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1017	NC_014718	GCAC	2	8	48177	48184	25 %	0 %	25 %	50 %	312602141
1018	NC_014718	GAT	2	6	48203	48208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312602141
1019	NC_014718	TGG	2	6	48252	48257	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312602141
1020	NC_014718	CGCGG	2	10	48326	48335	0 %	0 %	60 %	40 %	312602141
1021	NC_014718	GC	3	6	48340	48345	0 %	0 %	50 %	50 %	312602141
1022	NC_014718	GTC	2	6	48368	48373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602141
1023	NC_014718	GTT	2	6	48394	48399	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312602141
1024	NC_014718	CGT	2	6	48442	48447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602141
1025	NC_014718	ACC	2	6	48458	48463	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312602141
1026	NC_014718	CCA	2	6	48511	48516	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312602141
1027	NC_014718	TCT	2	6	48540	48545	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312602141
1028	NC_014718	CGGCG	2	10	48615	48624	0 %	0 %	60 %	40 %	312602142
1029	NC_014718	CGC	2	6	48631	48636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602142
1030	NC_014718	ATC	2	6	48674	48679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312602142
1031	NC_014718	CG	3	6	48680	48685	0 %	0 %	50 %	50 %	312602142
1032	NC_014718	GC	3	6	48690	48695	0 %	0 %	50 %	50 %	312602142
1033	NC_014718	TGC	2	6	48704	48709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602142
1034	NC_014718	G	6	6	48739	48744	0 %	0 %	100 %	0 %	312602142
1035	NC_014718	CG	3	6	48760	48765	0 %	0 %	50 %	50 %	312602142
1036	NC_014718	TGC	2	6	48876	48881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602142
1037	NC_014718	CCG	2	6	49000	49005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1038	NC_014718	CGC	2	6	49028	49033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1039	NC_014718	GCA	3	9	49040	49048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602143
1040	NC_014718	CGGC	2	8	49055	49062	0 %	0 %	50 %	50 %	312602143
1041	NC_014718	TCA	2	6	49103	49108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312602143
1042	NC_014718	CGC	3	9	49205	49213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602143
1043	NC_014718	CG	3	6	49218	49223	0 %	0 %	50 %	50 %	312602143
1044	NC_014718	GCC	3	9	49246	49254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602143
1045	NC_014718	CGG	2	6	49268	49273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602143
1046	NC_014718	CAT	2	6	49281	49286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312602143
1047	NC_014718	CGCA	2	8	49314	49321	25 %	0 %	25 %	50 %	312602143
1048	NC_014718	CAG	2	6	49323	49328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602143
1049	NC_014718	CGGC	2	8	49376	49383	0 %	0 %	50 %	50 %	312602143
1050	NC_014718	TGC	2	6	49411	49416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602143
1051	NC_014718	TCG	2	6	49571	49576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602143
1052	NC_014718	ATC	2	6	49591	49596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312602143
1053	NC_014718	GCA	2	6	49604	49609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602143
1054	NC_014718	CCG	2	6	49666	49671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602143
1055	NC_014718	TCG	2	6	49678	49683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602143
1056	NC_014718	GCACC	2	10	49763	49772	20 %	0 %	20 %	60 %	312602143
1057	NC_014718	GAT	2	6	49794	49799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312602143
1058	NC_014718	CG	3	6	49847	49852	0 %	0 %	50 %	50 %	312602143
1059	NC_014718	CCA	2	6	49868	49873	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312602143
1060	NC_014718	GCC	2	6	49903	49908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602143
1061	NC_014718	AACG	2	8	49938	49945	50 %	0 %	25 %	25 %	312602143
1062	NC_014718	GCA	3	9	50096	50104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602143
1063	NC_014718	CGCAC	2	10	50113	50122	20 %	0 %	20 %	60 %	312602143
1064	NC_014718	GCT	2	6	50126	50131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602143
1065	NC_014718	GAA	2	6	50160	50165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312602143
1066	NC_014718	CCG	2	6	50182	50187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602143
1067	NC_014718	TGAG	2	8	50220	50227	25 %	25 %	50 %	0 %	312602143
1068	NC_014718	GCA	2	6	50294	50299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602144
1069	NC_014718	CCT	2	6	50324	50329	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312602144
1070	NC_014718	CCG	2	6	50371	50376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602144
1071	NC_014718	GCA	2	6	50498	50503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602144
1072	NC_014718	CGA	2	6	50552	50557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602144
1073	NC_014718	GGC	2	6	50589	50594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602144
1074	NC_014718	CGA	2	6	50604	50609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602144
1075	NC_014718	TTGC	2	8	50649	50656	0 %	50 %	25 %	25 %	312602144
1076	NC_014718	GC	3	6	50655	50660	0 %	0 %	50 %	50 %	312602144
1077	NC_014718	CG	4	8	50714	50721	0 %	0 %	50 %	50 %	312602144
1078	NC_014718	CG	3	6	50790	50795	0 %	0 %	50 %	50 %	312602144
1079	NC_014718	GGT	2	6	50807	50812	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312602144
1080	NC_014718	CGC	2	6	50813	50818	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602144
1081	NC_014718	TCT	2	6	50842	50847	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312602144
1082	NC_014718	CGG	2	6	50879	50884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602144
1083	NC_014718	GGT	2	6	50925	50930	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312602144
1084	NC_014718	TGT	2	6	50933	50938	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312602144
1085	NC_014718	CGG	2	6	51006	51011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602144
1086	NC_014718	TGC	2	6	51026	51031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602144
