MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Burkholderia rhizoxinica HKI 454 plasmid pBRH01

Total Repeats: 17624

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_014718	GGC	2	6	257155	257160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602335
5502	NC_014718	CGA	2	6	257168	257173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602335
5503	NC_014718	GGT	2	6	257184	257189	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312602335
5504	NC_014718	CGGG	2	8	257225	257232	0 %	0 %	75 %	25 %	312602335
5505	NC_014718	GCAG	2	8	257313	257320	25 %	0 %	50 %	25 %	312602335
5506	NC_014718	T	6	6	257370	257375	0 %	100 %	0 %	0 %	312602335
5507	NC_014718	TCT	2	6	257393	257398	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312602335
5508	NC_014718	GAG	2	6	257449	257454	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312602335
5509	NC_014718	GCC	2	6	257461	257466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602335
5510	NC_014718	CCG	2	6	257473	257478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602335
5511	NC_014718	CTG	2	6	257494	257499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602335
5512	NC_014718	CGA	2	6	257529	257534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602335
5513	NC_014718	CGC	2	6	257563	257568	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5514	NC_014718	TAC	2	6	257597	257602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5515	NC_014718	CGT	2	6	257679	257684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5516	NC_014718	CATG	2	8	257756	257763	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5517	NC_014718	TGA	3	9	257799	257807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5518	NC_014718	GCAG	2	8	257832	257839	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5519	NC_014718	GTC	2	6	257851	257856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5520	NC_014718	CG	3	6	257857	257862	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5521	NC_014718	CG	3	6	257916	257921	0 %	0 %	50 %	50 %	312602336
5522	NC_014718	TTC	2	6	257941	257946	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312602336
5523	NC_014718	CGA	2	6	257965	257970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602336
5524	NC_014718	GGT	2	6	258002	258007	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312602336
5525	NC_014718	CAC	2	6	258112	258117	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312602336
5526	NC_014718	ATT	2	6	258145	258150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312602336
5527	NC_014718	GCA	2	6	258266	258271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602336
5528	NC_014718	ACG	2	6	258300	258305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602336
5529	NC_014718	GAC	2	6	258313	258318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602336
5530	NC_014718	CGT	2	6	258342	258347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602336
5531	NC_014718	GTT	2	6	258418	258423	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5532	NC_014718	TGG	2	6	258433	258438	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5533	NC_014718	CG	3	6	258593	258598	0 %	0 %	50 %	50 %	312602337
5534	NC_014718	CGA	3	9	258606	258614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602337
5535	NC_014718	TCA	2	6	258641	258646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312602337
5536	NC_014718	TGG	2	6	258731	258736	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312602337
5537	NC_014718	AAG	2	6	258775	258780	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312602337
5538	NC_014718	GCGCG	2	10	258789	258798	0 %	0 %	60 %	40 %	312602337
5539	NC_014718	CGC	2	6	258918	258923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602338
5540	NC_014718	GCG	2	6	258937	258942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602338
5541	NC_014718	CGA	2	6	258954	258959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602338
5542	NC_014718	CGCTA	2	10	258962	258971	20 %	20 %	20 %	40 %	312602338
5543	NC_014718	GC	3	6	259063	259068	0 %	0 %	50 %	50 %	312602338
5544	NC_014718	CG	3	6	259086	259091	0 %	0 %	50 %	50 %	312602338
5545	NC_014718	TGC	2	6	259132	259137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602338
5546	NC_014718	TGG	2	6	259194	259199	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312602338
5547	NC_014718	CGTC	2	8	259245	259252	0 %	25 %	25 %	50 %	312602338
5548	NC_014718	CG	3	6	259340	259345	0 %	0 %	50 %	50 %	312602338
5549	NC_014718	CGAG	2	8	259446	259453	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5550	NC_014718	AGT	2	6	259525	259530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5551	NC_014718	GGA	2	6	259564	259569	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5552	NC_014718	CTAT	2	8	259660	259667	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5553	NC_014718	GCT	3	9	259763	259771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602339
5554	NC_014718	TGA	2	6	259802	259807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312602339
