MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Burkholderia rhizoxinica HKI 454 plasmid pBRH01

Total Repeats: 17624

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_014718	GCT	2	6	283824	283829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602349
6002	NC_014718	GCT	2	6	283851	283856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602349
6003	NC_014718	AAC	3	9	283888	283896	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312602349
6004	NC_014718	TGT	2	6	283917	283922	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312602349
6005	NC_014718	TCA	2	6	283957	283962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312602349
6006	NC_014718	CGA	2	6	283968	283973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602349
6007	NC_014718	GCT	2	6	283989	283994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602349
6008	NC_014718	CCG	2	6	284102	284107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602349
6009	NC_014718	CAA	2	6	284116	284121	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312602349
6010	NC_014718	TGG	2	6	284178	284183	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312602349
6011	NC_014718	CAAA	2	8	284205	284212	75 %	0 %	0 %	25 %	312602349
6012	NC_014718	AGC	2	6	284230	284235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602349
6013	NC_014718	ACGCG	2	10	284248	284257	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
6014	NC_014718	GGC	2	6	284490	284495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602350
6015	NC_014718	AGGCG	2	10	284513	284522	20 %	0 %	60 %	20 %	312602350
6016	NC_014718	CTC	2	6	284537	284542	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312602350
6017	NC_014718	CGA	2	6	284551	284556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602350
6018	NC_014718	CGA	2	6	284714	284719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602350
6019	NC_014718	GCC	2	6	284786	284791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602350
6020	NC_014718	GAC	2	6	284826	284831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602350
6021	NC_014718	CG	3	6	284876	284881	0 %	0 %	50 %	50 %	312602350
6022	NC_014718	TGG	2	6	284909	284914	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312602350
6023	NC_014718	GCA	2	6	285050	285055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602350
6024	NC_014718	GAT	2	6	285081	285086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312602350
6025	NC_014718	GCGAC	2	10	285116	285125	20 %	0 %	40 %	40 %	312602350
6026	NC_014718	GCC	2	6	285129	285134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602350
6027	NC_014718	GCC	2	6	285174	285179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602350
6028	NC_014718	GAC	2	6	285213	285218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602350
6029	NC_014718	GTT	2	6	285227	285232	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312602350
6030	NC_014718	GGC	2	6	285293	285298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602350
6031	NC_014718	GTC	2	6	285373	285378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602350
6032	NC_014718	TCA	2	6	285392	285397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312602350
6033	NC_014718	TGA	2	6	285404	285409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312602350
6034	NC_014718	TCG	2	6	285430	285435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602350
6035	NC_014718	GCT	3	9	285440	285448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602350
6036	NC_014718	GAC	2	6	285513	285518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602350
6037	NC_014718	TGA	2	6	285521	285526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312602350
6038	NC_014718	GAC	2	6	285531	285536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602350
6039	NC_014718	GCC	2	6	285551	285556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602350
6040	NC_014718	AAC	2	6	285636	285641	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312602350
6041	NC_014718	TGG	2	6	285658	285663	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312602350
6042	NC_014718	GGC	2	6	285747	285752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602350
6043	NC_014718	GGC	2	6	285775	285780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602350
6044	NC_014718	CTGG	2	8	285876	285883	0 %	25 %	50 %	25 %	312602350
6045	NC_014718	CGC	2	6	285925	285930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602350
6046	NC_014718	CT	3	6	285996	286001	0 %	50 %	0 %	50 %	312602350
6047	NC_014718	GC	3	6	286062	286067	0 %	0 %	50 %	50 %	312602350
6048	NC_014718	GGT	2	6	286124	286129	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312602350
6049	NC_014718	CAG	2	6	286158	286163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602350
6050	NC_014718	TGA	2	6	286184	286189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312602350
6051	NC_014718	CAG	2	6	286266	286271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602350
6052	NC_014718	TCTA	2	8	286288	286295	25 %	50 %	0 %	25 %	312602350
6053	NC_014718	TCT	2	6	286357	286362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312602350
6054	NC_014718	TCAA	2	8	286363	286370	50 %	25 %	0 %	25 %	312602350
6055	NC_014718	GCC	2	6	286388	286393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602350
6056	NC_014718	GGGCA	2	10	286464	286473	20 %	0 %	60 %	20 %	312602350
6057	NC_014718	TGA	2	6	286552	286557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312602350
6058	NC_014718	TCA	2	6	286561	286566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312602350
