MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Burkholderia rhizoxinica HKI 454 plasmid pBRH01

Total Repeats: 17624

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_014718	CCT	2	6	21928	21933	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312602131
502	NC_014718	CGG	2	6	21957	21962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602131
503	NC_014718	GCC	2	6	21973	21978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602131
504	NC_014718	CAA	2	6	21998	22003	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312602131
505	NC_014718	TG	3	6	22006	22011	0 %	50 %	50 %	0 %	312602131
506	NC_014718	CCA	2	6	22016	22021	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312602131
507	NC_014718	TCG	2	6	22055	22060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
508	NC_014718	GCG	2	6	22072	22077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
509	NC_014718	GCG	2	6	22091	22096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
510	NC_014718	GC	3	6	22123	22128	0 %	0 %	50 %	50 %	312602132
511	NC_014718	GGC	2	6	22129	22134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602132
512	NC_014718	GC	3	6	22148	22153	0 %	0 %	50 %	50 %	312602132
513	NC_014718	GGC	2	6	22165	22170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602132
514	NC_014718	GGT	2	6	22192	22197	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312602132
515	NC_014718	GCC	2	6	22231	22236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602132
516	NC_014718	GCTG	2	8	22267	22274	0 %	25 %	50 %	25 %	312602132
517	NC_014718	CG	3	6	22278	22283	0 %	0 %	50 %	50 %	312602132
518	NC_014718	CGCC	2	8	22313	22320	0 %	0 %	25 %	75 %	312602132
519	NC_014718	TGC	2	6	22352	22357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602132
520	NC_014718	CGT	2	6	22388	22393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602132
521	NC_014718	TCG	2	6	22475	22480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602132
522	NC_014718	CCA	2	6	22527	22532	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312602132
523	NC_014718	GAT	2	6	22647	22652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312602132
524	NC_014718	T	6	6	22655	22660	0 %	100 %	0 %	0 %	312602132
525	NC_014718	TCA	2	6	22672	22677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312602132
526	NC_014718	CGA	2	6	22773	22778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602133
527	NC_014718	CAG	2	6	22857	22862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602133
528	NC_014718	GGT	2	6	22880	22885	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312602133
529	NC_014718	GC	4	8	22891	22898	0 %	0 %	50 %	50 %	312602133
530	NC_014718	GAT	2	6	22922	22927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312602133
531	NC_014718	ATA	2	6	23011	23016	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312602134
532	NC_014718	GAT	2	6	23025	23030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312602134
533	NC_014718	ATG	2	6	23045	23050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312602134
534	NC_014718	GAT	2	6	23066	23071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312602134
535	NC_014718	GCG	2	6	23164	23169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
536	NC_014718	TGTT	2	8	23308	23315	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
537	NC_014718	TTTC	2	8	23335	23342	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
538	NC_014718	AAT	2	6	23367	23372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
539	NC_014718	GTG	2	6	23381	23386	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
540	NC_014718	GCCGTA	2	12	23506	23517	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
541	NC_014718	TAAA	2	8	23522	23529	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_014718	GCGCC	2	10	23581	23590	0 %	0 %	40 %	60 %	312602135
543	NC_014718	CTTG	2	8	23629	23636	0 %	50 %	25 %	25 %	312602135
544	NC_014718	CG	3	6	23656	23661	0 %	0 %	50 %	50 %	312602135
545	NC_014718	CG	3	6	23670	23675	0 %	0 %	50 %	50 %	312602135
546	NC_014718	TTGGTG	2	12	23711	23722	0 %	50 %	50 %	0 %	312602136
547	NC_014718	ACGA	2	8	23746	23753	50 %	0 %	25 %	25 %	312602136
548	NC_014718	CGC	2	6	23786	23791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602136
549	NC_014718	TCA	2	6	23822	23827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312602136
550	NC_014718	GCA	2	6	24004	24009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602137
551	NC_014718	ACA	2	6	24033	24038	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312602137
552	NC_014718	AGCC	2	8	24072	24079	25 %	0 %	25 %	50 %	312602137
553	NC_014718	GAT	2	6	24149	24154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312602137
554	NC_014718	CAG	2	6	24263	24268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602137
555	NC_014718	T	6	6	24294	24299	0 %	100 %	0 %	0 %	312602137
556	NC_014718	GTT	2	6	24307	24312	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312602137
557	NC_014718	ATG	2	6	24362	24367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312602137
558	NC_014718	GC	3	6	24417	24422	0 %	0 %	50 %	50 %	312602137
559	NC_014718	ACG	2	6	24434	24439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602137
560	NC_014718	CGG	2	6	24441	24446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602137
561	NC_014718	AG	3	6	24478	24483	50 %	0 %	50 %	0 %	312602137
562	NC_014718	CAG	2	6	24599	24604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602137
563	NC_014718	TCG	2	6	24664	24669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602137
564	NC_014718	CGG	2	6	24687	24692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602137