5555	NC_014718	GTCGA	2	10	259810	259819	20 %	20 %	40 %	20 %	312602339
5556	NC_014718	GTGG	2	8	259847	259854	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
5557	NC_014718	TTC	2	6	259874	259879	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5558	NC_014718	GGC	2	6	259885	259890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5559	NC_014718	GTT	2	6	259987	259992	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5560	NC_014718	AGC	2	6	260010	260015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5561	NC_014718	ACG	2	6	260031	260036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5562	NC_014718	GAC	2	6	260123	260128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5563	NC_014718	GAA	2	6	260138	260143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5564	NC_014718	GAA	2	6	260147	260152	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5565	NC_014718	TTG	2	6	260308	260313	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5566	NC_014718	ACC	2	6	260348	260353	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5567	NC_014718	GTAA	2	8	260420	260427	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5568	NC_014718	GCTG	2	8	260447	260454	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5569	NC_014718	GCT	2	6	260676	260681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602340
5570	NC_014718	C	6	6	260842	260847	0 %	0 %	0 %	100 %	312602340
5571	NC_014718	GAGC	2	8	260907	260914	25 %	0 %	50 %	25 %	312602340
5572	NC_014718	CAA	2	6	261081	261086	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312602340
5573	NC_014718	TTG	2	6	261108	261113	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312602340
5574	NC_014718	TGC	2	6	261118	261123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602340
5575	NC_014718	GCA	2	6	261287	261292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602340
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5579	NC_014718	CGGA	2	8	261550	261557	25 %	0 %	50 %	25 %	312602340
5580	NC_014718	CGG	2	6	261668	261673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602340
5581	NC_014718	CAAA	2	8	261722	261729	75 %	0 %	0 %	25 %	312602340
5582	NC_014718	GCT	2	6	261836	261841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602340
5583	NC_014718	TGA	2	6	261844	261849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312602340
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5588	NC_014718	GCT	2	6	262118	262123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602340
5589	NC_014718	CAG	2	6	262137	262142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602340
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5591	NC_014718	CG	3	6	262170	262175	0 %	0 %	50 %	50 %	312602340
5592	NC_014718	GATG	2	8	262322	262329	25 %	25 %	50 %	0 %	312602340
5593	NC_014718	AGTTG	2	10	262337	262346	20 %	40 %	40 %	0 %	312602340
5594	NC_014718	CAC	2	6	262449	262454	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312602340
5595	NC_014718	CGC	2	6	262559	262564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602340
5596	NC_014718	TCCG	2	8	262612	262619	0 %	25 %	25 %	50 %	312602340
5597	NC_014718	CGG	2	6	262625	262630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602340
5598	NC_014718	CAG	2	6	262674	262679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602340
5599	NC_014718	CGA	2	6	262724	262729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602340
5600	NC_014718	CG	3	6	262733	262738	0 %	0 %	50 %	50 %	312602340
5601	NC_014718	GC	3	6	262760	262765	0 %	0 %	50 %	50 %	312602340
5602	NC_014718	AC	3	6	262787	262792	50 %	0 %	0 %	50 %	312602340
5603	NC_014718	GTT	2	6	262895	262900	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312602340
5604	NC_014718	CTGGA	2	10	262965	262974	20 %	20 %	40 %	20 %	312602340
5605	NC_014718	GCA	2	6	263138	263143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602340
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5607	NC_014718	CGCT	2	8	263251	263258	0 %	25 %	25 %	50 %	312602340
5608	NC_014718	TCAG	2	8	263287	263294	25 %	25 %	25 %	25 %	312602340
5609	NC_014718	GAC	2	6	263342	263347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602340
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5612	NC_014718	CG	3	6	263530	263535	0 %	0 %	50 %	50 %	312602340
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5619	NC_014718	TCG	2	6	263855	263860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602340
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5622	NC_014718	TGC	2	6	264020	264025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602341
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5624	NC_014718	GGA	2	6	264135	264140	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312602341
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5628	NC_014718	T	6	6	264436	264441	0 %	100 %	0 %	0 %	312602341
5629	NC_014718	GGA	2	6	264504	264509	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312602341