6059	NC_014718	ACA	3	9	286567	286575	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312602350
6060	NC_014718	TCAG	2	8	286650	286657	25 %	25 %	25 %	25 %	312602350
6061	NC_014718	GTG	2	6	286680	286685	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312602350
6062	NC_014718	CGA	2	6	286703	286708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602350
6063	NC_014718	GCC	2	6	286856	286861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602350
6064	NC_014718	TGC	2	6	287002	287007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602350
6065	NC_014718	TGG	2	6	287034	287039	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312602350
6066	NC_014718	CG	3	6	287046	287051	0 %	0 %	50 %	50 %	312602350
6067	NC_014718	CAG	2	6	287106	287111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602350
6068	NC_014718	GGCA	2	8	287162	287169	25 %	0 %	50 %	25 %	312602350
6069	NC_014718	AGC	2	6	287206	287211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602350
6070	NC_014718	GCC	2	6	287363	287368	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602350
6071	NC_014718	GCA	3	9	287396	287404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602350
6072	NC_014718	AGC	2	6	287422	287427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602350
6073	NC_014718	GC	3	6	287426	287431	0 %	0 %	50 %	50 %	312602350
6074	NC_014718	CAG	2	6	287457	287462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602350
6075	NC_014718	GGC	2	6	287464	287469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602350
6076	NC_014718	GCA	2	6	287483	287488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602350
6077	NC_014718	GCG	2	6	287514	287519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602350
6078	NC_014718	CG	3	6	287518	287523	0 %	0 %	50 %	50 %	312602350
6079	NC_014718	TGA	2	6	287579	287584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312602350
6080	NC_014718	CGG	2	6	287600	287605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602350
6081	NC_014718	CGT	3	9	287612	287620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602350
6082	NC_014718	ATC	2	6	287671	287676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312602350
6083	NC_014718	AAG	2	6	287677	287682	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312602350
6084	NC_014718	GCC	2	6	287709	287714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602350
6085	NC_014718	CGA	2	6	287729	287734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602350
6086	NC_014718	ACCG	2	8	287780	287787	25 %	0 %	25 %	50 %	312602350
6087	NC_014718	TG	3	6	287940	287945	0 %	50 %	50 %	0 %	312602350
6088	NC_014718	ACC	2	6	288040	288045	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312602350
6089	NC_014718	CGATG	2	10	288059	288068	20 %	20 %	40 %	20 %	312602350
6090	NC_014718	GTG	2	6	288075	288080	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312602350
6091	NC_014718	GC	3	6	288108	288113	0 %	0 %	50 %	50 %	312602350
6092	NC_014718	AGA	2	6	288275	288280	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312602350
6093	NC_014718	GCA	2	6	288296	288301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602350
6094	NC_014718	TTA	2	6	288319	288324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312602350
6095	NC_014718	GC	3	6	288349	288354	0 %	0 %	50 %	50 %	312602350
6096	NC_014718	GCG	2	6	288370	288375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602350
6097	NC_014718	CGT	2	6	288440	288445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602350
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6100	NC_014718	CTG	2	6	288577	288582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602350
6101	NC_014718	TCG	3	9	288592	288600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602350
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6103	NC_014718	ACA	2	6	288676	288681	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312602350
6104	NC_014718	ATGA	2	8	288717	288724	50 %	25 %	25 %	0 %	312602350
6105	NC_014718	ACC	2	6	288774	288779	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312602350
6106	NC_014718	TAC	2	6	288780	288785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312602350
6107	NC_014718	CGT	2	6	288809	288814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602350
6108	NC_014718	GTC	2	6	288861	288866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602350
6109	NC_014718	CGGC	2	8	288886	288893	0 %	0 %	50 %	50 %	312602350
6110	NC_014718	GGT	2	6	288911	288916	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6111	NC_014718	AGC	2	6	289038	289043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602351
6112	NC_014718	GCA	2	6	289076	289081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602351
6113	NC_014718	GCA	3	9	289133	289141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602351
6114	NC_014718	TGCGT	2	10	289165	289174	0 %	40 %	40 %	20 %	312602351
6115	NC_014718	CG	3	6	289191	289196	0 %	0 %	50 %	50 %	312602351
6116	NC_014718	CGT	2	6	289200	289205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602351
6117	NC_014718	GGC	2	6	289291	289296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602351
6118	NC_014718	GC	3	6	289431	289436	0 %	0 %	50 %	50 %	312602351
6119	NC_014718	CGG	2	6	289447	289452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602351
6120	NC_014718	CGG	2	6	289465	289470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602351
6121	NC_014718	TGA	2	6	289550	289555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312602351
6122	NC_014718	ACC	2	6	289596	289601	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312602351