565	NC_014718	CGT	2	6	24733	24738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602137
566	NC_014718	GTC	2	6	24844	24849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602137
567	NC_014718	GCA	2	6	24856	24861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602137
568	NC_014718	GCG	2	6	24919	24924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602137
569	NC_014718	ACG	2	6	24962	24967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602137
570	NC_014718	TGATCT	2	12	24985	24996	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	312602137
571	NC_014718	TGG	2	6	25003	25008	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312602137
572	NC_014718	GCT	2	6	25249	25254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602137
573	NC_014718	TG	3	6	25296	25301	0 %	50 %	50 %	0 %	312602137
574	NC_014718	CCA	2	6	25303	25308	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312602137
575	NC_014718	GTC	2	6	25487	25492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602137
576	NC_014718	CTG	2	6	25496	25501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602137
577	NC_014718	GGC	2	6	25636	25641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602137
578	NC_014718	GGCA	2	8	25867	25874	25 %	0 %	50 %	25 %	312602137
579	NC_014718	TGT	2	6	25929	25934	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312602137
580	NC_014718	TTCC	2	8	25938	25945	0 %	50 %	0 %	50 %	312602137
581	NC_014718	TGC	2	6	25974	25979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602137
582	NC_014718	TGG	2	6	25982	25987	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312602137
583	NC_014718	AACG	2	8	26052	26059	50 %	0 %	25 %	25 %	312602137
584	NC_014718	TCAA	2	8	26142	26149	50 %	25 %	0 %	25 %	312602137
585	NC_014718	CGGC	2	8	26221	26228	0 %	0 %	50 %	50 %	312602137
586	NC_014718	ATA	2	6	26235	26240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312602137
587	NC_014718	ACAG	2	8	26265	26272	50 %	0 %	25 %	25 %	312602137
588	NC_014718	CGGT	2	8	26289	26296	0 %	25 %	50 %	25 %	312602137
589	NC_014718	TGG	2	6	26308	26313	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312602137
590	NC_014718	GGT	2	6	26557	26562	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312602137
591	NC_014718	TGG	2	6	26607	26612	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312602137
592	NC_014718	TGA	2	6	26620	26625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312602137
593	NC_014718	TTAG	2	8	26630	26637	25 %	50 %	25 %	0 %	312602137
594	NC_014718	CTGC	2	8	26750	26757	0 %	25 %	25 %	50 %	312602137
595	NC_014718	GAC	2	6	26815	26820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602137
596	NC_014718	CGA	2	6	26826	26831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602137
597	NC_014718	CTT	2	6	26878	26883	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312602137
598	NC_014718	GCT	2	6	26902	26907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602137
599	NC_014718	TGA	2	6	26919	26924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312602137
600	NC_014718	CAA	2	6	27020	27025	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312602137
601	NC_014718	CAG	2	6	27092	27097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602137
602	NC_014718	TGC	2	6	27156	27161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602137
603	NC_014718	GC	3	6	27218	27223	0 %	0 %	50 %	50 %	312602137
604	NC_014718	GCGCT	2	10	27230	27239	0 %	20 %	40 %	40 %	312602137
605	NC_014718	TGC	2	6	27279	27284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602137
606	NC_014718	CGG	2	6	27285	27290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602137
607	NC_014718	CGCTG	2	10	27303	27312	0 %	20 %	40 %	40 %	312602137
608	NC_014718	GCG	2	6	27324	27329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602137
609	NC_014718	GC	3	6	27412	27417	0 %	0 %	50 %	50 %	312602137
610	NC_014718	TGC	2	6	27453	27458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602137
611	NC_014718	AGCCG	2	10	27550	27559	20 %	0 %	40 %	40 %	312602137
612	NC_014718	GCC	2	6	27562	27567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602137
613	NC_014718	GCG	2	6	27593	27598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602137
614	NC_014718	GC	3	6	27652	27657	0 %	0 %	50 %	50 %	312602137
615	NC_014718	ACCG	2	8	27691	27698	25 %	0 %	25 %	50 %	312602137
616	NC_014718	CCA	2	6	27762	27767	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312602137
617	NC_014718	CA	3	6	27766	27771	50 %	0 %	0 %	50 %	312602137
618	NC_014718	ACG	2	6	27803	27808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602137
619	NC_014718	CG	3	6	27847	27852	0 %	0 %	50 %	50 %	312602137
620	NC_014718	GTCAG	2	10	27856	27865	20 %	20 %	40 %	20 %	312602137
621	NC_014718	ACG	2	6	27867	27872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602137
622	NC_014718	CTT	2	6	27931	27936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312602137
623	NC_014718	GCT	2	6	27991	27996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602137
624	NC_014718	CG	4	8	27997	28004	0 %	0 %	50 %	50 %	312602137
625	NC_014718	GCG	2	6	28006	28011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602137
626	NC_014718	GTG	2	6	28058	28063	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312602137
627	NC_014718	GCC	2	6	28075	28080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602137
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629	NC_014718	AGGC	2	8	28230	28237	25 %	0 %	50 %	25 %	312602137
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1000	NC_014718	A	6	6	47401	47406	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

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