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5736	NC_014718	GTGCGC	2	12	269448	269459	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	312602342
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5744	NC_014718	GAC	3	9	270117	270125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602342
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5746	NC_014718	ACT	2	6	270199	270204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312602342
5747	NC_014718	GAT	2	6	270252	270257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312602342
5748	NC_014718	CG	3	6	270309	270314	0 %	0 %	50 %	50 %	312602342
5749	NC_014718	GAT	2	6	270354	270359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312602342
5750	NC_014718	CGG	2	6	270367	270372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602342
5751	NC_014718	GTG	2	6	270414	270419	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312602342
5752	NC_014718	CG	4	8	270434	270441	0 %	0 %	50 %	50 %	312602342
5753	NC_014718	TGC	3	9	270442	270450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602342
5754	NC_014718	GAT	2	6	270495	270500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312602342
5755	NC_014718	GAT	2	6	270503	270508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312602342
5756	NC_014718	TGC	2	6	270523	270528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602342
5757	NC_014718	CGC	2	6	270579	270584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602342
5758	NC_014718	GCA	4	12	270620	270631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602342
5759	NC_014718	CGCA	2	8	270645	270652	25 %	0 %	25 %	50 %	312602342
5760	NC_014718	GCC	2	6	270734	270739	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602342
5761	NC_014718	TGC	2	6	270856	270861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602342
5762	NC_014718	AGCG	2	8	270872	270879	25 %	0 %	50 %	25 %	312602342
5763	NC_014718	TGC	2	6	270928	270933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602342
5764	NC_014718	CCT	2	6	270957	270962	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312602342
5765	NC_014718	GC	3	6	270964	270969	0 %	0 %	50 %	50 %	312602342
5766	NC_014718	CGC	2	6	271030	271035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602342
5767	NC_014718	GC	3	6	271034	271039	0 %	0 %	50 %	50 %	312602342
5768	NC_014718	CG	3	6	271141	271146	0 %	0 %	50 %	50 %	312602342
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5772	NC_014718	GCT	2	6	271493	271498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602342
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5774	NC_014718	CTG	2	6	271540	271545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602342
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5776	NC_014718	CAA	2	6	271665	271670	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312602342
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5778	NC_014718	TCG	2	6	271837	271842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602342
5779	NC_014718	ACA	2	6	271846	271851	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312602342
5780	NC_014718	ATG	2	6	271912	271917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312602342
5781	NC_014718	CTA	2	6	271952	271957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312602342
5782	NC_014718	CGG	2	6	271990	271995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602342
5783	NC_014718	CGA	2	6	272063	272068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602342
5784	NC_014718	TGA	2	6	272153	272158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312602342
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5789	NC_014718	GC	3	6	272340	272345	0 %	0 %	50 %	50 %	312602342
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5797	NC_014718	GC	3	6	272654	272659	0 %	0 %	50 %	50 %	312602342
5798	NC_014718	AC	4	8	272721	272728	50 %	0 %	0 %	50 %	312602342
5799	NC_014718	GCC	2	6	272746	272751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312602342
5800	NC_014718	GCG	2	6	272847	272852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602342
5801	NC_014718	AGCC	2	8	272853	272860	25 %	0 %	25 %	50 %	312602342
5802	NC_014718	CA	3	6	272915	272920	50 %	0 %	0 %	50 %	312602342
5803	NC_014718	GC	3	6	272938	272943	0 %	0 %	50 %	50 %	312602342
5804	NC_014718	TGC	2	6	272965	272970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602342
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5812	NC_014718	TCGA	2	8	273343	273350	25 %	25 %	25 %	25 %	312602342
5813	NC_014718	CGT	2	6	273431	273436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602342
5814	NC_014718	CAG	2	6	273485	273490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602342
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5816	NC_014718	GC	3	6	273524	273529	0 %	0 %	50 %	50 %	312602342
5817	NC_014718	CAG	2	6	273537	273542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602342
5818	NC_014718	CGA	2	6	273548	273553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602342
5819	NC_014718	GGT	2	6	273644	273649	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312602342