6123	NC_014718	GTCGG	2	10	289682	289691	0 %	20 %	60 %	20 %	312602351
6124	NC_014718	GCC	2	6	289764	289769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602351
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6126	NC_014718	GCT	2	6	289841	289846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602351
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6133	NC_014718	TTGCAG	2	12	290304	290315	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	312602351
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6139	NC_014718	GAC	2	6	290529	290534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602351
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6143	NC_014718	TAC	2	6	290715	290720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312602351
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6152	NC_014718	GGGGC	2	10	291259	291268	0 %	0 %	80 %	20 %	312602351
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6172	NC_014718	CCG	2	6	292358	292363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6173	NC_014718	TCG	2	6	292536	292541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6203	NC_014718	GC	3	6	294224	294229	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6204	NC_014718	CAT	2	6	294247	294252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6206	NC_014718	AGC	2	6	294288	294293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6207	NC_014718	CG	3	6	294322	294327	0 %	0 %	50 %	50 %	312602354
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6214	NC_014718	GCT	2	6	294720	294725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602354
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6222	NC_014718	CGCT	2	8	295146	295153	0 %	25 %	25 %	50 %	312602354
6223	NC_014718	CAT	2	6	295253	295258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312602354
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6227	NC_014718	GCCA	2	8	295518	295525	25 %	0 %	25 %	50 %	312602354
6228	NC_014718	GCGAT	2	10	295537	295546	20 %	20 %	40 %	20 %	312602354
6229	NC_014718	TGTCA	2	10	295612	295621	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
6230	NC_014718	GCC	2	6	295652	295657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602355
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6232	NC_014718	TGGT	2	8	295748	295755	0 %	50 %	50 %	0 %	312602355
6233	NC_014718	CCG	2	6	295763	295768	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602355
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6237	NC_014718	TCCG	2	8	295852	295859	0 %	25 %	25 %	50 %	312602355
6238	NC_014718	CGA	2	6	295926	295931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602355
6239	NC_014718	CGA	2	6	296016	296021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602355
6240	NC_014718	GCA	2	6	296046	296051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602355
6241	NC_014718	GC	3	6	296065	296070	0 %	0 %	50 %	50 %	312602355
6242	NC_014718	TGC	2	6	296135	296140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602355
6243	NC_014718	GC	3	6	296139	296144	0 %	0 %	50 %	50 %	312602355
6244	NC_014718	CGG	2	6	296163	296168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602355
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6342	NC_014718	A	7	7	300979	300985	100 %	0 %	0 %	0 %	312602361
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6345	NC_014718	CGA	2	6	301068	301073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6348	NC_014718	GCCG	2	8	301225	301232	0 %	0 %	50 %	50 %	312602362
6349	NC_014718	GC	3	6	301233	301238	0 %	0 %	50 %	50 %	312602362
6350	NC_014718	GGT	2	6	301243	301248	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312602362
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6352	NC_014718	TCGCG	2	10	301396	301405	0 %	20 %	40 %	40 %	312602362
6353	NC_014718	GC	3	6	301473	301478	0 %	0 %	50 %	50 %	312602362
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6363	NC_014718	GCTC	2	8	301839	301846	0 %	25 %	25 %	50 %	312602363
6364	NC_014718	GCC	2	6	301864	301869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602363
6365	NC_014718	CGA	2	6	301878	301883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602363
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6367	NC_014718	CAG	2	6	302039	302044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6368	NC_014718	CG	3	6	302231	302236	0 %	0 %	50 %	50 %	312602364
6369	NC_014718	CCG	2	6	302272	302277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602364
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6489	NC_014718	TCGGC	2	10	307972	307981	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
6490	NC_014718	GC	3	6	308171	308176	0 %	0 %	50 %	50 %	312602376
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6493	NC_014718	GCG	2	6	308208	308213	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602376
6494	NC_014718	ATC	2	6	308222	308227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312602376
6495	NC_014718	GCC	2	6	308246	308251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602376
6496	NC_014718	GC	3	6	308297	308302	0 %	0 %	50 %	50 %	312602376
6497	NC_014718	CTT	2	6	308331	308336	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312602376
6498	NC_014718	GTA	2	6	308421	308426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312602377
6499	NC_014718	ATG	2	6	308432	308437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6500	NC_014718	TGCTG	2	10	308474	308483	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding

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