1087	NC_014718	CTG	2	6	51060	51065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602144
1088	NC_014718	ACC	2	6	51265	51270	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312602144
1089	NC_014718	GCG	3	9	51272	51280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602144
1090	NC_014718	GCTT	2	8	51292	51299	0 %	50 %	25 %	25 %	312602144
1091	NC_014718	ACA	2	6	51341	51346	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312602144
1092	NC_014718	CGA	2	6	51371	51376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602144
1093	NC_014718	GC	3	6	51401	51406	0 %	0 %	50 %	50 %	312602144
1094	NC_014718	CGA	2	6	51440	51445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602144
1095	NC_014718	GCA	2	6	51473	51478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602144
1096	NC_014718	CAG	2	6	51582	51587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602144
1097	NC_014718	GTT	2	6	51612	51617	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312602144
1098	NC_014718	GGAC	2	8	51747	51754	25 %	0 %	50 %	25 %	312602144
1099	NC_014718	GT	3	6	51813	51818	0 %	50 %	50 %	0 %	312602144
1100	NC_014718	TTC	2	6	51844	51849	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312602144
1101	NC_014718	TCG	2	6	51877	51882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602144
1102	NC_014718	TCG	2	6	51919	51924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602144
1103	NC_014718	CG	3	6	51977	51982	0 %	0 %	50 %	50 %	312602145
1104	NC_014718	CGA	2	6	52129	52134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602145
1105	NC_014718	ACG	2	6	52153	52158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602145
1106	NC_014718	CG	3	6	52157	52162	0 %	0 %	50 %	50 %	312602145
1107	NC_014718	GCCC	2	8	52189	52196	0 %	0 %	25 %	75 %	312602145
1108	NC_014718	CGGG	2	8	52342	52349	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1109	NC_014718	CTT	2	6	52373	52378	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1110	NC_014718	GCG	2	6	52412	52417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1111	NC_014718	CG	3	6	52427	52432	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1112	NC_014718	TTC	2	6	52434	52439	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1113	NC_014718	CGC	2	6	52460	52465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1114	NC_014718	CGC	2	6	52537	52542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602146
1115	NC_014718	CGC	2	6	52547	52552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602146
1116	NC_014718	TCGCG	2	10	52555	52564	0 %	20 %	40 %	40 %	312602146
1117	NC_014718	CGA	2	6	52579	52584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602146
1118	NC_014718	GAC	2	6	52613	52618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602146
1119	NC_014718	CGT	2	6	52750	52755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602146
1120	NC_014718	GC	4	8	52785	52792	0 %	0 %	50 %	50 %	312602146
1121	NC_014718	GAA	2	6	52796	52801	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312602146
1122	NC_014718	GAT	2	6	52918	52923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312602147
1123	NC_014718	GCT	2	6	52938	52943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602147
1124	NC_014718	ATG	2	6	52946	52951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312602147
1125	NC_014718	CCAG	2	8	52960	52967	25 %	0 %	25 %	50 %	312602147
1126	NC_014718	GC	3	6	52972	52977	0 %	0 %	50 %	50 %	312602147
1127	NC_014718	GCG	2	6	52989	52994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602147
1128	NC_014718	TCA	2	6	53016	53021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312602147
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1132	NC_014718	CTT	2	6	53154	53159	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312602147
1133	NC_014718	GCG	2	6	53236	53241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602147
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1136	NC_014718	GCATC	2	10	53451	53460	20 %	20 %	20 %	40 %	312602147
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1147	NC_014718	TTC	2	6	53969	53974	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312602147
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1164	NC_014718	GCC	2	6	54607	54612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602148
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1233	NC_014718	GTC	2	6	57255	57260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1236	NC_014718	TTTA	2	8	57319	57326	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1252	NC_014718	GC	3	6	57888	57893	0 %	0 %	50 %	50 %	312602152
1253	NC_014718	GC	3	6	57901	57906	0 %	0 %	50 %	50 %	312602152
1254	NC_014718	ACG	2	6	57940	57945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602152
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1261	NC_014718	GTGCT	2	10	58210	58219	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1262	NC_014718	ACCGG	2	10	58265	58274	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1263	NC_014718	GCG	2	6	58436	58441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602153
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1286	NC_014718	GCG	2	6	59508	59513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1370	NC_014718	CGA	2	6	63314	63319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602158
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1374	NC_014718	GCA	2	6	63515	63520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1375	NC_014718	AC	3	6	63521	63526	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1376	NC_014718	CGG	2	6	63562	63567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1377	NC_014718	CAA	2	6	63636	63641	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1378	NC_014718	C	6	6	63730	63735	0 %	0 %	0 %	100 %	312602159
1379	NC_014718	GCGCGA	2	12	63737	63748	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	312602159
1380	NC_014718	CGT	2	6	63830	63835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602159
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