5820	NC_014718	GTG	2	6	273651	273656	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312602342
5821	NC_014718	TTGCG	2	10	273670	273679	0 %	40 %	40 %	20 %	312602342
5822	NC_014718	GAA	2	6	273805	273810	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312602343
5823	NC_014718	TAT	2	6	273811	273816	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312602343
5824	NC_014718	GGC	2	6	273840	273845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602343
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5827	NC_014718	ATG	2	6	274037	274042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312602343
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5830	NC_014718	TAAT	2	8	274208	274215	50 %	50 %	0 %	0 %	312602343
5831	NC_014718	GAAA	2	8	274225	274232	75 %	0 %	25 %	0 %	312602343
5832	NC_014718	AT	3	6	274244	274249	50 %	50 %	0 %	0 %	312602343
5833	NC_014718	CTA	2	6	274376	274381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312602343
5834	NC_014718	GCT	2	6	274423	274428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602343
5835	NC_014718	TAA	2	6	274443	274448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312602343
5836	NC_014718	A	6	6	274473	274478	100 %	0 %	0 %	0 %	312602343
5837	NC_014718	CGA	2	6	274502	274507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602343
5838	NC_014718	GCT	2	6	274543	274548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602343
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5842	NC_014718	AAG	2	6	274751	274756	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312602343
5843	NC_014718	G	6	6	274820	274825	0 %	0 %	100 %	0 %	312602343
5844	NC_014718	AGG	2	6	274854	274859	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312602343
5845	NC_014718	GCC	2	6	274911	274916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5846	NC_014718	GT	3	6	274922	274927	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5847	NC_014718	ACGG	2	8	274935	274942	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5848	NC_014718	GCGA	2	8	274984	274991	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5849	NC_014718	TGTAA	2	10	275062	275071	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
5850	NC_014718	GGT	2	6	275147	275152	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5851	NC_014718	GC	4	8	275174	275181	0 %	0 %	50 %	50 %	312602344
5852	NC_014718	GGCG	2	8	275246	275253	0 %	0 %	75 %	25 %	312602344
5853	NC_014718	GCT	3	9	275266	275274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602344
5854	NC_014718	TGA	2	6	275305	275310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312602344
5855	NC_014718	CG	3	6	275347	275352	0 %	0 %	50 %	50 %	312602345
5856	NC_014718	GGC	2	6	275388	275393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602345
5857	NC_014718	GTT	2	6	275490	275495	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5858	NC_014718	AGC	2	6	275513	275518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5859	NC_014718	AGC	2	6	275555	275560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5860	NC_014718	GAC	2	6	275626	275631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602346
5861	NC_014718	GAA	2	6	275641	275646	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312602346
5862	NC_014718	GAA	2	6	275650	275655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312602346
5863	NC_014718	GTGC	2	8	275770	275777	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5864	NC_014718	TCA	2	6	275848	275853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5865	NC_014718	GCA	2	6	276109	276114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602347
5866	NC_014718	CGTTT	2	10	276120	276129	0 %	60 %	20 %	20 %	312602347
5867	NC_014718	GCG	2	6	276136	276141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602347
5868	NC_014718	GCA	2	6	276157	276162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602347
5869	NC_014718	CGG	2	6	276267	276272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312602347
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5991	NC_014718	GCCG	2	8	283159	283166	0 %	0 %	50 %	50 %	312602349
5992	NC_014718	AAGCG	2	10	283176	283185	40 %	0 %	40 %	20 %	312602349
5993	NC_014718	CGA	2	6	283192	283197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602349
5994	NC_014718	AAC	2	6	283256	283261	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312602349
5995	NC_014718	GCA	2	6	283320	283325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602349
5996	NC_014718	CAG	2	6	283333	283338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312602349
5997	NC_014718	GCT	2	6	283542	283547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312602349
5998	NC_014718	GCTTA	2	10	283566	283575	20 %	40 %	20 %	20 %	312602349
5999	NC_014718	GC	3	6	283756	283761	0 %	0 %	50 %	50 %	312602349
6000	NC_014718	CAA	2	6	283768	283773	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312602349

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